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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000035_pilon:1419379..1426731+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045738 ID=XLOC_045738|Name=XLOC_045738|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7353bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1419379..1426731+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGGCTGGCGAGAGACCAAAGAGACAAAATCTGTTTATCGGGAAATGGAT
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aaaaaagactaatgttttgttggcagctcatcgtcgctgctactgaggct
agatattgacagcttttggttggcaaagtttttgtttgtttttatcaagt
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TCACATTCGGGGttccattttttagctttttcgcacatctctttgatttt
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GTTTTACGGGATGActctttcataaaatctttcgtctgttgtatctcttc
ttttatcattttccttgttttggctTCTAGGTCGCTCATCTTTTGTGTTA
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tttttgagttttttgatttcgtcgtcttttttAGCAATCTGCTCATGTAA
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gtgtactcttaggttccaaataaacgggCTGGAAAATTTTCCAAATTTTA
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AACCcaaaaataaggtaaatataggctaaaatcaggctatttagagcaga
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GATGTTGCTATGGTGAGTATATTATACACATTATACACAACTATACACAT
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TTTTTGAAACTGTAAAATCGACCCTTAATTagattgaccattttcaggcc
aaatatggtcagattttcgacattttacacCCTGAGAGtacaatttttct
catttttgctcatCTCGACCCTCGCAGTACACTTTGGGAACATtgaaaaa
tatacccttaagggctgcacgtacggtaggtcgtttaccttgagtgcccc
ccccccccccccccgggataatCCCCTTTAGATTTTACCTCTTAAAAACT
TCTCACCGGGTCAATGAAACTCACTGAATGTCAGTCAGGAGAAATGTATG
GTGAAATCACTGATCTTTGTTTAGACCCTGGAAGCagtcaatcccggcca
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GtaaaatggcttctttgcgggtaccactttaaaaaaactccGACAAAATA
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GGATGCTGAAATGAACGCTCGTGATTTCTTGTTTTGGTTGAACATCACCA
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TCTTATAATGGGAACAGTTCTTTATTCTAATTATAGATAACCCGGGGGCG
GGTACTTAGGAAAAAATGGGTGCTAGGTAAGGGTTGGTTTTTTCACCTCT
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TCTCCTTCTACGCCGTGCAAGCATGAATGTtgagaaatttaatttattcc
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tggggggggggggtcattttgcaattttcggaaaaaatcacGCGTTGGCT
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ATGctatactacctgcggttttttCGAGGTCTTCGATTCAGCCTTTGGTT
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GTAGTAATAGTTGGAATTTTTATTGTATTGTATGAAGCCTGGAGAGAATT
CCCAATCAGCTGAGATTTGGCATAACTGTTTCattagaaaaacattttct
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GCCTTCGTGGGTAAATGGAGTAGGTTGACTTTTATAAAATTGCATGACCC
ATGAAGAGCAGTAGATTcagcaccccccccccaatcTAATACCTAGAGCT
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AAAGGTAAAGTAATCTACTAAAACAACCTGATGACCTCTTGTCGAAAGTA
CAACTGGTCGATGCCTTTATTGCATGTCAGACAATGATGATTTGATCTTT
TCTTCCCTCAAGCAGGCTGTTGATGTATTGAACTAAagtctacacatttt
ttttttataagaacgtcaaaaattttcgaagccttcggatgttcttagtt
ttttggatttgaagcataaaaatgttcttaaaatgttcttattttcagca
ttttttgagcattttgatgtaatttcttaagaaattgcatgtttttaagt
