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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000031_pilon:1219034..1224950+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045261 ID=XLOC_045261|Name=XLOC_045261|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5917bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:1219034..1224950+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggagAAATTCTTGCGAATCTTCTCAAAGACACCATCACTCATTGGTAT
GATTCACGTCCGGGCCTTACCAGGTAGGTTATATCTTTTTTGGCGCATAC
GGTATAAACGAACTTGCCTTCCTGCTAATTAGACGGGTCCCCCAAGAACC
GGATTGCACAATTATCcaagtttttcatttgttcaTGATTTTTGTGAATC
TTTTGAAGATTGCCTCCTTCTCAATTAGAAGGGGGTTGGGCCCTTCAAGA
ATCGGATTCAGTTGTTCATGTTTGTCCTtgtaaattatttgaaaattatt
tcatgGTTACTTTCACTTTTCCTTTTAacagaatttgaaatttcaaatgg
tAAAACCGATTTAATTTAGAGTCATCATTGAGGTCTTAATTTCTTCCCAC
TATTCAGGTACACCTCTTTACAAATCTGGATCGTTTGACAACATTGTTGA
CAAAGCAAAAGAGGAAGCTCAAGTACTTATTGAGGCTGGCATTGTAAGTA
GAATCATATTTTTATGTCATTGCTATTAACGGGATGCTCAAAGGTGCCCT
CAAAACCAGAAAAATCTAGACCTCAGTTGAATTTAGTGAAAATCCAGGGA
CCTCTTGAAACCAGACACAAATCCAAGGCGGGCCTCTTTAAATTTAAAGT
CAGCAGGGTTTTCATCATGGGTTACAAATCTTTCCTCGAATAACCCAACG
AATAACCCACAAGGAAATTAGGTATTACATGTTTGTTTCTTTAGGATGGT
TTAATGATTGAGAATATGCACGATATCCCATACATGAATCGATCTGTTGG
ACCAGAAATCATATCATCCATGACAGTGATTAGTCATGAAGTAAAAAACA
TTGCCAAAACAATTCCTTGTGGTATACAAATATTGTCTGGTTGTAACCAA
GCTGCTCTTGCTGTTGCTAAGGTgacattttttcttcatttgtcttgatg
tttttttctgaacaAGAAAgtatttggattttttcttcgaTGGAAGACCC
TAGAGTTGCTCTGGCATTTTGTTATTCTTAGCagtgtgatttttttcgaa
TCAGTTAGCCTTCACAAATCTTTACCCCATTCAAGCCCAAATAATTCATA
ATGCCGGGAACTTATTCAACCATTACCAAACCATGGTATGCAGCATGAAC
TGGAAGTCCCGTACTCAGGATGCACGATTTTTTCTCCATAGTATCCTTAA
GGGAACAACTTTGGGATCCACAAAATTAAGGAAAAGGAAGGGGGAAGCTT
TTGTTAAGATCAGTAACACTTCCAAAAGGAAggaatcaaattttttaaag
ctaaggggtttctttcgtgttttctttttgcgattagcttggaatttgct
tttttttcaatttgctattttttcaaacttattACGTTattcttcaggta
ggtccatttagcatgtagcttgtttgctttaaatttccaaaatgCTTTCT
AAGGAACACAAAATATATATGGCTCTAATCATTTTTTGAAGTTACCTGCG
TTTTTCACAGGCCGACACTTTTACAGCTCGAACGTTCTGTGTTTTGTTGG
TATTTACATAAGAGGAGTGCATAAGGCATGTCTGTTTGAACAGttttttt
CCCGAGCaaaaaaaTCTGCAAGCAGCAGTTTGCATTCAATTATGGACAGA
ATGCTTTATTAAGCTAATCTTTAAAAGCCTATCATTAGTGGGTTATATAA
TTGCTTTCAATTAGTTTCTCTGTGTTCCTTGTTGATTTAACAGTCATGTG
