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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000035_pilon:1435528..1443266- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045772 ID=XLOC_045772|Name=XLOC_045772|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7739bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1435528..1443266- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATCTCAAGTGGAACTTTTTAACTATTTTACTCCTTGAAATCATCTT
TCTTTTACACCATGGATGGAAAGCCGATGCAACTCTTTCGAAATCAAAGA
AAAAGAAAGACACCTGTAAAAGCAATGACTGCAAAGAAAAGATGCAGAAA
GTGGTATGCGAAAGATCTAGCTTTTTTATAAATACTTTTTATTTTTGTAC
GCTACTAAACAAATATTCAGATATTTTGAAAAATTTCTTCAGCTGATTTT
TGGAATTTTATGACAGGCTAGCTAGCTCTAAAAGCTCTAAAACAGCATAT
GCTAGCATCTAATAACATGAAAACCAGAATATGATTCTTCAATGGGAATC
AAAACTATAAAGTGCACTTACAAACATCAGTTTGTCAGACCTAACAAAAT
TAATAACCGCACTGTCATCATTGACAATAAAACAAACAATTTTCTGTCAA
GAGCCTTGTAAACATCCAGACGATGTCGATCGAACGAATCGAACGCCGAA
TCAATTGAACGCAATCGAACGCAATCGAATGATTGAAATTCGATTGCCGA
ACGCAATCGAATGCCAATCGAATATTACCGCGATTTTCTCGATTGATTAG
ATTGCGTTCGATTAGTGCCTGGATTTGATAGACCTTTTTTCAAAGAGGCC
ACCCTGTTGAATAATTATGTAGTCCAGCAGAAAAGCAATGATGCGTAATT
ATTACAATATGCATGATAAAGTACACTATCATTGTTTCTATGGCTGGACT
ACATAATTATTCAACAGGACGTCCTCTTTGAAAAAAGGTCTATTGATTCG
ATTGATTCGATTGCGTTCGATTGACTAATGTATTCGATTGATTCAACTAC
GTTCGGTTGGCTTATGCATTCGACTGGTTCGACTAATTGATTTGATTCTC
GTTCAACATTTGAATAGTTAAACGAGATGATATGAATCATTTTAGCCTGG
ATTCTAGAAAATGCAGATCATGCAGGCCCACATGTTTACTGCAAGTTGTG
TGTCAAAGCCCGTTCGTTGCGTTGATTGATCTATCGTATCGCGATACTTA
ACCTCCCTAATAAGAGGCGCTCGAAATTGAAAGGAATAGACCTTTTTTCA
AAGAGGCCACCCTGTTGAATAATTATGTAGTCCAGCAGAAAAACAATGAT
AAAACCATGCTTAATTATTACAATATGCATGATATAGTAATTATGCATGG
CTCTATCATTGTTTTTTATGGCTGGACTACATAATTATTCAACAGGACGT
CCTCTTTGAAAAAAGGTCTATTGAGGTAAATTGGAATCTAATTTAATCAA
CCACCCGTCGAATGCAGTCGAACGTAATCGAACATCAATCAACGTAATCA
AATATCAATCGAACGTAATCGAATATCAATCGAATCAATCGAATTTTACC
CAGAATTTTACGTTCGATTGATATTCGATTGCGTTCGGCAATCGAATCGC
AATCATTCGATTGCGTTCGATTGCGTTCGATTGATTCGATTGGAATTTTC
GTTCGATTCCGTTCGATTGACATCGTCTGGAAACATTCCAACAACTTCCA
TCGAAATGATCTATCACGGCTCAGTCTACCATTTTTAGGATTGAGACGAG
AATGCTTGCAGAACGCCTGCAGAACGCCTGCGAGCTCCAGCGCGTGTGAA
AAACTTCAATCTGTCAATCATTTTCTCATACTGAATTTGAAAGATCTTCT
AGTATATATGTGGCGTTTTTTTTGCAAACTTCAAACAACTGATTTTTGTT
