|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000031_pilon:1061150..1066916- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045296 ID=XLOC_045296|Name=XLOC_045296|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5767bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:1061150..1066916- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTATATTTTCGCACGCTCTGTAAGAAAGTTGGTTGCCAACCCTGCTAA
GTTGACACAAGCTGCTCTCAACACGTTGGCAAAGAGGAATGCTAGGAGTT
ATGCAAGATCAAGGATAATTGAGCAACAAAAAGTCAAAACAGGAGCCGGA
GGTTTTAGAGGTGTGTAAAAAAATTACTGTTTTAATTTTTTTGGTTCTGT
ACTGTACCAGGGCCTGAAATAATGATCCTGCATTGGACATTGTCTGACCC
AAATAGCTTCTTGTCCTACCCAAAAATCATAATTTTCAAGCTAAAGCAAC
TCTAATTACCCACTTAAAATCGTTATTTCAAACCTTGTGTATTTTGTAAT
GTTTATCCTGTTACACTACAGTACCTCTTAAAGAAAGTTAATGATTAAAA
CTTTTAGCATTTTAAGAATGAAATTTGAAAAAACCTGACCTCCTTCTCGT
TTCAGCTGAGAAAATTGGTCAAGCAGTTTTAGGTGGATCTGCAGCTGCTG
GTATTGGTGCATTGTGTTTTTATGGTCTTGGTCTATCCAATGATGTTGGT
GCTATTGATAAAGCAAGGTTAGCTGCAGCACTAATAACTTTTTCTTTAAA
ACAAACCTTAAAAGAAAAGCCTGGGAAGTTTATCGGACAAGCAGTGGTAT
TCTTCGGTCTTAACAAATCTGATGAAACCGTTTCCGACACTTTTATTTCT
AATGATTCGTATCTTCTTAGAATGTTGAATCTATGAATTCCTAAGACTCC
GTTACTACTCCATCATGTATTTATTGTATTATGTACATACTGTAATATTA
AAAACATTTAATTTTGAATTTTGTTTAGTCAAAGTAATCCATTTTTCTCA
ACGTTATTTTTCCTTGATAGTAAGTGTCTTAACTGAAACCAACTATGGTT
TAAATAAAAGTATATTATAAAAAGTGCTTGATAATTGCCTGATAATCGTA
ACCTTTTTTAATTCTATGATAGATTTTGGCCACCTGAGATGCGTTCAATG
ATCAAATCGACCTATTTGTATTTTCTTGGAAGTTTGAGTATAACTGCTGG
GTCAGCATATTATTTGCATCGATCAGCACTTGTCACTCGTATGATGTCTG
GAAATCCTTGGGTTGTAAGTTCAATTTCTCCGTTCTGCTGTTTGTTTTTT
CTAATTTCTCAAGATCGAAGAAATTTTGTCGACTACTCTAAGGTTCCAAA
CAAACGGCCCCCCGCTTATTAATTTTTCGAAAATTTTTCGAGAAGGTCCC
TTATTCTGCCCTAAATATCCCGATTTTAGCCTATATTTACCTTATTTTCG
GGTTTTTCGTAATTACAATTTCCAACCTCCGGCAATTAGGTCCATCTCAT
TTATTAAAATTTTGAAAATTTTCCAACCCCTCTCCGTTTATTCGAACCCC
CCGTTTATTTGGAACCTAAGAGTATTGATCGAATCAAACAAATCATTTTC
ACAGAAGCAAATAATCTAAATAATCTCATCGTTAAGATGTGTTGTTATAG
AATGTCTTGATTCCAAAAATCTTATTGGGGGGATCTATTTTGAAGGTGGA
AGCATAGTTGATTGGGAGTTTTAATAATGTGGTTGGAATTATAATTTTTG
GTGGAACCTTTACCCCTCTTGCATACTTTGTACTTATTGGCACATTATCC
CCGTCTTTATTTCAGGTTTTTGCAGGTAGCATGGCAGCCTTGATCGGAAG
TTCTATGGCTTGTCGATCCATTGAATATGAAGCAGGATTGAATGCAAAAC
ATTTAGCTTGGGGAGGTTTGTTGAATTTGATTCCTTATTTCTTTTTCAAA
