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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000278_pilon:113605..119436- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045554 ID=XLOC_045554|Name=XLOC_045554|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5832bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000278_pilon:113605..119436- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTGAAGTTGATAGATTGATAAAAAATATCAAAAATGGAACAACAGATAT
GAATTGGGATTCCATTTGCCTCAAGTAAGATTCACGTTTATTGATTTCAC
ATTTCCTTTGTCTGAAACTTCTTCTATCTAATTTTCTATATCCAGTTGTC
TCAGAGAGACTTTGTTGGTTACTTTGTAATCGATATGACGCTCTGCTAGA
AAATATCTTGTCATCAATGTTTTTATAGTTTCAATTTCAATGCTTCTCGT
TGTCATAGCAACCATCGTTTTTATTGTCTTTTTTTCAAGCATGACCTTTC
AATAAACCGAAACAATTATTAAAGATATATTTTCTTCTTTTAGCCTTGCA
GGAGCAGGTGGACCAGTGGTGTGTCGACCATCAACAATATTAATGTTATG
GAATTACGATTGCAACATTGTGAAACAGTTGAACCAATCACAAATCCTGG
CCAAAGTCAATGATGATACTGCACTGCAAACGTATGTATCATTTTAAAAT
TATTTCATTATTTACAATGCCAAGTCTTTTTTTTTCATCGGCATGACCTA
ATTTTTCTTTGACATGATCAAGATCAGCGTGATGTGTTATTTGGGCTAAT
TTTCCAGCTGGCACACAACGTTTTTCAACGCTTATCTAAAGTTCACACCG
CTCATACAACGTTAGATGAAAGTTGCGTGCCAGCAGGGTTAATGCTTTGT
TACTGTTATTTTTGTGATGCACCAATTTTGGCGCAATTTTCTTACTTGTA
ATTAATGATGGTTATGTCTTAAATTCACCTACCTTATTGGAACTTATTTT
CGCTGAATTAATTTTAGCATTTTTGGCAGTTTTTCGTCAAAATCGCAAAA
ATACGAGCCTGTGAAATATTTTGAGAGTTAAAAACCCCGAAAATTAATTC
CCGCGAAATACATTTTATCGAAGGAAAATCCCTAGGAAAATGAAAGAAAT
TTGTCCAAAAAAGGGCAAAACTGCAAAAATTCCAGAATAAAAAAAAAACG
CGAAAATTAAATCCTGCGCAAATTAAATCCTGCGCAAATTAGTTCCAATA
AGGTAGTCTTTTCTCTAATAACCCTCATTAAAAAAAATATTTTCAATACC
AGAGAAGTTAATAAAGAAATCTTTAGGGCAACATCGCCCAACGATATGGA
CCATCTCAAGTCAAAACCCCCCAAAATCGCCTAACTTTTTTAAAAGAACT
TTTTTGACTTTAACAAAGGATAAATAAATGAGGTTAACTTATTTTTATTT
GCTACTTTACATGCTAACTCAAAATTTATTCAGGTTCACAATGATATATA
CATTATAGAGGTTAAGTGTTGAATTTAAAGAGATATTCTTGGTCAAAGTA
GGGTTAAAAATATGAGGTTAACTTGCACTGAGGTTAACCTAATGGTCTGT
AAAGATAGATCAAAATTGGTATGAAATGTGAGGTTGAAGCAAAAATAAAT
GATTGGGTTTTACTATATAATGATTGGGCAACAAGCTAGGCTAGAAAAAT
GAGGTTAATATTTCAAGTAGGGTGTAAAATTTGAGGTTATTTCACAAAAA
CACCCTAATGTGAGGTTAACAATGATATTTCAGTCTAATTTTGGATATCA
GACAAACAGTAGCCTATTATCAAAAACAACTAAACATGAAATATTATATT
TTGGTCTAAAAAGTGAGGTTAACTGGTATATTAACTTGAGAGACGCAAGT
