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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000035_pilon:1709582..1712840+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045745 ID=XLOC_045745|Name=XLOC_045745|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3259bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1709582..1712840+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atGTACGTAATAGCAGTTTTAATATTGAGTTTGATAATGACTACACAAAT
ACATGGAAACTGTTTAACATCTTGCCAAGATGAAGCTGGATGTGTGGATA
ATTTGGATCCTATCTCAAGAAGTATAGGAATTAACAATGGTTTCATCTGC
TATCAATATAATAcatgtttcaataaatcatCGAGCAATAGTTCAAAAGT
TCCAGTCCAACAACATCCATTAGAAATATTATATGGACAAAATATAACTT
TCAGTATCAGTGATTTTGGATTCAATAATTTCACTTTTAGAGTTTTTCAA
AGTTCACGCTACACAGATTTTGCGACATGCAATTTATCCATACCTTTGCA
GTATAGCATCATAAACAATAGCTTAATAGAGCTACCACCTATGAAGTCAG
GCATTCATTATCTTATGTTTGAAAGTAACCATATATTATACACTTGTCAG
TTTGGTTTTCGTATACAGTTGACGATTTATGAAAATGAATGCCATTTTCA
GAACAATAAAGACCCTTGTTCTTTGAAAGGATTATGTAAATTAAATCGAG
AATATAATAAATATCAGTGTCACTGCTGTGAACCTTATTACGGTAAATCA
TGTCAAGAAATAGATGGTTGTCTACTACAAACATCACCATGTTCTAATAA
TGGAGAATGTAATGATTATGTTGCAGGATTGATACATCCAGGCCTTAATT
GCTCTTGTCATGAACAGTTCCATGGTACCACGTGTGATCAATGTATTTCT
GGTTATACAGGAGCTAATTGTTCTATTGATATAAATGAATGTAATCAAAC
TTCAACCATTTGTAATTATGGGCAATGTAACAATACTGAAGGTAGTTTTC
TTTGTCAATGTCCTGTCAATGTTACGGGGAAATTATGTGACACAGATTTA
TACGATAATTGTCTATCATCACCTTGCCAAGGAACAAATAAGACATGTAT
TGATAAATATGGTGGCTTTGAATGTCAATGTCCTGTGGATTTTACAGGGA
AGTTTTGTGAAACAAAGATTGATAATTGTAAAGATGGGAGCTGCGATGTT
GAAGGTACTTTGAATTGTGTTGATGGCTTTGGTGATTACAAGTGCAATTG
TAAATCAGGATATACAGGTATATATTATATAACCTAATTTTAAGTGTTCC
ATATTCCCCATAGGCTGAAATTTGTCTCAATAAGATCcaaattttcaact
ttccatTTTGTCAGTATTAGGTTTTCCACCACATAACCTTCTCTTCTAGA
CCCCTTGCTTATAGCCACATAAAGATAATTTCTTAAAAGTTCTCAATGTT
GTATTGACAGCTACAGCACCCAAAATCTGCTAATCTTTAATTAAAATCAC
TTGCTACAGTTTTTCCAGCTATCATAAAGAATTACTGTGTGAAAtgtaat
tttattatttgttattttaatttttcaggaaaaaactaACTATCATAAAT
ACAATTTCTAAATAGTGTTTCACTCTGGCGCAAACTTCAGACAATGCAGT
ATATTGTagattttaattcaattttacaTTACATATTATTACTTCTTGCA
TTATATTATTTGAATTTAATCTGCAAAGGGCTTTTCCCGAAAAACTTTTT
ACCCCGCCCattgttgaggatattgatttttcgaagtatcaaaccccttg
gatatcctctcttatcaagatgcttaccccctggatatccgatatccgat
atcctcaataCACAGCATTGTCTAAAAATTGCGCTAGCATGAAGCACCAT
GTAGCAAGTTGATTGTTAAAATCTGATATTTTgttcaaatcttttcaaat
tttctcgaACACTTTgtgattttgtttatttcactATGATTTTCTAGGAC
AACATTGTGAGCAAAACATCAACGATTGTATTGAGGTGAATACCAAAAAT
