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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000031_pilon:308978..314948- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045273 ID=XLOC_045273|Name=XLOC_045273|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5971bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:308978..314948- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCTCTCCAGGAAATGATTTTGATGGTTATGAACCATACAGTCCTTC
ACTATCTGAAGGCATAGTGCACCAAAAGAAAAAACTACGTTCTTGGCTTG
TTGAAAGACTTGATGTTAATGATTGCCCTGGATGCTCATGGATTAAAACA
AACGGAAAAGTTTTTCGGTTGTCATGGAAACATTATGGAAGACCTGGTTT
CGATGAGGAAAGGGTGAGGAAGAAAACTCTGGCTCTGTTTTTTGACTTTC
ACATTAAAAGAAGAAATACCTGAATCAGAGATATGTTATAGCGGATTTGG
ATGAAGGACGAGAATTCCTTAGCGGATTGCTTCTTTGTCTTTTCTATTGT
AAAGTGTTGATAATAATAATCCATCTCTTTCCCCTTGAGTGTTCTGTTTT
TATATGAAAAATGAAGCAGACAAAGTATTCATGCATTACGTTTGCACATA
TTTTGCTATGATGTTCCCGCTTTTCATCAAAATAATATTTGTAGAAGATA
CCCCAAAAGCTTCCTTGTAAATGAAATCTATTTTTATCAGCGTGTGTTAT
GAATTTGAGAAGCTTTCATGATTTCTCTTTAAAATTTTCGGATGTAAATA
TTTTGACGAATATTGTTTCAATTGACTTGAAATGTTTTCCATAATAAGAC
ATACCGACTTGCTATCTGAAAATATCAGTTAGAAAGTGAGGCACCCCACG
GTGTAGTGCGGTATTTCAAATGAAAAAGTACTATTTATAATCTTACAGAA
GAAGCTTCTTATAACTTTACTAATGAAAACAATGTTTTTCATTTTTTTAA
ATTGTCATTCACCAATGTTTTACAGACCCTCTTGATAATTAAAAGTTTTC
AATCGTGAACGATAAATGCAGCAGCAGAATCATTGGCTAAGAGGAAATAC
AAATTTCACGAGTTTGTAATTTAAAAAGTTCAATTTCATATCAAATTTTA
ATGTCAGGGACAGAGATAGAACAAGGCTTTTTTAAATGTACGTTATCCAG
CTCCGCTATAACATATCCTTGCCTGAATTCATTTTCACACTTTTTGAGTT
TGCACCAGAATGAAATTCTGTAAAGAAATGAAAGAAAAAAAGGTACATTT
CCGATCTGTATCATTTCCGTAACTGATTCTATAGTAAATCCTGGAAAACT
TTTTCAAAAATACCTTTGATAATAAGTTGAGATGAAAAAAGGTCAACTCC
GTCAGCTGATCTTTCTTTTTACCTGGAAAAGGTTGCAGTGGACTGCAAAA
TGCAAATTGAATTTCTTTATAGAAAAAAGCTGAAAAAAACTCTGGACAGT
CTTTTATTTATTCAAAAAATTATAAAGATAAGCAACATGTCCCTTAATAA
ATCCGCCCCTAAATCTGCAAGCTAGTAGCTGTCGAAAAAAAGACTCAAAA
TGCTAAAAATTATATTCTATACACAGGGCTTTACCTGGGAGGCTCCCAGA
TTTCAGTAACTTGAGATTGTTACTATTGGAAGGCTGTCTAAACTGAAAAG
TAATCATTTTTTTTTCTCTAACAAGACTAACGAAGAAGAAACAAAAAAAT