ctccaaagccttagtatgttcttagaatgttcttaaatttttgggcctcg
aagccttatgttcttatatagtttgtccttataaaaaaaaacgtgtattc
gctTTAAGTGCGTATTCTTTCTTCCTAAGATATGGAACCACCCTCAACGG
AATTAGTTTAATACATTGATCTCAGTGCAAATGTGAAACATGAAACCAGT
GCACACCTGAAGCAAATAAACATATTTCCATCCGACAAGAATCCCGATAA
GGACAAAATGCATAAACCTACTCCCAATCCCATGAAAGAGGatgaatttc
ttcacattttttacacgtatcttcattttcctttttaggTGGTTGGTTTA
CTCCAGCAGCTTTGAATGAGATGCCAAACTTTGATGAAACCTTTGTGTGC
AACCCTGATGCTGCTCATTACGGCTACCGATCATTCGACGAGTTCTTTAC
ACGATACCTGATCGAAGGACCGGATGGACGACGTCCTATTGCATCCCCGG
ATGATGATATGATCATTGCAAATGCGTGTGAAAATGCTCCCTACCAAGTT
GCATATTCAGTTCAAAGACATGATGCTTTTTGGATCAAATCACAACCCTA
TTCATTGCAATACATTTTGAAGGGAGCTGAAGAATACATTGAAAGATTTG
TTGGTGGTACTGTTTATCAAGGATTTTTGAGCCCCCACACATATCATCGT
TTCCATGCCCCCGTCTCTGGTGAACTTAAAGTTGCTAAggtaacgttttt
ttttatgtcCACCTTTCGCTGTTAAGATTGGCCTTCCTTTATTCCTTCAT
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AAAtttttttACGAGAACTTAATTTCTTCAGTCTCCTAGGGGGTTGGTTC
GGTTAAAatcgaattttgaatttttcacgAGAACtaaaattttcgcgaaa
attgcaGTAAATTAATTCACGGCAAGTTTTGTCCACTAAAAGAACAGGCA
GCGTTTGTTTGGATACAAGAAAATTGGTGAGACGGTTCACTAATTTGGTA
ATATTGCtttttttGTAGGTTGTCCCTGGAACTTACTTTTCGCAACCCTA
CTACACAGACAGTCAAGCTAACTACATCGCATCACAACCTTACTTGGCGC
ACATGGCAACACGTGGTGTGATCATTATTGATACTAAGAATCCAAGCATT
GGTCACGTGGCTTTCATCCCTATTGGTATGGTGGATGTGTCGACCGTTGA
TTTGTCACCAATTACACAAAGAAATACCAAACAAGTTGTCAAAGGTAAAc
agataattttttcttttatgaacCCACAATGATCTAAATctattacttta
atcgtagaaattttagcgagactaattttagcgttttagcgagttttccc
tattttcgctaaaataaatctcgctaaaacacaccgaaacgacagatcgc
taaaatttatccatgcgaaatttctggttatattgctttgatacattttt
atcaataggatgggtttcagtgcaaagaaatgctagaaaacgaatttggt
caataatgtaatacgaatattcgctaaaatttatccacgcgaaatttttt
gaaatcgtgattcgctaaattaaatccaaaaaaaatcaagatttttctgG
CTCGCTAATatgcgctaaaattagtctAAAATTTATACGATTAAAGTATT
CATGGTATACACAATCGCAATATCTTCTGAAATTTCATCATAGAACTtgc
agctgattggttgcaagtgacgtaaaatcagtcaatacaatAAATCACTT
ACAAGCAATCAGCTGTTAGGTTAGACTAAAGTGTACTTCTGACTCAACTT
tggtttttgataattttagagGAGTCCAGTGCAACTACTGGTAAAAACCA
GGTTGTTTCCGTTGaagacattacgtcatgaatatcatgaaatgATAGCT
GTATTTAGACGGAGAGGCATAGTGGCTGTCGCCCCTGCCTTTCGCCTGGG
AGGTGCGAAGTCGATTCTAACACTGTTATAGTATAAGTGGTTCACTTGGC
AATTGGCCTCCACTCGCGGGCTAAACCATACCATGCGATGGGAATTGGAT
ACCataacaaaagtcaaaaaggcCCAAATTCTTGAAGATGTTATTTCCTT
ACAGAATTAACCTTGAAATTAAGTTCCAGCGAAACAGCTTTCACCACCCA
TTTTAGGCCCCTCCCTACCCTTCAAAATAgaaagtttatttaggaaagtt
ttactaccaaaagaattttaagtttagaagtttttgaattttaattccct
ttaaattctaattaccttaatttttttttgtttctttaggaGAAGGTATT
GGTTGTTTCCACTTTGGAGGTTCCTCGCATTTGTTGATTTTCGAGAGAGG
AGTCGAATTGGCTTTCGATTTACAAGGCATTGTACCTGACCCAAATGGTA
ATGACTTTTTGGATGTCAGATCCAAACTTGCCACCGTTGTTCCAAAAGAA
TAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000035_pilon:1419379..1426731+ >XLOC_045738 ID=XLOC_045738|Name=XLOC_045738|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2730bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000035_pilon:1419379..1426731+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGGCTGGCGAGAGACCAAAGAGACAAAATCTGTTTATCGGGAAATGGAT
TCCACAAGACAGAGTAGCTATTATGAAATGGGCTAAAAGAAGGCTTGAGG
AGTATAAGaTGGCTGGCGAGAGACCAAAGAGACAAAATCTGTTTATCGGG
