XLOC_045457 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045457
Unique NameXLOC_045457
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000064_pilon:916380..923660-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045457 ID=XLOC_045457|Name=XLOC_045457|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7281bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:916380..923660- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGGATCCTCTCATATGAAATACGTGAAAAGTTCAAGCGATTGCTTTGCTT TCTCTTATCAAAAACAGAGAAAATTGTAACTGTTTAACAATAAACAAAAG GGGAATAAAGTTTTGTTACATGATGCTGGTTGATACGGTTTTTCTTGTAG TCATGGTTTTAGCTAGCCAATGTTTATGTAAGCCATGGCCCAAACGGAGG ACATTTAGAAGTACAATGCTCCCGGAGAGGGCAAGCAAAGATAGAATGCA GGCTTTATACAATAGTAGATCGTCAGGATTGGCTTCAGTAATCAATAACC TTGGATCACACATTGAAAAGACTGAGTTATCCAGTTTCAATGGAATCGGC AATCTAAAATGGTTTGAAACATCGACTAGCACCGAGACACAGCAGTCACC GCAAGTCGTTCAAGAGCTAAATAACCAATTACCAGAATTCACCCATGAAG TCAACAGACATATACAATATAAATCATTACGGCGGAATGCACACAAGAGA CAGAAACGCACAGTACCTTTGCTATCACCTTCAAAGACAATGTACATCAT TGGGGAAACTGAAGACAGACCTTTAATTATGATCGAGAAGCAGCATAATA AGCTGATTATAAAGGTTGAAGAGCAACAGATCATTGACACAGACATACAA GAAGATAGAACTCCAGAAGAATCTATGACAACACAATCAAATCCAGATGA ACAAAAGAATGGGATTGAAATCAAAACACAATCGCGAGTACCATACTTGA AAAATCTACAACAACAAGTTAGAGCGCGATCAGCTGCAAGCAATCATCAT ATGCCTTCATATTTAGCCGGTGGAGATGTTGGTGGACATGGTATTAACTT TTTCGATGAAGATGGAACATTCAGTAAAGAAATCAGGTCGTCCAGTAAAA AGACTAATAAAAAACCAACACACTCGTTTGACGACAAAGACGGCGTTTTT ATACATGACGTTGACAGCCACGGTGACGATAAACATAAAGACGACATACA GATACCGGCAAAATTTCTTTATCTCTACGATAAAGGTAAGTGAAAAAAGT TTTTATCATCTCCCTTGAATACGAGTTTCCCAATGAGGGTAGACATAGGT AAAAATGTTTTTCGGTATGTGCAAGCGGTAAGGGCTTCTGTCTCACACCT CAAAATTTCCTGAGGTTGTTTTAAAAAACCAATCTTCTTTCTTAAAGGGT CTCACATTTATGAAAATTGAAAATTTCTGAACACCCAGATCACTAATATT TCTGTTGAATTTTGGTGAAAACTTTTTGAAATATTAGTATCTGTAATCAG TAATCTGGGTGTTTCAGAAATTTTCAATTTTCATGAATTTGAGACCTTTT AAGAAAGAAGATTGGTTTTTAAAACAACCTCAGGAGATTTTGAGGTGGAC CAAAAATTTGAACAAAATCCCTCTGAAGGATCCAAAAACATCAACATATT CGGCCAAATCTTTTGTGTATATTTTCTAATTTCCCTCTTATAATACCTCT TTAAACATACAAACAGGAAAAAATAAAATCAGAATAGAATATTTAAAAAT ATAATCAAAGCCGTGCTAGAAGCCTCAGGAGCAAAGAAACACAAGAAAAG GCAACTTTGCAGAGTTCAGGAAAACAATCTAAATTTCTTAAGAGGGCCCT TATACGGATTGTAGAGAGAATCAGCCCCCTACTCGAAAAATGACAATCAA AATGTACGCTCTATTTTGATTACAAATACCACGAATTTGTTGTATGTTTT