ATGTCTCATTTCTTCTGCTCTTTGTTTTTATAGGATGCAACAATCTTTAG
GAAATGGGCAGAACACACTGGCAGATACCAGCAGGGTGATCCACCAGATA
TTTCAACATGGAAAACACGTTTTAGGAATGCTTTGCACAAAATGCCTGAC
ATTGAAGAGATGACAAATTATCACCAGTTGGATGGCAATGATCCCTTCCG
AGTGTACCGTTTCCGTACACCAGGTTTGAAAATATAAGAGTAAACCATAT
AAAAACATAGCCAAAATGATAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAAGGTTT
TGCAGACTCTAAATCACCCAATTTTTTCGGAAAATAGACAAAAAATACCC
AAATAATGGCGAAAATAAAAATATGCTCAGAACATTTTCAGGCTTAAAAA
CTCAAAAAGTTAAGAACATCCCAAGGTTTAAAAAAGTTTTGATGTTCTTA
TAAAAAAACGTGTATCAACAGCCAACCTTATGGGAACAAGTGAAACTTGA
ATACTGTACTTAATTTTGCGATCCATACTCATTTATTTATTTCATTTATC
AGGTTCAAAATAATTTTCAGCACTATTTTGCGTATGTATTAATAAAAATC
ATTTATGGACTTTGATAATTTGGGAATTATGTTGATGTTTATTTTATATA
TTTTTTAAATTTTTTTCTGTTCTTTTACAGAGGAGCTTGAGATTATCAAG
AATAAGGCAAACGATTCAAATCACATGAATGGCGGTAAAGCAAATACAGT
AAGTTGTAATGTAAGCTGCAGAAATCACGACGCAACGCCTGCGTTTCCCA
CTAGTTTTATTGTTTAAATTCAAAATTATTGGCAAACTCCCGGTCTTCTT
CGGGTACTTTTCTATAAAAACTATTCTATTGATTAAAAAAGGGGTGTACA
ATGCAGAAGTAGGGCTAACCTAATTCACTACAAGTAGCTTTGTAGGGAGC
GCGAATAGACGGACAGCTTTTAAACTTAAAGCAGATTCGGATACTCCATA
AGCATGGCTTGGTATGTATTCACTCTAAGGGTCACGGCTCCGTAAGAGAA
TCTGCTCAGGTTTGGCCGGATTTGGGATGATTGCGGTGATTGGTTAAAAC
AAAACAATCGCACCAAAATAAAAACCATCTATGAACATTAGAAATAAATT
GCTTTCGTTTTCAAGCAAAAAGTAATCGTGGTTTTGATTGTTTTGGCTTA
TTAACCAGGTCAGATAGTCACATTCACCATATCCCTTCATCAAAGAGCGT
GGTATGCACGGAATGGATGATCAGTTCTATGACGTATGAGACTAAACAGC
TTGTGCTTTTCTTTTCTAGAACCCACCACCCTATCCTTACCAAAGCTACC
AGCAGCAAACACCATACTACGGAAACACTGCACCGCAAATGGATCTCAAT
GGTTTTGCTAAGGAACTCGAAATGCAATCAGTAAGATGACTACAGTAACA
TTGCTCCCTTCGTTATTGTCCAAAGTGGGAACAGAAAAGTTTTTTGTGAT
ACGGCTCTCTTTCAGCTATAGTTAGGGAAACGTTACTCTATCCAAGATTC
CTCCTCCTTTCAAAATTTAGACCCCCTCAAAAGACAATGTACCATTTTGA
ATCGAATGTTTTGAAATTGTAAAATCACAATCAAAACCAAATTATTATCA
ATCACCAAAAAAAGTGCGCCAAGTAAGCTGGTTCAATTTTGGTTTAGTCA
CCGAAAACAAAGGACACAAATGCGTCAGTTTTTGCGCACATCACAGCTTC
CTCCTCCTTTCTAAATTTAAACTGGCCCTCAAAAGACAATGTACCGTTTT
GAATCGAATGTTTTGAAATTGCTAAACAATTAAAAAAAGAATGTCACTTG
TCAGCCATAACTATTGAAATTACACAACAGTTTACTTTCAGTTGGGTTGT
ACCCTGTTCGTATTCTTAATCTATCTTTCCTTGGATTTCCAGCAAATGCA