AGTAGTAAATGTCAAAATGGTGGCATCTGTATTGATTTATTGAACGGCTT
CAATTGTCATTGTTTACCTGGGTACGACGGTGATCAATGTCAGAATATAG
CCAACAAATGTCAAGCCTTAGAACCATGTAGAAATGGGACTTGTGTACGC
ATTGGAACCAATAAACGAGATTATGTTTGCAATTGTTTCGAAGGATACGA
AGGACAGAATTGCACTGAGATTGTCAATAAATGTCGGATATTTCCCTGTC
AAAATAATTCTACGTGTAATTTTACGTTTAACGATTATACATGCGACTGC
TTGCCAGGCTGGGAAGATAAGAATTGTAGCTCTAATATAGATGCATGTGA
ATTGTTGAAACCATGTGAGAATAATGCAACTTGTGTTGATTCTATACATG
ATTTCGATTATGTTTGCCAATGTTTGACTGGTTTCACAGGGCAGAATTGC
TCCGTTAATATTGATGATTGTATTGGCGTGAATTGCATTAATGGGCAATG
TATTGATGGTATCAATTCAAGTTATTGCCAATGCGATGATGGTTGGTTTG
GTGAAAAATGCAATGTTGATAAAGATTATTGTGGATTGTCACCCTGTGTA
AATGAGATTGAATGTATTAATGTACCAAATACACCTGGATTTAAATGTAT
ATGCAAATCTGGATATACTGGTCAAAGCTGTGTTGAAAATATTGATGATT
GTATAAACAACACGTGTCAAAACAATGCAGTATGTCGTGACTTGATAAAT
GACTACAATTGTACATGTGCACCTGGTTATCAAGGACAATTTTGCGAGAT
TGATATAAATGAATGTGATAATGACCCATGTTTAAACAATGCGACATGCC
AAAACTTGGtaaatcaatatttttgtgCATGTAAGCCTGGCTTTGAAGgt
aaaaattgtgaaattaacATTAATGAATGTATTTCAGACCCTTGCCAACA
TAATTCAACTTGCATTGATAAAGTTAATGATTTCGAGTGTAATTGTACTG
AAGCGTATTCTGGAAAAGATTGTGGTATCCATATATGTTCTTTGAATGAT
ACATGCTTGAATGGAGGGCAATGTGAGGATACCGGTACTGGTTTCAAATG
TCATTGCCCACAGGAATTTACCGGAAAATATTGTAATATCTCAGTCAATG
AATGTGAAAACTCTACCATATGTTTACATAATGGGGTATGTGTTGATTTA
TATAAAGGATACCAATGTCGTTGTGTTTTTCCATTTAATGGAACCAACTG
TGAAACTCATGAATGTGATACAGACATTTGTCAAAATAATGGATCTTGCA
TTAAAAGTAATACAAATTTCACTTGTGATTGCGTTTATCCTTGGACAGGC
CGTCATTGC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000035_pilon:1709582..1712840+ >XLOC_045745 ID=XLOC_045745|Name=XLOC_045745|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5058bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1709582..1712840+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atGTACGTAATAGCAGTTTTAATATTGAGTTTGATAATGACTACACAAAT
ACATGGAAACTGTTTAACATCTTGCCAAGATGAAGCTGGATGTGTGGATA
ATTTGGATCCTATCTCAAGAAGTATAGGAATTAACAATGGTTTCATCTGC
TATCAATATAATAcatgtttcaataaatcatCGAGCAATAGTTCAAAAGT
TCCAGTCCAACAACATCCATTAGAAATATTATATGGACAAAATATAACTT
TCAGTATCAGTGATTTTGGATTCAATAATTTCACTTTTAGAGTTTTTCAA
AGTTCACGCTACACAGATTTTGCGACATGCAATTTATCCATACCTTTGCA
GTATAGCATCATAAACAATAGCTTAATAGAGCTACCACCTATGAAGTCAG
GCATTCATTATCTTATGTTTGAAAGTAACCATATATTATACACTTGTCAG
TTTGGTTTTCGTATACAGTTGACGATTTATGAAAATGAATGCCATTTTCA
GAACAATAAAGACCCTTGTTCTTTGAAAGGATTATGTAAATTAAATCGAG
AATATAATAAATATCAGTGTCACTGCTGTGAACCTTATTACGGTAAATCA
TGTCAAGAAATAGATGGTTGTCTACTACAAACATCACCATGTTCTAATAA
