|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000035_pilon:1405394..1412662- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045769 ID=XLOC_045769|Name=XLOC_045769|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7269bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1405394..1412662- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGGCGAGAGACCGAAGAGACAAAATCTGTTTATCGGAAAATGGAT
TCCACAAGACAGAGTAGCCATTATGAAATGGGCTAAAAGAAGACTTGAGG
AATACAAGGTAGGTTCTCATTAAAATGTTTTATCGTGTAAAAGGGGCTGA
CAATGAAAAAGAAATTTGTACCCCCCTATGTTAAGGAGATCTTTTCTGGT
AAAGGTGACCGCCGTAGATATTTTTTTTGGAATTTTTCAGGACCTTTTGA
TTTTTCACCTCATTTATGTGGATTTTTACACTCGAAAAACAAGACCAGGG
GGGGGGGATTTTTATTTTCTAGACCACCCTGGACGTCGAGCTTCCTCAAC
ATAAGAGTTACAGAATTTTTCTGGAATAACCCAAAAATGAAAAATCCAGG
GAGATAAAAAGTCCAAAATAAAAGTCCAAGGGAAACTTGAACTGCGACTC
ATTTAGACAGACGAGTTTAATACCTTTTGAAAATTGAGGAAAGAATTTTT
TTTAGAAGACTTTCTTAAAGTCATCACAAAGATGTCATATGTGGGCGTAA
CAAGTTTATGTCCCTTAGTGCTGTAGGAAGTATTTTGAATTTTGGTTTGG
GGGGGGGTTAAGGTTTAGTAACACTACGAGGGGAAAGAAAATTAGAAATC
CCAAGGTTCCCCCGGTCCCAGTAGCTACTACTTTGTACCAGAGTGTATCT
CACGTTTATCTTTTCCTAGTACGGCCTCTACGGCAATAAATTTTGAAATT
AGACGTAGATATCAGGTCTGTGTACAGACTACAATCATGGTCAAAATTCA
ATCAGAATTTAGCTTATTTTCTCGTTTTTCGAAATTTGGAGAACGTCGCT
TTTGGGCTAATTGATAAATTTATTCGAGTATTTCAATTCGGGAGGGTTTA
TAGACTTCCAGGCAATATTCTGAGCCGTATTGGAACATTCTTGAACTTTT
GGATCCTTAGAACCTAAGTGTGGCGTTAAAACTCGGAGTTAAAACCGTAC
CTTTTTAGAGCGCTTCCAAATTTCCCTTTTTTCTCAAATATTACGACCAT
GAATGTAGATAGCTACACCGCTGTTTCCATACTGTAGATAATAATTCCAC
TTTATAATATTTCTTATCAAGGTGAAACACGCAGAACAGTACGCAAAGTT
GGTTGCATTATTCCCAGATACACATTCAGTGGATGAAGAAATTCAAGTCT
TTGCAAGAAATGTCAGTAAAATTGCACCTGCCACACTTTTCTTACCGGTT
GTCAATGATTTGGCAATGAACCAGATGTTGCTATGGTGAGTATAATGATA
CACATTTTAGACCAATCAGATTCATGCATTTTCGATCAACCTATAAATTC
CTGGATGATCTTATCGTCTATACAATGTCACTAAAAAGAGGAATAATTTA
GGAGGTGCGATAAATTTGAAAATAGAGTTTAGCTTGGGGCGGAGTGAGCA
GTGGCGGAGGTGTTTTCAGTGTTTGTTCCAAACACTACCGCCACTATTTT
