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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000048_pilon:1372728..1379223- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045305 ID=XLOC_045305|Name=XLOC_045305|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6496bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048_pilon:1372728..1379223- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGGAAATGTACCGACCAAAAGTTCGCAAATATTCCCCAGTGAAAAC
TTCTGTCTTCACTATGGGAGAATACGACTTTTATTTCGCAACTCGAACAC
TTGAAATGTAAGATTTTAGTTTGATTTCTTTTATCTGATTGGCATCTGAT
TGTGGCTTCAAGTTTGTTTTAGATAACAATAAAAAAGTATTTTGTCAAGC
TTTCGAAGTGGACTGTTAGTATTGGTATACACTTTCTACTATTTTTTGTA
AGAAAAAGTAATTTTTTGTTGAGCCTCAGCTGTTCTTATTTTTTCAGCAC
TTTGTAAAAAAAACTAGAATTTAAACTACATAGGAAAGACAAGAAGTAGA
GATGGAAGCTAATCTGAAATCTACTTTACATTGAGCCTTGATGAAACAAT
TTTACAAGAGAACAACGAGGCTTAAAATCGCTAAAAAATAAGACCAATTT
AAGAACAATTGTTGTTTAATTTTTAAGAACTAATAAATAAAGGTAATATC
ACCGTCTATCAAGAGTTATTGATTTGATTCTTATAAAGTATATGCTTATA
AGAAAAATAAATAAGCTCATATTGTGTGCCATCCCTTGTTTACTTTGTAA
AAACTTATTACCGAAAGGTATATCACCGTCTATCAAGAGGTATTGATTTG
ATTCTTATAAAGTATATGCTTATAAGAAAAATAAATAAGCTCATTTTGTG
TGCCATCGCTTGTTTACTTTGTAACAACTTATTACCTAAAGGTATATCAC
CGTCTATCAAGAGTTATTGATTTGATTCTTATAAAGTATATGCTTATAAG
AAACATAAATGTACTCATATTGTGTGCCATCCCTTGTTTACTTTGTAAAA
ACTTATTACCTAAAGGTATATCACCGTCTATCAAGAGTTATTGATTTGAT
TCTTATAAAGTAAATGCTTATAAGAAAAATGAATAAGCTCATATTGTGCG
CCATCCTTTATTTACTTTGTAAAAACTTATTACCTAAAGGTATATCATCG
TCTATCAAGAGGTATTGATTTGATTCTTATAAAGTAAATGCTTATAAGAA
AAATGAATAAGCTCATATTGTGCGCCATCCTTTATTTACTTTGTAAAAAC
TTATTACCTAAAGGTATATCATCGTCTATCAAGAGGTATTGATTCGATTC
TTATAAAGTAAATGCTTATAAGAAAAATGAATATGCTCATATTGTGCGCC
ATCCTTTGTTTACTTTGTAAGAACGAATTACCGAAAGGTATATTACCCTC
TATCAAGAGTTATTGATTTGATTCTTATAAAGTAAATGCTTATAAGAAAA
ATGAATAAGCTCATATTGTGCGCCATCCTTTATTTACTTTGTAAAAACTT
ATTACCTAAAGGTATATCATCGTCTATCAAGAGGTATTGATTTGATTCTT
ATAAAGTATATGCTTATAAGAAAAGTAAATGTGCTCATATTGTGTGCCAT
CCTTTATTTACTTTGTAAGAACTAATTACCGAAAGGTATATTACCGTCTA
TCAAGAGTTATTGATTTGATTCTTATAAAGTATATGCTTATAAGAAAAAT
GAATATGCTCATATTGTGCGCCATCCTTTGTTTACTTTGTAAGAACTAAT
TACCGAAAGGTATATTACCGTCTATCAAGAGTTATTGATTTGATTCTTAT
AAAGTAAATGCTTATAAGAAAAATGAATAAGCTCATATTGTGCGCCATCC
TTTGTTTACTTTGTAAAAACTTATTACCTAACGGTATATCATCGTCTATC
AAGAGTTATTGATTTGATTCTTATAAAGTAAATGCTTATAAGAAAAATGA
