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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000063_pilon:1471150..1476314- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045424 ID=XLOC_045424|Name=XLOC_045424|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5165bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000063_pilon:1471150..1476314- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGACGTTAATAAAATATGTAGCTGGTTTGTTGGTTGCAAAATATGG
TTTAGATTTTGTTTTGTTTTTCATGAGAATGATCAAATTGTATTTGTTAC
CGAACCTGGGTCTTGGTTTGAAGTTGAAAAAATATGGCTCCTGGGCAGGT
GAGTGACTTCATGAAGATCTACATCATGATTAGTTTAAAATCCAATTTGC
AATTCATCCCTTTAAAAAAAGGTCAAAACTTCTAAGTTTCTCCCTTTTGT
CAAAAATTATTCTAAAGGAGAATTAGATGACTTTAGATATTTTGCCTGCT
GAAATTCACTATGGTTCTTAGCAAAACCTCCAAACATTTTCCTAATTTTC
CTAATTTTTCAAAGTCAATAGAAATTAGAGAATTTCTGCTATTATTAAGA
ATAAAAACGTTCTTGTCACTTTCAGTCAATAAGATGTTTTTTAGAAATAA
GTCATCTTTTTGATACTGATTTCTCTTAGTGGTGACTGGAGCTACAGATG
GTATCGGCAAAGCAATTGCAAAGCAGGTAACAACGATTCTAATTGAATTC
ACTTTATTGATAGGGTGTTTCAACTACTTTTAAGACCTACTTTTTCTTTT
TAAGAAACTAGTTTTACCAAGCAGCCTCAATGTTTCTTAAGAAATCGGAC
TTTTGAGCCTTAAATGTTTTTCTAAACTTTGTCAAGCTTTAAAAGAAGCA
TGTCGATAATACAATAGTCTAATAGACTAACTAATCTACAGTACTTTCCT
ATCTTCTATATTGATTTTCTGACTTTCTCAAGTGCTTCTAACTGTTATGT
TAGGTTCTTAAAAAAGAAATCGAATTAAAAAATGTGATTTTCTCATTCTG
AGCCTCAGCATGTTTCTTAGATGTTTATTAGTTTTTAAGCATTCTGAGCC
TCATGTTTCTTAAAAGTGTGTTTCTTTAAAAAAAAAAGTGCATTACCTAA
ATCAACTATTTTAATTGCTCTTGTTGCATCAACGATTTTCTAAACTTATA
TTCTAGTGACCAGAATAAGATACTGTAAATATAAGATTGGAAAATTAATT
CTCCCCAATACTTTGAGGTTATTTAGAGGTTGCGGGAATAACGACCAATG
TGCAAGGTCAAATATAGTGAAGGGGAGGCTTTTCAATGTAAGTTGAAAGA
TAATGATGAGAACATAATTGTAGAAACACTTTGTCAGAATGATTAGATAA
CAATCTCATTTTATTCCGTTGTAGTTAGCGAAACGGGGGATCAACTTGGT
TTTGATAAGTCGTTCAGAAGAAAAACTCAAAGCCACAGCTCAAGAAATTG
GTAAGTGCATGATTCATGATTTAGCCCTGAGGTGCTCAAGATAAGTGGTC
TTAATTAAGGGTATCTTTTTTCAGGTTTCATAAAGTGCACTGTTAGGGTG
GACAAAGTGAGAACAACAAAGTTTTTAGGGAAAATTGCTGAAAATTTTGA
TGGCTGACCATCTCTCAAGAAAATGCATTTTAATTAAGAGTGGAATTTTT
GCCCAGATTTTACCCACTTACCCATTTGTTCTGCACTGTATAGGTCAATA
ATTTAAAAGGCATCATTTTGGGCTGTACATGCAGTAGTTTTCGAGTGCAA
CCCCCCACAAGGATTTTACAGCTTCTTTGGTTTAGATTCAAAGTTTCTAT
