|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000035_pilon:1443774..1462040+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045739 ID=XLOC_045739|Name=XLOC_045739|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18267bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1443774..1462040+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGCATTTTTCGATACCAGAGACGGTTCAAGCATCAGAGGAGAATGGATC
AAAGTTTTGGGTAAAAATtctttacatattttttctttcgtGTTTAGAAT
AGACTTTTTGCTAGTTAGAATGTCATTTTGAATAGCAGCATTAAAACTAT
GACATGCTAATGCATGATTGTTTTAGGTGTGTATTaatttttcttatcat
tgtCTGTGAATTACCGTAAGGCggtcattgaaaaattgttctattcgcgt
cacccgcccgcatcaaattagggaggtcgggccttacgcgtgcggcagta
acaaaacatagattttggaagaaaaatattcaagcttacatacctcaagg
aaggaaacctcttttaacaaaagtattttttccaaagtgtagagaattta
ttcagctttcttttgcagaaaaaatcagcacatcatgtcttcattttcct
tcaaaatttgaaaatgagtactcacgggtgagttttttcaaacttcttgt
tcgcggcacggcaaaattttttatccgggggttctaaaatccaaagcgct
agccacccgAAACAGCTATCGACCTGGAATTTTTCGCATCGTTCCCCGCG
atagtttagcttttgagacgtaccacgttcgttggttggagcaacgtata
tttttcaggaagtcaaattatgtacttaaaatgcgtttttttgcgttttt
ttttcattgaaaaaatcaaatttttttatcgaacgtgaattttttagaaa
gaacaatgttttttctttccaaatgtgaaaaaagtaagaatcaagctgtt
tccggtggcaagcgctaagggaaagattatggtgtaattacccccgtttc
agctacatctacggaaaataaaactcgcaccaaacctcccgcgcggaatt
tttcataaaacactttcgcttttggtgccgtgatgaaggtacaaaatggc
tggcgatgcgtgcacgaaaatgcttgaaaaattgaacttcaaaatggaat
atctttggaactttaaagaattggaaggtaaatgacccctcatttttctt
ctgatggttatggctttccattaaacttggtttggtattctgcaagtaag
tttgaaatttcctctgaccaccctaatcaaattttccgctgattttccag
TGCGGAGATCtaggaaaatcaattttttcttttaaagtatagcttttttc
tcaattgctctgacgaccatcgaaaattgttttgctcgcgttaccacccg
cccctgagttactggcgtgattaaaaaaaaactgggaatgtttttgatcg
cccgtccgcccgcattgcatttttcattgaaaaattgttctattcgcgtc
acacTGCTGTTCCCCTCAGGCAAAATCGTCGATTCTGTAGATGTCACAAA
ATTGCCGAGTAGAGTACCCTGCCCACCCAGTTGgcgaccaaaatttttta
attcaaatttctcacttactttttacttttttgaaaatccttttcgacTA
ACAATTAGACATTGTAGccctaaagctctaaaccagcatctaataacatg
aaaaccagaacatgattcttcaatgggaatcaaaactataaagtgcactt
acaaacatcaatttgtcagatctaacaaaattaataaccgcactgtcatc
attgacaataaaacaaacaattttctgtcaagagccttgtaaacattcca
acaacttccatcgaaatgatctatcacagctcagtctaccatttttaaca
cggtctgaggattgagccgagtacgctccgcgaactcctgcacgggtaaa
aaacttcaatctgtcaatcattttctcaagcgaagagtacgcgaagcgat
tctagctttacgatagtgccgcggatcatcaatggatagtattcaaatat
tattatccctttattttcattcctagaacttttgcaaaaaaaaggaaaaa
tagaaaagttgtattttttattgctctattcatatactgaatttgaaaga
tcttctatgtggcgtttttttgcaaacttcaaaaaactgatttttgtccc
gccttagcgggactttggcttaagtgcttgagtgcagcatagggtacaaa
gtccaaacatgcgtttcccgtaatttttgtgtgaagagttaggtctacac
tgttagacaacttttaacatgctcttcgtatttgttttgattttttattt
gaggcgatcttcttagaataaaaaactttcaaagcgagcagtactagtgc
ccagttcccgaccgacgtaccagtctgcgaccgatcgctaaaaagaaaaa
atcagtgctctacttgcaggttAGGTCATATgaattgatcaggatgataa
aaaaactcataagctttcccgtatttaatttctttgcactcattcttttg
