XLOC_045746 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045746
Unique NameXLOC_045746
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000035_pilon:1712931..1721692+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045746 ID=XLOC_045746|Name=XLOC_045746|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8762bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1712931..1721692+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGCGGCGCGGTCGGCTTTTTTGgggactggtaatgaatttacaaggaaga TTTATTCTCGGTGCACAGCATTTTTAGGCTACAACTAAATCAAACCAAGA AAATTGCTGTCAGAATTTTAGATGTATTTTCTTGAGTCTCTGAGGTAGAG CGCAAACTATTTTTAGGATTCGAATTACTTAACTATATTGACGTTACTTA ATTACCCTTCAACGCTAGTGTATATAACATCTTTTACAAGAGCGCTCTTA CGCTTGTGTTTTCGATATCATCGTCGCGGAgaattttccttgtattttcg tTACCAGTCTCCTCAAAAGCGCTAAGGGTTGATCTAAGTAGGTGAATTAT ATGCGAGTAAAACTTTAATATGAGACCGTAAGACAGAATGATATAATATA TGTAATATGTTATCggcagttgcgagtacaataggaaaaatattttacga gttccgagatttttccgtaaaaTATAcagaaaatccggaacgagtgaaat atttccatattgtacgaggaAATGTATGCTAACTGgcttatcggtgaccc aaaaaatacactttttgtgttggaaaaaagcgcagggcacttttgtagaa AATTGACGTTAGATTGccgctaccgctacaatgcaacaacatcttttcgt caatttatactTGGTACATGTAAAATACGAGATATATTGTACtgtttttt ttaaccaatcagattgcagatattggATCGCTGATAGTAACAAAAACTGT TTTCTATTACTCCagtggccgggtagctcagtcggtagagaattcgcctt acaatctaaggttTGTGGGTTCGATACCCGGTCACCGCcgggtaagttac tgggagctgatagtaggtgtggcgctccacctcagcattcgatctcccag gtctagtgcaaatagaaaaggggatagactccctcactcccggctccgcc 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000035_pilon:1712931..1721692+

>XLOC_045746 ID=XLOC_045746|Name=XLOC_045746|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1712931..1721692+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATTGTACATTTCCGTATAACGGTACCGGATGTCAGTATCACGTATGCGA
TATAGCGTTTCCTTGTCATAATGGGACCTGCATGAAAACCCATGGTGGCT
TTCAATGTCAATGTAACCCTGGTTTCACCTCCCAAGATTGTTCAACAGAT
ATAAATGAATGTTTAGTAGATGATGTTTGTCAGAATAATGGAGCATGTGT
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AATGTTATTGTCTTGAAGGTTATAATGGCACACAGTGTGAAGAGGTTATC
AATGCTTGTGCAATGAGGAATATACTGGCAACCAATGTCAATACGATTTG
AACGAATGTTTATCATCACCATGCCAACATAATGGTAGATGTGCAGAAGA
TGGGATTGGTTCGTTCAAATGTTATTGTCTTGAAGGTTATAATGGCACAC
AGTGTGAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045746XLOC_045746-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000035_pilongenomesc0000035_pilon:1712931..1721692 +
Properties
Property NameValue
Aaloc790-954:8598
Aaloc577-786:6696
Aaloc388-576:1152
Aaloc1-387:1