AGGTGGTATGGGAGAAATGCGCCATACACAACAACAACAACAAACTACTG
GTGGAATGTATGTTCCTCCACCGCAAAACCAACCACCTCAATTGACACCT
CAACATCATCAAGCAGCTACCTTGTGTAATGGTATGTTAGAAATATACAG
TATTGTCAAGACTCTTGTACGTGTCAAATAAAAGATCAGTCTTTGCAGAA
AAATCAAAAACCAAAAAGGAAAAAGTGAAGTTTGGTATCTAATTTTTGCT
TCACTTTCCAACCAAAGTAAATGGCAATTCTCAAGATTGATAGATATAAT
CGATATTTTATGCGTATACTCCAGTAATCTAGGACTTTTAGGCAATCTTT
TGATTGTTTTCACGGGGTCCATGGCCAGCCGGCTCGGCCATCTATGAACT
GAACAGAACATTGGAAGAAGTGGGGATTCGAACCGCAAATCCCTGGTTTA
AGACGCTGACGCCTTTGACCACTTGGCCATCGCTCCTTATTCTCAAGAGA
TATATATGACCAGCTATCAGGGATAATTTTTACAACGAATTGAATCGCCT
TTAATTTCGAAACATTCTTTTTTTCAGATTACATGCCACCAGCTTTTGAT
GACGACAAGATCGACAGTATCGTTGATGTGAGTAAAATCAATTACTTTCA
GCTTTTCCTTTTAAAAATACGGATCAAAATATAGTTATATTTGGTCCATA
GACTGTTAATCCCTTCCGTCTTTTTGCTGAAGGGCCTAGAGTTTTTCGAA
ATTTTCCGAAATAGGGAGGAGGTGCCCAATTAATTCAATTAACTCTTGGT
ATGTGAGGCTCAAAAAGAGTGCAACTACTTTTTTTTTTAGAGCCTGTGTT
TTATTGACGGCTATATATCCTGCTAAGATTCCTAATTCGACTTTTTTTTA
TATACCTCATTACACAAATATTACTAGTCATTTTATTAACACGAATTGAA
AAATCTCGTGTTAATAAAAAGACCCTTAAATTAAAACCAGCCGTAGTGTC
CTTGAAAAAGCAAATAAAATTCTTGGTAATTCTTTGCGTGTTAATTTCAA
GGCCGTTGAATACTTGCCTTGTAATATAGGTGTAATAAAGGTAGTTCTTC
TAACGTGTACTTACATTAAAATTTACTGAAATAGTCAAATGCCAAAACTG
ATTATCCCTATAAGCGAATGTGGTTGCCTGCTAGGGTCCTTTCTCTCATG
ATATTTTAGTGTTAAATGATATGTAGGGATCGTGTATGTTGGTTATGCAC
CATTATAATGACTGATGAGATATTGACGAAATTCTGCTATTTTTTCAAAC
TTTTCAACGCATCTAAGTGTCGCATATCAAGAATCGTTATGAATTTTTTC
TCGCTCCGCTATATAGGAATTTCTTCGCGAGCAACAGCAAGCACAACAAC
AAACACATCAGCATCAACAAAGCAATAACATGGAACAATTGTCACAGATG
AGTAGTGCTATCTCTACATATATCGCTGCTAACAGTAACATACCTGTCAC
TGGTAAACATTCATGTTCTTATCGTTTATTGGGCTCTTCCAGAAAATTTT
TGTACATAGAGGATATATTGGATATTTTGTCCGGGGGTAGTGAAAAATCT
GCAAAATTTGCCTTGTTTTACGGGCAAACTTCTTCTAATTAGGCGTGATA
TTGAATGTCCGGGGGTCAACTGATGCTTGTCTGGGGGTGAGATCCGTTGT
CCGGGGGTCAAAATTCACAATGTCCCCCGGACGTAAATTTCCCAAAGATG
TTTTATTCTCCACCCCATATTCAAATTTTTTCTGGAAGAGCCCATTCCAA
ACATCACGAAACGTTATTTGATTGGATAAAAAAAGGCTATTGACCTTAAA
AAATTTAATCTGGAAAAAAGTGAGGGACCATACCCATGCTTATAACTAAA
AATACCCCACATCAGAAATAACTTTGTTTGGTCGACTTCGAGATTTGTTA