CCCCGCCGTGATGATCGTAAAATCTGCGCTTTTTTTTTCTCCCGCGTTTG
CTATCCCTATAACGGGCGATAGCAGCCTATGAATTCCCAATTATAGAAAA
GTGCTATAGCTATCATTTTCACTGAAGTGAATCCTTGATCATAGAACGTC
ATTACTGTGAAAAAATTTCTAAATAATCATTCAGTCAAAAGATATCAAAC
AAAGTTATAAGCTAATTGTCGTCTAAAAACTCTGTTTTCTGCTGTTTTCT
GTTGTTTTTTGGGGTCAATCACTTACTAACTTTGTATCATAACTTTATAT
TGAATAAATATTTCAGTGAAACTTCTTCACAGTGATGACCTCCTAAGATC
AAAGAATCTCTCCAGTGGAAATGAAAGTTATATCACTTTTCTACAAGATC
TTCATTTTCATCTTTGTTTTTAAAAATTTTTTAAAGACTTTTTTATTTCA
AGTTGTTCCACTCGCAAATATCTTTCCAACGATACCAAATTTATAAAGAT
TTAAGAATTCCTTCAAAAGTTATAAGTAAACGAAAAAAGAGTGCACACTT
ATCGTGAACAGACTTTAGTTATAATTTCCTGGAAATTTGAAAGTGGAATG
AGCAATGAAACAGTGGTAAAACCAACAAAATATTTTTCCACCACTTCTCT
AAACAGGTGATGTGTACAATGTTCAATTCTGATTCTGAAATGAACGCTCG
TGATTTCTTGTTTTGGTTGAACATCACCATTCGACAAGCACCAAGATTCA
TTGAAGATGAAAGTGAGTAAACCTTCTTCTCTTCTAATGGAAACAGTTGG
ATCGGAACACCCAACAGGCAGACAACGTTGTTTCAACGTTTATCTCATGT
TCACAACGTCCACATATAACGTTAGGATGCACGTTGAAACGACGTTGTCT
GCTACCTTAGCAGTTCTTTTGATAGTTAAGAAAGCCGCGGCTGGAATGAT
GACGCTATTGTTTTTGTCGTTAATGGATGTTCTATCTGTGATCTGTGTCT
CCGTGGTTTATAAGATTTAAACTTATCACAATACAAAACGAGGCGCCTCC
TATAGCAAGTTTGTGAGGCGGCCAAAAATTTCCAGTTAAGGAAGGGTTTT
TATTCCTTTAAAAAATCACTTTTGTTGTCCTTGACTTTTTGGGTCAAAAC
TGTCGGTTATTTCAAATCATTTCAGTATTAATATGAAAATTACCATATTT
TTGGCAAACATTATCCGGCGGGTAATGATCAAACCAAATGATTTACTACG
AATGATACTATAATAAAGTTTCCCTGTAGAGGTGTTACATAATTGTTTAC
GCCTTAATTTTCGCGAAAAACCGCTAAAACCAAAAAGTGATAACGTCAGC
AAAACTTTTTTTTAAAATAACTCCAGTTCGGCTAATGGTAGAAACATGAA
ATTTGGACTAAAGTTGCACATCATTAAAAGGATAATTTTGCAAAAAAAAA
ATTAATTTTGCTGACGTAAGCACTTTTTTGCAACATTTCGTATTTTGCTG
ATTTCTGCTGACAATAGCAATCTTTGAAAAAACTCACTTATCATATAGAC
AATCTCCTAGGTCTATTATCGATTATCGACTAAAAATCAAAGTAACTAAT
TCTCATTTTTTCCACTATAGATATTCAGATCCCGGTCCCAGTTGGAGCTC
TCTTGACATGCGCAATGGGAACACCTGGAGGTTTCGCTGGTTTCATTAAA
AACCGAATTAATGAATTATTCAAAGCTATCTTGGACGATTATGGAATGTA
TTTGACAACTTATGCATCAACTAGCGTCTTAACAGAGGATCCAGATTTCG