ttttaaaatagctcacttacatttccctttggcatgtttttttagaattt
ttcttcaagtcgccatttttttctaaagtttgtttttgttttgttttgaa
agtgacgggctatggagagtcttcatttgataaaaacgcgggaatttttt
atgtctaCCCAGAGATTCGATATACCggtttcctttgttatttcaatCCG
GAGCTAGAAACTTCGCATTGGAGTTGTCAAGTTAAAGACCGCGGGCATGC
CCCTTGAATGTTGTGATTGCAatgtaaagtcttctttttttctcagcatc
tggaatgttttgatcgcaatgtagggttctttttcttactttcgattttg
ttggtcgcagactggacgtctaatttcgaaactgattgcatcaacttttt
tatcaatatttcagacgAAGGAAACCCtatcgagctgatttttacagaaa
tgctttctaacatactcatagttttggacaagtatttttggAGTGGcagt
tgaagcgttttttcttacgaagcttttttgtccacagttagccatttttt
atttttttcgaaaaatccggctttttcgtgtgcttccgtgcaaagttgga
tctttcgaATTCTACTCGTtgttttctagaattttttttacacagttagg
gaaataggtcaaggcagattactaccaaaagaaattctccagaggtttgt
ttttgtatgacttttctgggatcaaagacgttcggtcgccaactagaccg
gtcgccaactgggcaggggactctacagacatcgaaaaaaaaaattcaaa
atggctgccgagtgagcactgacaaaaacaaaaaatcaggagttttcaat
tgcctactacagcagaataagaccagacgatctcaatcgaacggaatcga
cgatcgaaccagtcaaaccaaatcgaacgcaatcgaccgattgaaattcg
attgtcgaacgcaatcgaatctcaatcgaacgtcaaaattctgggtaata
ttcgattggttcgattgttgttcgactggttcgatcgtcgattccgttcg
attgagattgtctggctttattcttgcagcttcccaacatccaagctctc
aaacatcacaagccgaatgaaattacttttgatttcccgtagaaattatg
cgatgaacaatccgggggccaatgaatcaacgatcgaacgcaatcgaaca
tcaatggAACATCAATTGaatgaacgcaatcgaataccaatcgaatctga
aaattgcggtaatattcgattgagattcgattgcattcaacaatcgaatt
tcaatcggtcaattgcgtttgatttggttcgactggttcgatcgttgaat
ccgttcgattgagatcgtctggataagacagagaaatgcagtaaaattaa
aagtaaacaaaccttgaaccttttatttttcaaaataaagaaaatattct
agctgcagtaatgtttatattcagaaataaatccattttccaccagaccT
ACAACAACCACCAGCAAGGTTTCAAACCACGCTGCGGCATtactggcaat
gaattctgacttCAAAACTGTTGGTCCAGTTCCCTGGAAAGGGTATGATT
ACACTTCCAAATGACTTTTCTTTACAATAAGATTTGTCTTGtcacaaatc
caaaaagataGGCTATAAAACCAACACAGGGGTCAACtttttttACAACA
AACCATCAaatcaaactttataaagatcaaccatgtaaatgtcacctgat
tttgtaatatttggatgatattaaaacctttttgcatatatttggttctt
caaaaccatttccctttccCGCAGCAGGCTTTAAAAGTTCATACTGACCT
CCAGtttttttttGCGCTGTAATCTAGAAAGGCCTTTAGTGcggtataaa
caaatgatttcattggtttaaaaaagtcaaaacatcacGTGATCAGAATC
ATGATCGGAGTGAACGGAAGCCATGGTCATACGTCATATGATATTTTCGC
GCGTTTTAATTCAGCAAAGTTTAGTAAACTCGACCACGtattaatgtttt
gatttttcaagcggggatttctgtagaatgataaaatatggcttggctgg
aatggacaccataacagcagtggtcacccgcccgcatcaaattttccgct
gattttccggtgcggagatgcggaaaaaaaatctgggaaaagcaatttgt
tcttttaaagtatagcttttttctcaattgctctgacgaccatcgcaAAA
TTGTTTTCCTCCCCTTACCACTTGCCCTGAGTTACTGgtgtgattaaaaa
aaacccgggaatgtttttgaccgcccgtccgcccgcatttttttgatgac
cgcctaaaaagggtgttgaaattagaggagggatgtcgacattagaccaa
gttacagtaCATTGTAGGTAGCTTCGTCAGTGCATCACAAAGTGGGATAT
AGacaaaactcaacatccttacaaaagttgtctttttgatttcccaaaca
tttttttcaagcgttcacttccacaataatttatgtaatagCTGTTTTGG
TCAGTCGAATTCAACATATACACGGTTTTTAGTCACCTTGTGactgaagt
gcctactaaaaaacaatccgggggtaagtgttgaagcaacacagcaggtt
attctttaaaagaaatatcttttggtaTTGACAATTAAATATAATATATC
acattatatttccttaattcaaaaatacaaaaattcactttgcacttaat
attacatactaaaacgcccccgtcttttagtCTCGTCTAATTTCTGATCT
