XLOC_045616 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045616
Unique NameXLOC_045616
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000388_pilon:101305..112897-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045616 ID=XLOC_045616|Name=XLOC_045616|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11593bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000388_pilon:101305..112897- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CCAATGAGCTATTGGGTCCATGATGTAATGTCAGAAGACATTGCAGTGGT GCATATCATGAATTGGGATACAATATTTTGATGATTTTGACGCCTTTTAC TGCCACGTCGTGCATGTTGGTTTTTGAATTACGCATTATTTAGGTTTCTT TGATGCCAGTAAACATTTACAAAGTAGTTTGTCTGACATTTTTTGAGTTT TGTTTAAAAATATTTCGCGAATAACGCCTTTCCGAATCTTATTAGTATCT TAATTTGGCGGAGGACACCAACAAAATCCGCAAAATTTAATAAAGAGGTT TTAGGTTTTTCCGTCTCAAAGCTCTGCATAATTCAGCAAAATTTCAAAAA CATGTACTAATTTGCTGTGTAAAAGCCATTTTGCTTTGACCACTGCTCAA CTGTCACAAGTAGGATTCTCATTCAACTTCAGCATTTCTTCAACAAAAAC CTATCAGTCAAGAACACCTTCAAATTAGCCTATCATAGGCTGATTTTCCT ATCATAGGCTATTTAGACTATTTTATATAGGCTATTTAGCCGAAAATCGA TTAAAACCTCGATTTCTGACGAAATATAAATATGTAAAACCATCATTGCT GTTTCATCTCCAATAAGCCAAACCCTACCCATTTCCCTTAGTTTAAACTA TTTATAACATTTTACTATCTATGGCTTCTCATCTCATGTTTACAATCCAT ATGTAGAGGAAACGTCTGCTTTATATGATCCTAAGAAAAAATCTTTCAGC TCTTTCATTTTACTTTCCAAAATAATCAAAATACTTTTAAACAAGTCCTT CTAAGCTTTAAAACTATCAAATATCTATGGTCCAAATTTTCTTGCTTATT TTTTGCTTATTTTTTGCTTATTTCTACCAAAGTTTTTGGGCCATCAGGTT CAAAGCAGATTGTTTGTTTAGAAAGGATGAAAACTTTTGATCTTCTTTTG AAATTCTCCAAAGTCTTTGTTTATAACTTGGATGAGATAACCTTCGGGTT CTTGTTTATTTTCGGCTTTCGGGCCTTTTGAGGAGTAAACACTTTCTCCA TCCATATGTCCTCTAAAATGTGGTACATTTGATTTCAAAACCTTTGAAGT TTATTGAAATTATATCTTCTTGAAATAACTCGTTAAAACATTTTGAAAAT CATTTTGAAAAGTGCTCAATATGTTGGTGCTACACGCATCTTAAATATAT GTTTCAATTATTTATCAATCCATATCATATGGATGCTGTCTTATCTCATA ACAGATCGACCATTCTGCGCATACTACACTCTGCTCTAAAAGGTTTTTGC CCCGCAGGGGCTTTTGTTGCTTCACGTAGCGGACCTGCTCGCCAGAAAAA TATTCATGATTCAGATTCATGTTGTTTCTTCCGATTCTGAGCGGACCGCG CGCGGTTAAAAAATGTTCGCGCGCGATATCTCTTTTGCTGCTACTTGTAT TGATTTCCTAGCTATGCACGGACAGAGAAGGTACTAGCTTCCCGTCTGCA CTGCCAGTCCACACAGCTAAAAGCTTTCACAAACAACAAACAGCACACAA GATTTTTGCTTGGTTATAACGTATTTGCTCAACTGGATTTACTTGAGGGA CATTGTTTGCTACCGAATGAATAACTATCAAACTACTGATATTAGATCAA ACCTTATACAATTGTCAGAATGGACGATGGACATCTTCAATGACAGTTTG TTACACACGACACACACAGACAGTGTTATGCGCTGCTCTAACGAAACCCT GCTGATATTATAAAGGCATAGACAAAAAGGAAATTGACCGTTAATTCATA TTGTTTACCTATATAGTGATTTCATTTTGAAGAAAATTAAATTGAAATTT TTGGTGGAAAGACAAAACCCAGAGTACCCTATAATTATATGGATATTGCA TGCGCCGAAAGTAATTTTTCAAAGAGTAAGCCTTGCGCCAAAACGTGCCA AAAACTGGTACCAACATCGAGTTTCTTACAAAAGGTTTAGTGAGTGAGAC ATGCCAATGAAAATATACTATGACTAACATGAACTGATTCATTCTCGTGG