TTGGTGAGTTCAAATGCAACATAAGTGTTCCCGTTTCATATCAGACACAT
ATTTCATATCAGGACAGTGTCTGCCTATTGTTATATTGTGCTGATATAAG
CAAAAAATGCTTTTCTTTTCCTCTTTCTGACCAATCTTGCTCCACATCCG
TGTCAATTCAATACCAAAAAGCTTGTAATTTAAAATTGAGGAGTAAGCAA
ATGATATCACTTTTATTTAAAAACAAAACCTTTAAAAACCTCAGTAGTAT
ACCATTCTTCTTGGGAATCTTGTAAGTAAGTTTGCAACCGCAGTCCAGGT
CGACCCGAAGGATCTTTTTTCTCTAGCTGTCCACCCGAAGGTAGGGGACG
ACTCCACTCCTTTCCCTGGATCACTCCACTTATCCTTTATTATCAAGCCA
TCGAGGCATCAAGGACTCTTTTGAGCATCTTTAGGATAACCCTGGGCACT
GTAGCTGGATGCTCTGTCTTCATGCTACAGCCATTGGGAATCTACATAAC
ACTGTAGCCCGAACAAGTTTTCAGACCCTTTTAAAGGGAAACTTGAGTCA
CAAATGGGAACCAGTTAACCTCAAAACAAACCAACATATGACAAAATGGG
TATGGTTATAAGGCCGGTCTTCACTTTCGCACGACAGAAGCAAAAACTTT
TAGACGTTTGTGTAAGGTCATTGGTCGGTTGAAAAATGAAGCAATTCCAT
TGGTCAAAATTGACGTAACGGATGAAAAAAGGAGAACTTCCTTCAACTTT
TTTTGATCGCGCGAAACTTTTTTATGTTATGACGTAATCTTTTCTTCAGG
CAAAATAGGTTAAGAAAAAAACTGTCGCCTATTTCGCGCGAAAGTGGAGA
CCGGCCTTTACATATATAGTCAAGAAGTATACGAAACCTTCAACTAGTCA
AAATGGAAACATAGAGAATAAAACCCACAAAACAAAATACAAGACAAATC
ACAACAAATATCTATCTATCCACAAGTAAAGCTATCAGGTTTGTTAAGAA
ATGGAATTAATGTGTTTCCTTGAACTAAAATGTATTTTTCTTTTAGGTGG
TTGGTTTACTCCAGCAGCTTTGAATGAGATGCCAAACTTTGCTGAAATCT
TTGTGTGCAACCCTGATGATCCAAGAGGACATTGGGGTTTTAACTCATTT
GATGAGTTTTTCACTCGAAATCTGGTAGAAGGACCAGCTGGCCGACGTCC
TATTGCATCTCCAGATAACGATTTGGTTGTTGCCAATGCTTGTGAAAATG
CTCCCTACCAAGTTGCATATTCAGTTCAAAGACATGATGCTTTTTGGATC
AAATCACAGCCCTATTCCTTGCAATACATTTTGAAGGGAGCTGAAGAATA
CGTTGAAAGATTTATTGGTGGGACTGTTTATCAAGGATTTTTGAGCCCCC
ACACCTATCATCGTTTCCATGCCCCCGTCTCTGGTGAAGTTAAGGTTGCT
AAGGTAAATAATTGGAATTTTACGAACACCTTTGTTGCGGCTTTTTACGG
CTGGCTCTTATTGCCGTTATTTTCAGGCATGCGTCATAAAGAAGGCGAAC
GATGTAAAAAGGTCGATGTCAAAAGGGTTGTAAGCTTTGAATTTTGAGCC
TAAAATCAACGATATAATTTTTAAAATTTAATAAACGGTAACGGTTATGC
TGCTTGCATTCACTAAAGGATTTGTGCTCCTTATGCTACCGGCGGTTTTG
ATAGTATGCGATTCAGACTGATAAAGGGTTGGAGCCTAAAAGCTGTTGGA
GGAGATTTTTAATTTAAAACTTACGGGAAGCTTGACAAAGTTTTTTTCCG
AATGGAATTTAATCTAAATTTCCTCTTTCTTAAAAAGTTATCTTTTAATA