CAGAACGTGCAAAATGCCCGTCCGACCAATGTACGACCAATTATCTTAAA
TTCACCTTGATTgccctttgactttcaaaaaatagtatttaaaaaatatg
aatttataataagtacaaaatacaaaatgtttgatacttcattagtgaaa
tattcaataattcctagtttcaattttcagtgggcatTTTTCTAGCGCTT
cctttatcgcgcaatttttgcgtcacacaaattTTCCCAGCCGTtcataa
taattatgcattgtcaaatttggttctccattgttcTTACTGTCAAGTCA
GAATCGACATAGTGACGCCAcctaagaataaaaaagaaaggaatttgtca
gttttatgcatatattaatttgcgcaATATTCTATTCGCTGTGCGTGAGC
AcattttcgtagactagtcggaatacctCTTTTTGCTCCCAGGGTcaatg
gtaacttttcatcttcattatttttaaaatgaagcacaacctaaaaaaaa
attaaaacttccgaaagttgcgtatttccagtgagtaaacagTTCTGATA
ATTGACAAAATTAATGATGATTATAAGCCAAATGTCTCGtaattgggggt
tctagtcttgaggcTTAAACTCGAAAAAAGCTGGTCTTTTGAAGCGTTTC
GGTGTGGTCGCAATATTGCACTTTGTGACGCACTGTTCTTGTAATGACGA
CCCTGCTGATGCACCAAACAGTCTGGTGTTTTTGCTGTAAAAGTATCCCT
CAGTCACACTGGAAACCTTTTTTCTGGTGTTAGTCCgatgttaatttttc
aaacttctggACACTTGACACGTGTGTCAAGAATAATAATGCGCACGGAC
CGGACTCAAGTTGAGATTGTCTGGTGTTAAAAAGTATACTCATCTGATAT
ACACCAGATTTTGCATGTCCAGTGTTCGTAAAGTCCAGGGTGTGGACAGG
GTCATGTGTCATGTTGACacgtaccgtaacttggtctaatgtcgacaccc
ctcctctaattctgacaccctctttattagctgaaatttatagaaaggct
GAAACTGTGTTTCTTTGCTAaatggtcagagaggaataatcctttttcaa
tcagtgattcaaacttTTATATtcttcctttctctaaagaaggatgtcag
aattagacaagggatgtcgatattagaccaacttacggtatagtATAGAT
TAAGAAAAAGCTCAGGATCAAtaaacaatatttgaaaatttgcttataaa
aagttataacggttaattataattttaatgACATACATCACAATTgccct
tttttcaaaatcaattttctcaaGTTACTTTGAGAAAACATATATATCTA
CTTTAAAGGTCTTCTAtatcaaattttgagaatttttgaatGGTGgtatt
accttattggaactaattttcgcgggaattagttttagcgtttttcgtca
aaaatttGACCCCGCGAACGATTTTGAGAGTTAAAAGCCGCATAAATTAA
TTCctgcgaaatacaattttttccaattttatcaaaaaatttgaaaaatc
cctaagaaaatgaaagaaatttgtccaaaaaagggcaaaaccgcgaaaat
aaaaacgcgcaaaaaactccagaatgaaaaaaaaaacgcaaaaatttaaa
cctgcgaaatgcaattttttggatattttttttcgactgcgaaaattagt
tccaataaggtgattttcattttgaagagattgaattttaaattcttttt
cctctCGGACCAGGTAAAAAAGTGACATTGTGGGCATTAAAGAAACCTTT
GTAACCTTCTTATATAGAGAAATTTTCAGCTATGGTTGTTATGTACTTAT
TCAAGTTGATTTAGACAGATTAAGTTGAGACAGTAATAAGCTATTCAGCT
TTATGTCGCCATCTTGAATAAGCAAGACTAGAGAACAAAGTACTatttat
ttatagaagtgtatttctcaggtctattgacctctatgaaacaatcttac
atctttacaatttatagatcttctCGTTCCATTcgtttttcaattctgtt
ataGAGTTTTACAGTTAGGCACCTGGGCCTCTAACCCACTCTTCTTATAA
TCATTTTGTTTCcgtcgtaaatttctttaaatagagtttagtcctaggac
tacctctcactttccatatatgactcttgtcttttttttttcgatgtttt
ttcttttgctttataatgccattgttttattatctcgCGTTCTTTCCTTA
AAAAACCAACGGTATATCAGGAAATATTAATGTAACTCACGAAAAAATCT
ATCAGTGATCAAGAAACAAATCAGAAAGTCAAAATAGTCCATTGTGGCTT
GTAGAAATTATTATcttctaattccaacacccagttttagagatacgaaT
AATAGTAAGGTCAGAtttcactgatagacaaaagatttttcctctctggT
TGCtaagcaaaaaaagaaagtttccaTCAGCAATTCCGACTTTCCTtact
attcctatctctaaagaatggtgtctggattagaagagggatgtcgacat
tagaccaagttacagtaCTTTGTTGGATGGCATTAATATTTTCAATACAA
TATTTTCAATGATTCCCTACTACTGTTCATCAAGAATATAaccttatata
ctttgttcaaTGGATTTCATTAATATTTCCTAACATGTTTATTGAGCAAC
TTATTTGAAAGAGTTACTTGTGTGTACTtatccttgggtgaatatctggg