ACATTTGAAGCACACAGTGTTACAGCAACAAAAAATGATTGTGCATGGGA AGCAGCGAGCAGAAAAATGTAAACAGAAGCGGAAAAAAAGCCGAAAACGA TGGATTATGAAGTATTTGATGCTATTTTGTGAATAATTCTTTACGCCAAT ATTGAAGCTTAAAAAGCAAACTTTGAAAATGCTGTTTATGTCACTGTGCC AGAACGGTACTTCGATATGTAATGTACGCCGAAGATTTTCAGCCTCATAT TATGAACAGACTCGAACACTCTCTCTACTAATACCACCACGGCAGTGCCG TGACGGCACATTGTACCGTATTGATGTTGAACGCAGGAGTATACTTTGCT CAAATCAAAACTGAACAAACTTTTTGACTTTTTAGAACCAGACGTCCAAT AAAATACAAACACAATGTTGTACCTACCTGTGAAGTGAAAAGTTTTTAAC CATGTTGACGGTGGTTACAACAGGACACGGTATCTGAAAATTCCCCTGGC AATTTTGAGAGCAACTATCAAATTCATATCTTTAGTAACCATGAAGAAAT TTTATTCTAACTGAAAACTTTTTGCAGAAACACGTATAAAGATTGTTAAA GTTTTTCAAAATAAATTATATCTACAGTATGCCACCAGTCCAAAGTTACT TACTTTTTAAATTTCAAATCAAATGACTGAAATTATATTCAATTTCATTT TCAAATTCACCTTTTAATCTGCATTATGTATATTCTTTATGAAAGGGAAG CACTTTCAGTTTCACAGTACACATTCTTATGTTTGGGTTTTCAAAAGGGA TTTTTATTAGATTTTTATCTGGTGATTGAAGAAAATCAACTTTGATATCA TTCTAGTTCTTAATATGTTGCGAAACCTGTAATGGTTTTAATTTAAGTCA CTTTGCATCAGAAAGGGTAGATTAAACATGTTTTTTTTTGGATTGACACT TTCGTTATGTATGGATCTTACTGAGAAAATTTTAACCGCATCGGCTCGTG CTTCTTAACTTTAAACAGCTCTAGTAACATTGAGCACTTTTTATGAAGAC TCATTTCACCAATTTATAGTCTGATTATGATTCCCTTGCTCTCTTCATGA CTAAGTTCCTCTGGGCTAATATCTGCTATCGGCGGGGCATTCATAGCGAC AGCTAATTGCTAGTACTTAAAAATGAAAGCAAAAGTGACATTTGATATTT ATACGATTGGAGTTTGATTTTGGTGCGATTGTTTTGCTTAAGCCAATCAC CGCTCTTTGAAGCTCATTCAATGTTGATCCCAAATCTAGATGAAAAAAGT CAAAGTGGTGTGTCAACCTTTACATTCTGTTACGGAGCCATGGCCTTTAG AGACAACGTGCCATGCGTGGAGTAATCAGGAAAAATAAAATTAACTCATC AAAATTATCCAAATAAAAAAACCTCGATCATGTTCCCTTTGGCATCGAGG ATGACCTCACAGTGCATTTTTTCTCTTCTTGCGACCTCTACAGCACAATT CTTCTGATGACCTTACAGTGCGTTACCACAATTTTTTTATCAAGGAGTAT GTATTCCTTTTTTATACCTGTCTGGCTAAATTATAATCACACGCTTTTTG CTTCAGCATTCAAACATAAGCTTTTTAGTTTGTACTATTTAAAAAACCTA CCAAACTAATCGGTCAAGATCTGTCTAAGTAGGGTTCTATTAAGCTTTTA CTATAAGTTAATCCTAAATTAAATGAATGATTTGATTCAAACTATCTTTT GGGGCTCAAAATTGTTTTTGGATTCGAAATAAAAGCGATTTTCAAAAGAA AGTAAATCTTGGGAAAAGGAAACGAGGAAACAATTAGGATTGTATAAATT AAATAATCTGAATCTGGTGTATTGGATTTTTCTATGGCTTCAAAATAGAA TTTTCGTCTAGCCATCTCAAGGTCTCAATTTCGTATTTTGAGATTTTTTT AGAAAGCGAAATACCAAAAATTATGTAACAATTTAAACCTCCTTAAATAC ACCCAGAACAATCAGGGAACATGGCCCTATGAACCACTCACCATGGAAAG AAGGACCAATAGTTTCTCATATGTGAAAAAATACCCTCACCTTTTATTCA ACATTAGGAAAAGGGACACCCAAGCACATTTTAGGGAACACTTGATATCT GATTTTTGACAATAAAATTCAAAACGCCCATCTGGTATTATCTTCTTCAA TTCATTGTCACTGAGACAGGGGTGTTAAGAACAAAATACTCACTCGACGC GTAATATAAAGCGTATGATCAGTTTGTTGGTCAAGTCAGGAAACAAAAAC TTTCAATATTTACAAATCCTTATAGCTAAAAATTTCACACGAAATAATTT TTATTGAAAATTTTCATCTAATAATTATATTGAACTTTGATTTTCAGATC ATCCTCGTTATGTGCAGATCGATGTGAAATCGTTCTTGAATCTTCATCAC CGTCTTTTGATTTCAACACCTTCCCATCATACAGTTCGAGGGAAATACCC GAAGAAGTTTTTGTTTTGATTGATTCTCCGATAGCCTCCTTTCCATTTTT