ATAAGCTCATATTGTGCGCCATCCTTTGTTTACTTTGTAAAAACTTATTA
TTTAAAGGTATATCATCGTCTATCAAGAGTTATTGATTTGATTCTTATAA
AGTAAATGCTTATAAGAAAAATGAATAAGCTCATATTGTGCGCCATCCTT
TATTTACTTTGTAAAAACTTATTACCGAAAGGTATATCACCGTCTATCAA
GAGGTATTGATTTGATTCTTATAAAGTAGATGCTTATAATAAAAATGAAT
AAGCTCATATTGTGCGCCATCCTTTATTTACTTTGTAAAAACTTATTACC
TAACGGTATATCATCGTCTATCAAGAGTTATTGATTTGATTCTTATAAAG
TAAATGCTTATAAGAAAAATAAATATCCTCATATTGTGCGCCATCCTGTA
TATCACCGTCTGTCATGAGTTTTTGGTTTAATTCTTATAAAGTATATGCT
TATAAGAAAATAAAGAAAAAATCACAACTGTGAAGCTAAAGACACAAAGG
TATATGACGTAATCCAAAGAAAACCCGCGAAAATTGTCCGTGGTTATACG
AGCGTGTAATTTGTAAATTAAATTTAGTGAGTTCGTCCACCGTATCGAGT
ACTTTCGTTTTCTAATTTTTTTTCCGATGACACCAACACCGCCGCCGCGA
AAGGCTATCGTAATACTTTCGCTAGGCGAAATTAACAAAATTGAGTTGTC
TTAGGCTTAGATAAGCTTTTTAAATATTTCCCTACTATAGGGGAATATTT
GTTAAAACGGCCTTTTTCCGTCTTTTCTTCCATTTTCGATGTTAATGTTT
TCTTTATTCGTGCTGCACATTATGACTAGGCTCTTCAGTCACGTGACTAA
AAATCGTCGCGAAGCTTTAGCGGGGAAGAAAATAGTATCCTTTCTATCAA
AATATGGCAGGGGTTTTTACCAGCTTTTCATAAAACAAATGATTGTGTGT
AAAGCTCAGAAGACTGCCTGAGTTTCTCTCGTGTGTGCTGAATTTATATT
TTCCATAAGGAGAAGAAGAAGGGTAGAGAAAGAAGCTGAAACACATGGAA
ATCCAATCCATTCCTATCTTGACTTGAGAAGAAGGTGAGCATAAATTTCT
TTCTGATTTCCATCATGTATATATTGTCTAGATATTAATGGTCAAAACTT
GGAAAAGCTTGCACTCTTCTCAGTGCCCCATTTGTAGCCTTGATGCCAGA
TGCTAAAAAGAAAACTAGATCATAATAGATGCTTTTACTCCCTGTTTACT
GTACCTTTTTGTATGCTCCCCTCCCTTGTATCTTTTGTGTGCGCTCTCTG
GGATCCTTTGGTACGTTAGGACCCTGTCGACGCACGGTACTATCTGTTGT
ATTTGTCCGGTGGCAAAAAGTATCCTTTCGCTACACCGGACAAAATAAGT
CCGGTGTTCGTTAAGTCCGGTGCGTCGGCATGGTCCTGGTACGTTTTGTG
TGGTCCTTTTTGTACTACCCATGGTCCTTTTTGAATGCTTTCAAGGTACC
TTTTGTACGCTCTCCGTTGGTCCTTTTTGTGTGTTTCTGGGTACCTTTTT
GTACGCTCCCCGTGTACCTTATTGTACGTTGTTCCAGTGTATCTTATTGT
GCCGTTCCCCGTATACATTATTGTACGTTCCCCAGTACCTTATTGTATGT
TCCCTGTGTATATACCTTATTGTAGGTTCCCTGTAGGTTCCCTGTGTACC
TTATTGTGCGTTCCCCGTGAACCTTATTTTATGTTCCCGTCTACCTTATT
GTATGTTACCAGCGTACCTTATTGTACGTTCCCCTTGTACCTTATTGTAT
GTTCCCCGTGAACCTTACTGTACGTTCCCAGTATACCTTATTGTATGTTC
CCCGTGAACCTTACTGTACGTTCCCAGTATACCTTATTGTATGTTCCCCG
TGAACCTTACCGCACGTTCCCAGTACCTTATTGTATGTTCCCCGTGAACC
TTATTGTACATTCCCAGTGTACCTTATTGTATGTTCCCCGTGAACCTTAC
TGTACGTTCCCAGTATACCTTATTGTATGTTCCCCGTGAACCTTATTGTA
CGTTCCCAGTATACCTTATTGTATGTTCCCCGTGAACCTTACTGTACGTT
CCCAGTATACCTTATTGTATGTTCCCCGTGAACCTTATTGTACGTTCCCA
GTGTACCTTATTGTACGTTCCTCGTGTACCTTATTGTATGTTCCCCTTGT