ggtgttattttcattttttcaaaatttcgatttttagggcctggtcacga
gttttagcctcaaaacgcAGGCAAAAAACTTTTGGgtaggctggagactt
caaaaatggtcagatttggctgaaattcttcacacttgttccttgggtga
atatccgggggtagtttttcattttttgaaagttatgATTTTCAGGGGCA
TGGTCATGAGTTTTATGCcaaaaacgaggctaaagctttggggCAGGCTG
AAGACTTCataaatggtccgatttggctgaaattttgcacactttgtTCC
TTGGCtgaatttctgtttttttttcttcattttttcgaaattttcattta
aagggCGTGGTCAGACATAAGGTTTAGACCCAaatgaggctaaaactttt
gttttaccAAATAtttattcttatatttttttaatttttttttttatgtt
tataattgGGCCTACGAGTAATTTAAAAGATAGTTAAATTGAGCCAGTGC
AactagcacgttcgacagtaaTTTCTaataccataaatttacataaagag
atacaattttgaaattatagtAAAATTGTTTTAATACTTCCTTTTTCCAC
CCTTGGATGTACTGCAACAAATGacttttaaaagtaaattttttaatttt
ttgttttcagaacTTTCACATTCATGTCAATGGGGTGTTTCATTGCAAGT
TGCGCTATTCTCAATTAGACAAATTCTATGAACAGGTAATATAATATAGA
AAGCAATATTATTTACTCCTCACCTATTGTCAAAAGAAGTTGCTTTCTTG
TGAGTGATGGACAACATTTCTGCTTTCCTTTTCAGTCTCCCTTATTAAGA
GTATCACCCCTCTTTAAGTGCCTTTCAAAATTAAAGCTGGTACCCTTAAA
ATAGACTTCGAAGGTTCACAGGACCCTTCTTATAGAAACTCAGCTGTAAT
TTGTATATTCCgtttttaatggcgttttttaTATTCTCTTGATTAACCAA
ATATTATAAatgaatacatgttttttcttttataagcataacgtttataa
gtatggacaggctcagttttttttagaacaatagaatgctaagcataatg
caagCCTGGaatagggacagacacttgcttataaataaaaaaacatgtaa
tttttctttctcagcTCAAGAATGATTTCCCTGGAAGGATTCAATCGAGG
TTATTTCCAGGGAAGAAATTGTTTTCCCTTTCACCTGATCAATTGGAGGA
ACGAAGAGACATGTTAGAGAAATTCATTCAACACATCAGCCAGGATCCTG
TGATTGGTGTCAGTGATCAATTCAATGATTTCTTTGTTAAAGCTCAACAG
GTAATGTTTTAAATGCAGATTTATTGACTGTATAATAAAAAGTCTGTCAT
CTCTTTGAAAACAAATGCTGTTGCAAACAGTATTGCGGTTTTTAAAGTAA
ATGATCAAGCAAAACAGCGTGCGCTACGTGACTGCGCTAATTATTATCGT
TTTTCTAACAATGTTGTGATGTATTCTTTTTAAGAATTACACATTACTGA
CCATTAGAACTCTTTTGAGTAAAAATAGAAACGATGAtttttttCccata
gaaaaaaaaatgaaattagtaGCAGAAGTCTGCTGCTGGCCGTTTTAATT
ATCGAGAGATAAAGAACTAACGTACAACAATTGCTACACCGTGTTTCATG
TTGGCGCAATCTACAGACAATGCAatgttttgtaaactttatttcCACCA
CATTTTACACTAAAATACAATTGATTTCCCTGAAGGTTGTTGCATCAAGT
TTTATTAAGAGCATTTGTGACGTAAATTTCGCAATTTtgcgacctcgcga
aagttttacGTCTAAAGTAATAATGAAATTGTATATTTTACAGGCTGGTC
TAGACATACCGTCTGAGAACGTATCACTTGATGTCTTTTTAATGAATGGA
AATAAAGTGACGCTAGAGATTAGTACCACGGACCAGACAGACGACGTCCT
TGAAGCAGCCATGACCAAGATTGGACTACAAGAGAAGTTCTATTACTATT
TTGCATTGTTCTTTGTGAGAAAGGAGGATAATGGTGGTGGTATTAGAAGT
AAGTTTTGAACACTATTGATACTTCAGGTCCTCACCGGTAACTCACCCAG
GCACGACGCACTGGGTACGGCATCCGCCGTACCAGATCAGATTTACacaa
aaaatcccaaaattttcctcttcgtcggtaaaatcccttaaatttcctca
ttctcCGTACCAGATTTAAAAGGTTTCCGTCGTATCATTCACCTGACAAT
AATTGTCGTACTTATCTAATATACAGATGGcagattggcggccgcccacg
gcAACTTCCCATCGGGAGGAATGATTGTCGGCCTTTGATAAACCACATCC
CCAGCCGGACTCAACAACTCTTGTGGGGGTATGCAAGGGGCTTGAGTTCA
GGCCTCCCACTGCAATATCCTTGACAAGGTCTGGCGAAATTctgtaatct
aaaccttccagatgttggaCATATTCCCggccttcagagctttagcgtat
cggaagaaaattttctaCATCGAGAGCCAGATATGGTGTGTACAGAACGG
ACCTCCGAAAACTGAGAGACTATTTCTGAATAACTTGCtacccatagatt
tataaagcccgaagggccagatggcgtacttttgctgacaagtgtgccgt
ggttagataggaaatcctacctaggtcacgtgacattacaagtagaattt
