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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000330_pilon:123333..130662+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045597 ID=XLOC_045597|Name=XLOC_045597|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7330bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000330_pilon:123333..130662+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTCCGCCTTGCTTCTTATTGCTAATCTACTTGATTAATCCAGGTAT
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AACAAGAACAAACGCTTAACATAAAACTGCATAATAGATCTATAACAGCA
AGCATCGCACACTTAATGAAAGAAATGTACTTACTGTCAAAGTACTATAA
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TGAAACAGCTAATCGAATTGGTCTCGCTTAAATAATCTTAGAAAGTGTTT
TTGGGATacttaccttaaaggaagaaattttggcgggaatttaatttggc
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caaatccgccaaatccgccaaattttctttccgccaaaatttcttccttt
aaggtactaaGtttttaggatcaatttttccacggtaaatttcctttcct
aattttaattttttgggctGAGGTGTCTTCATTGGAGCTCCCTAGCTAAT
TTTATGCAATTATTTATTAGGTGTCTACATTATTCGCACAAGGAGAAGGT
ATcttaacaaaacataaaatggTAGATATTGATAATGAATATTTCACCAA
CACCTACATCGTTACTAAACCAGCCAGAAGACTTCATTATGATCGGGTTT
GGTGTGATCGACCTTTAAACGATTGTTCAGCTTCCAACACTTTCACCACA
GTGACTAATACATGGTCTAAAGAATTCCCCTTATACAAAGAAGAATCACA
GACAGAGCCTTACGGTAATTAAGAATGAAGttaacacccctgtatcatag
GCTCACCGGAAGATTTTTTCCTCAGTAGTGGGGGATGAAAATTCTATCGA
AATCTAAATGGGGATAGCAATTCTATTGTTcacagctcgaaaattccagt
ggtaaaagttttggagtgcaattgtttttcattgaatttccagtggtaaa
agttttggagtgcaattgttttccattgttttcaattgAGGATGAAAGCT
AAGTCAATTTTTCAATCGGGGATGAAATTTTGGGCAAGTTTTCCAATAGA
AATGGGGTCCTATATGTATACATTCTGACGTGGTCCTTTGAAGGGAGTCC
TAGGATCTTTCCCTAGGTACCCCCACTGGATCTATTATTCATGATGAAAA
AGCGTGCAaacaaaattgttgtttttctatAGTACCTTATCGGATTAAAC
AACTCCAGAGCGGACTGTGTTGGGAATTCAAAGACAATGTCATCATCTTA
TCCTCAAAATGTCGAGATCGATTTCACTTCAATTACAAATTGGAAATCTT
CCATTCGGAGACTGGTAAACAGTTATATCTCCATGGCAACGGTTGGAAAA
CGACACCAAGTTCGGCTGGATTCTTCAATAAAGAGCATGGATCTTATACT
GCTATTATTGCTGGATGGCGCTTTGGAAAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000330_pilon:123333..130662+ >XLOC_045597 ID=XLOC_045597|Name=XLOC_045597|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2928bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000330_pilon:123333..130662+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTCCGCCTTGCTTCTTATTGCTAATCTACTTGATTAATCCAGATGG
TTCCGCCTTGCTTCTTATTGCTAATCTACTTGATTAATCCAGtttttGGT
TCATGGAGCTCTTGGAGTTCGATCAGAGGATGTTACAACAAAGATATGTT
CGGTCCAAAGGTCAACAAACACAAACGAACATGTTCCGGTAGTTGTCCCA
CTGGTACCAATTCCATCCAATTCGGATATGCATGTCATGAAGGATttttt
GGTTCATGGAGCTCTTGGAGTTCGATCAGAGGATGTTACAACAAAGATAT
GTTCGGTCCAAAGGTCAACAAACACAAACGAACATGTTCCGGTAGTTGTC
CCACTGGTACCAATTCCATCCAATTCGGATATGCATGTCATGAAGGATAT
ACTGCCCCGTATATTATAAAAGATGATGGCACACGTCCCAACTGTGGCGG
TCCATTTATTTGCAAAGCCACTTATAATTTTGATGTGCAGTTCCATTTGA
ATTTTCATCTCATGAACTTTCCTACCAGTAATCTTGATATCATTGTTGCC