ACTATTTTTCTTTTTTTTCTCTTTACTCAGCTGTTGGTGTCAAATTGTAT
TTCTCTGACAAAGAGGTCGAATGCAAGATTGTTAATAACATGAACGGGAT
GCGGATATCACACGAGCCTCCTCCGGTTGTTCCCACTGATATGGTTCAAG
AGCCCGATGCCAAAAATATATTATCCAATATCTTTGGTCCCTTGGATGCA
GAACAGATCTATTTTCCAGATTCAGATGACCTAAATACACAGGCTATCTT
AAAGAACATACAACGCGGTGTTGTCATCATTGTAAAACCTAATGGAGACA
TTTGCGCTACGCGTTTATGCCAAGCGCGCGTTTACGTAGCAGATAATGCG
TTATCGGCACCCCGTCTATTGAACCGTAGCGAGGAAACGTTGATTTACAG
TTTTCAAAATGATTTTGTGCCAAAACTGATTGAATACCAAAACGGCGCGT
CTTGTGCGGCACCTTCTTGCGAACGCTATTTCTCGCTCGGTCAGCAGTGG
AGGCCTGGGCTGGAACCTTTG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000031_pilon:308978..314948- >XLOC_045273 ID=XLOC_045273|Name=XLOC_045273|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2754bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:308978..314948- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCTCTCCAGGAAATGATTTTGATGGTTATGAACCATACAGTCCTTC
ACTATCTGAAGGCATAGTGCACCAAAAGAAAAAACTACGTTCTTGGCTTG
TTGAAAGACTTGATGTTAATGATTGCCCTGGATGCTCATGGATTAAAACA
AACGGAAAAGTTTTTCGGTTGTCATGGAAACATTATGGAAGACCTGGTTT
CGATGAGGAAAGGATGGCCTCTCCAGGAAATGATTTTGATGGTTATGAAC
CATACAGTCCTTCACTATCTGAAGGCATAGTGCACCAAAAGAAAAAACTA
CGTTCTTGGCTTGTTGAAAGACTTGATGTTAATGATTGCCCTGGATGCTC
ATGGATTAAAACAAACGGAAAAGTTTTTCGGTTGTCATGGAAACATTATG
GAAGACCTGGTTTCGATGAGGAAAGGGATGCAACAATCTTTAGGAAATGG
GCAGAACACACTGGCAGATACCAGCAGGGTGATCCACCAGATATTTCAAC
ATGGAAAACACGTTTTAGGAATGCTTTGCACAAAATGCCTGACATTGAAG
AGATGACAAATTATCACCAGTTGGATGGCAATGATCCCTTCCGAGTGTAC
CGTTTCCGTACACCAGGATGCAACAATCTTTAGGAAATGGGCAGAACACA
CTGGCAGATACCAGCAGGGTGATCCACCAGATATTTCAACATGGAAAACA
CGTTTTAGGAATGCTTTGCACAAAATGCCTGACATTGAAGAGATGACAAA
TTATCACCAGTTGGATGGCAATGATCCCTTCCGAGTGTACCGTTTCCGTA
CACCAGAGGAGCTTGAGATTATCAAGAATAAGGCAAACGATTCAAATCAC
ATGAATGGCGGTAAAGCAAATACAAGGAGCTTGAGATTATCAAGAATAAG
GCAAACGATTCAAATCACATGAATGGCGGTAAAGCAAATACAAACCCACC
ACCCTATCCTTACCAAAGCTACCAGCAGCAAACACCATACTACGGAAACA
CTGCACCGCAAATGGATCTCAATGGTTTTGCTAAGGAACTCGAAATGCAA
TCAGAACCCACCACCCTATCCTTACCAAAGCTACCAGCAGCAAACACCAT
ACTACGGAAACACTGCACCGCAAATGGATCTCAATGGTTTTGCTAAGGAA