cagcgcttgaccatcaagcgatattcacttttttgcctgtgatggcttaa
agcacgacatctagcccttcgggctttataaatctatgtttcTACCCtta
aaaagacttttttcaaagcaaaaaacaaaggctttactaaaaaTAATATC
TTGTTTTTACAGTTGTTCGAAAATTACAAGACTTCGAATCTCCATACTTA
TCTTTGAAAGCTGTAACCAAACCGCATCGCATTATCATCAGGAAAAAGTA
AGTACATTGTTCAAACACCTATAAACCATGAGTTTTTTAAAGCCCCGAAG
AGACGAGAATTTAACCTGTTGGGACCCTTGGATAGGAAATAAATAGAGTC
TCTTATTTCCTATCTGAAACGTTTTACCCAGGTGGTTTTCGAACAAACGC
TAGATTGAAAGGAAAAATCCTTGGCCTaactttgcaaaaaaatatgcCGC
GTGAAAACAAAGTAAGCGTCAGATTAAACCGGCCATTAAAAAGTGTCCCA
AATTATAGGGCTTCACTTTTTCCTTCCTTGggaatttttgaagatttcta
tCTAGTACCTCAGGCTTAAAAGTGAGAAAACCTTAGGAAACCGTCATTTC
CCTaacataaaaataatatttttcattttctagttATTGGAGCCCTTCTT
ATGATGATGATTTATTGGAAGATAGGATAGCAATGAACCTTCTATATGTT
CAGgttacatatttttaaaaactagGCCAATTTGTCGTATTGATTCCATT
TTCCGTCTGGGattaaaaattttgctttgaccactAATACACtcattttG
tgttataagcatacggtaaatttcggctgaagctcactatgcttaagtaa
agctcaattttgagcctcgactatacttaaccctatgcttggtaaaaaaa
ttatgaaggggTGGTAAAAATTCTCGCGCATTTTCCCCTATCTTTaatct
tgagagaaatgaagacattctattgttttcgaatgtttaccatatgattt
cttctgttattttcagaagtttttgaaattatgattCTGAAAGTTTCTTT
GGCTGtgcctcaaggtatgcttagcatatgcttaatttttcttgaaattt
gagcttcagtatgcttataaaacaaaatgagtgcaTGCAATTATTTTCTC
TATGCATCaattatcttgattttacttTAGTGCGAAAGTTTTTGCGGAGA
ACCAGGGATGTGAGCATTTTGCTCATGTAGATCTAGTTTGCTATGATTTT
AATGATGGAGTGTTTGACTTTGTAGATCACAGATGACTTAGACCGTGGAT
GGATGTTATGTTCAGATGaacagaaaaaaagaatgaagaaattacaaaat
caagGATCAAGAAAAGATGTAAGAACTTGATTGCAATGAAGATCTATAAC
GCTAGTATAGAAAAGCCTTAGATTCGAAGAGTCTTAAATTTGAAAAGCTG
ACTAATGCGATTCTTCAACGAATCATTAGAGATTTTTGccgaaattttgg
aaaataatgattttttgggaaattgtCGTAAAATGTTCAAAGAGATGTCA
AAATTGTCGGCATTCGGATTAAACAATATCCTTCCTACTATAGACCCACT
TGCTTCAATTTGAAATAATCATAATGTattttttaaagtctattcGTTTT
AAAGGAacataaaaatagtaaaatgtaaacattgtgcgaaccacgtttca
ttaaagagaacaattaaaatcatgtgtcctaaacaaacttgtaaaacaat
ttaaaaacaatcaaaatcagccatatttgttttgattttttattgtgaca
tttgcatacggtttgtttacaaatttcgtcagtacttttatgtcccttta
agtgtACGCTGTATTTCGCTACCATATGATAACAATTCTCAAGGAAATTA
CTCAAATTACGCTGATATGGTTTCTACatggtaccgtcaactgctctaac
ttgggacgattggtcgaaacatgggactggttgatatctggccagTATTT
TTACTTACTGAACAGGACagtaaatttgttttgataactcccccaagttt
atcaatcttactgtcataacatgtcacgataccTTTCATTGATAGTGCGC
CCTTTTTAgctgttttgttttcattgaaaatgaccggacgccgattggag
aattagagaaaaCCCACCgtctaaccgcctatcgcctgGTGGGATTAACA
ATTAACGAGTGTGGAACTTGCAGCGCGAGTGACGTCTCCatcattttgcc
actaatttgttcttcttcgtcCCAGACATTTACGTGTTCCACTACgaatt
ttttacatattttgatttaaaagcctactcggtgcgaaagagaaatcgtg
tatttatTAATACACCGTTCATTGACTCAAATCAggtgactttggaggtt
cggtgaaatggtggccgaaatgccgtcccatgttttgtcagatagtccca
agttagagcagttgacggtaacaaAGAAGAATGTACACTTAAAGCGAATA
TGTACTTTAATGTTATTTTCGATTCAAACATTCCAGGTACTTAGGTTGGC
ACGTGACtttaaattttatggatttctACATTACTCGCCGTGCACGTCTG
ATTATCCCGATCCCGATTCAAGTGCATTGATCGCTTCCGGTGATCGGGAA
CTCAACATACGTGTCTCCAAGGAGAATGTAAGTCAATAAATTCATATTCC
CTTTTAATCTAAGTTACATGACATATTTAGcggccgtagcatgaaggtag