CCGCCTTTGTGGGACTTTGCTTGGCTTAAGTGCTTGGGTGCAGCATAGGG
TACAAAGTCTAAACATGCGTCTCCCGTAATTTTTGAAGAGTTAGGTCTAT
ACTGTATGGTGAAGCACGCACATGCAAGTCGGTTGGGGTTGGGTTATTCA
GACCTGCCATCTTTCTTACCGTCTTACTTGCTTACTTGGGACGATTGGTC
GAAACATGGGACTGTTGATATCTGGCCTGTATTTTCACTCACTGTTAAAT
CTCTTTGACAATAAATTTGTTTTGATAACTCCACCAAGTTTATCAATCAT
ACTTTCACTGATAGCGCGCCCTTTTCTGTTTTCATTCAAAATGACCGGAC
GCAGATTGGAGAATTAGAGAACGTCTGCCGCCTATCGCCCGATGGGATTA
ACAAATAACGAGTGTGTAACTTGCTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGACGTCA
GACGCTCCATCGTTTTGCCTCTAATTTGTTCTTCTTCGTTCACGACACTC
GCGTATGTTTCGCTAGGGATTTTTTTCATATTTCCATTTAAAAGCCTACT
CGGTGCGAAAGAGAAATTGTGTATTTTTTAATACGCCGTTCATTAAATCA
AATCAATTGCCGTCCCATGTTTTGTCAGATAGTCCCTGCCAAGTTAGAGC
AGTTGACGGTAGCTGTCAACTCTCCTGCATGCCAATGTTTTCTCCCACGG
AAATTGTGTATTTTTTAATACGCCGTTCATTAACTCAAATCAATTGCCGT
CCCATGTTTTGTCAGATAGTCCCTGCCAAGTTANGAAAGAGAAATTGTGT
ATTTTTTAATACGCCGTTCATTAACTCAAATCAATTGCCGTCCCATGTTT
TGTCAGATAGTCCCTGCCAAGTTAGAGCAGTTGACGGTAGCTGTCAACTC
TCCCGCATGCCAATGTTTTCTTCCACGGGAAAAAATTCAGCCAGATTTCC
AGCATTTTCAAGATTTTCTCCTGCATCTCCAGCTTTTCCAAAAATTTTCC
AATTTCCTGAAAAAAATTCAGATTTTGAAAAAACGGAATGGCAAAATTGC
CTGATTTTGGAAAATTGGGACAAAAAAATCCCCGATTTCTCCCCCTATTA
CCACTAGGCTTTATAATTTGAATTTAACTTCACCTACGTTTTGAGGGCCC
TAAACCTGCGTTTTGACAACCAGGGGTATACCGTAAAAAAATTATCAAAC
TAATTTATGCCCAAAACCCTCTAAATCACATTTCCAAACTATGGTCAAAA
TTTTATATTCATATCTTAAAGATATCTCAAGAAATCGCTAAAATTGCAAA
CCTCTGTTTTGGGGGCCATTAGAAAAAAGCCACCTATCTTTAAGCGATTG
AAATATTGTTGAAATTGAAGGTTTTGAGAAAGAACTTCCGGGAAATAAAG
TAGAAATGTTAAAGTTTTTCATGCAGCAAAAATTTTTGTAAAACCTTTTT
TCCTCAAGATTTGAGAGAAATTTTAAATTTGATTGACGTTTTGGGGGCCA
CATACTGTATAAAAAATGTGTGAGAAATCAAACTTTTTGCATAAGACAGT
GTGGAATATAGGCCAAGGATCACAAATAACTTGTGTTTGTGTTGCTCGAC
CGACTGATATGATAATCTTTCTTAATTTTCCAATTCTTTTGATTCGGAAG
GTTGCAAAATTTCCTATAGGTTAGCGGAAATGTGTTATTATGTCCCTAGT
CATAAAAACAGAGATATTACATTTGAAAAAAGATGACTTGTATTGTAAAA
CTCAAGGACAGCATTATTGACGGACCGTCTACATAAACAAGGCAAAACTG
CAGGCTGTTTATTTACATTTTCTGATAGTTTGAAAATCTATTTTGCCGAC
TGACTCTTCTTTTTTTTACATAAAAATGATGCAAACACAAGTTATTGGTG
ATGGTAGCCTAATTATCCTATGGATAGGATTTAGGGCTTGGTAGTTAAGA
AGGGGTTTGGTTGAAATGACTGGCTAAACCAAAGATTTATCTACTTTTCT
ATCAACAAGAATCTCTTGAAATCATCATTTGAAAATTTCTTTATTATATA
TACAGGTTGGTCCAATCACTTCATCAGTGTTCACAAATAATCTGGTCAGC