ACCTGAGAAAGGGTTTGATTTTAAGCTTTCAGAAATCCTGCATAGAAATG
CAAAGTTGTGTAATAGAAATAGTGGGATCCATTATTCAATGGTTGAGGAA
CAAGGTTAGATAGAAAAAAATGAGGTTAATATCTTAGTTTGGGTACCAAA
AGTGAGGTTATTTGTGAATTGGGCTTATAGGGTTTTTAAATTCTTTGTTG
TATACTTTAATGACTTATAAATCTGTTTTTGATATCAATACTGAGCTTAA
CTTTTTATCGTAGTATCCCTTAAACGTTTTTCGTTCAGTTGTTGTTTGAC
AAAAACAATGAAGTTTGAAGGTATAAACTAAAACATCCTACTTTTTCAGG
TTGTTTAACCTCATTTTAAGAACCTTTTTGGTCTCTTTCATATTTTTTTA
GCTTAGTTACTTTATGAAAACTTTTAAAAAGTAATTTTGTTCCTGTAGCT
TTAATAGAACTATTTAGATCTATTAGAAAATCAAATTTCTCACATTCCTT
AACATAGAGTTTTAATTTTAACCTCAATTTTTAACCCTACATTAGAGCAA
AGATTGTCAATTTCATAAAAACCCTATCGATCTAAGGTTCTAGTATCATT
TTACTTTTGTCCCATAACTTAATACACATGCTAGCAGAAGATATGGTTAA
GAATGTGAGGTTACATGTTACCATTTTTTTAACCTCATGAATTGCACCTT
TCTTGTGGGAAATCTCTAACCTTTTTTAGACAAGCTTGATATTCGAAGCC
TTTTTGATGACTCCCTAATAATTTTTTCCCCGATAATTCAATAAGCGTCT
CTATATTTTGAGGTTAACAAAAGTCTATAAATTGTCATATTAACCTCAAA
TAACAAACCTTTTTCAAGTTTTTTTTTCATTTTTGGGTATAAGCCATCAA
TTATGACCAACCCTCAAAATTTCAACCTTTTTAGATAAAAAATGAAGATT
ATGTGGCCAATTATGTAAATTTTTCCACTTTTTCCTCAAAAAAAATAACT
TTTTCTTAGGTGACATTGATTTGAGATTGTCCATATGAACGCATTTTATA
ATCCTCAAGGAAAATTTGTAGATTATTACCATTGTGATATTTTTTTGGTT
CTAGATTAACCGGGAAAATCAATTTGGATTTATTGCTTGGTAGTATTGTA
AGGTCAAATGGTGACATCACTGGAGCAAGTGCAACCAAAATGACTTATTT
TCTGAAGAACCAGGAAGTGTATGTTGAAAGCCAGGGAAAAAATGTAAGAC
TTCTTTCTGGTGAAAATTTGAATACATAATTTTTTCATAGGTTACTTAGG
GCTTTAAAATCATTTACAATACATCTTTCAACTCTTAAAACATTATAAGA
CTGGGTCACAGTTTACCAGGTAGCATTGCTGTCAAAAATTTGTAGAGTTG
ATTTTCTCATAGACTCTCGCAGATTCTGATCTAATTTACTGCTGACAAGA
TACCAAATGAGTGTTCTATTAGTATGGGCTAATGTAGAAAACATTTGTAC
TCCCAATGTTGAGGGGGTCATTTTTGGGAATATGACCCAGTTGGACTTTT
TTCTAATTTTTTGGACCACCCTGGACTCTTGACCTTACTGGCTTTTTAAC
CTTCATTTTACTAACCCCCCATATTTGCCATCACATTTTTCTGACCACCC
TGGATTTTTGCACTCAAAAAACCCGACTATTCTAGAATGAGTGCAGACAA
AAATGGCTAAATTTTAAAAACTTTGATTTTGTGTTTATTTTGCCCTTTAT
ACCCATATTTAGATTAAAACATTCAAGAAATACCCAAGAATAGCAATGCT
GCAAAATATAAAAGGCTAAATTTTTCCTTGTATAGGTTGACCAGAAAGGA
GAGGATTGGGAGACAGAGTTTTCTGATGTTTTCATCAAACAAAAGGTCAC
TGGTGGTTTTGACAAAGTATACATTTTTTCTTTTGTCAGGTTAGAATTTA
TTTCCGTTTTCACTTTATCTCAATCTACAGTAAAAGTATAGCCTATACTT
GATTCCATTTTTCTGTGCATTAATGTCTTTACAGATGTTTTTCATGCTTT
TTAAAGTTTCGTAATCCCCCCCCCTTCAATTCTGTTAAGGCAATTCCTTT