GAATTTAGGATTAAAGGTTTAGCAATACTTTATCACGTTTTGATGTATTG TAAATAATAAACTAGATTTCAAAGTGCAAAATTAGCAAAACGTTTGGATT CATAGACCATGTTCACACGTTACTGTTTCATCTCGCTCCGGTATGACTTT TGTTACGGATCGAGTGTGTTCATATTGGTTTCGGAACGTTTTGGAGCAAG AAAACGGAGCAGTTCCGTTCCGATGAAAAAAGAGCAAAACCATTTCTGTT TTGCTTTGTTTTTTGACATTTCGAATTTTGACGTTCACACTTGTTTTTGG AACCGTTTCGTTTCGTTTCGTTTCGTTTCGTAACGTCTGAACATGGTCTA AGTAGTTGACCTTTCCTAAAAAAAACACATTAGCGTTTATAGTATACCCA TAGTATGATAGTTGATAGAAGAGAACCAATTTTAAAATGCTTAAAATATA TTATTAGGGGAAAACAAATTAAGCCGAAATTGTATTTTTTTTTCAAGCAA GTCGCCAATGTAGTTAGGCATGTTCAGAGTCTAGAGGTTATTTTTTTGTT TGTTATTGTCAGTTTTACTATAAATCTCAATTTTTCAGATTTTTCGAAAA GAATAAGGTGCAGCTATTAACCCCGTTTATTCAAGCCTGGGTTGTTTGTC AAAATAATTGAAAAAATGGCTCCGAAGAACTTAAAAGGCCTTGGAAAATC AAAATTGATCGGCAATTTTTGCACGCACGAAAAGAATGATTCGGTAGCAA ACGTTTTTAAAGAATGTCGTTACTATAGACATAATCTTTGATGCCAAAAA TCAAAGTATCACTTTAGATTGATTATTTGGCATGTGACAGAAAACGTTGG CGTGTGGTGCCTGTCATACGAAAGTAAAAACCTCAAATAATGAAGCTTTC TTTATGTTTATTCCTTAAGGCCGGTCTCCACTTGCGCGCGCTTCAATCGC ACTTTTTCTAGCAAAGCTTCCACGTTAATGATCGTCTACGTTATTGGTCA AAAGAAAAATGAAGCAACTCCTTTGGCGCGAGCTGACGTAACGGTTGAAA ACAGCTGAAATGTGTCAAACTTTTTTTTCGAGCACACGCTACATTTTCAT GACGTAATCTTTTTCCAAGCAAAAAGGATTGAAGCCAAAAAGTGCGATCC CAGCAGGAGCAAGTGAAGACCGGCCTTTAGTATTTCTTTGATGTATTGAG GTTCATTTAGGAGGTTAAAAAATCAAAATTCATTTGTGAAATAAAATATA TTGCGCCTTCTCTATCACTACACAATATTGGAGAAAACTAGATTTTGATA TAATTTTTAACTAGTGACGAACAAAACTGAGATAGAAATTTCGGGCTGAG GAGTTATTTTTCGTAACGGGAGACAAGCAGATCACGCGTGACTCTTCTTA GTCCTTTTGGGAATGTTATTGCACCTTAACCCCGCGTGTTCTTCCTTTTT TGACCCACGCAGTGCTTGGTCGTGTTTTTCATACCCTCTTCCGACCCTTG CATAAACTCGATTATTTTACCCATACGGGTCACTCGTCTCACCGTCGGAA TTTATCAATTAAATTGTTGAAGGTTGCTTCACTTAGCTTTGTAGATCTAT AGAGAACTATGATTTCGGGGGAAAGTTCTCATAATTCATCCTTAACATAG CAGCTATAGAATTGTAGTAGCTCAATAAAAAACATGTCAAAATTAACCTC AATATATTTTTTCTATAGGGGAAACCAATTACAACAGGGAGACAAGATTA ACAACCATCTCCATCAACTTGACAACGATACATGATGTAATAGACGGAGC CAAACTCAACCTACGGATATTCAACAACACCAAAATCAAAGCATTCTATT TAACAAATGTTGTGAAGTCTTTCAAAGTTCATCTCAGAAGAAGTTTATAC GATGTAACACAGATATTTAACACTAAATGGTTGACCATTGATTTTTCGAG GCAGTTGAAAGAATTGGTTAAGAAACATGGAAACAGGTAAAAACATTTAT GGTGATTTATGGACTATTTCATAGGATTCGTGCATCTGTTACTTGCTATT TTTTGTTCAGTTTAAAGGGGAAAATACACATATCGGTGCAGAGTTCCCCA TCGGGAAAGTTGTGTTTAATTACTACAATGGCGTAGAAAAATATCATGTA CTAAAAACACGAATCCTATGAAATAGGCTAATTATGTCTTAAATAGTCTA