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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000225_pilon:44627..52949+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045548 ID=XLOC_045548|Name=XLOC_045548|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8323bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000225_pilon:44627..52949+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCAATGCCTTTTTATGGCGTCGTGAAATAGACGGGTCTTTCATTTT
GATTGGGCATCGGAAGCCTTCAAAAACTGATTTGCCTTCAAATTGCCCGA
TCCACATCCACAAAATTGGAGAACATTACGAGCCTATTGTCGACAAAAGG
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catttttaccatttttagtTAGGACATCCTAACTATCAAAAAGTCTATAA
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TACACTTATAATCAACATACCCCTATGATGTTGATTATTATGTTGATACC
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TGTACTTTTAATCAGGGAAATTTATTTAAAGCTACAAGTATTACAAAATC
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ttagtttgttttttaaattctgcATTAATTAATAATGGAGTCGATTACtt
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GAGATCAAGAAAACGCTTATTATGTACGTATTAATGCAACACAAGAAGGG
GGTcaaattgtgaatgttttgtGACATATGATGTTCAATGACATTAACTT
TAAGGCAGCAATCACTAATACACctccattttattttgaatcttcttcag
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TCAAACACTTTAAATACTTCTCAAATAAAATAAGCACTTTAGaagcattt
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TGATCGCTGCATTAGaatataccttaagtggataaattttagcgtaGATT
TACTGTAATTTGGCAATTgaccaaaatacaatttttgacAGGGATTTGCC
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TAAATGGCTGGacggactttaggtgtcgaaccgggttctgggcctacttt
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aggctgagtgtttaAAGCAGCTGCGCCTGTCGCAAgtcagggactccaga
ttgcattggttgggtttttgagtggttttcggtgtttgtgtttttctgct
tggctttttaaaattatgtctattggtttgttggttctttttcgcataaa
attctcatttcttgacaatatgtttgattggtttgatttatatatttaga
aaaattaaaaaaattgaaaaaacgtatagttataaaaatattagtgcctt
tttatgtttcatctttattttatttagtattttcaacactttctctcctt
gaggtcagatctctgatcttcaccatatatatatcTGATCAACATTGCTA
GGCCTACCTACATTACCCTGTTTATATCATTTGGGAGGATATTTTCGAAA
TTGGCCGAAATCCTATGTaggttgaaaactgaagaacagagtttgtgttt
tctttgaatatatttaattgattcatattgagttacttgtatttgtgttt
atttttacTTATTCTCACATTGAGTTGCTTCTTTCCTTTTGGTCGACTTA
GATCACGATGTGCATTTTTGCTTTTGAGATACTTCCGAAGAATACACCAT
TGTCCCATTTCTGTTTTTCTGTTCCATCAGAATTATGTACAAATAGTTTA
GATCTTTGTCATCATTTGATATCACATACCTGGTTTccattttatgaata
ttcaTCCTGAGCATGAATTGTTGtgtctctttttgtttattacatTTCTT
GAATAGTTGAAGCTTCAATACTTCTTTGACTATATGTATTCATTTTCATC
TACTTATCCTTTCTATTTCATCTATTCAGATTCCTATCATAGTAAATCTT
CAAATCAGAAGAGTCAACAACTTGAAAtggtatttttattttaataaatt
atAGCATCGTGGAAAAGTTAAACGGATGCTTGAAtaatcaatttcttcaa
aaagtgtGATACTTTGATGTCTCAGATTTTGCTGAAATCTTGACAGGATG
ATCCTTTCAGTAAGATGAGACAACGCTGAAAATTACAGCTACATATTTCA
GGCGGTTCTAGGGATATAGCAGATTGAACCTCGAATTCCTTAAATAGCTC
TCCCTAAAGAAATAGCTAGAATTTCTGCAGGGAAGAAACTTTGAATGTGA
ATAAAGACCTATTCTTTCTAATTTATTAGAACTTTTGGCTTGGATTCAGA
AAAACACAAAGTTGGTTGTCAAAGAAATCCCAAATAATTTTCCGGACTCC
CTAAACTGGTTCTATGTCCGAGTGAAAACCTTATTCCTTTTCTTTCTCTG
AAATAGCAGATTTGAATCAAAAAgtttaagtaaaaaaaatatttagttga
attgaatttttgattaatcaatcaattaaaTAAACGTCGTTGCATTTCAT
TTAGAATGCCGAGCTGGATCATTTCGAAACCTTGATGCACAGCATAGATG
ACAAATCATTACTGCAACATGCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000225_pilon:44627..52949+ >XLOC_045548 ID=XLOC_045548|Name=XLOC_045548|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=894bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000225_pilon:44627..52949+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCAATGCCTTTTTATGGCGTCGTGAAATAGACGGGTCTTTCATTTT
GATTGGGCATCGGAAGCCTTCAAAAACTGATTTGCCTTCAAATTGCCCGA
TCCACATCCACAAAATTGGAGAACATTACGAGCCTATTGTCGACAAAAGG
TTCGAAGATGGCCAATGCCTTTTTATGGCGTCGTGAAATAGACGGGTCTT
TCATTTTGATTGGGCATCGGAAGCCTTCAAAAACTGATTTGCCTTCAAAT
TGCCCGATCCACATCCACAAAATTGGAGAACATTACGAGCCTATTGTCGA
CAAAAGGTTCGAAGAGACTTCAAAGGCACTGTCCAGAACTCATGGATTAT
CTATGCAGGAAACACAGGCCTTGTCACTTCTTTAGACTTCAAAGGCACTG
TCCAGAACTCATGGATTATCTATGCAGGAAACACAGGCCTTGTCACTTCT
TTGTTCCTCGGAAGAAGAAGAATCAAAACATGCGACCAAGGGTTCCTCGG
AAGAAGAAGAATCAAAACATGCGACCAAGGAATCATCTCTTGATTTACGG
AAATTACATGATGAGCAGATCGAAATCATATCGGAAATTCCTCAATCATC
TCTTGATTTACGGAAATTACATGATGAGCAGATCGAAATCATATCGGAAA
TTCCTCATTCCTATCATAGTAAATCTTCAAATCAGAAGAGTCAACAACTT
GAAAtgATTCCTATCATAGTAAATCTTCAAATCAGAAGAGTCAACAACTT
GAAAtgAATGCCGAGCTGGATCATTTCGAAACCTTGATGCACAGCATAGA
TGACAAATCATTACTGCAACATGCTAATGCCGAGCTGGATCATTTCGAAA
CCTTGATGCACAGCATAGATGACAAATCATTACTGCAACATGCT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000225_pilon | genome | sc0000225_pilon:44627..52949 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 379-447:8255 |
| Aaloc | 331-378:7682 |
| Aaloc | 268-327:1040 |
| Aaloc | 229-264:817 |
| Aaloc | 160-225:431 |
| Aaloc | 1-156:1 |
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