XLOC_045759 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045759
Unique NameXLOC_045759
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000035_pilon:1113154..1125864-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045759 ID=XLOC_045759|Name=XLOC_045759|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12711bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1113154..1125864- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAATTTAGGTGTAAATTTTAGTTTCAATCTGTCATTTGTGTAAAAACCAG GTGGAGTGCGCTAGGCCGCGCAACTTTGGTAGGATTTGGTAGGCTTCAAA TCCTTTACCTGCAAGATCGATTACCACTTTTTTCCTTCAAGGTATCGACA TTCGCTCGAACGCGAATCCTATTATTCAACACAATGAAATTTATGGCGGT CAACGTTCAGGAGTTGTTTGTTTGGAAAACGGTAAAGGAATGATTCGAGA GAATGATATTTATAATAATAAAGAAGCTGCCATTTATATTCTGCACCATG GAAACCCTAAAATCAAGTAAGTCCATTTTAATCCATTTTTTCATGAAAAA CTTTCATATCATTGAGCCCTGTTAACATGTTCGCTGCCAAGCCTTTTCAG AAATTTGACCTCTTGGTATTTGATCGAAAGTTTGACTTTCAAAGGCCTCG ATTTTTTTTTCAAATGCCTTCAAATTGTACACCAATCGACGCGAAATAAA AATATGCAATAAAAATGTAAGCAAAAATTTTACAACGATTCTCTATTTTC TTTTTTCGTTTAGAAATAATTTCATCTGTTCTGGAAAAGCATCTGGTATA GCGGTTACAGAAAATGGGCGTGGTCATATCACGCAAAATGTCATCACTGG TATGGAATGGGCGGGAATTGATGTACGCCATGGCGGTAATCCTGTCATTT CTCATAACATCATAAAGAACGGACAGTCGGATGGTATTGTTATCGGGGAT CAAGGGAAAAGTGTCATTTTTGATAATACGATTGAAGGTACATGTTTTTT TCTTGTTTTTTCTTCTCATTTTGTTTTGTTTAATAGTGAAATGCTACAAT ATTAATAATTTGACCCTCCGTTATTCGAACCAAATAAGCTCATTTTCAAG ATTCAAATTATAGAAAATATTTTATACGCCGTCCTTGACGGGAAACGGTA AATTTTCGAATTGTGAAAAGACTAGTCGAGATAACATTCGAGAGTCGGGA TTAACGAGGGTCCATTGAGCTATTATATGCTTTTTTATAAGAACCAGTAG ATTTTGGTGTAGGCTAGGCTGTTCTTAATTTTTTTAAATTTGCAGCCTTA AATTTTCTTACCATGATCTACAATGTTTAAAATCTGTTCAAGTCTGTTAA AATCAGTGCTTTTATTGTAATTTCTGAAATCTGAGGCTCATATTGTTCTT AATCTCTTCTTAGGTTTTGGCCAATTTTCAGCCTCATGTTTTTATTAAAT TGTTCTTATAAAAAGAAAAGCGTGTAATGTCAGTGCAATCATAGAACATG AGGAGTGCTGAACATTAACACGGCCAGGGGGGGGTATCGAGTCAGTGTAC TGGCCCATAGCTGGTGGGGTGGTGTATTTTTTAGGTTAAATTGAGTTAGT ACAGTGTACTAAAAGGGTGGTCCTCTGAGAAAAATACAATGAAAAAGTTA GTACAGTGTACTAAAAGGGTGGTCCTCTGAGAAAAATACAATGAAAAAGT TAGTACAGTGTACTAAAAGGGTGGTCCTCTGAGAAAAATACAATGAAAAA GTTAGTACACTGTACTAAAAAGGGTGGTGTTCTGAATTGATACACACTGA GAAGTTAGTACATTGTACTAATTTCAGTGGTAAAACACAAACCCAGTGAG TTCCCATGTATATTTGCCCTAATTTGCCAGGTCCAAGCTGGTCCGAGACC TTCAAGTCAAGGCTGGTTAAGCTATACAAATTGGTACACTGATTTTCTCC CAATGTTTCCTGTTTACTTGATTGGATTTGATTCAGAGTCGCAGCATGCG CAAGTGGAGACCGGCCTTAAGTCCAATCTTGTTTACGTTTTCTTTAAGGC CCTATCTACATTATGGCAACAACAAGAATTTGAAATGTGTAAACGTTCGA 