TACATAATCCATGTGTACAAGTGTCTTGAAATAAATTATTATTTAGGCTA CACACATCCCCTCTGATATGTTTTGATATAGGGGTTTCGTACAAAGATCT ATAAAGCCCGAAGGGCTAGATAGGCAATTTTAAGCTTTCTCCAGCAAAAA AAAGTGAAGCAAAAATTTAACTTTTTAAATTTCGTGCCGATGGATAGGAT CTAGCATTTTAATTGTTTTCGGAGCGCGAGATCAAAAAAAGTAGGTGGCA AACGCTATTTCACATCTCTTAAACTGGTGAAATTGCATATTTTAGTCACG TGACTTTGGTAGGAAATCCTTCCAAACCTAGGCTTCACTTTTCGATAAAA GCCGCAAATCTAGCCCTTCGGGCTTTACAGATATCTGTGGTTTCGTATCG TCCGAGAGAGTTGTTTTTCAGGGCTATATTTTGCGAACAGGCTGGTTGAA CGTTACGCTCTCTGTGTGTATTTTCTTAACAAACGAACGAGATTCGTATC AGTCTTATCAAATTCGTATCAATCAAAAAACAGATTACCACAAGGAAATT TTATACACGATACACATCTTTTTTATATCAAAATCAATCTCTGGGCCAAA TTAGTACTTTCTTTTGGCATAAGCACAAGAAAAAATCAAAAGAATCACTG TGACGGCTTCCTAAGTAAAATCGGGTTAAAAAGCTTTATTCTACAGTGGA GTCTCCATAACTCGAACCTTTTTAACTCGAATTTCGCCTTAACTCAAACA AGTCTGTTTGTCCCTAAGGACTAGGTATTTCAATTTCTACATGTAGAATC TGTCCGTATAGAAAATAATTTTTATCCACATCTGCTGATAGCCTTATGCG TGAAACACCGTGTAATGGCTGTTTTTAATTTTTGAAGAGAAACTAGCCGT ATGCGCAGCGTCGCACGCTGCGTGTCCCAATCCAGTGAATAACTACACAT CTAAAAAATTCTAACGGAAGAAAAACAGCCACCGATCGATGATTTGATTT TGATTTTAGGAAATAAAGGAGAAAAAAGATATCATTGCATTGCAATTTGT AACCACAATTAAATAATTGACTTAGCAAAAGAATATTTTAGATCTTCTTA GCCATCGTGGCTAGCCATCGTGGTTGGACATTCGAGGGTGACAGAAGGTT GATTTTAACCCATCAAGCTCCAAACTTGGTGAATAGAAAATAGCATCTTG GGGTCTCAAAGTTAGTCTAGTGGTAGGAAATCTGCTTAAGGTGCAATAAG ATGACGGTTCAACGCCATGAAGAGGAGGCTTTGTAGAGCTTTGTTAGATT TTCGAAAACTGTTTACAAAACGTTGTAAACACACACGTTTAAGCGTATTA ATATATAGATATATTAAATTGAAGTATGCTGGTATCTTCAGTAAACCAGA CCTTATAAACTAGTCTCGAATTTTCCATAGATCGAACAAATTTGCGCCCT CCCCTAGGCTATCGAGTTATGGAGGTTTCTCACCGTGAATTATTACTAAA ATGTAGAAATTAACAAAAATTTGATTTTTTAGAAAAGTTGAAAACAATCG ATTATATGAAAGTAATCAATTGTAAATGATGCATTCCATCGGAAATTTGA TGTAATATTTTACCCCCTTCGTTAATTGCGTAGAAAAAATGCGGGTGGCG TCTAATGTAGGCTAATTCTACCCCCGTCCCTTTGAATGAATTTAGTTGAC CCAAGTGATCGTATATCTGTTTCACATTTGCTTTATACAGTCAACTCTCT ATAATTCGAACCTCTATTATTTGGATTTTTCTGTAATTCGAACTCAAGTA TTGGTCTCCTCAGCTGGAAAGATGTGTATAAGGCTCCCTGTAATTCAAAT CTTTGTCTCGTTCAAATAAAATTGATGAGCTATGTAAAACAATTTCGAAT ATACAGTCAACTCTCTCTAATTCGAATTTATAAATGAATTTTTCTGTAAT TCGAACTTAAGTATTTGTCCCATTAGGCTAGAAAGTGGTTTGAATTATTT CCATAAATCGAATCTTTCTATAATTTGAACAAAATTTTAAGCACCTTGAA CATCGTATTAGATATGGATATCAATGGTATGATAGTTGAACAAAAGGAAA CATAAGACTTGTTCGAGTTAAGGAAACATTCGATTTATAGAGGTTCAAGT TATAGGACTGCAACATTGTATGATATGGCATGACTGAAACCATGATTTAA