AAAAACATTAAATATCAAGATATTTTAAAATACAACAAAGCGTATTTTGA
TGATGTTTATGAAAGAAAGTTCATGGGTGATGTCCTTGGCTATGTTACAC
CTGTAAGTATGAGTTCTGTCACTTCAGAAGATCAGAAAAAATGAGTGATA
TTAAATTTAGCTCCCTCAGGTGCCTTATAAAGGTCGCCCCCTCTCCCCGT
TTATTAATCTCTCGAATTTTTCAAACCCCTGGAGCTTAGGATCCCCTTTT
TTCGAAACATTTTTAGCTGTCAAAAGAAGAGTTCCTATTTTGCTCTAAAT
AGCCTGGTTCTATAATCATCTTATTTTGATATTATTGAAATTTGAAGATT
TTTCCAACCCCCTGTTTATCAACTTATTGGTTAAAAGGTTAAGCATTATA
ATGACTAAGCAAAAAAATGATGAACTAATATATGCTGTAAATCAGTCCCA
AGATATGTATATAACACTCAACCCCTAAAACACAAAAAACTGTAAAAGAT
CGTAATTTGCGTGCCTCTCCTATGCCCCTTAACTAAATCATTTATCAGTT
ATTTATTAATAATATTATTTATTACTAATAAGTGACCTGGTAAATTTTTT
AATGGCAGTTGGTATAAAACAAGGTACTACTGTATATACAGTAGAGATTT
CAACAATATCAGTATATTACCCTATGGGGATGAAGTTCAGAGTGTCTTTC
CCCTTGGCGACGAAAGTTCAACTTATTTTTCCAGTATATACAAGTTTTTT
TATGAGAACATCGAAGATTTTTGAAGCTTTAGGATGTTCTTAATTTTCTC
AGTTTTAAGCCTAAAAATGTTCTTAATTTCACAATTTTTGAACATTTTTG
TGCAATTTCCTAAAATTAGGCATTTTAAGTCCCTTAAGCCTTAAAATGTT
CTAAACTTGTTCTTAATATTTCGGCCTTGTGCTCTTATGATTCTATAGTT
TAAAAAAACGCGTAGAGGTGAAATTTCACCTTCATTTCATCATTTCTAAT
TTCCCATTTTCCTTCTTTTTTTTCAGTGGAATAATCATGGATATGATGTT
GCCAAAACATTCCCAAAGTTTACCTTAATTTCACCAGTCTGGTTACAAAT
TGTGCAACCACAGCTTGGAGTTTACAAAATCAAGGGTACGCATGACATTG
ATGAGAAATGGATAAGAGATGTTCGAAATAAAAACCATTTAGCTAAAATT
GTACCAAGGATGCTTTTAGATGGATGGAGTTTGGAAGGTTTTGTTTCCTT
ATTCAGTCAAAGCCAATACATGTATAAGTTTGTGGATACCATTGTAAATT
TTGTTGATGAAAGAAATTTGGATGGTATTGTATTGGAGATATGGTCACAA
CTTGGTGGGAATTATAAATCGTGAGCAACATTTTATGCTTTTATGCTCTT
TTCTAAGATGTGTTTACTTGTTTAATAAAATTTATTTTTTGATAATATTG
GAATTTTGATAGCAGGACGTGTATATATATTTTTAAACCAAGCGATTTAT
ACAAAGCTCAACACTTAGTGTTTTGATCACTTTAATGCGACATCAGTCTA
TGCTACCTTACTCGAGCCTCACTGATGAGTCCTAGGAAGGACGAAGCACG
TGTCTGCGGTTAAATACAGTGTTTTTAACCATGATGTCATGTTTTTTTGT
TCTCATGTAGAGAAGCATCACAACTGATCAAAGAGCTTGGCGAAGCAATG
ATGTCACGAAAACAAAAACTTATACTGGTCATTCCACCGCCTTTGGCTGC
CAGGTATAATGATTTTGACATAACTTCAATCAGAAAGATTTCTACGAGAT
TTGGTTTTGCGCATTCGCGAATTTTTTTATTCGAATTACGAAATTTCCGA
AATGGGGTCTGACGAGCCCTATACAATTGGTTGTATGATCAGAACACTTG
GGTGCCTTGGACACTATTAGTTAATGGGTTTTGAGTTTGTACCAAAGGAG
TAACTCCCACAACTTACGGGTGGTGCACCCAAACCCACACCCACACATGT
GCTTGTTCTGGCTTGTGTGAGTGTTTACCCTCCTACCCAGCTGACTCAGA
ACGTTGTTTCGACGTTTATCTAATGTTCACAACGTCCATATAACGTTAGA
TGAATGTTGAAACAACGTTGTGTGTGTCAGCAACGGTCTAAGTCCGTTCA