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TACTGAAAGGGTGGTAATAAAAATCTAGTTGTGGAAAAACATCAGTACAG TGTACTAAAAGGGTGGTATCAAAGCTCCGGCTGTGGAAGAAAGTTAGTAC AGTGTACTAAAAGGGTGGTGTCAAAGCCCCGACCGTGAAAAAAAGTTAGT ACAGTGTACTAAAAGGGTGGTGTCAAAGCCCCGACCGTGAAAAAAAGTTA GTACAGTGTACTAAAAAGGGTGGTGGTCTAATTTTTTGGAAAAAAATCTA AAAATCAAGTTAGTACCCTATGGTCCAGTACACTGACTTGGTACCCCCCC CCTGACACGGCTTTCAAATGAACATTAAACTTCATTAAAATAGAGAACAA AATGGGGACAAATTGCAGATGAGATGGAGTTTTTATATAATAATAATTGG TCATTTGAAGTAATAAAAAGTGACGCGTTCTTTAGAAAAAATAACAAAAT TATTTTATGTACTGGTTAACGACCAACCAATCAAATAAGAGCTTGTAAAA ACTCCATCTCGTCCCACAAATTGATGTTTAGTCTAGCTCCACAACTCCAT ATTGCATCATTCTTTTAGGTAATAGTGGCTGTGGAATATGGATTTTAGAC GGTTCCCACCCTCTTGTACATAGCAACCGTATTATATATTCGGGTAGCAA CGGGATTGCGTTCGTTAGCAAGAGCGATCAAGAGCATGATCGAAAATTTG AATCACATCTCATCCAGAATGATCCATCTTCCAGACAGGTATACACCCAG CTGGCACACAACGTTGTTTCAACGTTTTTCTAACGTTATATGGACGTTGT GAACGTTAGAAAAACGTCGAAACAACGTTGTGTGCCATATCATAAGCGAT TTTAGACCACGTCGGATTTATCAGAGGGAGGGATTTGTAAATGTAATTCC ATTGTTTTTTAACGAACGTTGCACTCTTTCGCGTGTCTCCGACGTACTTG CTCTATTCTCTTAAATCCGCGAGTGCATATGACTATTATTAGCCTATTTC AGAGATTTCGTGTTTTTGATGTTAAAAGAGAATGTGATGTGATGTCTAAA GGACATCATTTAAAATTTGCTTACACAGCAAAAACAAACTTTGAAAAATT ATTTTGTTTTTTTCTGCCTCCTTTCTAAATTATAAGAAGGATTTCAACGG ATTGTAAATGTTACTCGCCATTTATCTTTTGTGTGAAAACAACACGTGGA GCGCTTACTGAGCCCCCCAGATGGACGAGATGAAATTTTTACAAGCTCTT ATTTGATTTGGTTGGTCGTTAACCAGTAATAAATCAATTTTGTTATTTTT TCTAAAGAACGCGTCATTTTATTTACTTCAAATGACCAATTATTAAAGTA TCTTATAAAAACTCCATCTCATCTGCCAAGCAGACCTTCAATTCACGTAA TCACGCAATTTTTTTTCCCAATCCACGCAATTTTTTTCCACGCAAAGCTT TCTAATTCATACAATTCACGCAATGTTTTTTAATTTTCATGCATTCACGT AAGTGAAAAAGCCATTTCACGCATTCACGCAAACCGCTGCTGGTGGGGGC TTACTTATGTAGGAAATAAGTGGCCCAAAATCATATTTAGGAACTTTACT TCAAGCCTTGGTTTATACTACGGTGGTTTAAATCTCGATTCACAAAACAC ACCCCCAACTGCGATATCATATCTCTCATTCCCTATTTTCAGCACGACGC CAATGACGGTCATGGTAATGGCGGGGGCGGGGCTGGTGGGGGTGGAGGCG GTGTTGATGGTTTTATTTTTGAAGAGGATGGTTTTCCGATTGCCCCGATA AATTTCGCTCTCCCGGAAATTGAACCCGAATCGAGATACATTCATGGTAA GTGATTAGAGTTACTTAGTTTTAAATTTTGACTTTTTTATCATTTTTCAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000035_pilon:1113154..1125864-

>XLOC_045759 ID=XLOC_045759|Name=XLOC_045759|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5628bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1113154..1125864- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTACATCCAGGCACTTATCAAGACTCATCTATACTTTATTTGAAATATCC
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GATACCACACGTTGGAAACAGATCTATCTTCTCCAAGAGCGTACCAAACG