TGGAGAATGTAATGATTATGTTGCAGGATTGATACATCCAGGCCTTAATT
GCTCTTGTCATGAACAGTTCCATGGTACCACGTGTGATCAATGTATTTCT
GGTTATACAGGAGCTAATTGTTCTATTGATATAAATGAATGTAATCAAAC
TTCAACCATTTGTAATTATGGGCAATGTAACAATACTGAAGGTAGTTTTC
TTTGTCAATGTCCTGTCAATGTTACGGGGAAATTATGTGACACAGATTTA
TACGATAATTGTCTATCATCACCTTGCCAAGGAACAAATAAGACATGTAT
TGATAAATATGGTGGCTTTGAATGTCAATGTCCTGTGGATTTTACAGGGA
AGTTTTGTGAAACAAAGATTGATAATTGTAAAGATGGGAGCTGCGATGTT
GAAGGTACTTTGAATTGTGTTGATGGCTTTGGTGATTACAAGTGCAATTG
TAAATCAGGATATACAGatGTACGTAATAGCAGTTTTAATATTGAGTTTG
ATAATGACTACACAAATACATGGAAACTGTTTAACATCTTGCCAAGATGA
AGCTGGATGTGTGGATAATTTGGATCCTATCTCAAGAAGTATAGGAATTA
ACAATGGTTTCATCTGCTATCAATATAATAcatgtttcaataaatcatCG
AGCAATAGTTCAAAAGTTCCAGTCCAACAACATCCATTAGAAATATTATA
TGGACAAAATATAACTTTCAGTATCAGTGATTTTGGATTCAATAATTTCA
CTTTTAGAGTTTTTCAAAGTTCACGCTACACAGATTTTGCGACATGCAAT
TTATCCATACCTTTGCAGTATAGCATCATAAACAATAGCTTAATAGAGCT
ACCACCTATGAAGTCAGGCATTCATTATCTTATGTTTGAAAGTAACCATA
TATTATACACTTGTCAGTTTGGTTTTCGTATACAGTTGACGATTTATGAA
AATGAATGCCATTTTCAGAACAATAAAGACCCTTGTTCTTTGAAAGGATT
ATGTAAATTAAATCGAGAATATAATAAATATCAGTGTCACTGCTGTGAAC
CTTATTACGGTAAATCATGTCAAGAAATAGATGGTTGTCTACTACAAACA
TCACCATGTTCTAATAATGGAGAATGTAATGATTATGTTGCAGGATTGAT
ACATCCAGGCCTTAATTGCTCTTGTCATGAACAGTTCCATGGTACCACGT
GTGATCAATGTATTTCTGGTTATACAGGAGCTAATTGTTCTATTGATATA
AATGAATGTAATCAAACTTCAACCATTTGTAATTATGGGCAATGTAACAA
TACTGAAGGTAGTTTTCTTTGTCAATGTCCTGTCAATGTTACGGGGAAAT
TATGTGACACAGATTTATACGATAATTGTCTATCATCACCTTGCCAAGGA
ACAAATAAGACATGTATTGATAAATATGGTGGCTTTGAATGTCAATGTCC
TGTGGATTTTACAGGGAAGTTTTGTGAAACAAAGATTGATAATTGTAAAG
ATGGGAGCTGCGATGTTGAAGGTACTTTGAATTGTGTTGATGGCTTTGGT
GATTACAAGTGCAATTGTAAATCAGGATATACAGGACAACATTGTGAGCA
AAACATCAACGATTGTATTGAGGTGAATACCAAAAATAGTAGTAAATGTC
AAAATGGTGGCATCTGTATTGATTTATTGAACGGCTTCAATTGTCATTGT
TTACCTGGGTACGACGGTGATCAATGTCAGAATATAGCCAACAAATGTCA
AGCCTTAGAACCATGTAGAAATGGGACTTGTGTACGCATTGGAACCAATA
AACGAGATTATGTTTGCAATTGTTTCGAAGGATACGAAGGACAGAATTGC
ACTGAGATTGTCAATAAATGTCGGATATTTCCCTGTCAAAATAATTCTAC
GTGTAATTTTACGTTTAACGATTATACATGCGACTGCTTGCCAGGCTGGG
AAGATAAGAATTGTAGCTCTAATATAGATGCATGTGAATTGTTGAAACCA
TGTGAGAATAATGCAACTTGTGTTGATTCTATACATGATTTCGATTATGT
TTGCCAATGTTTGACTGGTTTCACAGGGCAGAATTGCTCCGTTAATATTG
ATGATTGTATTGGCGTGAATTGCATTAATGGGCAATGTATTGATGGTATC
AATTCAAGTTATTGCCAATGCGATGATGGTTGGTTTGGTGAAAAATGCAA
TGTTGATAAAGATTATTGTGGATTGTCACCCTGTGTAAATGAGATTGAAT
GTATTAATGTACCAAATACACCTGGATTTAAATGTATATGCAAATCTGGA
TATACTGGTCAAAGCTGTGTTGAAAATATTGATGATTGTATAAACAACAC
