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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000031_pilon:1090727..1098121+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045254 ID=XLOC_045254|Name=XLOC_045254|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7395bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:1090727..1098121+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGAAAAATAAAAGCTGTCGAATATTTATTTTCTCTATTTGTCATTGC
ACTTCTAGTTCAGGTGAGATGATTATATGTGTTTTTAAATTCGTCAGGAT
GAGCTGCGGATTTTTTAGGTGCTTTTTTAACACTATTTCGGTAGGGAATA
AAGCCTGGTAGAAAGAAATCACCATGGCGAGTCTATTTCAAAACTAGATA
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ctatcactgactctttttaaaaagcattgatgatattttttagttgtgtt
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ggtgccgcccaactttcgaaatttggacccttaccgggactaaaaaggag
agaactaaagaaaattttgggaattttacgacccttagcgggacaaaatt
gaccaattttgaccaaatttcgatctttcagggggtaaaaagttgaaatt
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ctaataattaagactgaccaaaaatttgggccatttctaaatttacaagc
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TCGAAGTCCAAGGTCAGCTCTGGCAAAACCACCAAGAACCAAAGAAGCAT
CTCAACGACATGAATCAAATTTGGGAAGCATAAAACAACAACATTGCACA
TCCGCCTGTCATAATGTCTTTTATCTTTGCATTTCTGACATTACTGGCAA
GCCACCTTGTGACATGGTTCAATTAGATAGTCGAAGAATCGATTCTGATG
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GTTGTAAAATCGGTCAATACgtcttttcaaccaatcagctgtcggGTTCG
TGGaatgcaatggtgcatatcatgaattgcaaTTATTAGTAAACATTAGA
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TGGATGTCTGATTCTTCAAATGACCCTGGACCATCACTTAAAGTGAAAAG
CTATACAAGAGGGGATTTCACTCCATTTTCCATTAGCTTTAGGGCTCGAA
GCAACAAATCTTCGGCGTGCCTCCGCTCGACCATTTTCCCTAGGAGTCGG
TTTGTTATTGGCAAATATACTTCGAAATCAAACAGTGTACTCGTTAACTG
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AAAAGAGTCAAATTTTACATATACTGTAAGGTAATTTGATCCATTACTTT
TTAGGGTCAAATTGAATTAGACGTTATCGTTCTTGACGGAGCTAAACACG
CAAAAGATCTATCCTATACTATCAGTTCAAACAATGTGAAAACCATCAAT
ATGACAGATACAATCGCCACATTCTACATGAGACGTCAAATCTCAGCATA
CAGCAAAGACGAAGAATCTTGGATCAAAACACAATTAGTTAGCCATAATA
ATAAGACATTAGATTTGAGAATAAAGTAAGTTGACAGTTTCGTTTGTACG
TTTGGTTCTCTCAAACTGACATTTCTACCATGTATtaccacacccctgtc
tcacagccccggcggaacttttttcctcagttgggATAAAagttcctatt
gaaatcccaatggtgatagaaatttgattgttccaattccagtggggatg
ggtttggagtgcaattgttaaacatttaatttcgagtggggataaaatct
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ctatataacgttagatgaacgtctaaacaacgttgtgtgccaggaGAAAC
TCATTCAATTTTcgttaaaattttaaacattttagagTATATTGTGATCC
TGGCTATTATCCACCTGATTGTGAACGAAAATATTGTGTACCAGTGAACA
ATGAAAAAGGTTAGATACATGGttgatttcattgattttaacCTTTATTT