TCCAACAAAGACGTCTCAGGGGATGCTGATACTGCCCCGTATATTATAAA
AGATGATGGCACACGTCCCAACTGTGGCGGTCCATTTATTTGCAAAGCCA
CTTATAATTTTGATGTGCAGTTCCATTTGAATTTTCATCTCATGAACTTT
CCTACCAGTAATCTTGATATCATTGTTGCCTCCAACAAAGACGTCTCAGG
GGATGCTGaaatcaaaattgaaagtgTCAATCATGTTGACGACTCCAACT
TAAATCTGGCTTACACGAAGAATCCGTTTGATTTCACGGCAACACATTTT
GTTGCGGATCGCTATAGGGCCCAGACAACAACATTTGGTTTTAATTCAGT
TGTTGTTGATGGCAACAGATTAAAGATTAAAGCAACTGGaaagaaatcaa
aattgaaagtgTCAATCATGTTGACGACTCCAACTTAAATCTGGCTTACA
CGAAGAATCCGTTTGATTTCACGGCAACACATTTTGTTGCGGATCGCTAT
AGGGCCCAGACAACAACATTTGGTTTTAATTCAGTTGTTGTTGATGGCAA
CAGATTAAAGATTAAAGCAACTGGaaagatTACATCAAACTCTCAACCCT
CTTCTCAAGCAGTACTTAGTGCTggtttccattttcaaaattccaataTG
GATGCAGATGAGGCTAACGAGACCATAATTATCCTTCAAAACAAGCGTGA
AAGAGCTGGTAGCAGCCTCAAAGGAAGTAGTGATATCATAAATAAGGGAG
CCAGCGAATTGAGTGGTGCTCCAGCTATGATACTGAGGCCTGGatTACAT
CAAACTCTCAACCCTCTTCTCAAGCAGTACTTAGTGCTggtttccatttt
caaaattccaataTGGATGCAGATGAGGCTAACGAGACCATAATTATCCT
TCAAAACAAGCGTGAAAGAGCTGGTAGCAGCCTCAAAGGAAGTAGTGATA
TCATAAATAAGGGAGCCAGCGAATTGAGTGGTGCTCCAGCTATGATACTG
AGGCCTGGCTTTGTTTATCCATCATCAACGGAAATAGGGGCAACTGGTGA
AAATCAAATCTATGATCTTACACATCGGGTTTACATCCCCAAATTACAGT
TCAATATCCATACTAACATTTACTGTGATATGGCGTCTGGTTACAGTCCA
GAAAAATTAACCATGTGGACGAACACTGAGAAAAGTCAACACGTGCTTCA
GCTTTGTTTATCCATCATCAACGGAAATAGGGGCAACTGGTGAAAATCAA
ATCTATGATCTTACACATCGGGTTTACATCCCCAAATTACAGTTCAATAT
CCATACTAACATTTACTGTGATATGGCGTCTGGTTACAGTCCAGAAAAAT
TAACCATGTGGACGAACACTGAGAAAAGTCAACACGTGCTTCAGGTGTCT
ACATTATTCGCACAAGGAGAAGGTATcttaacaaaacataaaatggTAGA
TATTGATAATGAATATTTCACCAACACCTACATCGTTACTAAACCAGCCA
GAAGACTTCATTATGATCGGGTTTGGTGTGATCGACCTTTAAACGATTGT
TCAGCTTCCAACACTTTCACCACAGTGACTAATACATGGTCTAAAGAATT
CCCCTTATACAAAGAAGAATCACAGACAGAGCCTTACGGTGTCTACATTA
TTCGCACAAGGAGAAGGTATcttaacaaaacataaaatggTAGATATTGA
TAATGAATATTTCACCAACACCTACATCGTTACTAAACCAGCCAGAAGAC
TTCATTATGATCGGGTTTGGTGTGATCGACCTTTAAACGATTGTTCAGCT
TCCAACACTTTCACCACAGTGACTAATACATGGTCTAAAGAATTCCCCTT
ATACAAAGAAGAATCACAGACAGAGCCTTACGTACCTTATCGGATTAAAC
AACTCCAGAGCGGACTGTGTTGGGAATTCAAAGACAATGTCATCATCTTA
TCCTCAAAATGTCGAGATCGATTTCACTTCAATTACAAATTGGAAATCTT
CCATTCGGAGACTGGTAAACAGTTATATCTCCATGGCAACGGTTGGAAAA
CGACACCAAGTTCGGCTGGATTCTTCAATAAAGAGCATGGATCTTATACT
GCTATTATTGCTGGATGGCGCTTTGGAAAATACCTTATCGGATTAAACAA
CTCCAGAGCGGACTGTGTTGGGAATTCAAAGACAATGTCATCATCTTATC
CTCAAAATGTCGAGATCGATTTCACTTCAATTACAAATTGGAAATCTTCC
ATTCGGAGACTGGTAAACAGTTATATCTCCATGGCAACGGTTGGAAAACG
ACACCAAGTTCGGCTGGATTCTTCAATAAAGAGCATGGATCTTATACTGC
TATTATTGCTGGATGGCGCTTTGGAAAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000330_pilon | genome | sc0000330_pilon:123333..130662 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1219-1464:7085 |
| Aaloc | 973-1215:6421 |
| Aaloc | 781-972:3443 |
| Aaloc | 565-777:2754 |
| Aaloc | 382-564:1814 |
| Aaloc | 202-378:1283 |
| Aaloc | 49-198:202 |
| Aaloc | 1-45:1 |
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