TGCACGCTTTACAATATATTATCCACCCAAAATACACACTTTTATATAAG AGCTAGCATATTTGACTGCGAGAGATCAGATGTTCTTATTTTTGCATATT CCTAGGGTCAATTGTTCTCAACTTATTCTTACTTTCTTTGAGAACTTTAA TACCTTTCAATTTTTAAACATTTTCAAAATCATACATTCTCAAATTATTC CTAAAACCTTTTAGCTTTAAGCAAAAATTGAGGTTCGTGTTCTTATAAAA AGCATGTATACTTAATAGGCTTAGATAAACAAGGAGAATAACCACTTCTT GGCTTCTTGAAGTACTTTTGGAACCATCAATTCGTGTCCCCTCCCAATTC CAAATTTCATCTTTAGTAAAAACCACTTTGCACTTTCCTATTCATAATAT AACATTACAATTTAAAACTCAAACGGTCAAATTTCATAAAATTTACCCAA TTAAAGCGAACAACAAAGATATTTCACCCGGATTTCACCAAGCTCTTGAA TGAATAGGTTTTTGACTCGAAAGTTTTTATCCAGCTTTCACAATACCAAT CTGCTTGATAATGAAAAAAAGTCACGGTGATAGTTTAAAGTTCATGGCGA ACGGCAATGATTGTACATATAGTCAATATTCTTATCAAAAATTTAAATCC TCTATAATTCGAAATTGTCAATCGTAAAAGATTATTGGCCCGTTAAGGAT TGAATTAGAGAGAGAAAGTTAACTGTAGCTTTCTTTCACTTTCATTTTTC AGTATGCTGTTACGTATCCAGATCACGTCGACTGATCGAGCAACGTCACT CAAGCAACGTAAAGAAACATACGTCAAGTTAGCTATCAAGCCACCGAAAA CTCGTACTAAAAGACATAAAGATACCGATTGTGCGCTTAAATCCTCCTAT TTGAATCTAAGCGATCTTGGTTTGAAATCTTTAACACTTTGGGATAATAA ACTAGCGATACGATATTGTGTTGGCAAGTGTAATGGTAAAAATGGCCAGG GTGACGTCAAATGTTGCGTGCCGAGTAAATGGGGTAAACGTGAGGAGCAT ACGGTGCGGATAGGTGGGGTGCACGGTATAATGACAGACATTTTTATTGA AAAAAATGTTTTAGAATGTGAATGTAGGTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000064_pilon:916380..923660-

>XLOC_045457 ID=XLOC_045457|Name=XLOC_045457|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3364bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:916380..923660- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGGATCCTCTCATATGAAATACGTGAAAAGTTCAAGCGATTGCTTTGCTT
TCTCTTATCAAAAACAGAGAAAATTGTAACTGTTTAACAATAAACAAAAG
GGGAATAAAGTTTTGTTACATGATGCTGGTTGATACGGTTTTTCTTGTAG
TCATGGTTTTAGCTAGCCAATGTTTATGTAAGCCATGGCCCAAACGGAGG
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GGCTTTATACAATAGTAGATCGTCAGGATTGGCTTCAGTAATCAATAACC
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TGGGGAAACTGAAGACAGACCTTTAATTATGATCGAGAAGCAGCATAATA
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ATGCCTTCATATTTAGCCGGTGGAGATGTTGGTGGACATGGTATTAACTT
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TAGATCGTCAGGATTGGCTTCAGTAATCAATAACCTTGGATCACACATTG
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GAAACATCGACTAGCACCGAGACACAGCAGTCACCGCAAGTCGTTCAAGA
GCTAAATAACCAATTACCAGAATTCACCCATGAAGTCAACAGACATATAC