GGAGTTTCATTTGATCGTGTTTTCCTGGAACTTACTTACCACAACCCTTC
TATGGTGACTTCGGAGCCAATTACTTCGCATCGCAACTCTAGGGCTAATT
TTCGCGAAACATGCCTAAATTCGCGACATTGCGGTCAATTAATTCACGCA
AAGTACGACCCACTAAAGAAAGGAACAAGAACCCTTTGTTAGAAGACAAA
ATCATTGTCGAAACAGCGACAAAAAAATCACTAATTGGGTCCCATATTGC
TTTTCGTAGGTTGTCCCTGGAACTTACTTTTCGCAACCCTACTACACAGA
CAGTCAAGCTAACTACATCGCATCACAACCTTACTTGGCGCATATGGCAA
CACGTGGTGTGATCATTATTGATACTAAGAATCCAAGTATTGGTCACGTG
GCTTTCATCCCTATTGGTATGGTGGATGTGTCGACCGTTGATTTGTCACC
ACTTGATGCCAGTGTTACTAGACAAGTGAAAAAAGGTAGATGTCAATTTA
TTTATTCTCTACACATTTTTTTTGCAAGGTTGCTAAGGGTCCCAGGGGGG
GGTACTTAAGCAAATGGTGGGTACGCTATGTGCCGCCCTTAAGGTCACCT
TTTTGGACTTCCAAAGTCCCGCTAAGGGTCGGAAAATCAGAAAATCAAAT
TTCATTCCAACTAAGGGTCGGAAAAATAGGAAAAATTCAACTTTTTACCC
CCTGAAAGATCGAAATTTGGTCAATTTGTTCCGCTAAAAGGGTCGTAAAA
TTCACAAAGTTTTCCTTTGTTTTCTCCTTTTTAGTACCGGTAAGGGCCCA
AAGTTTGAAAGTCAGGCGGCACCCCCGTCAGCACACAACCCTAGTACCCC
CCCCGCGCTAAGGATCGAAGGCTTAAATATGCCAATTTTTTTTCACTGTC
TCATAAAGTAAAGGCTTTTTAGATAATTTAACCATGGCAAACGATAGTCT
TTGACCCTATGAGCATAAATAGTATATTTAGGGGTGGTCAAAGTATATTT
TTCAAAAAATAAACTAGAATGCTAAGCAACTCAAGGACCCAAATATTGGA
GAGTTGCTTATAAAAAGAAATTTGTAATCTAAAAACGGTCCTTACACCCT
ATGTTCATTGAGTTTCAAGCCTGAAGGGCTAGACGCGAGACTCCTGGATG
GGAAATGAAACCACTTATTTCCCTCCACAACGCCCGCGCGTAGTTTTTAC
ACAAACACCGGATTGAAACTTATTAAATTTATCGCTAGATTTCCCAAAAC
AAAGTTACCGCTAGATACAATCCGTCGTCATGATTACGGCGCGTTCTATG
CGCGTTTTGGATGGGAAATAAGTGGCTTCAATTTCTCTTGCCTGAGAAGG
GTTAAAGTTTTACCTCTAGCCCTTCGGGCTTTAAACTCAATGGTTAAGGT
CTGTTTGGACTGGAGTCCTTCATAATCATTTATTGATATAGTAATACACA
CAGGTGTTACATAATAATACAATAGTAGTTGTTGGTTTATAGAAGTTTCT
ATAAACCACGACTTTTGTTTTCGACTATTTTTTTATTATTATCTACTATG
TCTGAATAAGTCTTTTACTCTGTCTTAATAAGTCATTTACGAAGCCTGAA
TAAGTCATTTACGATGTCTGAATAAGTCATTTACTCTGTCTGAATAAGTA
ATTTACTCTGTCTGAATAAGTCATTTACGAGGCCTGAGTAAGTCACTTAC
TCTGTCTGAATAAGTAATTTACTCTGTCTGAATAAGTCATTTACTCTGTC
TGAATAAGTCATCTAGCATGCGAGACTATTGTTTTTTCCAAGGATCTATG
ATGCTAAAACTACAGGGTGTCCCGATAAAAAATATCAAGTCGTACCACTG