CGTCACTGTTAATACCCCCCCCCAGGCTTTATCAATAAAATATTTATTTT
TTACCAAATTATCTTGAACTGTGGCACAGTTTGCTCGCTACTAATAAAAT
GTGACATACTATGTAACATACTACCCACACATTGAAAGACAAGGAAAGAT
TTAGTTAAAAAGATATCTACCCAAGCACAGCTTTCAGGGCTCATCTTAGC
CAGTGCTGGCATCGTATCCAACTAAGCCCTCAGATGTAAATTCACTAGAT
AGCATAAAATAAATTATCTCTTTGTTTCAAGGCAGGAAAGTGGATGTAAA
AACCATCTCTTATGATTTCTCCAACCCAGAGGATTATTCAAAGATCGAAA
CAGAACTGAGAAACTTGGATATTGGTCTGCTTGGTAATAATATAACATTG
TTTGTAATTGCATAAAAATGTATTGAGTTTGAATTTTTCGAATAAAGAGT
TTTTCTTTTTTTATCTGTTTATATGTAATTTTTCGGTCTTCCCATATTTT
TCATTCCATTGGAAGATTTTTTTAAAAAATCGTTAGTTTTTATGAAAATA
AAAATTTTTTATACCTATTTTTCTTTCCAGTGAATAATGTTGGAATGGGT
TATGATCACCCTGATTTTTATCTCCACTATGGCGAACAAGTATATTTTCT
TTAAAACAGTTTTAAATGTTTATTGTTGTTGTCCTTTATGTTAATTTTCT
CTTTTTATTTACACGAAAACAGTTGTTTGTGTGTGTATCTTATTTTTTGG
CAAAACCATAAAAATATGAACATCAAAATTCAAAGTTTGAAAAATCCCTA
GGAATATGATAGAAATGTGTCCAAAATAGAGCGAAATATTATTCCTGCGA
AATGTGATTTTTTCGACCGGAAAAATTAGTTTCCTTTGAAATTAGTCCCC
TGAAGGTATAATACTTAGTTGATAATGACACCCTTTACCGTTTCATTCAT
TTTAGTATTTCGACAAGATGATTGACATCAATGTAACTTCAGTATTGAAG
GTTTGTCAAATCTCTTTTGAATCTTTCTGGTTGTTAAATTGATGTGCGTT
CTTTGAATGCCACACCTATGAGAACTTTTCTTTTGCAAGGTCAATACTCT
GTAGCAAGTGTAGCAAGTTACCCACTACGAAAGCCAGCCTCATTAATTAG
AGTGAAAATTTTTTGATTTTTGATGATACTATTTGTAGTGTAGCTTTCTT
TGACCGACTGCAAAAACAGTCTGTCAGATTCTAGTTGCTTGAAATGTAAA
AGGATTAAGTATTTGTTTATATTTAAAAACAGGGTTTTTCAAATTAGCTT
TTTTGGGTTCTCATTTTTTCAACTCGAAGTAGCTATTGAAGGGTTATTTG
GATTTTAGTGTTTTTCTTTCAAAATGGAGGCTTCGTCGAGTGGTTCAAAT
CTTCTTCATGTTCAGACAGAAATAAACTCCAGACCATGCTATCCGTTGAT
TCAAAAGAAGAAAAAGAAAAAAATTAGCCATTGAAATAAAATTTTTCTAA
TTTTCAGATGACAAGAATTGTTTTGGATGGTATGGTACAAAGGTGTGAAT
CTTTATGATTTCTTTTCATGTTCTATCTTTGAAATGTTTTGAGACAACAG
ACAGCCAAAGGTACTGCTTTCCCTTGTTATCCTGCTTCTCATCGCCTACT
CAAGTGGAAATGAGATGAAATGCAACACTTTTATGCAACAACGTTAACTA
GATTATGATTTTAGTGGTATGATCTTCTTTTCTATCGAGTTATATGAAAA
ATTGTAATTTCCATTTTCTTTTCAATTTAGGAAGAAGGGATTATTGGTTC
ATGTTTCATCTGCTTCTTCACTAATGCCAATTCCTTTCTTGTCTGGTTAC
AGCGCTTCCAAGGTATCCTAACCAAGACTTTCCCATCAATATATTGACAC
TGCGCAGTATAAATTCATTAAATAAATAAAGTATTTTATCTGAAATCTTC
ACTGTGTGATATCTGGATTTAAGAGAAAACACATATCAAGCCTCATTCAA
CTGAGGTCCTTTCTTTTGCTCTTCTCACATTTGCAGTTCATTATTGCGTT
GGTAACCTGAGGGGAACAACGATAACTATGTGATTCTCTCTGTTCTCTTT