agcaccCAGTTAGGgagcgcaaggttgtgggttcgacccccccccccagc
tgggtcataccaaagattcccaaaatggtacctGACGCCTCtatgcttga
tgctcagcaactaaagagacggatcaagggtaagtggggAAACCAGGGAA
AGAAGTTGCATCTTCCCCTACTTTTGagtagacagctagagaaatgGAAT
TATCACATCTTGAAAGTTCGCATCAGTGTTGATGTTAGGAAAAGGGGCTT
ACCACGATTTTAGTAATATTAGTTGTAGATCCTGTTTTTGATATTAAGAT
TTTTTCGGATTACACCCTCTTCATTAATCAAACCATTGAAAGTTAAAATA
ACTACACCCCCTTATGGGTCAGAATTGATAACATACACAGCCTGCTACTT
TGGCTTAGCACTCAATATCGAATGGTTAAAGtgattatatattatatata
gaaTTTCTTGGAAAGGAGTAGACACGGGAGCCATTCTGGTCCCTTTTGAC
TGCCATTACATAGATTTCATTGGCTCCAAACAGAAAGCTACTTAAAAGAA
AGCCTTTCGGGTCTCCTTGGACTGCCATGACAAACCTCTAAGTACATATC
TCCTTAGAACGCGAATTCATATTAAAAGTGATCGAAAAGGGAACCTTTCT
GcccccccTTGGACAGCCGTGCGAAGCCTTAAACTAAtttcttgttcatt
tttttttcaggatacAAAAGTAATGGAGGGTCGGTTTAAAGTTCAACGAA
TTCGAAGCTGGAGGCTTACTTCATTGGTAAGGACAATAAATAGCCGAGTC
TTTTTAATGTGACGCCATtgattgggctgttccatttaaaatccctacag
gggggtggacgaaccttttcaaacGAAAGAATTCGttaaaatgtgtggat
accccccttgaaaatgtcaaaatttgcaaCAGCaaaaaaacccttggaaa
aaaaaaatattcttcataccttaaagtgagggtggacaaactaaaatcag
tctgtTAAACTCTGGAAGTTTTGGAATAATTTGTTACCCCAtgaaaggta
aaaaaaagtttccttaGATCCTCTGGAAATACTTTCCCAGGAGAAGTTGG
TCCAGGGGGTGTAttgatataaaatgaaatggccAATTGGGCCATAAATG
TCTTGCCTTTGATCTAATTTTTAAAACCTTGAATATAGCCAAAAGGTACT
CTTTTcaagcaagtgaaaaaaatagattttacatTCTGAATTAAAAGGCA
TGAATTTGTATAAGTTGGATTATGTTACCCACTTTAGCTAGGTTTTATAT
ACTTCTTGAAAGGCctcaaataaaagaattgacCTCTTCAATCAAAGGCT
TGAAAAGTCTTGTGCCACATTTTTGAGAGGTGGTTTCCACccaaaatttt
tacttgaaaaagatgaaaagaagACATCGCctttgacgtcaaaagaaaGT
TAAGTAACGCATTGACATTAGACAGTCAACTTTCTGCCCGATTTAATTCC
GAATttgaataggcagggcgaaaagagGACCGTCTCGACCAGGGCTTATT
TCATTTTAGCCCCTTTAGTGGTTTGAGATTCCACATTTTAAGTCCTAAcc
gttttcaattttctttattaCGAAGCCTGGGGACGATGATGCGAGCAAAG
AGAAACTACAATTTGCTTTCGAATATTTGTTCGGTAAAGACGAACTTCGT
TGGGTAACTATCGAATCAGATCAAGCGATCATGATGTCCATGGCCTTACA
AGGAATCGTTGATGAGATATTGAGAGAGAAACGTGGTCAAGGTATTAGGC
TGGTAAGTTCTTGTTTACACGTTACGGATATCTGTTGTTTTGAAGCGGAA
AGGAGTTACGGTAcgacatagatttataaagcccgaagggctagatatcg
tgctttaagctcttccaaacAAACAAAGTTTATATCGCAGAAAATATTGC
TGTTATTGTTTTCGagaacccgcgaagcttctaaTTGGTCAAGCGccgaa
attctattgtaatgttaCGTGACCCAGGTAGAATTCCCTACCTAACTACG
gtacacttttcagccaaagtacGACATccagcccttcaggctttataaat
ctatggttacGAAGACGCTCTCTAactcgacgttctactattggATGCGC
TCCATTATTAggtaatattgaaagtcaccgtcaataaGGGAGTGTCAACT
GTATTCTTTTTGGTTTGAAACAGTTGCACTTCCAAAAGTGACCAATAAAA
TGCAATTTCGTATTAAGCGGTGATTTTCCTCTGCAACGTgtaaaatgtta
ttttattctggaataaaactttctacttaAATTTTGTGGGGattattttt
ttgctattttcgctaattttggccaaaacccccctagaaaaattaaagaa
attaggTGAAATTGAGCCTTATCGCTAATTTGGACTAAATCGAAAATTAA
TCAACTTATATaggtatgtttttttatagtgacctaagattttttcttaa
cttgactttttgtttgtttagccacgaaagaaagaaaagaaagatcCGAA
CGATACATCGTCGTCTTCAATATCTGGACAATCCTCAAATAGCACGGTAA
GTCCATATACAGTAGAGTCGCCATAACTCTAATGTCTCCTTAATTGGAAC
AAGTTTCTTGGTCCCTCCAACAAACAAACATCTTTATAACTTGTCATTTC
CAAAACTCTCGACCAAATTTCAATTCCCCGCgcgtgttcgaattatggag
actccactctattcatgatatgcaccactgcaacgacttcacGAAATCAt