AATTGCTCACGGTATGGTGTGTTTTATGAACactccctcccccccccccc
agcagcGAAGGCTCTGTttacgccatcacgccaaaaaaaacagttaaTTT
CGCcattattaaaaaaagatttcttatcaatcaataatcaatcaGTCACG
TGTATCACGCTTATTGAAATCATAGATCACACCATCACGCCAACTGCTAA
GGTGACCTCTTGTAGAGCTCACCGACACACGCGTGTCTTCTGCAAGCCCG
GTggaacaaccgttaaagtggggaggctaTATGCTCAAAATGACattaaa
aaaatctcatttgctcaaaagtggggaggttGATGTCATCTCTTCCACCG
GGTCTGTTCTGTGCTCTTTTTCATAATCTTGAAGAAAGGTTGAGTTATCA
AAAGTGAAACAAACATTACTTAAAAACATCAACTTAAATAGTTCAGTGAT
AGAGATTTTAAGTgttcaaatgaaaaattttggattagTTAATATATCCT
TGATTCTTGTTCCAAACAGGGCACTACAATTGTACGCATCTTGGTGATAA
ACAATGTTTACCAGGTTGGTCAAATATGACCAGTAATTGCACAATCAGAT
ACTGTAAACCTACAAACGACTCCATCAATGGTCATTATGCCTGCTCTGAG
AATGGAACTAAAATCTGTTTACCAGGTTGGATTAAACCAGAATCGAATTG
CATCATTAAACTCTGTCAGCCTTCAAATGATACTAATGGTAATTTTGTAT
GTGATCGAAAAGGCAATAAGGTTTGCTTGCCAGGCTGGGAAAATACTTCA
AAGAATTGTACTATACGTTATTGTGAGCCGAGAGATGACAAGTCTGGACA
TTACAATTGTGGTGAAAAAGGCGAAAAATTATGTTTGATAGGTTGGGAAA
ATCCTGATAGGAACTGCACTATTCATTTTTGTCAACCTCAAAACGATTTA
CTTGGACATTATAAATGCTCTGAAAAAGGTGAGAAGATTTGTTTGGCTGG
ATGGACAGATTTAGATTCAGATTGCACAGTGAAAGTATGTGAACCTAGAG
ATGACGAATATGGACATTATTACTGCGATGATATTGGTGATAAAGTCTGT
TTAAATGGTTGGCTGAATACCACTTTGAATTGTTTAGTGAAAACTTGCAC
acccaaaaatgattttactggACATTACAAGTGCTCAGAAATGGGTGACA
AAATTTGTTTAGATGGTTATGTGAATCCTAGCTTAAACTGTACAATCAAA
GAATGTCATCCACAAAACGatgatgaaaatggtcattACTCTTGTTCAAA
GACAGGAATTAAAATGTGTATGGGAGGATGGACGAATGAGGGATTGAATT
GTACAGTGAGGTTTTGTGAAGCACAAAATAGCACGGATAAAGGACATTAT
GTTTGTGATGAGAAAGGCAAGAAGATTTGCTTGGAAGGATGGATGGATGA
GGAAAGCAATTGTACCATCAGTAAGAAATATAATCCTCATCTCTGTAACC
AACTTGGGACCCACCTCAAGCATCCAGCCCATTGGGAATTCTTTAACCTA
CTTCCTCGACACTCAacactgatttttttttcgatattgACCCATAagaa
ccccttctcacagaaccaCTGGGAACACTTTTCACTgtaaaaattgtcca
aaatatcatcccctGTGGGAAATTATGCaacaatttttgtccccgctgaa
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ATCCCCACTGTATTTTGtgacttaaaaacaatggaATCTAATTCCCCAGT
CATATAAAATATGGGAATTTCaattcccatcgagtttcaattggttattt
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AGATCCATAAAAACATCTTCACAGTATATTCCCTTAATTTAGAAGAGGAA
TTACCACCATTTAAATACAACAGAAAACCATCATTGAAACGTTCGACATC
GGTTGATAAAGAGCACCCTGCAGCATACTATGCGTTTATTAGTGTTCCTA
TAATTGTTATAATAGCTGTCATCGTAGCATTATCAAGGTAGGTAaccttt
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GTATCCAAacttacttaaaaaaaaaaaaagtctattcacgataagtgtgc
actcttttttcatttacctataatttttgaaggaattcttcaatctttat
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aaaaaacttaaaacttcataaaaaaatgaagatgaaaatgaagaagaaaa
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agtgagggggccaacgttttggaaaaaatgtgggcgacgaagaaaatctT
TCACTGTTTAcgccctcaaaacaccttaaaacaaTATCTAAAGTGGGGGG