ACTCAAGTTGAACGTTTGTTTCCATAATGGTGGAAGTCATTATGTCACTT
GACAAAACATGAAAATAACCTCTGTTCAACTTTACGATCTTTTCCAAATG
TCTGTGGAGTCCGGGTTTTCAGGCTTTTTTAAAAACATTCAATTTTTCGA
CGTCACCTAAATTTCAAAGCAGTAGCGAGAAAAAAATGCATGCATAAAAG
TTCTTCTTTCTTCATGAAACTCACTAAGAAACCACAGATTTATGTAAAGC
CTGAAGGGCTAGATGTCGTGCTTTAAGTCATGACAGGTAAAAAAAGTGAA
GAAGAGAAAGAGTTGCTATTGTTTTCGAAAATCTGCAAAGCTTCTGAATA
GTCAAGCGCTGAAATCCTATACTAATGTCACGTGACCTAGGTAGGATTTC
CTACCTAACCACGGCACACTTTCCAGACAAAGCACGACATCTAGTCCTTC
ACGCTTTATATAAATCTGTGCAAGTATAACGGAGTAAAAGATCTGGTTCT
TGATAAGATACTCTCTAGTAAAGGCACTATTTGAACAGACTGTGGTTTTC
ATCTCCTAGTTGATGAATTTCAATGCCAAATATTTTCTTAATTTTTGACT
AAATTGGCTGTCTAAAACATGCTTTTAAGGTTTTTTACTTTCATTTTTTT
TTCAGTCAACAAGACGAGAGTGGTGGACAAATTTCTGACGATTTGAAATT
TTTGTTTGTTGGTTATGTTTTGATCATTGCATACCTTGGTATCATGTTAG
GAAGTTTCTCCAGACTCGACCAAAAGGTTTGTTCTCATTCATTCTTATTT
CATATTCATTGGAAATTTCAGGTTTTTAAAGTTCTTTAACCCTATTCTTA
TTCATCGGAATCGGTTTTTAAAGTTCTTTAACCCTATTCGTTCGGGAGGG
GCTGTTCCTGTTCAGAGGTCAAATTAATGTTAATAGCTCCTAAAATAATA
GAGCTTTTGTCATGAAATTTTCTATAAATTCCTAACTTTTATTTAGCTTT
AATAAAAAATTGACATCTAAAGATGTCTCACACCTTGAGCATGATGACAT
TTCTGACAGTAAAGGGGCACAAAAATTGACACTTTTCCAATGCAATACAA
ATTTATTTTCTATGTCAAATATATCGTTTAAACCGTAATTTATTGAATAT
TTAGGATAAAAATAAGCATTTTAGACTCAGGGAACTTTTTTAAAGCTTTT
GTTAGAAAACAATAGCTATTTGTAAGAACAAAGGAAATTCTCGGTTTTTG
ATCACTGTGGGCATGGTGAGTGACGTCATCAAAAAAATTATTTGTCAAAA
GTTACCTTATGTGACAAAGATCTTGTGTGCCAAGATTTCATCCAAAAAGA
CCCACTAGATCAAAAGTTAAGGGGTGGTACAGGAACACCCCCCTAGTTTT
GAACCGCCCCTAAAAGCCTAGTATCAACGATAGGTTTAAAGATGTTAACA
ATTTTATTCATAGATACCCACGTTATGATAAACTTTTTATTTATTTCTAA
AATTATCTACATATATAATGTAACGCATGCATCTAACATCGGTCGAACGA
GAATGGTATTAACTGTTTTGAATAATATCAGATGCATCATTATCTACGAT
TTTTTTTCAATTTACAATTTTCTTGGCATTGGAAAAAATCTTAAGAAAAT
ACTGTTTCCATGTTGCCGATCTTTGACATAAGATTCTAATTCACTCGGAT
GAGATGGAGTTGTAAGCATTGTTACTTTAATAATTGGTCATTTGAAGTAA
TAAAAATGACGCATTCTTTAGAAAAAGTATTAAAATTGTTTTATTACTAG
TTAGAATTTGTAAAAACTCCATTTCGTCCAAATTCACTCATTCAAATTTC
TTTTTTGATAGGTTTGGTTAGCATTGTGTGGTGTTTTGAACATTGGCCTT
GCAATTGGTATTGCTTATGGATTATCAAGTGCATTCCAACTCTTTTCAAC
ACCCGTCCACAGTGTTCTACCCTTCTTGCTCCTAGGTATGTTCCACTACA