AGATCTCTCAAGAAGAAATATTTTTTAAAGAACATTCTTGAATCTAAACC
TGTTGAAATTAGAAATTAAAAAATGTTTATCTTTGAGTTTCCAAAGATTT
TCAATTACAATCGAACGATTCTTATCTAGGTAGGTAGATTTCACCTTGAA
TTTTTTTTTTAAAAGGAAACTTAATCGTCTGAAACATTTTTCTTGGGGTA
TATATAATTAAAGTTTGCGAAAAATCACTTTTTTAAGAAACTTTGTCACA
ACATCCTTGGAGTTGACCAGAACGGGGGAACTTCATTACTTACATTACTT
CATTGCCTAATATAAGAAATTTCGTGACTATTCCCGAAAAGTAGTAAGTC
ATCCATTTGCTAAATCGGCCCTACAGTACTTTCTGTAATTCTATTCTAAA
ATATTAATCCCAATCTTTCATTAACTCTAAGAATATTCGCGGTTCTTTGA
AGATCGAATTAGAAAGAGTTAACTTGAAATTGATATTTCTTTTTTTTTTT
ACAATTTTTAGTCCACAGTGGCGTTGTTGGGCTTGTCGTTGCACCCTTGA
TGTTCTTGGGCGGACCACTCATCTTGCGAGCCGCCACATACACCGCCGGA
ACCGTAGCGGCGCTTTCACTGACGGCTGCATGTGCACCCGATGAGAAATT
CTTATCATGGGGCGGACCATTGTCATTGGGACTGGGTGGAATTTGCGTTG
CTTCATTGGGTAAGTCAAGTTTATAGAGTTTCTTATTCGAAAAAATAAAT
ATTTTAGAGACCTCGAAATGGAGGATTACAATCTATTGCTCTCCAAATGC
TAAAGTTGGTATCAATAAAAATTCAAAATTCAAAAAAGATTTCCTTGATT
TCTTAGTCAAGGGATAGGTTCAGAAATTGCTTAAAACATTCTACCGCCAG
GTCTCATACAAAGAGTTCAGCATGGGTAAACCTAAAATAAAAGAAACAAA
AAACTTGATACCTTAATGGTAATAAATTTCGCGTGTTACAATCGCGAAAT
TTTTTTCAGGAAACGTGTTTCACATGTATTGAATTTCGCGATTCACTAAA
TTGGGCATTTTCAAAAAGTGGGAATAAAGAAAGAAAATGGCTGATTTCGC
TTGAAACACAACGTATTGGGTGTAAACATATTAAAAAAGTAACTAAGTGT
AACAAAAAAATTCGCGATTTTTGGTCTATTTTGAAATTTTTTCACGTGTA
TTTAATTTTGTGATTTTGAAAAATTTAAACGGTATTAAATTTCGCGAAAT
GTGACCTAAAAAATCGCGAAATTAAGTACCCGCGAAATTTGTAACACGCG
AAATTTAATACCATTAAGGTAAACCTGTTAAAGGGAACCTTTACTTGACT
AAGATACTTACATTCGAAACTTACAAACGACCCCATCTACTTTCTTAACC
AATCAGATGAAAAAGTCAAATTTAATTTTTGAAAACGGTTTCAAATGTCT
TGTTTGTAGAGTTTTGTATTGACAATTGACGCCATTATGAAATGCTCCAA
AAGGGTTCAAAATTCTTTAAGGTGGTTCTAGGACCCATATAAGAAACCTG
TGTACCGAATTTCAGCCAAATTATTTTTGAAAGGTAAAATCTAACTTGGA
TCCAAAAAGTGAGTAAATCACCCGGATGTGAAAAGTTAATTTCACACCTT
GGAGCGTGAATGATTTTCCTGCCCCTTTGAATTTCTTTCACGCTCTAAGG
TGTGAAATGCACTTTTCATACCCAGATGATTCATCCATATTTTGTCACCA
TTTTCCAGGTGGTATGTTTTTGCCAGCCACTTCGGCAGCAGTACCGGTCA
TCCAATCTTTGGTGACGTACGGTGGTCTTGTTGTCTTTGGAGGATTCATG
TTGTACGATACACAGAAGATCATCAAGAAGGCTGAACTTGCCACGTACAG
TGGAAAGAAATATGATCCTATCAATGCGTAAGTTTATCGTTGGTCGTAAA
AAGCCTTCTTTATACATGACTGTCTTTATGACATTGTACTTTTCGATATC
TAATTAAAGGTACTGTTGTGCGCAGATTTGTAATACTTTCTGCGCAGATT
TGTAATACCTGCGCAGATTTGTAATAAACTTTGCGCAAATTTGTAATACT
TGAGCTGCGCAGAAATGTAATACTTCTCTGCGCAGATTTGTAATTTGAAT
TGATATTTTCATTGCATTGGTAACCAAATTCTATTCTGCGAACAAAATGC