gcaaattttctgtttttgttccaaccaatacttcactttttttattgttt
aagtgaagtatttgggtggaaaattttaaaagttctcagaaaactctcca
gtggtgcattaTCATGAATAGTCTTATCTTACAGTTGCCACAGTTAAAAG
TAacagaaaaattaaatcttgGCAACTGGATGGGCAGAAAACTTTACTAC
TGAGAAACCATTTAGGTTCATCGCGGAAAATAATGCAATTTATTTTAATT
GAGATTCATGTGGACCTCGCAGTGCAATAGACCTTttaataaattacgtc
acgaacatcatagcctcgtattcaaacaattaccatggggATGGTCTATC
CTTCAGGTACTctgttttgaatatttatttatagTTGACTCTTGCGAATT
CGAATTCAAACGGGGTATCTTATTTGTTCGATTTAaagagagattcaaat
tatagaaagtattttaagaggtcaagagggtttctccttgactgGGACTG
AGACTGGGACAAATTgtagaaacattcgaataatagaagttcgaataagc
gggAGTCTACTGTGATTCGTTTCAATTAAGGAAATTCAAACCATATTTTT
AAATGATCCTACATTCTGAGATCCGTGCTTTCTTGATTTCACATCACTCT
TGAAATTCAATCAATATGTGACctaacaatttaattttttaatcgaTTTC
AACTGTTTCTTGATCGATATAATGTGTTGAAACCTATTTCGGCATAATCG
AATTCGACCGTATTAAATACAATCCATTTCAAGAACAGCCCGTCTATTTT
GTAAGTTTTTCATACTAAACTCGATTAACCAATTTCTTTCTCTAGACTAA
CCGCTCTTTCTTAATACGATCATCAAGTCAGGTATGTGTTTACAAGAAAC
TGAACTATTAATTATGTCAATAACTCATTTAGTTGGCTTGTCCATCGGCA
CTTAGTGATTAAAATTTTACTCGAAACCTCAAAATAGCAAAGTTTTGCCC
TTATTAGTAGatcaaaaaaaatgtagtgtttccggaaaccggctgggtga
aaaaaataatttttctgacccggccgcagactatgggttcatctatatga
ttcatcataaagaaaatcaagttgaccgttcaagctatcaaacttcgttt
ggttagatattgccgcttttaaatcaagttttgttcgttaaaAATAGCAA
acttttttccggccggccgcatcagagctttccggaaacactaatttttt
tttattttcgccttacaAAGGAAGTTTTCTTGGAGATgagtttctttttt
aattgtttacctaatttaaattttcacggTGCTCTGTATCACTCTGTTTA
TCCTTGTTTATTCACAAATTacgtgcttaattgtagggggagggtcactt
tgcaatttttggaaaaaaatcacccccataTCGCTTTATAAAGTCCACTC
CCCCATTTTATGACCTCTATGCTacgaagtgccaaaattggccaaaaacc
ttcattttcctagggaaatcaggtcaatagcacttaattatgaccccccc
ccccccccatttcgTTGATTTTTATCTGGAGTACCCACCCCCACTAAAAT
TAAGCATACTAGAGTAgagggggcgtacgggggtcgcagacaccgaaata
ccgacgcatatttcttagattaccgtcaacaccgacagcaaaatttggta
aaatccttattttgtcaccgcgaggcatgtttgacaccgaaataccgtca
tttttttcttcaaacaccgaaacaccgacagaaaaaagggttaataccgt
cacaccgtcaaacccgtaagccccccccccagagTAGTGGTTTCCGCAAC
TGCGTGAGATGAGGAGAGAGGGCCGTACTGTTCGTTATTAATATTCGTAA
tactatttttctatttttgattttcaggataaaaaatcaaaaaggagTGA
TAAAAACAAAGGGATCGGTGTCAATGAAGACTTTGCTGCTGGAAATATTG
GTGACGATGATCTATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000035_pilon:1443774..1462040+ >XLOC_045739 ID=XLOC_045739|Name=XLOC_045739|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2718bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1443774..1462040+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGCATTTTTCGATACCAGAGACGGTTCAAGCATCAGAGGAGAATGGATC AAAGTTTTGGATGCATTTTTCGATACCAGAGACGGTTCAAGCATCAGAGG AGAATGGATCAAAGTTTTGGaacTTTCACATTCATGTCAATGGGGTGTTT CATTGCAAGTTGCGCTATTCTCAATTAGACAAATTCTATGAACAGaacTT TCACATTCATGTCAATGGGGTGTTTCATTGCAAGTTGCGCTATTCTCAAT TAGACAAATTCTATGAACAGcTCAAGAATGATTTCCCTGGAAGGATTCAA TCGAGGTTATTTCCAGGGAAGAAATTGTTTTCCCTTTCACCTGATCAATT GGAGGAACGAAGAGACATGTTAGAGAAATTCATTCAACACATCAGCCAGG ATCCTGTGATTGGTGTCAGTGATCAATTCAATGATTTCTTTGTTAAAGCT