AAATGGATTCCACAAGACAGAGTAGCTATTATGAAATGGGCTAAAAGAAG
GCTTGAGGAGTATAAGGTGACACATGCCGAACAGTACGCAAAGTTGGTTG
CATTATTCCCAGAAACACATTCGGTGGATGAAGAAATTCAAATCTTTGCA
AGAAATGTCAGTAAAATTGCACCTGCCACACTTCTCTTACCGGTTGTCAA
TGATTTGGCTGAAGCGATGGGCAAGGAACCAGATGTTGCTATGGTGACAC
ATGCCGAACAGTACGCAAAGTTGGTTGCATTATTCCCAGAAACACATTCG
GTGGATGAAGAAATTCAAATCTTTGCAAGAAATGTCAGTAAAATTGCACC
TGCCACACTTCTCTTACCGGTTGTCAATGATTTGGCTGAAGCGATGGGCA
AGGAACCAGATGTTGCTATGGTGATGTGTACAATGTTCAATTCGGATGCT
GAAATGAACGCTCGTGATTTCTTGTTTTGGTTGAACATCACCATTCGACA
AGCACCAAGATTCATTGAAGATGAAAGTGATGTGTACAATGTTCAATTCG
GATGCTGAAATGAACGCTCGTGATTTCTTGTTTTGGTTGAACATCACCAT
TCGACAAGCACCAAGATTCATTGAAGATGAAAATATTCAGATCCCTGTCC
CAGTTGGAGCTCTTTTGACATGCGCAATGGGAACACCTGGAGGTTTCGCT
GGTTTCATTAAAAACCGAATCAACGAATTATTCAAAGCTATTTTGGACGA
TTATGGAGTATATTTGACAAGTTATGCATCCACTGACGTCTTAACTACAG
ATCCAGATGTCGTCGATATTCAGATCCCTGTCCCAGTTGGAGCTCTTTTG
ACATGCGCAATGGGAACACCTGGAGGTTTCGCTGGTTTCATTAAAAACCG
AATCAACGAATTATTCAAAGCTATTTTGGACGATTATGGAGTATATTTGA
CAAGTTATGCATCCACTGACGTCTTAACTACAGATCCAGATGTCGTCGgT
GGTTGGTTTACTCCAGCAGCTTTGAATGAGATGCCAAACTTTGATGAAAC
CTTTGTGTGCAACCCTGATGCTGCTCATTACGGCTACCGATCATTCGACG
AGTTCTTTACACGATACCTGATCGAAGGACCGGATGGACGACGTCCTATT
GCATCCCCGGATGATGATATGATCATTGCAAATGCGTGTGAAAATGCTCC
CTACCAAGTTGCATATTCAGTTCAAAGACATGATGCTTTTTGGATCAAAT
CACAACCCTATTCATTGCAATACATTTTGAAGGGAGCTGAAGAATACATT
GAAAGATTTGTTGGTGGTACTGTTTATCAAGGATTTTTGAGCCCCCACAC
ATATCATCGTTTCCATGCCCCCGTCTCTGGTGAACTTAAAGTTGCTAAgg
TGGTTGGTTTACTCCAGCAGCTTTGAATGAGATGCCAAACTTTGATGAAA
CCTTTGTGTGCAACCCTGATGCTGCTCATTACGGCTACCGATCATTCGAC
GAGTTCTTTACACGATACCTGATCGAAGGACCGGATGGACGACGTCCTAT
TGCATCCCCGGATGATGATATGATCATTGCAAATGCGTGTGAAAATGCTC
CCTACCAAGTTGCATATTCAGTTCAAAGACATGATGCTTTTTGGATCAAA
TCACAACCCTATTCATTGCAATACATTTTGAAGGGAGCTGAAGAATACAT
TGAAAGATTTGTTGGTGGTACTGTTTATCAAGGATTTTTGAGCCCCCACA
CATATCATCGTTTCCATGCCCCCGTCTCTGGTGAACTTAAAGTTGCTAAg
GTTGTCCCTGGAACTTACTTTTCGCAACCCTACTACACAGACAGTCAAGC
TAACTACATCGCATCACAACCTTACTTGGCGCACATGGCAACACGTGGTG
TGATCATTATTGATACTAAGAATCCAAGCATTGGTCACGTGGCTTTCATC
CCTATTGGTATGGTGGATGTGTCGACCGTTGATTTGTCACCAATTACACA
AAGAAATACCAAACAAGTTGTCAAAGGTTGTCCCTGGAACTTACTTTTCG
CAACCCTACTACACAGACAGTCAAGCTAACTACATCGCATCACAACCTTA
CTTGGCGCACATGGCAACACGTGGTGTGATCATTATTGATACTAAGAATC
CAAGCATTGGTCACGTGGCTTTCATCCCTATTGGTATGGTGGATGTGTCG
ACCGTTGATTTGTCACCAATTACACAAAGAAATACCAAACAAGTTGTCAA
AGgaGAAGGTATTGGTTGTTTCCACTTTGGAGGTTCCTCGCATTTGTTGA
TTTTCGAGAGAGGAGTCGAATTGGCTTTCGATTTACAAGGCATTGTACCT
GACCCAAATGGTAATGACTTTTTGGATGTCAGATCCAAACTTGCCACCGT
TGTTCCAAAAGAATAGgaGAAGGTATTGGTTGTTTCCACTTTGGAGGTTC
CTCGCATTTGTTGATTTTCGAGAGAGGAGTCGAATTGGCTTTCGATTTAC
AAGGCATTGTACCTGACCCAAATGGTAATGACTTTTTGGATGTCAGATCC
AAACTTGCCACCGTTGTTCCAAAAGAATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000035_pilon | genome | sc0000035_pilon:1419379..1426731 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1204-1365:7192 |
| Aaloc | 976-1200:5919 |
| Aaloc | 577-975:5191 |
| Aaloc | 394-573:4000 |
| Aaloc | 286-390:3028 |
| Aaloc | 109-285:2186 |
| Aaloc | 1-108:1 |
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