AGAAGGAACTTGTAATTAAACGTCAGGAAATGTGCAATTATCTTGCCAGA
TTTTGTAATTAGCTGTCATTTTAGATTGCCAGTGCCAATATACTgtattg
tgaaattttttaaagcgAATTGCAAAGCTTATATTTCTAAAGGCCTTTAC
TTCAATGTTTTGTCCAAACAAACTCCCTTTGTATTTATATTCCTTTGAAG
AATAAAACCATCTTTCAAAATCTACGTTGGgctatttccagaaaaaaacg
taCACAGGGGCTGGAGGGTATGTTGGTCAGGAGATCCAGTTGTATTTAAA
AGATTGTCAAAAACTCATTTTCCACGGGGTAAATTCACAATGCCCTGGGT
TATAATTAGTGTCCAGCAAAGATTTAttttatacactggataaacgactc
ataaaacgatggagagcgctcattgtattttcattgtttcagaaaacaat
ggatgttctagctttgtccgcaaaggacaactgtcatggctcgaagatgt
ctgatttttgaaaatgtttatcagtcttatttttaaaaggttctctagct
ctttctttttgtacatttacagaaaaaaaagtttgaaagtaaggctagca
tttcGAGCTGGAtgcatttgtgaaatctaatgtgaaaaaaacatcattag
acaagaaattcagacaaaatgcttataatgacacaaaattttcaattgga
aatatctttccaagactgtccccagaacaGCTGAAATTAATATACaaaag
acttgagtgtcttgtctccactgtggtatgaaaatcctttggaggcacgt
ggtggcaaggtggtttttttttaggttaaagtttgaaaatttccggtgtc
aacattcaatttcttatacacaacacgtcttttgcatctttctcacagct
tgaaacgtcataacgacctatgattagcaattaagtggaagaatctgact
ctcacaggaaagttttaagtctcttttgggaattgggtgagtgatttttg
ataagaaatgcaataaaaatgcttcgaaaaatcatttaatgagggaagga
gagtgaacaataatatcattactgcggacatagctagtacacgagaaatc
ggcaaaaatctgttacttgtatatccagtgtataataaatcctttcTGTC
CAGAAAGTAGATTTGATGCTTGCCCGTAAAAGTCGTGTCAAGAGGATGAA
AAATCCAGATGTCTCGGTGTACTTGTACTTGAGCCCACTAAAAACTTTTA
TTGTAATCACAATAAAAAAGTGTAAGACCAATCTCTCTTTAAAGTCTCGT
AAAAAGCCTTGCTAAGAGTTATATTCGAAACTTTCTGAGCCTGCTCGTCT
TTGCCCTTTTGATTAATGTTGACCATGATTTTAATAGATTACTCATAAAC
AATCCATCAAATctgttttctttataaattGATTGAGTATTCAAAACTAA
GGATGTTTAAATCAATAGACCAGAAGTACATTATAATTGGTTTTTTATCT
ATGTTTTGCAAAAGTGCAACGTTCTTTTCCGCTCCTTTGCTATACTAAGC
TTGACGTTATGCAATAGCCAGTATTTGATTCGCAGTGATTTACCAAGCAT
AATAACGCCTTTAAGCCTTTAGATAGTCATAAACAGGCTTCATCGATTTA
AATGTTTTAATTAAACTTTGTtgtcagattttcaaaaaagattcaaTAAT
TGATATTTAATTGATTACCGCCCTTACTGTGCATTATCCTATTGTTTTTC
TAATCCCCTATTAAAATGAAAGGGATAGATGAAATGTCATGATAGATTCA
ATAGGGTAAACCTCTTTTAAATACTTCATGCTTCAAAAAGGTGCAGTGTT
TGTTTTAGGCCACTTTTAAGCAAAACTCAGTTATGCTTCATTGTAAGAGA
CTTGCAAATTCTTTCTGCAAACACATTATCACACAGTATGAAAGGGGGTG
TTGTGTTCCTTTTTCCTGCAGATGTCTAAATAAGCAAGCTGTGAACAGTA
GGTATACTTCATGTACTGTATTTCATCGTGAATATGGAACTACATGTCAT
CGTCTAATAGaggaaaattgtccaaattcCTTCTCtgttcaatatatttt
ttagtgATTGCTACATTATTTAACCTAAACTGAAGTTCATATATATAAAC