CAACAGcTCAAGAATGATTTCCCTGGAAGGATTCAATCGAGGTTATTTCC AGGGAAGAAATTGTTTTCCCTTTCACCTGATCAATTGGAGGAACGAAGAG ACATGTTAGAGAAATTCATTCAACACATCAGCCAGGATCCTGTGATTGGT GTCAGTGATCAATTCAATGATTTCTTTGTTAAAGCTCAACAGGCTGGTCT AGACATACCGTCTGAGAACGTATCACTTGATGTCTTTTTAATGAATGGAA ATAAAGTGACGCTAGAGATTAGTACCACGGACCAGACAGACGACGTCCTT GAAGCAGCCATGACCAAGATTGGACTACAAGAGAAGTTCTATTACTATTT TGCATTGTTCTTTGTGAGAAAGGAGGATAATGGTGGTGGTATTAGAAGCT GGTCTAGACATACCGTCTGAGAACGTATCACTTGATGTCTTTTTAATGAA TGGAAATAAAGTGACGCTAGAGATTAGTACCACGGACCAGACAGACGACG TCCTTGAAGCAGCCATGACCAAGATTGGACTACAAGAGAAGTTCTATTAC TATTTTGCATTGTTCTTTGTGAGAAAGGAGGATAATGGTGGTGGTATTAG AATTGTTCGAAAATTACAAGACTTCGAATCTCCATACTTATCTTTGAAAG CTGTAACCAAACCGCATCGCATTATCATCAGGAAAAATTGTTCGAAAATT ACAAGACTTCGAATCTCCATACTTATCTTTGAAAGCTGTAACCAAACCGC ATCGCATTATCATCAGGAAAAAttATTGGAGCCCTTCTTATGATGATGAT TTATTGGAAGATAGGATAGCAATGAACCTTCTATATGTTCAGttATTGGA GCCCTTCTTATGATGATGATTTATTGGAAGATAGGATAGCAATGAACCTT CTATATGTTCAGATCACAGATGACTTAGACCGTGGATGGATGTTATGTTC AGATGaacagaaaaaaagaatgaagaaattacaaaatcaagGATCAAGAA AAGATATCACAGATGACTTAGACCGTGGATGGATGTTATGTTCAGATGaa cagaaaaaaagaatgaagaaattacaaaatcaagGATCAAGAAAAGATGT ACTTAGGTTGGCACGTGACtttaaattttatggatttctACATTACTCGC CGTGCACGTCTGATTATCCCGATCCCGATTCAAGTGCATTGATCGCTTCC GGTGATCGGGAACTCAACATACGTGTCTCCAAGGAGAATGTACTTAGGTT GGCACGTGACtttaaattttatggatttctACATTACTCGCCGTGCACGT CTGATTATCCCGATCCCGATTCAAGTGCATTGATCGCTTCCGGTGATCGG GAACTCAACATACGTGTCTCCAAGGAGAATgatacAAAAGTAATGGAGGG TCGGTTTAAAGTTCAACGAATTCGAAGCTGGAGGCTTACTTCATTGgata cAAAAGTAATGGAGGGTCGGTTTAAAGTTCAACGAATTCGAAGCTGGAGG CTTACTTCATTGCCTGGGGACGATGATGCGAGCAAAGAGAAACTACAATT TGCTTTCGAATATTTGTTCGGTAAAGACGAACTTCGTTGGGTAACTATCG AATCAGATCAAGCGATCATGATGTCCATGGCCTTACAAGGAATCGTTGAT GAGATATTGAGAGAGAAACGTGGTCAAGGTATTAGGCTGCCTGGGGACGA TGATGCGAGCAAAGAGAAACTACAATTTGCTTTCGAATATTTGTTCGGTA AAGACGAACTTCGTTGGGTAACTATCGAATCAGATCAAGCGATCATGATG TCCATGGCCTTACAAGGAATCGTTGATGAGATATTGAGAGAGAAACGTGG TCAAGGTATTAGGCTGccacgaaagaaagaaaagaaagatcCGAACGATA CATCGTCGTCTTCAATATCTGGACAATCCTCAAATAGCACGccacgaaag aaagaaaagaaagatcCGAACGATACATCGTCGTCTTCAATATCTGGACA ATCCTCAAATAGCACGACTAACCGCTCTTTCTTAATACGATCATCAAGTC AGACTAACCGCTCTTTCTTAATACGATCATCAAGTCAGgataaaaaatca aaaaggagTGATAAAAACAAAGGGATCGGTGTCAATGAAGACTTTGCTGC TGGAAATATTGGTGACGATGATCTATAGgataaaaaatcaaaaaggagTG ATAAAAACAAAGGGATCGGTGTCAATGAAGACTTTGCTGCTGGAAATATT GGTGACGATGATCTATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000035_pilon | genome | sc0000035_pilon:1443774..1462040 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1270-1359:18178 |
| Aaloc | 1234-1269:17096 |
| Aaloc | 1159-1233:15972 |
| Aaloc | 982-1158:15076 |
| Aaloc | 916-981:14161 |
| Aaloc | 775-915:13237 |
| Aaloc | 682-774:11976 |
| Aaloc | 613-681:11335 |
| Aaloc | 529-609:10865 |
| Aaloc | 322-525:9844 |
| Aaloc | 136-321:9115 |
| Aaloc | 61-135:8611 |
| Aaloc | 1-60:1 |
|