ATTAAAAATGACTTAGAAAATAATACCCAAATAAAGTTGTGATTATTGAG
CACACCGAATAAATAATCAATCAATATTTCTTTTCTAAGCAGTGCTTTTA
TAAGAAATTTATCTGTTAATATAAAAATTGTTTATGAGAATAGCGTGGAC
ATAATTTTTATAAGAACTGCTTTTATAAGAAACTAATCAATAACTCGTAA
AATAAAAATTATTTGTTGTCGGTAATTGTTTATTTCGAAGTAAACAAGGT
ACGAAGAATAACATGAACATATTTATTTTTTATAAGCACTGCTTTTATAA
GAAACTAATTTCCTTTAGATCAAAAGATATTGATTAGTTTCTTATAAAGT
TGATACTTATAAGAAAAATGAAAATACTTAAAATAAGCAAAATCCCATAT
TTGTATTGAAAGAACCAAGCGCCGAAAGCCAATTTCCATTAGATTAAAAG
ATATTGATTCGTTTCTTATAAAGTTGATTCTTATAAGGAAAATGAAAATA
TTAAAATTATTCCCAATCCCATGTTTGTATTGAAAGAACCAACTGCCAAA
AGCCAATTTCCATTAGATTAAAATATATTGATTCGTTTCTTATAAAGTTG
ATACTTATAAGAAAAATGAAAATATTAAAATTATTCCCAATCCCATGTTT
GTATTGAAAGAACCAACTGCCAAAAGCTTATTTTCATTAGATTAAAATAT
ATTGATTCAATTCTTATAAAGTTAATGTTCATACAAAAGATCTACAACCT
TTGTGTTTTTTTCTGATTATTTTCTAAGTCTTTTTTTCGAAACTTTTCTT
CGTGGAAAACATATGCCCTCGAAGTAAAAATCTAAATTCCAAATTGCAAA
TCTGCGCAGAGAAGTATTACATTTCTGCGCAGCTCAAGTATTACAAATTT
GCGCAAAGTTTATTACAAATCTGCGCAGGTATTACAAATCTGCGCAGAAA
GTATTACAAATTTGCGCAGGTATTACAAATCTGCGCAAGTATTACAAATC
TGCGCACAACAGGTACACAGAAGACCTCTTAAATAGCTGGAGTAGTCTTT
GAAAAGCTAACCAATTATTAATGACATTCTCAAAAACCAGTCCTTTTTTC
CATTCCTGGGACTGGATTAAGGTCTCATTTGTTAAAAGTCTATGAAATGG
GATCGTAACCATAATACTGTAATTGGTGGAAAATAAGGACCTCGAAAAAA
TTTGATAAGGTGGGGAGCTGGAGTTAATTTGGAGTACACTCTTTTTTTTA
TTAGCATATGGAAAAATCCGTTCGAGGCTCAATATGCTTAGCAAAGTTTA
ATTTATGCTTTATTTTATGTGCTTAGACTTCGATTTGTTAGTTTCTCTGG
GTTCATGAAAATTTCGAACTATAAGTCTGCACATTGATCGGTTCAAAGAA
TGAAAGTTATCTTTGTAATTTGGAGCAGCAGGCGAAAATCTTTGGTCTAA
GAAAGTTTAAACAGCTTTAAAAGTAACCCTAAAAAGGTCAGCGTTTTAGA
AAAGCAGCACGAATTTTTTTGCATATCAGCTTGGAGGTATGCTTAGCATT
ATGCTTTTTTTACCGAATTTGACCCCTAGTGTGCTTATAAAACGTTATGC
TTATTAAAAAAGAGTGTATCCAAATTGGAATGTTTCCGAAAAATTGAATG
ACCGTTGCGTATGGTCATTTTTCTCAACATTTCAGATCGATCGGTATTTA
TATGGATACTATCAACATTTTCATTCGAATTGCTATGATTATGGCTGGAA
ATAACCGTCGAAAGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000031_pilon:1061150..1066916- >XLOC_045296 ID=XLOC_045296|Name=XLOC_045296|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1926bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:1061150..1066916- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTATATTTTCGCACGCTCTGTAAGAAAGTTGGTTGCCAACCCTGCTAA
GTTGACACAAGCTGCTCTCAACACGTTGGCAAAGAGGAATGCTAGGAGTT