GAGAGTTGTCAAAAGTCCGACACTTTCAAGTCCAACAGCAAAAATGTCTG
ACCATACAATTAATGGTTTATTTAATTATTTCTTTAGGTGATGGAATTGG
TTGTTTCCACTTTGGAGGTTCCTCGCATTTGTTGATTTTCGAGAGAGGAG
TCGAATTGGCTTTCGATTTACAAGGCATTGTACCTGACCCAAATGGTAAT
GACTTTTTGGATGTCAGATCTAAACTTGCCACTGTTATTTCAAAAAGAGT
TCCATTGCGTAAAGATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000035_pilon:1405394..1412662- >XLOC_045769 ID=XLOC_045769|Name=XLOC_045769|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2778bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1405394..1412662- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGGCGAGAGACCGAAGAGACAAAATCTGTTTATCGGAAAATGGAT
TCCACAAGACAGAGTAGCCATTATGAAATGGGCTAAAAGAAGACTTGAGG
AATACAAGATGGCTGGCGAGAGACCGAAGAGACAAAATCTGTTTATCGGA
AAATGGATTCCACAAGACAGAGTAGCCATTATGAAATGGGCTAAAAGAAG
ACTTGAGGAATACAAGGTGAAACACGCAGAACAGTACGCAAAGTTGGTTG
CATTATTCCCAGATACACATTCAGTGGATGAAGAAATTCAAGTCTTTGCA
AGAAATGTCAGTAAAATTGCACCTGCCACACTTTTCTTACCGGTTGTCAA
TGATTTGGCAATGAACCAGATGTTGCTATGGTGAAACACGCAGAACAGTA
CGCAAAGTTGGTTGCATTATTCCCAGATACACATTCAGTGGATGAAGAAA
TTCAAGTCTTTGCAAGAAATGTCAGTAAAATTGCACCTGCCACACTTTTC
TTACCGGTTGTCAATGATTTGGCAATGAACCAGATGTTGCTATGCTTCTC
TAAACAGGTGATGTGTACAATGTTCAATTCTGATTCTGAAATGAACGCTC
GTGATTTCTTGTTTTGGTTGAACATCACCATTCGACAAGCACCAAGATTC
ATTGAAGATGAAACTTCTCTAAACAGGTGATGTGTACAATGTTCAATTCT
GATTCTGAAATGAACGCTCGTGATTTCTTGTTTTGGTTGAACATCACCAT
TCGACAAGCACCAAGATTCATTGAAGATGAAAATATTCAGATCCCGGTCC
CAGTTGGAGCTCTCTTGACATGCGCAATGGGAACACCTGGAGGTTTCGCT
GGTTTCATTAAAAACCGAATTAATGAATTATTCAAAGCTATCTTGGACGA
TTATGGAATGTATTTGACAACTTATGCATCAACTAGCGTCTTAACAGAGG
ATCCAGATTTCGTTGATATTCAGATCCCGGTCCCAGTTGGAGCTCTCTTG
ACATGCGCAATGGGAACACCTGGAGGTTTCGCTGGTTTCATTAAAAACCG
AATTAATGAATTATTCAAAGCTATCTTGGACGATTATGGAATGTATTTGA
CAACTTATGCATCAACTAGCGTCTTAACAGAGGATCCAGATTTCGTTGGT
GGTTGGTTTACTCCAGCAGCTTTGAATGAGATGCCAAACTTTGCTGAAAT
CTTTGTGTGCAACCCTGATGATCCAAGAGGACATTGGGGTTTTAACTCAT