CTCGAAATGCAATCAGAAATGCGCCATACACAACAACAACAACAAACTAC
TGGTGGAATGTATGTTCCTCCACCGCAAAACCAACCACCTCAATTGACAC
CTCAACATCATCAAGCAGCTACCTTGTGTAATGAAATGCGCCATACACAA
CAACAACAACAAACTACTGGTGGAATGTATGTTCCTCCACCGCAAAACCA
ACCACCTCAATTGACACCTCAACATCATCAAGCAGCTACCTTGTGTAATG
ATTACATGCCACCAGCTTTTGATGACGACAAGATCGACAGTATCGTTGAT
ATTACATGCCACCAGCTTTTGATGACGACAAGATCGACAGTATCGTTGAT
GAATTTCTTCGCGAGCAACAGCAAGCACAACAACAAACACATCAGCATCA
ACAAAGCAATAACATGGAACAATTGTCACAGATGAGTAGTGCTATCTCTA
CATATATCGCTGCTAACAGTAACATACCTGTCACTGGAATTTCTTCGCGA
GCAACAGCAAGCACAACAACAAACACATCAGCATCAACAAAGCAATAACA
TGGAACAATTGTCACAGATGAGTAGTGCTATCTCTACATATATCGCTGCT
AACAGTAACATACCTGTCACTGCTGTTGGTGTCAAATTGTATTTCTCTGA
CAAAGAGGTCGAATGCAAGATTGTTAATAACATGAACGGGATGCGGATAT
CACACGAGCCTCCTCCGGTTGTTCCCACTGATATGGTTCAAGAGCCCGAT
GCCAAAAATATATTATCCAATATCTTTGGTCCCTTGGATGCAGAACAGAT
CTATTTTCCAGATTCAGATGACCTAAATACACAGGCTATCTTAAAGAACA
TACAACGCGGTGTTGTCATCATTGTAAAACCTAATGGAGACATTTGCGCT
ACGCGTTTATGCCAAGCGCGCGTTTACGTAGCAGATAATGCGTTATCGGC
ACCCCGTCTATTGAACCGTAGCGAGGAAACGTTGATTTACAGTTTTCAAA
ATGATTTTGTGCCAAAACTGATTGAATACCAAAACGGCGCGTCTTGTGCG
GCACCTTCTTGCGAACGCTATTTCTCGCTCGGTCAGCAGTGGAGGCCTGG
GCTGGAACCTTTGCTGTTGGTGTCAAATTGTATTTCTCTGACAAAGAGGT
CGAATGCAAGATTGTTAATAACATGAACGGGATGCGGATATCACACGAGC
CTCCTCCGGTTGTTCCCACTGATATGGTTCAAGAGCCCGATGCCAAAAAT
ATATTATCCAATATCTTTGGTCCCTTGGATGCAGAACAGATCTATTTTCC
AGATTCAGATGACCTAAATACACAGGCTATCTTAAAGAACATACAACGCG
GTGTTGTCATCATTGTAAAACCTAATGGAGACATTTGCGCTACGCGTTTA
TGCCAAGCGCGCGTTTACGTAGCAGATAATGCGTTATCGGCACCCCGTCT
ATTGAACCGTAGCGAGGAAACGTTGATTTACAGTTTTCAAAATGATTTTG
TGCCAAAACTGATTGAATACCAAAACGGCGCGTCTTGTGCGGCACCTTCT
TGCGAACGCTATTTCTCGCTCGGTCAGCAGTGGAGGCCTGGGCTGGAACC
TTTG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000031_pilon | genome | sc0000031_pilon:308978..314948 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 880-1368:490 |
| Aaloc | 742-876:1106 |
| Aaloc | 694-741:1893 |
| Aaloc | 685-690:2348 |
| Aaloc | 586-684:2456 |
| Aaloc | 472-582:3103 |
| Aaloc | 406-471:3740 |
| Aaloc | 214-402:4389 |
| Aaloc | 1-213:5972 |
|