CCCGCATACCATATTACTTCAAATAAACGCCCCTTCTTTAAACGCCCCCT
CATAAAACAATTTTATAGAAAAATTTAATGAACGCCAGGGGCGTTTATCG
AAGTAGGTATCGAAGGTATTGTCAAATTTCGAATTTTGCGTGCAGCCTAG
CGTAGTGCTAGCGTGCCGGGCTCAGAATTGCTCATGAAATAACTTAAGTT
GGTCGAGTCAAATCTAGGGTTTTGTCTCGAGGTGTTCTGAGCATTTAGTT
ACGTGTTACCAAATGTTTTCATTGAATTAAATAAATTTTAAAATGTAGAG
AGAAATAGATCGCTTTGTTCGTGAAGTTCCTCGACGATCTTTCCCATTTT
TTTCATCATACAGAGATACACCAGGAATGTTTGATCGTAACGATTTTGAA
CTTTTGGCACCAATCGTTGATGGGTTTAGTTTGATGACGTATGATTATCC
TCACTATGGAAGGTAAGAAAGTACAACATCTGTTTTGTGATCACAGATCA
CCTCGTCCCCGTGTATTCAAGGCACGTGACCAAGCTTTTTTTTAAATATT
TATCGAAGCAAATACACATGTACACTACGAACATATATTACAAAACACTA
CTTAAACATAAAATATAGTCCCTCCCCCCGCTAGGAACTAACGTTATATC
GCCAAGCTTTATCTAACTTCCATCTTTGATCAGAGTTTCTTTTAAGTGGT
ATACGCAAAGAAGCCATTGCAGTGTTAAAAATCAACCTCTAACTGCACTG
TATCATCAAAACTATCCTCGGAAAAGTAGATCTAGTGCTCTCAATGCATT
TACAATGCTATTGAGTAGTGCTATAATTAGGGTACCACTTTCAAGAAAAC
TCCGATCAAATATTTTACTTGACCATTTTACTTGGGTTGAGAAACTTGAT
CTCTAGGGTATATAAAGGTCAATGACTCCAGGTTTTATTTACCTTAAGGC
CGGTTTTCACTTGCGCGTGCTACGATCGCACTTTTTAGCTTCAATCCTTT
TTGCTTAAGGAAAAAAGATTACGTCATAAAAATGTAGCGTGCGCTCGAAA
AAAAAATTTACTCCATTATGTCAGGTCGCGCCAATAGAATTGTTTCATTT
TTCTTTTGACCAATAGCGTGGAAGCTTTGTTCGAAAATATGCGATCGCAG
CGCGCGCAAGTGGAGACCGGCCTTTACAGACATTGCAAAGTAATGACCAT
TACACTGCAATGCAACAACTTCAAAATGTAAGAACAAATGAAATCTGACG
AAATGAGATCTACTCAAATTTTCCTCTTTGATGATAACAAAGATAAAATT
TATTGTAGAAATCATGCAAAGTTCCATCAATTGTGGTTTCAGTACATTTG
AACGATTAAAACACTGCTTTTATGCACCGAAAACTTGAATTTTCTACTTA
AAACATACCTAATTCGCAAGCATAAACAAAACAAAAGTTTATACTCGACG
CGAAAATTTTTTATGTCAAATTCGCGAAAGTAAATGTCGTAAATTTCGCG
AATTTTCGACCTCGCGAAAGTTTCTGCTCGCGAAAGTTTGTACGCCTAAA
GTAGATCCATTCAGCATATGTATGGTAACTTGTTTTCTTTTCATATCTTT
TAGCCCTGGAGCTGTTGCACCATACGATTGGATTAAAGATTGCGTAGAAA
ATCTTGTTCCAGAAAAAACATTATTTCGTCAAAAATTATTACTGGGGTTG
AACTTTTATGGATACACTTATAAAGGAAGAAGTCAAACA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000035_pilon:1435528..1443266- >XLOC_045772 ID=XLOC_045772|Name=XLOC_045772|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1944bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1435528..1443266- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATCTCAAGTGGAACTTTTTAACTATTTTACTCCTTGAAATCATCTT
TCTTTTACACCATGGATGGAAAGCCGATGCAACTCTTTCGAAATCAAAGA
AAAAGAAAGACACCTGTAAAAGCAATGACTGCAAAGAAAAGATGCAGAAA