TTGATGAGTTTTTCACTCGAAATCTGGTAGAAGGACCAGCTGGCCGACGT
CCTATTGCATCTCCAGATAACGATTTGGTTGTTGCCAATGCTTGTGAAAA
TGCTCCCTACCAAGTTGCATATTCAGTTCAAAGACATGATGCTTTTTGGA
TCAAATCACAGCCCTATTCCTTGCAATACATTTTGAAGGGAGCTGAAGAA
TACGTTGAAAGATTTATTGGTGGGACTGTTTATCAAGGATTTTTGAGCCC
CCACACCTATCATCGTTTCCATGCCCCCGTCTCTGGTGAAGTTAAGGTTG
CTAAGGTGGTTGGTTTACTCCAGCAGCTTTGAATGAGATGCCAAACTTTG
CTGAAATCTTTGTGTGCAACCCTGATGATCCAAGAGGACATTGGGGTTTT
AACTCATTTGATGAGTTTTTCACTCGAAATCTGGTAGAAGGACCAGCTGG
CCGACGTCCTATTGCATCTCCAGATAACGATTTGGTTGTTGCCAATGCTT
GTGAAAATGCTCCCTACCAAGTTGCATATTCAGTTCAAAGACATGATGCT
TTTTGGATCAAATCACAGCCCTATTCCTTGCAATACATTTTGAAGGGAGC
TGAAGAATACGTTGAAAGATTTATTGGTGGGACTGTTTATCAAGGATTTT
TGAGCCCCCACACCTATCATCGTTTCCATGCCCCCGTCTCTGGTGAAGTT
AAGGTTGCTAAGGTTGTCCCTGGAACTTACTTTTCGCAACCCTACTACAC
AGACAGTCAAGCTAACTACATCGCATCACAACCTTACTTGGCGCATATGG
CAACACGTGGTGTGATCATTATTGATACTAAGAATCCAAGTATTGGTCAC
GTGGCTTTCATCCCTATTGGTATGGTGGATGTGTCGACCGTTGATTTGTC
ACCACTTGATGCCAGTGTTACTAGACAAGTGAAAAAAGGTTGTCCCTGGA
ACTTACTTTTCGCAACCCTACTACACAGACAGTCAAGCTAACTACATCGC
ATCACAACCTTACTTGGCGCATATGGCAACACGTGGTGTGATCATTATTG
ATACTAAGAATCCAAGTATTGGTCACGTGGCTTTCATCCCTATTGGTATG
GTGGATGTGTCGACCGTTGATTTGTCACCACTTGATGCCAGTGTTACTAG
ACAAGTGAAAAAAGGTGATGGAATTGGTTGTTTCCACTTTGGAGGTTCCT
CGCATTTGTTGATTTTCGAGAGAGGAGTCGAATTGGCTTTCGATTTACAA
GGCATTGTACCTGACCCAAATGGTAATGACTTTTTGGATGTCAGATCTAA
ACTTGCCACTGTTATTTCAAAAAGAGTTCCATTGCGTAAAGATTGAGTGA
TGGAATTGGTTGTTTCCACTTTGGAGGTTCCTCGCATTTGTTGATTTTCG
AGAGAGGAGTCGAATTGGCTTTCGATTTACAAGGCATTGTACCTGACCCA
AATGGTAATGACTTTTTGGATGTCAGATCTAAACTTGCCACTGTTATTTC
AAAAAGAGTTCCATTGCGTAAAGATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000035_pilon | genome | sc0000035_pilon:1405394..1412662 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1210-1389:181 |
| Aaloc | 982-1206:1861 |
| Aaloc | 577-981:2922 |
| Aaloc | 394-573:4148 |
| Aaloc | 274-390:5126 |
| Aaloc | 109-270:6149 |
| Aaloc | 1-108:7270 |
|