GTGTCAAAACAATGCAGTATGTCGTGACTTGATAAATGACTACAATTGTA
CATGTGCACCTGGTTATCAAGGACAATTTTGCGAGATTGATATAAATGAA
TGTGATAATGACCCATGTTTAAACAATGCGACATGCCAAAACTTGGtaaa
tcaatatttttgtgCATGTAAGCCTGGCTTTGAAGgtaaaaattgtgaaa
ttaacATTAATGAATGTATTTCAGACCCTTGCCAACATAATTCAACTTGC
ATTGATAAAGTTAATGATTTCGAGTGTAATTGTACTGAAGCGTATTCTGG
AAAAGATTGTGGTATCCATATATGTTCTTTGAATGATACATGCTTGAATG
GAGGGCAATGTGAGGATACCGGTACTGGTTTCAAATGTCATTGCCCACAG
GAATTTACCGGAAAATATTGTAATATCTCAGTCAATGAATGTGAAAACTC
TACCATATGTTTACATAATGGGGTATGTGTTGATTTATATAAAGGATACC
AATGTCGTTGTGTTTTTCCATTTAATGGAACCAACTGTGAAACTCATGAA
TGTGATACAGACATTTGTCAAAATAATGGATCTTGCATTAAAAGTAATAC
AAATTTCACTTGTGATTGCGTTTATCCTTGGACAGGCCGTCATTGCGACA
ACATTGTGAGCAAAACATCAACGATTGTATTGAGGTGAATACCAAAAATA
GTAGTAAATGTCAAAATGGTGGCATCTGTATTGATTTATTGAACGGCTTC
AATTGTCATTGTTTACCTGGGTACGACGGTGATCAATGTCAGAATATAGC
CAACAAATGTCAAGCCTTAGAACCATGTAGAAATGGGACTTGTGTACGCA
TTGGAACCAATAAACGAGATTATGTTTGCAATTGTTTCGAAGGATACGAA
GGACAGAATTGCACTGAGATTGTCAATAAATGTCGGATATTTCCCTGTCA
AAATAATTCTACGTGTAATTTTACGTTTAACGATTATACATGCGACTGCT
TGCCAGGCTGGGAAGATAAGAATTGTAGCTCTAATATAGATGCATGTGAA
TTGTTGAAACCATGTGAGAATAATGCAACTTGTGTTGATTCTATACATGA
TTTCGATTATGTTTGCCAATGTTTGACTGGTTTCACAGGGCAGAATTGCT
CCGTTAATATTGATGATTGTATTGGCGTGAATTGCATTAATGGGCAATGT
ATTGATGGTATCAATTCAAGTTATTGCCAATGCGATGATGGTTGGTTTGG
TGAAAAATGCAATGTTGATAAAGATTATTGTGGATTGTCACCCTGTGTAA
ATGAGATTGAATGTATTAATGTACCAAATACACCTGGATTTAAATGTATA
TGCAAATCTGGATATACTGGTCAAAGCTGTGTTGAAAATATTGATGATTG
TATAAACAACACGTGTCAAAACAATGCAGTATGTCGTGACTTGATAAATG
ACTACAATTGTACATGTGCACCTGGTTATCAAGGACAATTTTGCGAGATT
GATATAAATGAATGTGATAATGACCCATGTTTAAACAATGCGACATGCCA
AAACTTGGtaaatcaatatttttgtgCATGTAAGCCTGGCTTTGAAGgta
aaaattgtgaaattaacATTAATGAATGTATTTCAGACCCTTGCCAACAT
AATTCAACTTGCATTGATAAAGTTAATGATTTCGAGTGTAATTGTACTGA
AGCGTATTCTGGAAAAGATTGTGGTATCCATATATGTTCTTTGAATGATA
CATGCTTGAATGGAGGGCAATGTGAGGATACCGGTACTGGTTTCAAATGT
CATTGCCCACAGGAATTTACCGGAAAATATTGTAATATCTCAGTCAATGA
ATGTGAAAACTCTACCATATGTTTACATAATGGGGTATGTGTTGATTTAT
ATAAAGGATACCAATGTCGTTGTGTTTTTCCATTTAATGGAACCAACTGT
GAAACTCATGAATGTGATACAGACATTTGTCAAAATAATGGATCTTGCAT
TAAAAGTAATACAAATTTCACTTGTGATTGCGTTTATCCTTGGACAGGCC
GTCATTGC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000035_pilon | genome | sc0000035_pilon:1709582..1712840 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1120-2529:1850 |
| Aaloc | 1-1116:1 |
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