ACCTTATTGTACGTTCCCCTTGTACCTTATTGTACGTTCCCCTTGTACCT
TATTGTACGTTCCCCTTGTACCTTATTGTACGTTCCCTGTGAACCTTATT
GTATGTTCCTCGTGAACCTTATTGTATGTTCCCAGTGTACCTTATTGTAC
GTACCCTGTGGTCCTTTTTGTACGTTCCCGTAAACTTCTTTAATGGCTCA
GTTTATATGCATGGCAAACATAGCTCAAACCATCAAGCAGAGTCTCACCC
TTTTAAAGCCTTTTTTTGGGAGATTTCAGCGAATGACCACACATTTGGCA
TTGATTACTGTAAAGAGATTATTTCCCATTATGAAATTTTGAATTTTTCT
TTCCTTTCACATTCAGGTGCCAGGATTACAAATTCAACAAAGTTTGACGA
CCTCTAAATCTGACAATACAATGTAACTTGCTGGCAATGATGTAATGATA
ATGTTGCACACAATGAGAATATGAACAAAGATAAACATTCTTGCAATAAT
TGAACCAAGGAACTCTATTGTTCCAAGATGTGATTTAATGATCAATGATA
CCAATGTCATGGAGTTTAGTTTATCAAGACACAAATTTCACAAAAAAGTT
TGCTGGAAAGTGTTGTAAATATTCAGCAATACTGTAACTAAATGTGACAA
TTTCAAGGTTGACAATTTGGTATATTATCACATGAATACTAATGTAACAG
ATGTTATGCACTGGAAATCTAAATCTGTAAAGAAGGAGATCCATTTTTAA
GTAACTTTTTACTTGTGGATGGTATAATATGGTGGTTTAAAATATTGATG
ACAAGGAAGTTTTTCACTAATGTGTACAACATATTTCGATATCTCCCAAA
TTCATATTGCCATATTTCCATATTAGTCCCTTAGTAGACAGTCTCAAAAT
ATTTTGGCACTTTCTTACTCAGATGAGTCTTAGAATAATATCAACTTGTA
AATCTAAGATTTTATTTCCTTAATGAAGGTAAAAAACAATATTAGTTGAA
TAAAATACATTTTTCTTTGTGTCAAAATGGTTATCATTTGCATGCAATTT
TTTAACAAGTTTTTAGACTTATATCATCTCTGAACATGTCTATGAAATAA
AGACAATTTTTAGCAGGAATATGGTTAAATTTTGTTTTGCATCGGATATT
GCTTAATATAAAGGCTTTTAAATAAATCTAAGTTACTAAGTTGGGGCTTT
AGGATAATCTGTGGGGTTCGACTGCGACTACAATCTATGCTCTGAGCTAT
TGGAGGAAATATTTAACCACATCTTTGTGGCTCTTGTTTACTGATAATTT
ACTGAAAAATGAAGCCTTTCCTGATTTATCATGGATGATTTTTCTTAAAT
TTAATGTCTCGTTGTTGTTACAAAACTGTTCTGATAAAAAAGAGAGTATA
CTGTCGCCAAATTAGTTCAGGAGCTGTCTTATTTTTAGTTTTTTTCCTAT
TTTGACCTATGGAACTTCAAAACCAATTTTTTTTTGCCAAGCTGGCAAAA
CTAGGAGAAGTATTTTCGTTAGGACATTGAAGGGAGGAGGATCATTTTGG
CTTAGAGACCCTTAGAAAGTCGATTGTGGCAAAAAGGTTTACTGATGGTT
TACTGATAGTAACATTTGTTAGATTGTTAAACTAGATCTCTGAAATAGAG
CCCGTCGACAATCTCTTCCAGGAGCAAATGCGTTTCGGAAGGTACCGTCT
ATTAAAAATAGCTTATAAGGTTTCTATGGCTCGATCGATATTTCAGTTTG
AAATTTTGTTGAATCAGCGTTTGCGACCGGGTGTGGTGATTCCGAAATAG
ATATATTACTTGCTTGTTAATATGGGGGTTTCTTGAACAGGGACACACGA
CCACAGAATATCACAATAACCGATCGATACAAAAACCTTTTTGAATTTTT
CACCTTTTAGAACTCCAGTAAATATGGACGAAGTACTGAAGTTCGAAGAT
GTCATAGAAATAGAAGTACCTCCGGAAAAACAAAAAGAACTTATCTTTGA
AGACCAAAAGATTCATGGGGATGAAAGTGAAAGTCACCGATCAGATTCTT
CATCTCTTGATGAGAGTTTCCAAGATTTGTCACGTCTTGACAAAGAGCAA
CAGTTAACAGCTGATAAAACATCAGTTTCTCGAGAAGGAAATTCTGATGG
TAACAAACCAGAGATGATAAACATTCAAGAGCAAGAATCTGAGTCTTCAA