AATATAAATCATTACGGCGGAATGCACACAAGAGACAGAAACGCACAGTA
CCTTTGCTATCACCTTCAAAGACAATGTACATCATTGGGGAAACTGAAGA
CAGACCTTTAATTATGATCGAGAAGCAGCATAATAAGCTGATTATAAAGG
TTGAAGAGCAACAGATCATTGACACAGACATACAAGAAGATAGAACTCCA
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AAGTTAGAGCGCGATCAGCTGCAAGCAATCATCATATGCCTTCATATTTA
GCCGGTGGAGATGTTGGTGGACATGGTATTAACTTTTTCGATGAAGATGG
AACATTCAGTAAAGAAATCAGGTCGTCCAGTAAAAAGACTAATAAAAAAC
CAACACACTCGTTTGACGACAAAGACGGCGTTTTTATACATGACGTTGAC
AGCCACGGTGACGATAAACATAAAGACGACATACAGATACCGGCAAAATT
TCTTTATCTCTACGATAAAGGGGAAACCAATTACAACAGGGAGACAAGAT
TAACAACCATCTCCATCAACTTGACAACGATACATGATGTAATAGACGGA
GCCAAACTCAACCTACGGATATTCAACAACACCAAAATCAAAGCATTCTA
TTTAACAAATGTTGTGAAGTCTTTCAAAGTTCATCTCAGAAGAAGTTTAT
ACGATGTAACACAGATATTTAACACTAAATGGTTGACCATTGATTTTTCG
AGGCAGTTGAAAGAATTGGTTAAGAAACATGGAAACAGGGGAAACCAATT
ACAACAGGGAGACAAGATTAACAACCATCTCCATCAACTTGACAACGATA
CATGATGTAATAGACGGAGCCAAACTCAACCTACGGATATTCAACAACAC
CAAAATCAAAGCATTCTATTTAACAAATGTTGTGAAGTCTTTCAAAGTTC
ATCTCAGAAGAAGTTTATACGATGTAACACAGATATTTAACACTAAATGG
TTGACCATTGATTTTTCGAGGCAGTTGAAAGAATTGGTTAAGAAACATGG
AAACAGTATGCTGTTACGTATCCAGATCACGTCGACTGATCGAGCAACGT
CACTCAAGCAACGTAAAGAAACATACGTCAAGTTAGCTATCAAGCCACCG
AAAACTCGTACTAAAAGACATAAAGATACCGATTGTGCGCTTAAATCCTC
CTATTTGAATCTAAGCGATCTTGGTTTGAAATCTTTAACACTTTGGGATA
ATAAACTAGCGATACGATATTGTGTTGGCAAGTGTAATGGTAAAAATGGC
CAGGGTGACGTCAAATGTTGCGTGCCGAGTAAATGGGGTAAACGTGAGGA
GCATACGGTGCGGATAGGTGGGGTGCACGGTATAATGACAGACATTTTTA
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CCAGATCACGTCGACTGATCGAGCAACGTCACTCAAGCAACGTAAAGAAA
CATACGTCAAGTTAGCTATCAAGCCACCGAAAACTCGTACTAAAAGACAT
AAAGATACCGATTGTGCGCTTAAATCCTCCTATTTGAATCTAAGCGATCT
TGGTTTGAAATCTTTAACACTTTGGGATAATAAACTAGCGATACGATATT
GTGTTGGCAAGTGTAATGGTAAAAATGGCCAGGGTGACGTCAAATGTTGC
GTGCCGAGTAAATGGGGTAAACGTGAGGAGCATACGGTGCGGATAGGTGG
GGTGCACGGTATAATGACAGACATTTTTATTGAAAAAAATGTTTTAGAAT
GTGAATGTAGGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045457XLOC_045457-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000064_pilongenomesc0000064_pilon:916380..923660 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1309-1686:379
Aaloc1042-1305:3812
Aaloc982-1038:6305
Aaloc835-978:6449
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Aaloc1-66:7282