GTGATGGATCTCAAGTGGAACTTTTTAACTATTTTACTCCTTGAAATCAT
CTTTCTTTTACACCATGGATGGAAAGCCGATGCAACTCTTTCGAAATCAA
AGAAAAAGAAAGACACCTGTAAAAGCAATGACTGCAAAGAAAAGATGCAG
AAAGTGGTTGGTCCAATCACTTCATCAGTGTTCACAAATAATCTGGTCAG
CAAAAACATTAAATATCAAGATATTTTAAAATACAACAAAGCGTATTTTG
ATGATGTTTATGAAAGAAAGTTCATGGGTGATGTCCTTGGCTATGTTACA
CCTGTTGGTCCAATCACTTCATCAGTGTTCACAAATAATCTGGTCAGCAA
AAACATTAAATATCAAGATATTTTAAAATACAACAAAGCGTATTTTGATG
ATGTTTATGAAAGAAAGTTCATGGGTGATGTCCTTGGCTATGTTACACCT
TGGAATAATCATGGATATGATGTTGCCAAAACATTCCCAAAGTTTACCTT
AATTTCACCAGTCTGGTTACAAATTGTGCAACCACAGCTTGGAGTTTACA
AAATCAAGGGTACGCATGACATTGATGAGAAATGGATAAGAGATGTTCGA
AATAAAAACCATTTAGCTAAAATTGTACCAAGGATGCTTTTAGATGGATG
GAGTTTGGAAGGTTTTGTTTCCTTATTCAGTCAAAGCCAATACATGTATA
AGTTTGTGGATACCATTGTAAATTTTGTTGATGAAAGAAATTTGGATGGT
ATTGTATTGGAGATATGGTCACAACTTGGTGGGAATTATAAATCTGGAAT
AATCATGGATATGATGTTGCCAAAACATTCCCAAAGTTTACCTTAATTTC
ACCAGTCTGGTTACAAATTGTGCAACCACAGCTTGGAGTTTACAAAATCA
AGGGTACGCATGACATTGATGAGAAATGGATAAGAGATGTTCGAAATAAA
AACCATTTAGCTAAAATTGTACCAAGGATGCTTTTAGATGGATGGAGTTT
GGAAGGTTTTGTTTCCTTATTCAGTCAAAGCCAATACATGTATAAGTTTG
TGGATACCATTGTAAATTTTGTTGATGAAAGAAATTTGGATGGTATTGTA
TTGGAGATATGGTCACAACTTGGTGGGAATTATAAATCAGAAGCATCACA
ACTGATCAAAGAGCTTGGCGAAGCAATGATGTCACGAAAACAAAAACTTA
TACTGGTCATTCCACCGCCTTTGGCTGCCAGAGAAGCATCACAACTGATC
AAAGAGCTTGGCGAAGCAATGATGTCACGAAAACAAAAACTTATACTGGT
CATTCCACCGCCTTTGGCTGCCAGAGATACACCAGGAATGTTTGATCGTA
ACGATTTTGAACTTTTGGCACCAATCGTTGATGGGTTTAGTTTGATGACG
TATGATTATCCTCACTATGGAAGAGATACACCAGGAATGTTTGATCGTAA
CGATTTTGAACTTTTGGCACCAATCGTTGATGGGTTTAGTTTGATGACGT
ATGATTATCCTCACTATGGAAGCCCTGGAGCTGTTGCACCATACGATTGG
ATTAAAGATTGCGTAGAAAATCTTGTTCCAGAAAAAACATTATTTCGTCA
AAAATTATTACTGGGGTTGAACTTTTATGGATACACTTATAAAGGAAGAA
GTCAAACACCCTGGAGCTGTTGCACCATACGATTGGATTAAAGATTGCGT
AGAAAATCTTGTTCCAGAAAAAACATTATTTCGTCAAAAATTATTACTGG
GGTTGAACTTTTATGGATACACTTATAAAGGAAGAAGTCAAACA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000035_pilon | genome | sc0000035_pilon:1435528..1443266 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 838-972:136 |
| Aaloc | 739-834:1376 |
| Aaloc | 646-735:2229 |
| Aaloc | 301-642:2864 |
| Aaloc | 154-300:3935 |
| Aaloc | 1-153:7740 |
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