TTCCAGAGCTTTGTCAACAACTTTGGTGAATCTCTACACTATGAATACAT
GGCGAAGGGAATCAAAAGTCAGGTTGGTAGACTCGCTTTATATAAACATG
AGCTTTTCCCGAAACTTTTGATAATTTTGGGCATTTTTCCAGGGAAGATC
TGCCCAATTATTTGGCTTGAAAAGGTTCGTCCATCTCCCTTTATGGACAT
TAAAAGGAACAGCCAGTTTCCTGTTCTCAACTTCAGTTGAGCTACAATCT
GACAATGTCTGTGTGTGTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCACAAAAACTTTAG
GGCAGCCTGGAGACTTCAAAAATGCTTGGATTTAGCTGAAATTTGGCACA
CTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGTGGTGTTTTTTTCATTTTTTGAAAAT
TTTGATTTTTGGGGCCTGGGGACGAGTTTTTCGCTAAAACAAGGCTAAAA
CTTTGGGGCAGCCTGGAGACTTCAAAAATGGTCGTATTTGGCTGAAATTT
TGCACACTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGGTTTTTTTTTTTTCATTTTT
TGAAAATTTTGATTTTTGGGGCCTGGGGACGAGTTTTTGGCTAAAACGAG
GCTAAAACTTTGGAGCAGCCTGGAGACTTCAAAAATTGTTTGATTTGGCT
GAAATTTTGCACACTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGGGAAGTTTCTTCC
ATTTTTCAAAACTTTTGATTTTTGGGGCCTGGGGACGAGTATCTCGCCAA
AACGAGGCTAAAACCTTAGGGCAGCCTGGAGACTTCAAAAATTGTTTGAT
TTGTCTGAAATTTTGCACACTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGGGATCTT
TTTTCCATTTTTCAAAACTTTTAATTTTTGGGGCCTGGGGACGAGTATTT
CGCCAAAACGAGGCTAAAACCTTAGGGCAGCCTGAAGACTTCAAAAATTG
TCAGATTTGGCTGAAATTTGGCACACTTTTTCCTTTGATGAATATCTTGG
GGTCTACAATTGGGCCTATAAATTAAATCAAAGAAATTAAATTTGTGTTG
AGTCGACTTTTAAATATTATGGCTTCAAAAGTAGCTATGAAAATCATAAT
TGAACAAATTCTGAGTGATTGAGGAAAGCTTTTTTATTTTGACTTTTTCG
GCAGGTTGTGTTCCCTTACTTCGTGGCTACCAAGATGTCAAAGATGCGTT
CTAATGGTTTTTTAGTTCCCAGTGCCGACCAGTACGCTTGTCAAATGGTA
AACGCCATTTGTTTAACGCCCACTATGGCGGGGTACTGGGCACACGAGTT
GTTCCTTGCTGTTTCCACCCTTCTCCCTAGATGGCTTGTGATTGGTCAAA
CGCGCAAAATGATGGATGCTACTCGAAGAAGATGGGAAAAGAAGCAACAA
GCCAAAAAAGATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000063_pilon:1471150..1476314- >XLOC_045424 ID=XLOC_045424|Name=XLOC_045424|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1842bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000063_pilon:1471150..1476314- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGACGTTAATAAAATATGTAGCTGGTTTGTTGGTTGCAAAATATGG
TTTAGATTTTGTTTTGTTTTTCATGAGAATGATCAAATTGTATTTGTTAC
CGAACCTGGGTCTTGGTTTGAAGTTGAAAAAATATGGCTCCTGGGCAGAT
GGAGACGTTAATAAAATATGTAGCTGGTTTGTTGGTTGCAAAATATGGTT