GTGGAAGCATCCGAATTGGCCAAACGAATCATCATCATCGCCAGCATTAA
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TGGCTCCGAAATCAAGTGGCTGCGTCTTGTGTGGTGCCGTTTTTATTCCC
ACGCCGGAAATCACCAAGGACTTTCCATGTGGGCCTTGGTAAACAATACC
AAACAATCAAAGCGGCGCTAGATAAAGCGTCACCCTACGCCAAGATCATT
GTACATCCAGGCACTTATCAAGACTCATCTATACTTTATTTGAAATATCC
AATAGCAATCCTTGGCATCGACGATGCAAGTAATATCACATTGATGATGC
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CCATTGTATGTTCGCGCTAGAGGACGAGGCTCTTCAACAGCTATCATAAG
AGCATCGACGATGCAAGTAATATCACATTGATGATGCAAATTGAGATTCG
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CATTTGTGTTTATTCAACTGTATCGTAACACAAGGATGTATAAGTGTGGT
CTCACCTGGCTCCGTAACTGTCCTCAATTGTACATTCACGTCCGCATTTA
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TCTAAACGAAATATTCAACCGGAAATCAAAGCCGCCCCTGCACCGCCCAT
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ACCAAAAGCCAACCTAAGGATAATTCTATATTAGACTCCAATACGCGTGG
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AATTCAACTTTCCATAATTTGGTGTACGGTATACGTTGCTTACAGAGTTC
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TCTTTTTTAGAGACCATTCTACTGGATTAGTGGCTGGAAACCAAATCTTT
TCAAACGGAGAAGCTGGCATTAACTGGTCATTTGTGTTTATTCAACTGTA
TCGTAACACAAGGATGTATAAGTGTGGTCTCACCTGGCTCCGTAACTGTC
CTCAATTGTACATTCACGTCCGCATTTATCAAATTCGTCGGCGTCGGTTA
CAGTAGTATAACCGGGACGGATTTCATTCCAAATCGGATTGCTATTTGTA
TCGAAGAACCCTTATTTCAATACCCAGTGCGGCCAACTCTTACATCGGAG
GATGTGGGCGGTTGGATTTTTGCTGCCAATGATAAAGCGTTTGATGAATA
TTATAAAGGGTGTATCAAGGGCGGATGCTCTAAACGAAATATTCAACCGG
AAATCAAAGCCGCCCCTGCACCGCCCATTTTATCTGATACAGAATACAGT
GACTCAGAAAGTGATATGGTGGGCAGAGTTGGTGGGACTTCAAACAATAC
CGCCAGTACAAAAGCATCATCTAAAGACACCAAAAGCCAACCTAAGGATA
ATTCTATATTAGACTCCAATACGCGTGGAATATTAAAAACTGCTCAGGGG
GTTATCATCAATAACATCCGTGTCTCAAACGGTTGGGGTGGTATAACAGT
GTACCGTATGGGACAAGCATGGATTGAGAATTCAACTTTCCATAATTTGG
TGTACGGTATACGTTGCTTACAGAGTTCGAAATGTATCATATTGAATAAC
AAGATTCATGACTGTGAAACAATGGGAGTCTTTTTTAGAGACCATTCTAC
TGGATTAGTGGCTGGAAACCAAATCTTTTCAAACGGAGAAGCTGGTATCG
ACATTCGCTCGAACGCGAATCCTATTATTCAACACAATGAAATTTATGGC
GGTCAACGTTCAGGAGTTGTTTGTTTGGAAAACGGTAAAGGAATGATTCG
AGAGAATGATATTTATAATAATAAAGAAGCTGCCATTTATATTCTGCACC
ATGGAAACCCTAAAATCAAGTATCGACATTCGCTCGAACGCGAATCCTAT
TATTCAACACAATGAAATTTATGGCGGTCAACGTTCAGGAGTTGTTTGTT
TGGAAAACGGTAAAGGAATGATTCGAGAGAATGATATTTATAATAATAAA
GAAGCTGCCATTTATATTCTGCACCATGGAAACCCTAAAATCAAAAATAA
TTTCATCTGTTCTGGAAAAGCATCTGGTATAGCGGTTACAGAAAATGGGC
GTGGTCATATCACGCAAAATGTCATCACTGGTATGGAATGGGCGGGAATT
GATGTACGCCATGGCGGTAATCCTGTCATTTCTCATAACATCATAAAGAA