TAATCGAAGAAAAGGGGAACTATGACACGAAACATGAAATCCATACGAGA
CCAATAGATGGTAGCAGACCTATCGTAGAAGAACAGCGTAATACAGAAAA
GCAACAAAATGTTGATGCAAAAACATCACAATCAGGTGTAGATTGTATTG
ATCGGGAAAATTCAGCAATCAATAACAGTGAAGACGTTTGTGAAAAAAAC
AGTGCATGTGATAATCCACCAGATTCAAACATTAGTGGTTGCAAAATGTC
GCCACAATCTAATCAAGTTCTCGATGGAGACCGTATAAAAGCAGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000048_pilon:1372728..1379223- >XLOC_045305 ID=XLOC_045305|Name=XLOC_045305|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1386bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048_pilon:1372728..1379223- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGGAAATGTACCGACCAAAAGTTCGCAAATATTCCCCAGTGAAAAC
TTCTGTCTTCACTATGGGAGAATACGACTTTTATTTCGCAACTCGAACAC
TTGAAATATGTTGGAAATGTACCGACCAAAAGTTCGCAAATATTCCCCAG
TGAAAACTTCTGTCTTCACTATGGGAGAATACGACTTTTATTTCGCAACT
CGAACACTTGAAATAACTCCAGTAAATATGGACGAAGTACTGAAGTTCGA
AGATGTCATAGAAATAGAAGTACCTCCGGAAAAACAAAAAGAACTTATCT
TTGAAGACCAAAAGATTCATGGGGATGAAAGTGAAAGTCACCGATCAGAT
TCTTCATCTCTTGATGAGAGTTTCCAAGATTTGTCACGTCTTGACAAAGA
GCAACAGTTAACAGCTGATAAAACATCAGTTTCTCGAGAAGGAAATTCTG
ATGGTAACAAACCAGAGATGATAAACATTCAAGAGCAAGAATCTGAGTCT
TCAATAATCGAAGAAAAGGGGAACTATGACACGAAACATGAAATCCATAC
GAGACCAATAGATGGTAGCAGACCTATCGTAGAAGAACAGCGTAATACAG
AAAAGCAACAAAATGTTGATGCAAAAACATCACAATCAGGTGTAGATTGT
ATTGATCGGGAAAATTCAGCAATCAATAACAGTGAAGACGTTTGTGAAAA
AAACAGTGCATGTGATAATCCACCAGATTCAAACATTAGTGGTTGCAAAA
TGTCGCCACAATCTAATCAAGTTCTCGATGGAGACCGTATAAAAGCAGAA
AACTCCAGTAAATATGGACGAAGTACTGAAGTTCGAAGATGTCATAGAAA
TAGAAGTACCTCCGGAAAAACAAAAAGAACTTATCTTTGAAGACCAAAAG
ATTCATGGGGATGAAAGTGAAAGTCACCGATCAGATTCTTCATCTCTTGA
TGAGAGTTTCCAAGATTTGTCACGTCTTGACAAAGAGCAACAGTTAACAG
CTGATAAAACATCAGTTTCTCGAGAAGGAAATTCTGATGGTAACAAACCA
GAGATGATAAACATTCAAGAGCAAGAATCTGAGTCTTCAATAATCGAAGA
AAAGGGGAACTATGACACGAAACATGAAATCCATACGAGACCAATAGATG
GTAGCAGACCTATCGTAGAAGAACAGCGTAATACAGAAAAGCAACAAAAT
GTTGATGCAAAAACATCACAATCAGGTGTAGATTGTATTGATCGGGAAAA
TTCAGCAATCAATAACAGTGAAGACGTTTGTGAAAAAAACAGTGCATGTG
ATAATCCACCAGATTCAAACATTAGTGGTTGCAAAATGTCGCCACAATCT
AATCAAGTTCTCGATGGAGACCGTATAAAAGCAGAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000048_pilon | genome | sc0000048_pilon:1372728..1379223 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 109-693:586 |
| Aaloc | 1-105:6497 |
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