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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000278_pilon:46876..52676+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045542 ID=XLOC_045542|Name=XLOC_045542|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5801bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000278_pilon:46876..52676+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTTGGAGCTTCAACCTGTTATCCTAGCTGGTGGTGAGGGATCTAA
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ACGCAAATCGATTATCTAATATTCCCATGGCgaattggcggccgcccact
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gccaatcctcgaaaacgagggctggatTACCAGGCCTCCCGCTGTAAAAT
CCTTGACACAGTCCGATTGCAAAATTCTGTAATATAAActttccagatgt
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tgcatctgggtgccagataagaaaatcgaacgtttgcttctatTTTGGCG
GAATTTATTACTTAAAAACCTCTATAGCGATTTACTGGTCAACATCATGA
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ATTAGGGTCCTCTAATTATTGTTcgttaatttttgaatttagttTATACA
CCCGCGATTTTTGCTATTTCTCGCGAAAACGtgtgaaattttgaaacttt
ctgtaattcgaaatgATTCCCAGTTCCTGTCAAAAACAAATATTGTCTTC
AATACGAATACTAGTAACTCTTTCATTCGAACAAAATTAGAATttccgtt
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GTACcttaaaaaaccgagttatgtaactcgaaaatttaatgtGATCCTGA
AATGACTGAGTTGTGTAACTCGGAAAATTAAGGTACACCTGAAAAAACTG
AGTTATGACGTTAAAACTCGGGTTttcataactcgggttttccaggCCTC
CTATGATATGAATCATCCTCTAATTCCAAGAAGTTTTTGTTTGTCTCTTT
AAGATCGAATAAGAGAAAGATAACCTGATTTCAAATACTTTTTGCTTCCA
TACTTTTCAGATATCCGAAGATGAAGATACAGAGCTCTTTAGTCGACGCC
CATCTATACATCATCAAAAATTGGCTTCTCAGCTATCTCGCTCAAAAACC
G Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000278_pilon:46876..52676+ >XLOC_045542 ID=XLOC_045542|Name=XLOC_045542|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1392bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000278_pilon:46876..52676+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTTGGAGCTTCAACCTGTTATCCTAGCTGGTGGTGAGGGATCTAA
ACTTTTCCCGTTGACTGATACAATACCAAAATGTCTTCTCCCAGTTGGCA
ATAAACCTATGATATGGTACCCGGTTCAATTTCTAGAAAAATACGGCTTT
CAAGATGGTTTTGGAGCTTCAACCTGTTATCCTAGCTGGTGGTGAGGGAT
CTAAACTTTTCCCGTTGACTGATACAATACCAAAATGTCTTCTCCCAGTT
GGCAATAAACCTATGATATGGTACCCGGTTCAATTTCTAGAAAAATACGG
CTTTCAAGACTTCATGGTGATTGTGCGCAAAGCATCAGCGGAGAAGATCC
ATGAAGCATTGCGAACACATTGTCAAGAAAGTTCCAAATTTCAGATGATT
TGTATCGATGATGACGAAGACATTGGAACAGCAGAAGCAATGGTTTTGAT
CAAAGATAAAACCAAGACTTCATGGTGATTGTGCGCAAAGCATCAGCGGA
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AGATGATTTGTATCGATGATGACGAAGACATTGGAACAGCAGAAGCAATG
GTTTTGATCAAAGATAAAACCAAGaCTGACTTATTGGTGGTGAGTAGTGA
TATGGTTACAGATCTTGCTTTACACCGGCTGGTTGATACGTATCGCACGT
ACGATGCTACGTTGTGCGCCGTCATGGCGAAACGTGTCGACGTACACCCT
CAAGTCGAACAGactaaatcaaataaaaagagTAAAATTACAGACCCGAA
TGTCGaCTGACTTATTGGTGGTGAGTAGTGATATGGTTACAGATCTTGCT
TTACACCGGCTGGTTGATACGTATCGCACGTACGATGCTACGTTGTGCGC
CGTCATGGCGAAACGTGTCGACGTACACCCTCAAGTCGAACAGactaaat
caaataaaaagagTAAAATTACAGACCCGAATGTCGGGACTCGCGATATC
GTTTCAATCGATCCGAAAGAAAAccgtttattatttttatcgAACGAAGC
AGATTTGGAACAGGAAACGATATCTTTCACTAAATCGCTACTCAAAAAGG
ACTCGCGATATCGTTTCAATCGATCCGAAAGAAAAccgtttattattttt
atcgAACGAAGCAGATTTGGAACAGGAAACGATATCTTTCACTAAATCGC
TACTCAAAAAATATCCGAAGATGAAGATACAGAGCTCTTTAGTCGACGCC
CATCTATACATCATCAAAAATTGGCTTCTCAGCTATCTCGCTCAAAAACC
GATATCCGAAGATGAAGATACAGAGCTCTTTAGTCGACGCCCATCTATAC
ATCATCAAAAATTGGCTTCTCAGCTATCTCGCTCAAAAACCG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000278_pilon | genome | sc0000278_pilon:46876..52676 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 607-696:5712 |
| Aaloc | 496-603:4884 |
| Aaloc | 313-492:2679 |
| Aaloc | 157-312:899 |
| Aaloc | 1-153:1 |
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