CCCATAGACATTGAGACATGCGCAAAATGATTCTGTCTGTAGTCACAGGT
TGttttttttGAAGGATGAATTCTCGAGAAATTCTAAGCGACATCCCTGT
ATCGGTGAACCGGTCAGATTCCGGTGGAGAAAATCACCAGCCCCGGTGGG
ATAGTGAGTTAAACACGGTCAAAGTTTATGGAAATCCTCTATTTCGATCA
AAACTGGGATTTATGGTCTACCCGGTCAATAATCGTACTGATAGATCACC
CCAGTTCAAATTGCAAGAATGAAACATTTAATGAATTCTAGGAATAAAAG
CGTGAAGTTATTTTTCCTACCCCAGTGAAAATGAGTTAAAATATCTCACC
CCAGTGAGCTTTTGAGATCTCAAAATTAAACCCAgtaaaattttactatt
ttcatagTCAACCCTAAAATTCACAGGGTCACTGAGAAAAGGGGTGTTAA
TCTATTTTTAACTATTATTCTTCATTTAGGATACGTGGAGCAAAATATGA
CAAATTCGAAAATCCTCAAGATGGCTTCCCTATGCAACAGACTAGTATGA
CCCTAGATACAGCTGACATCAGCATTTATGGTTCAAATCGCTATCAATAC
AGAGACCATTATTCAGATACGAACTATCTTGTAGAAAGTTTATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000031_pilon:1090727..1098121+ >XLOC_045254 ID=XLOC_045254|Name=XLOC_045254|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4230bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:1090727..1098121+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGAAAAATAAAAGCTGTCGAATATTTATTTTCTCTATTTGTCATTGC ACTTCTAGTTCAGATGGGAAAAATAAAAGCTGTCGAATATTTATTTTCTC TATTTGTCATTGCACTTCTAGTTCAGATTACCGAAGGATCTGGCAAAGCT ATTGTTCATTTTCTGGATTATCAGAACCCTTTATCAACAAAACTGAATGG AGAATGTTGCAAAGCCCGTCCAAATCACCAAGAAACATCTCTGAGGACTC CAACTAATTTACCAGACGAATCTGGTGTGAACAATAACACGATTACCAAA TCAACACCTTTATCTTTGGTGAAGGAAAACAAAACTGTACATCAATCTCG AAGTCCAAGGTCAGCTCTGGCAAAACCACCAAGAACCAAAGAAGCATCTC AACGACATGAATCAAATTTGGGAAGCATAAAACAACAACATTGCACATCC GCCTGTCATAATGTCTTTTATCTTTGCATTTCTGACATTACTGGCAAGCC ACCTTGTGACATGGTTCAATTAGATAGTCGAAGAATCGATTCTGATGACA TTGAATTTTCTGGTGATGAAAGAGATACTAGGATGGCGTATCCTTTTAAT TACACTTTCTATAAATGGAGTATTACCGAAGGATCTGGCAAAGCTATTGT TCATTTTCTGGATTATCAGAACCCTTTATCAACAAAACTGAATGGAGAAT GTTGCAAAGCCCGTCCAAATCACCAAGAAACATCTCTGAGGACTCCAACT AATTTACCAGACGAATCTGGTGTGAACAATAACACGATTACCAAATCAAC ACCTTTATCTTTGGTGAAGGAAAACAAAACTGTACATCAATCTCGAAGTC CAAGGTCAGCTCTGGCAAAACCACCAAGAACCAAAGAAGCATCTCAACGA CATGAATCAAATTTGGGAAGCATAAAACAACAACATTGCACATCCGCCTG TCATAATGTCTTTTATCTTTGCATTTCTGACATTACTGGCAAGCCACCTT GTGACATGGTTCAATTAGATAGTCGAAGAATCGATTCTGATGACATTGAA TTTTCTGGTGATGAAAGAGATACTAGGATGGCGTATCCTTTTAATTACAC TTTCTATAAATGGAGTGGTCAAATTGAATTAGACGTTATCGTTCTTGACG GAGCTAAACACGCAAAAGATCTATCCTATACTATCAGTTCAAACAATGTG AAAACCATCAATATGACAGATACAATCGCCACATTCTACATGAGACGTCA AATCTCAGCATACAGCAAAGACGAAGAATCTTGGATCAAAACACAATTAG TTAGCCATAATAATAAGACATTAGATTTGAGAATAAAGGTCAAATTGAAT TAGACGTTATCGTTCTTGACGGAGCTAAACACGCAAAAGATCTATCCTAT ACTATCAGTTCAAACAATGTGAAAACCATCAATATGACAGATACAATCGC CACATTCTACATGAGACGTCAAATCTCAGCATACAGCAAAGACGAAGAAT