ATGCAAGATCAAGGATAATTGAGCAACAAAAAGTCAAAACAGGAGCCGGA
GGTTTTAGAGATGTATATTTTCGCACGCTCTGTAAGAAAGTTGGTTGCCA
ACCCTGCTAAGTTGACACAAGCTGCTCTCAACACGTTGGCAAAGAGGAAT
GCTAGGAGTTATGCAAGATCAAGGATAATTGAGCAACAAAAAGTCAAAAC
AGGAGCCGGAGGTTTTAGAGCTGAGAAAATTGGTCAAGCAGTTTTAGGTG
GATCTGCAGCTGCTGGTATTGGTGCATTGTGTTTTTATGGTCTTGGTCTA
TCCAATGATGTTGGTGCTATTGATAAAGCAAGCTGAGAAAATTGGTCAAG
CAGTTTTAGGTGGATCTGCAGCTGCTGGTATTGGTGCATTGTGTTTTTAT
GGTCTTGGTCTATCCAATGATGTTGGTGCTATTGATAAAGCAAGATTTTG
GCCACCTGAGATGCGTTCAATGATCAAATCGACCTATTTGTATTTTCTTG
GAAGTTTGAGTATAACTGCTGGGTCAGCATATTATTTGCATCGATCAGCA
CTTGTCACTCGTATGATGTCTGGAAATCCTTGGGTTATTTTGGCCACCTG
AGATGCGTTCAATGATCAAATCGACCTATTTGTATTTTCTTGGAAGTTTG
AGTATAACTGCTGGGTCAGCATATTATTTGCATCGATCAGCACTTGTCAC
TCGTATGATGTCTGGAAATCCTTGGGTTGTTTTTGCAGGTAGCATGGCAG
CCTTGATCGGAAGTTCTATGGCTTGTCGATCCATTGAATATGAAGCAGGA
TTGAATGCAAAACATTTAGCTTGGGGAGGTTTTTGCAGGTAGCATGGCAG
CCTTGATCGGAAGTTCTATGGCTTGTCGATCCATTGAATATGAAGCAGGA
TTGAATGCAAAACATTTAGCTTGGGGAGTCCACAGTGGCGTTGTTGGGCT
TGTCGTTGCACCCTTGATGTTCTTGGGCGGACCACTCATCTTGCGAGCCG
CCACATACACCGCCGGAACCGTAGCGGCGCTTTCACTGACGGCTGCATGT
GCACCCGATGAGAAATTCTTATCATGGGGCGGACCATTGTCATTGGGACT
GGGTGGAATTTGCGTTGCTTCATTGGTCCACAGTGGCGTTGTTGGGCTTG
TCGTTGCACCCTTGATGTTCTTGGGCGGACCACTCATCTTGCGAGCCGCC
ACATACACCGCCGGAACCGTAGCGGCGCTTTCACTGACGGCTGCATGTGC
ACCCGATGAGAAATTCTTATCATGGGGCGGACCATTGTCATTGGGACTGG
GTGGAATTTGCGTTGCTTCATTGGGTGGTATGTTTTTGCCAGCCACTTCG
GCAGCAGTACCGGTCATCCAATCTTTGGTGACGTACGGTGGTCTTGTTGT
CTTTGGAGGATTCATGTTGTACGATACACAGAAGATCATCAAGAAGGCTG
AACTTGCCACGTACAGTGGAAAGAAATATGATCCTATCAATGCGTGGTAT
GTTTTTGCCAGCCACTTCGGCAGCAGTACCGGTCATCCAATCTTTGGTGA
CGTACGGTGGTCTTGTTGTCTTTGGAGGATTCATGTTGTACGATACACAG
AAGATCATCAAGAAGGCTGAACTTGCCACGTACAGTGGAAAGAAATATGA
TCCTATCAATGCATCGATCGGTATTTATATGGATACTATCAACATTTTCA
TTCGAATTGCTATGATTATGGCTGGAAATAACCGTCGAAAGTAAATCGAT
CGGTATTTATATGGATACTATCAACATTTTCATTCGAATTGCTATGATTA
TGGCTGGAAATAACCGTCGAAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000031_pilon | genome | sc0000031_pilon:1061150..1066916 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 883-963:82 |
| Aaloc | 715-879:2208 |
| Aaloc | 517-711:3455 |
| Aaloc | 415-513:4103 |
| Aaloc | 274-414:4795 |
| Aaloc | 163-270:5311 |
| Aaloc | 1-159:5768 |
|