TCGCCCAAATCGATTGAAATGAGCTCATTTGGCTCGCCATTCACAAAACT
GATCTTTATCTACCTTGCCCTTGCCCTTGCCCTTGCCCTATCTATGCATG
ATCAAAGACTACAACTGGTCCGTTCTGTTAGCCTATTTCAACACTTTTGA
GTTCACTCTATAGATTAGTTCGATACGCGATATTTCGTTGAAGTTCAACT
GTTTTTAACTTTCTGGTACTTCAATGTTGTTTTTCAATGCTGTTATTTTT
ACTATTTGTATACTCTGCCCTAATCTTCACTTATTCACGGAATCTGGTAA
ATGAACGGTCTGAATTTCAGAATGGCCAAGGAGTAGCCAAAATGTTTCGA
ATTTGTTTGATGTAGAAACTTCTTACAAGGAAAACTTACTAAAAGATTGA
AATTATTCAAAGATTTGCTTTTCCTCATTTATACAGGCTGCTTCTTTGCA
ATACATCCGTGCTGAGGGATTTGTATTTGCGCATGTCGCTGATGAGGGAA
TTATCCAATCAGATGCCGGCTCGTTGTTACGGTACCGAAAATCTATTGAT
GCTGATGACATCATGATTTGGACAGATATCAAGAAAAAACACAGGTTGGT
TAAAGAACAAAgaacataccttatcggccctttttacattggcccttatt
ggcgttatttttgggctcttGGCGTAATAAAGGCCGGTGTAAAAACGGCC
GATAAGGTAGCCTTTTTCAGTTGCAATTCGATTCAGTTTCTTGCACACTT
TTTGTGTTTGACTTTAAGTTCAGGAATTGCATGACCACGTGATTAATTTC
GCCTGATGAAATAGCCAATCATAGTGGATACTGTTCAACCTTACAATGTG
ACCGACTCCTGTATCATTTAGTCATTTTGAAAGATTAAGGGAGACGAAGT
ATATGTCAAGTATTGTGCTACATTGACATATAAAAAACGAGTGATTAATA
TCATTTGATACAGTGTCCAAACTTTTCCTATCATATTCATACGAAAGATT
TCTGATTACACCCAATTTTTCCATCACACTAATATATTGGATTATATCCA
TCAAAAATCTGTGAAAATTAATAACAGCACaaaaaaaaaCTAGGTCAAGT
TTTTTCTGatataatgttttgattttgatgtctGCAACTATAGAAACGTC
TTcttgaatttgatattttgttaaaattcaaaacataacTTTTACAGCAT
TCTTACTTTCCTTCCCAGCTTCACTTTTTATACTTTTAATCATAAAAATG
CTAAACTATACCAACAACGGTATCATAGTTTTGTTTCTGATCTTGACATT
CTTATCAACGTACCTTGCAATATTTTGCTAAGTCAGCATAAGAGAATGAT
ATAACCGAACTATATATATACTTCACTACATACATACAGTCATAATGtcg
ttttaagccaatcaaaataattgaaattttttgaaagtaagCTGGTGTTT
TCTGAGAGCAGAAAGCATTTCATTTTGTTCTTCCGTAGTCAACAATTAAT
TCCTATAGTGTACTTTAATACTGTAGTCTCTTTTGACTTCTATCCTCTAT
ACATGAGTTTGTTCCAATAATATTGGTCGTTCGTCAACACTGTAATTGTT
ATGACGCATTAACACAAGATTATAAACTGATACCTCACCTTCCAACTCAG
TGATAGTTATCTCATgaattcttatattttttatagcTCACACCAGATAA
CATCAGACGTGTCGCTATCTGAAACGTGTCACGCTGCTGAATTCTTTCTA
TCGGACGGTCTTATCATCACTGGATCGTCTACCGGACAAGCTGCCTCGGT
TACTGACCTTAAAGATGCCGTATCCACCGTGTCTATTCCGGCTATAATTG
GCTCCGGAATCAGCCCGGATAATGtggaaaatttctcaaaagcaCACGCT
ATGATCGTTGGTtcttatttcaagaaaaatgggCTATGGAGTAATGAAAT
TTGTATGGATAGGTTGAACTCGTTGGTTCGTGCTGTTACACAGCTGCAAA
ATGAACCTCAAAGGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000031_pilon:1219034..1224950+ >XLOC_045261 ID=XLOC_045261|Name=XLOC_045261|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1650bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:1219034..1224950+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggagAAATTCTTGCGAATCTTCTCAAAGACACCATCACTCATTGGTAT
GATTCACGTCCGGGCCTTACCAGatggagAAATTCTTGCGAATCTTCTCA
AAGACACCATCACTCATTGGTATGATTCACGTCCGGGCCTTACCAGGTAC
ACCTCTTTACAAATCTGGATCGTTTGACAACATTGTTGACAAAGCAAAAG
AGGAAGCTCAAGTACTTATTGAGGCTGGCATTGTACACCTCTTTACAAAT
CTGGATCGTTTGACAACATTGTTGACAAAGCAAAAGAGGAAGCTCAAGTA
CTTATTGAGGCTGGCATTGATGGTTTAATGATTGAGAATATGCACGATAT
CCCATACATGAATCGATCTGTTGGACCAGAAATCATATCATCCATGACAG
TGATTAGTCATGAAGTAAAAAACATTGCCAAAACAATTCCTTGTGGTATA
CAAATATTGTCTGGTTGTAACCAAGCTGCTCTTGCTGTTGCTAAGGATGG
TTTAATGATTGAGAATATGCACGATATCCCATACATGAATCGATCTGTTG
GACCAGAAATCATATCATCCATGACAGTGATTAGTCATGAAGTAAAAAAC
ATTGCCAAAACAATTCCTTGTGGTATACAAATATTGTCTGGTTGTAACCA
AGCTGCTCTTGCTGTTGCTAAGGCTGCTTCTTTGCAATACATCCGTGCTG
AGGGATTTGTATTTGCGCATGTCGCTGATGAGGGAATTATCCAATCAGAT
GCCGGCTCGTTGTTACGGTACCGAAAATCTATTGATGCTGATGACATCAT
GATTTGGACAGATATCAAGAAAAAACACAGGCTGCTTCTTTGCAATACAT
CCGTGCTGAGGGATTTGTATTTGCGCATGTCGCTGATGAGGGAATTATCC
AATCAGATGCCGGCTCGTTGTTACGGTACCGAAAATCTATTGATGCTGAT
GACATCATGATTTGGACAGATATCAAGAAAAAACACAGcTCACACCAGAT
AACATCAGACGTGTCGCTATCTGAAACGTGTCACGCTGCTGAATTCTTTC
TATCGGACGGTCTTATCATCACTGGATCGTCTACCGGACAAGCTGCCTCG
GTTACTGACCTTAAAGATGCCGTATCCACCGTGTCTATTCCGGCTATAAT
TGGCTCCGGAATCAGCCCGGATAATGtggaaaatttctcaaaagcaCACG
CTATGATCGTTGGTtcttatttcaagaaaaatgggCTATGGAGTAATGAA
ATTTGTATGGATAGGTTGAACTCGTTGGTTCGTGCTGTTACACAGCTGCA
AAATGAACCTCAAAGGTGAcTCACACCAGATAACATCAGACGTGTCGCTA
TCTGAAACGTGTCACGCTGCTGAATTCTTTCTATCGGACGGTCTTATCAT
CACTGGATCGTCTACCGGACAAGCTGCCTCGGTTACTGACCTTAAAGATG
CCGTATCCACCGTGTCTATTCCGGCTATAATTGGCTCCGGAATCAGCCCG
GATAATGtggaaaatttctcaaaagcaCACGCTATGATCGTTGGTtctta
tttcaagaaaaatgggCTATGGAGTAATGAAATTTGTATGGATAGGTTGA
ACTCGTTGGTTCGTGCTGTTACACAGCTGCAAAATGAACCTCAAAGGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000031_pilon | genome | sc0000031_pilon:1219034..1224950 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 496-825:5588 |
| Aaloc | 337-492:4337 |
| Aaloc | 160-336:745 |
| Aaloc | 76-159:410 |
| Aaloc | 1-72:1 |
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