AATACAGTGTGTCCCAAAAAAAAAGCGGATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000278_pilon:113605..119436- >XLOC_045554 ID=XLOC_045554|Name=XLOC_045554|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1494bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000278_pilon:113605..119436- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTGAAGTTGATAGATTGATAAAAAATATCAAAAATGGAACAACAGATAT
GAATTGGGATTCCATTTGCCTCAATGTGAAGTTGATAGATTGATAAAAAA
TATCAAAAATGGAACAACAGATATGAATTGGGATTCCATTTGCCTCAACC
TTGCAGGAGCAGGTGGACCAGTGGTGTGTCGACCATCAACAATATTAATG
TTATGGAATTACGATTGCAACATTGTGAAACAGTTGAACCAATCACAAAT
CCTGGCCAAAGTCAATGATGATACTGCACTGCAAACCCTTGCAGGAGCAG
GTGGACCAGTGGTGTGTCGACCATCAACAATATTAATGTTATGGAATTAC
GATTGCAACATTGTGAAACAGTTGAACCAATCACAAATCCTGGCCAAAGT
CAATGATGATACTGCACTGCAAACATTAACCGGGAAAATCAATTTGGATT
TATTGCTTGGTAGTATTGTAAGGTCAAATGGTGACATCACTGGAGCAAGT
GCAACCAAAATGACTTATTTTCTGAAGAACCAGGAAGTGTATGTTGAAAG
CCAGGGAAAAAATATTAACCGGGAAAATCAATTTGGATTTATTGCTTGGT
AGTATTGTAAGGTCAAATGGTGACATCACTGGAGCAAGTGCAACCAAAAT
GACTTATTTTCTGAAGAACCAGGAAGTGTATGTTGAAAGCCAGGGAAAAA
ATGTTGACCAGAAAGGAGAGGATTGGGAGACAGAGTTTTCTGATGTTTTC
ATCAAACAAAAGGTCACTGGTGGTTTTGACAAAGTATACATTTTTTCTTT
TGTCAGGTTGACCAGAAAGGAGAGGATTGGGAGACAGAGTTTTCTGATGT
TTTCATCAAACAAAAGGTCACTGGTGGTTTTGACAAAGTATACATTTTTT
CTTTTGTCAGTCAACAAGACGAGAGTGGTGGACAAATTTCTGACGATTTG
AAATTTTTGTTTGTTGGTTATGTTTTGATCATTGCATACCTTGGTATCAT
GTTAGGAAGTTTCTCCAGACTCGACCAAAAGTCAACAAGACGAGAGTGGT
GGACAAATTTCTGACGATTTGAAATTTTTGTTTGTTGGTTATGTTTTGAT
CATTGCATACCTTGGTATCATGTTAGGAAGTTTCTCCAGACTCGACCAAA
AGGTTTGGTTAGCATTGTGTGGTGTTTTGAACATTGGCCTTGCAATTGGT
ATTGCTTATGGATTATCAAGTGCATTCCAACTCTTTTCAACACCCGTCCA
CAGTGTTCTACCCTTCTTGCTCCTAGGTATGTTCCACTACAAATACAGTG
TGTCCCAAAAAAAAAGCGGATAAGTTTGGTTAGCATTGTGTGGTGTTTTG
AACATTGGCCTTGCAATTGGTATTGCTTATGGATTATCAAGTGCATTCCA
ACTCTTTTCAACACCCGTCCACAGTGTTCTACCCTTCTTGCTCCTAGGTA
TGTTCCACTACAAATACAGTGTGTCCCAAAAAAAAAGCGGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000278_pilon | genome | sc0000278_pilon:113605..119436 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 577-747:172 |
| Aaloc | 457-576:1377 |
| Aaloc | 352-453:2298 |
| Aaloc | 214-351:3028 |
| Aaloc | 76-210:5489 |
| Aaloc | 1-72:5833 |
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