TAGATTTTGTTTTGTTTTTCATGAGAATGATCAAATTGTATTTGTTACCG
AACCTGGGTCTTGGTTTGAAGTTGAAAAAATATGGCTCCTGGGCAGTGGT
GACTGGAGCTACAGATGGTATCGGCAAAGCAATTGCAAAGCAGTGGTGAC
TGGAGCTACAGATGGTATCGGCAAAGCAATTGCAAAGCAGTTAGCGAAAC
GGGGGATCAACTTGGTTTTGATAAGTCGTTCAGAAGAAAAACTCAAAGCC
ACAGCTCAAGAAATTGTTAGCGAAACGGGGGATCAACTTGGTTTTGATAA
GTCGTTCAGAAGAAAAACTCAAAGCCACAGCTCAAGAAATTGGCAGGAAA
GTGGATGTAAAAACCATCTCTTATGATTTCTCCAACCCAGAGGATTATTC
AAAGATCGAAACAGAACTGAGAAACTTGGATATTGGTCTGCTTGGCAGGA
AAGTGGATGTAAAAACCATCTCTTATGATTTCTCCAACCCAGAGGATTAT
TCAAAGATCGAAACAGAACTGAGAAACTTGGATATTGGTCTGCTTGTGAA
TAATGTTGGAATGGGTTATGATCACCCTGATTTTTATCTCCACTATGGCG
AACAATGAATAATGTTGGAATGGGTTATGATCACCCTGATTTTTATCTCC
ACTATGGCGAACAATATTTCGACAAGATGATTGACATCAATGTAACTTCA
GTATTGAAGTATTTCGACAAGATGATTGACATCAATGTAACTTCAGTATT
GAAGATGACAAGAATTGTTTTGGATGGTATGGTACAAAGATGACAAGAAT
TGTTTTGGATGGTATGGTACAAAGGAAGAAGGGATTATTGGTTCATGTTT
CATCTGCTTCTTCACTAATGCCAATTCCTTTCTTGTCTGGTTACAGCGCT
TCCAAGGAAGAAGGGATTATTGGTTCATGTTTCATCTGCTTCTTCACTAA
TGCCAATTCCTTTCTTGTCTGGTTACAGCGCTTCCAAGAGCTTTGTCAAC
AACTTTGGTGAATCTCTACACTATGAATACATGGCGAAGGGAATCAAAAG
TCAGAGCTTTGTCAACAACTTTGGTGAATCTCTACACTATGAATACATGG
CGAAGGGAATCAAAAGTCAGGTTGTGTTCCCTTACTTCGTGGCTACCAAG
ATGTCAAAGATGCGTTCTAATGGTTTTTTAGTTCCCAGTGCCGACCAGTA
CGCTTGTCAAATGGTAAACGCCATTTGTTTAACGCCCACTATGGCGGGGT
ACTGGGCACACGAGTTGTTCCTTGCTGTTTCCACCCTTCTCCCTAGATGG
CTTGTGATTGGTCAAACGCGCAAAATGATGGATGCTACTCGAAGAAGATG
GGAAAAGAAGCAACAAGCCAAAAAAGATTGAGTTGTGTTCCCTTACTTCG
TGGCTACCAAGATGTCAAAGATGCGTTCTAATGGTTTTTTAGTTCCCAGT
GCCGACCAGTACGCTTGTCAAATGGTAAACGCCATTTGTTTAACGCCCAC
TATGGCGGGGTACTGGGCACACGAGTTGTTCCTTGCTGTTTCCACCCTTC
TCCCTAGATGGCTTGTGATTGGTCAAACGCGCAAAATGATGGATGCTACT
CGAAGAAGATGGGAAAAGAAGCAACAAGCCAAAAAAGATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000063_pilon | genome | sc0000063_pilon:1471150..1476314 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 661-921:262 |
| Aaloc | 595-660:1410 |
| Aaloc | 514-594:1735 |
| Aaloc | 478-510:2009 |
| Aaloc | 433-477:2561 |
| Aaloc | 376-432:2934 |
| Aaloc | 274-372:3233 |
| Aaloc | 196-270:3942 |
| Aaloc | 151-195:4685 |
| Aaloc | 1-147:5166 |
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