CGGACAGTCGGATGGTATTGTTATCGGGGATCAAGGGAAAAGTGTCATTT
TTGATAATACGATTGAAGAAATAATTTCATCTGTTCTGGAAAAGCATCTG
GTATAGCGGTTACAGAAAATGGGCGTGGTCATATCACGCAAAATGTCATC
ACTGGTATGGAATGGGCGGGAATTGATGTACGCCATGGCGGTAATCCTGT
CATTTCTCATAACATCATAAAGAACGGACAGTCGGATGGTATTGTTATCG
GGGATCAAGGGAAAAGTGTCATTTTTGATAATACGATTGAAGGTAATAGT
GGCTGTGGAATATGGATTTTAGACGGTTCCCACCCTCTTGTACATAGCAA
CCGTATTATATATTCGGGTAGCAACGGGATTGCGTTCGTTAGCAAGAGCG
ATCAAGAGCATGATCGAAAATTTGAATCACATCTCATCCAGAATGATCCA
TCTTCCAGACAGGTAATAGTGGCTGTGGAATATGGATTTTAGACGGTTCC
CACCCTCTTGTACATAGCAACCGTATTATATATTCGGGTAGCAACGGGAT
TGCGTTCGTTAGCAAGAGCGATCAAGAGCATGATCGAAAATTTGAATCAC
ATCTCATCCAGAATGATCCATCTTCCAGACAGCACGACGCCAATGACGGT
CATGGTAATGGCGGGGGCGGGGCTGGTGGGGGTGGAGGCGGTGTTGATGG
TTTTATTTTTGAAGAGGATGGTTTTCCGATTGCCCCGATAAATTTCGCTC
TCCCGGAAATTGAACCCGAATCGAGATACATTCATGCACGACGCCAATGA
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GCTCTCCCGGAAATTGAACCCGAATCGAGATACATTCATGTTTCGAAACC
GGATAAAACAGTCGCGCAAATCGAATCAAATCACGTCGAAAACAATCGAG
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CGTATTTCGGGTAACTCAAAACACGGAATCGCCCTTTTACGGTCAAACGA
AATCACCATTGATCGCAACACTATCCGGAATAATTTGTTGTCCGGAATAA
ATGTTGAAGTTGGTGTTTGTTGCTCCATTCATAAAAATGGTATCTATGAC
AACAAGGAACATGGGATCCATAGCGGAGGTTTGGGTCTCATAAAACTTAA
CGATATTTTAAGCCATGCTTCGCCCAGTCTTTTTATAAGGACTTACGGTA
ATTTAACGGTCACTCAAAACCGGCTGCACTCTTGGAAACATGAATGTGTT
TTCGTTGAAGAGAAATGTCGAGTGATTTTGGAGGATAATGAATTTTTTAT
CACGCTTGAACCGCCAGCTAGTGAGCTATGCGTTTTAGAGAAAACTGACA
TTACCTATGTTGAGAATAGGGAACTGGTACACAGGCTAGGTCCGATCCGT
TATCGAGAAGGATTAAAAGTAGAAGACTTGATCGAGTTTCGAAACCGGAT
AAAACAGTCGCGCAAATCGAATCAAATCACGTCGAAAACAATCGAGGTTG
TGGAATACTTTACGACGGCAAAGAAGGTATCGTCATTTCCAAAAACCGTA
TTTCGGGTAACTCAAAACACGGAATCGCCCTTTTACGGTCAAACGAAATC
ACCATTGATCGCAACACTATCCGGAATAATTTGTTGTCCGGAATAAATGT
TGAAGTTGGTGTTTGTTGCTCCATTCATAAAAATGGTATCTATGACAACA
AGGAACATGGGATCCATAGCGGAGGTTTGGGTCTCATAAAACTTAACGAT
ATTTTAAGCCATGCTTCGCCCAGTCTTTTTATAAGGACTTACGGTAATTT
AACGGTCACTCAAAACCGGCTGCACTCTTGGAAACATGAATGTGTTTTCG
TTGAAGAGAAATGTCGAGTGATTTTGGAGGATAATGAATTTTTTATCACG
CTTGAACCGCCAGCTAGTGAGCTATGCGTTTTAGAGAAAACTGACATTAC
CTATGTTGAGAATAGGGAACTGGTACACAGGCTAGGTCCGATCCGTTATC
GAGAAGGATTAAAAGTAGAAGACTTGATCGAGATTTTTGAAAATTTTGTG
TCGAACGACAATTTTGACGTGAAACGAGAAATTTTTGAAAATTTTGTGTC
GAACGACAATTTTGACGTGAAACGAGAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045759XLOC_045759-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
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