CTCAGCCTCGTTTGGGTTTTCGTAGACACAAAAAGTTTGAATACAGGGCA AGTCTTTAGAGGTGTTGCTCTCTACAGAATCTTTCTTTTGTATTTCAATC AGTAAGCTATTTGGACCATATCTTGTTTTCTGGGACGGTTTTATCATTCC GATCGGTGATTTATTCACGGTCGCCGGAAAGTTTGGAATTTGAATCCCTT TCTCACTGATGACTCTCATTCCGCAAAATATACTTTGGAAATCATTCATC GTGAATTTGAATTCGTTCTGTTCGTAAAATGGTTTGTCCGAATCTTCAGA GTTAATTGAACACTCTGAGCTATTTTCATCTTCAGAAAGTTGTGTTTCGT TCGCCCATTCTAAAGCTAGTGGCTCGCCAGTTAAGCTGCATTGACTAGCT TCTTTCTCTTTGGACCAATCAGAAACTATAACAGACTGTTCTGTCAATTT GAATGGCTGATTTGGCCGATCTGTTAGCCAATCAGACACAAAAGAATCTT CTAACTCCGGCACCTCAAATTTTTGATACTCGTTTCTCGGAATTATTGAA GATTCCACGACAACTTTTTGACAGGAATCCTTGGCTTCATTCTCGGTGAA TCTAGAAAATGATGTCAGACAATAAAATGTAACGTTTGCTGATCTGGTGG TTGGAATATCACGTGATATGACTGGAACAATACACGTATTCTCGATAATT TCTTCACATTCGCTTTCTTCGATTACATTCATTTTATCGACATATCTCGA TCGAACGACTGAATTATACAGATTTTTCGGTTTAAGTAAATGAGGGGGTG ATGTATTGCTGACGAGTAATTGCGATGATTTGATTGGAACGAGAATTTCT TCGTCAAATAGCGAAACATCATCCTCGGTTTCTGAAGTCTCGTATAAATC ACTCTCCTCATAATTCGTCGGTAAAAAGTCGTCTGCTATCGAGGTATTGC TTTCGTTTTCACTGTCGTTCTCAAAATGACTGTTGTCGATAGGGATGTAG CGAAAAATCCCATTTTGGTCGGAATGAGTTGAAATGGGGAGAAAATAGGG TGGTGACTCAACATATCCTATGATTTCTTTTGTTATTTCCCGACTCTGAA TTTGTACCTTCTTTTTAGATGCTGATAAAAGATTTTCCTCACTTTTGGCC TTGATCATTCGTTCACGCCGTTTGAGAGATTGGAAAAAATCTTCACTGTC AGTTTCCGGATACTCTGGTGGTTTATGGAACAAATCATCGCCGGAAAAGT CGGTGTCATCCGCGAATTGGAGACGAATGACCGGTATTTCTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000388_pilon:101305..112897-

>XLOC_045616 ID=XLOC_045616|Name=XLOC_045616|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=648bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000388_pilon:101305..112897- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGAATTTTTGAATTGCACCTCAACTATGATTGGGAAATACTACAGCT
CTGTAAATGGGAATTTTTGAATTGCACCTCAACTATGATTGGGAAATACT
ACAGCTCTGTAAATCATCCTCGTTATGTGCAGATCGATGTGAAATCGTTC
TTGAATCTTCATCACCGTCTTTTGATTTCAACACCTTCCCATCATACAGT
TCGAGATCATCCTCGTTATGTGCAGATCGATGTGAAATCGTTCTTGAATC
TTCATCACCGTCTTTTGATTTCAACACCTTCCCATCATACAGTTCGAGAT
GCTGATAAAAGATTTTCCTCACTTTTGGCCTTGATCATTCGTTCACGCCG
TTTGAGAGATTGGAAAAAATCTTCACTGTCAGTTTCCGGATACTCTGGTG
GTTTATGGAACAAATCATCGCCGGAAAAGTCGGTGTCATCCGCGAATTGG
AGACGAATGACCGGTATTTCTAAATGCTGATAAAAGATTTTCCTCACTTT
TGGCCTTGATCATTCGTTCACGCCGTTTGAGAGATTGGAAAAAATCTTCA
CTGTCAGTTTCCGGATACTCTGGTGGTTTATGGAACAAATCATCGCCGGA
AAAGTCGGTGTCATCCGCGAATTGGAGACGAATGACCGGTATTTCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045616XLOC_045616-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000388_pilongenomesc0000388_pilon:101305..112897 -
Properties
Property NameValue
Aaloc148-321:175
Aaloc55-144:1446
Aaloc46-51:11546
Aaloc1-45:11594