CTTGGATCAAAACACAATTAGTTAGCCATAATAATAAGACATTAGATTTG AGAATAAAagTATATTGTGATCCTGGCTATTATCCACCTGATTGTGAACG AAAATATTGTGTACCAGTGAACAATGAAAAAGagTATATTGTGATCCTGG CTATTATCCACCTGATTGTGAACGAAAATATTGTGTACCAGTGAACAATG AAAAAGGGCACTACAATTGTACGCATCTTGGTGATAAACAATGTTTACCA GGTTGGTCAAATATGACCAGTAATTGCACAATCAGATACTGTAAACCTAC AAACGACTCCATCAATGGTCATTATGCCTGCTCTGAGAATGGAACTAAAA TCTGTTTACCAGGTTGGATTAAACCAGAATCGAATTGCATCATTAAACTC TGTCAGCCTTCAAATGATACTAATGGTAATTTTGTATGTGATCGAAAAGG CAATAAGGTTTGCTTGCCAGGCTGGGAAAATACTTCAAAGAATTGTACTA TACGTTATTGTGAGCCGAGAGATGACAAGTCTGGACATTACAATTGTGGT GAAAAAGGCGAAAAATTATGTTTGATAGGTTGGGAAAATCCTGATAGGAA CTGCACTATTCATTTTTGTCAACCTCAAAACGATTTACTTGGACATTATA AATGCTCTGAAAAAGGTGAGAAGATTTGTTTGGCTGGATGGACAGATTTA GATTCAGATTGCACAGTGAAAGTATGTGAACCTAGAGATGACGAATATGG ACATTATTACTGCGATGATATTGGTGATAAAGTCTGTTTAAATGGTTGGC TGAATACCACTTTGAATTGTTTAGTGAAAACTTGCACacccaaaaatgat tttactggACATTACAAGTGCTCAGAAATGGGTGACAAAATTTGTTTAGA TGGTTATGTGAATCCTAGCTTAAACTGTACAATCAAAGAATGTCATCCAC AAAACGatgatgaaaatggtcattACTCTTGTTCAAAGACAGGAATTAAA ATGTGTATGGGAGGATGGACGAATGAGGGATTGAATTGTACAGTGAGGTT TTGTGAAGCACAAAATAGCACGGATAAAGGACATTATGTTTGTGATGAGA AAGGCAAGAAGATTTGCTTGGAAGGATGGATGGATGAGGAAAGCAATTGT ACCATCAGGCACTACAATTGTACGCATCTTGGTGATAAACAATGTTTACC AGGTTGGTCAAATATGACCAGTAATTGCACAATCAGATACTGTAAACCTA CAAACGACTCCATCAATGGTCATTATGCCTGCTCTGAGAATGGAACTAAA ATCTGTTTACCAGGTTGGATTAAACCAGAATCGAATTGCATCATTAAACT CTGTCAGCCTTCAAATGATACTAATGGTAATTTTGTATGTGATCGAAAAG GCAATAAGGTTTGCTTGCCAGGCTGGGAAAATACTTCAAAGAATTGTACT ATACGTTATTGTGAGCCGAGAGATGACAAGTCTGGACATTACAATTGTGG TGAAAAAGGCGAAAAATTATGTTTGATAGGTTGGGAAAATCCTGATAGGA ACTGCACTATTCATTTTTGTCAACCTCAAAACGATTTACTTGGACATTAT AAATGCTCTGAAAAAGGTGAGAAGATTTGTTTGGCTGGATGGACAGATTT AGATTCAGATTGCACAGTGAAAGTATGTGAACCTAGAGATGACGAATATG GACATTATTACTGCGATGATATTGGTGATAAAGTCTGTTTAAATGGTTGG CTGAATACCACTTTGAATTGTTTAGTGAAAACTTGCACacccaaaaatga ttttactggACATTACAAGTGCTCAGAAATGGGTGACAAAATTTGTTTAG ATGGTTATGTGAATCCTAGCTTAAACTGTACAATCAAAGAATGTCATCCA CAAAACGatgatgaaaatggtcattACTCTTGTTCAAAGACAGGAATTAA AATGTGTATGGGAGGATGGACGAATGAGGGATTGAATTGTACAGTGAGGT TTTGTGAAGCACAAAATAGCACGGATAAAGGACATTATGTTTGTGATGAG AAAGGCAAGAAGATTTGCTTGGAAGGATGGATGGATGAGGAAAGCAATTG TACCATCAAAGAGGAATTACCACCATTTAAATACAACAGAAAACCATCAT TGAAACGTTCGACATCGGTTGATAAAGAGCACCCTGCAGCATACTATGCG TTTATTAGTGTTCCTATAATTGTTATAATAGCTGTCATCGTAGCATTATC AAGAAGAGGAATTACCACCATTTAAATACAACAGAAAACCATCATTGAAA CGTTCGACATCGGTTGATAAAGAGCACCCTGCAGCATACTATGCGTTTAT TAGTGTTCCTATAATTGTTATAATAGCTGTCATCGTAGCATTATCAAGGA TACGTGGAGCAAAATATGACAAATTCGAAAATCCTCAAGATGGCTTCCCT ATGCAACAGACTAGTATGACCCTAGATACAGCTGACATCAGCATTTATGG TTCAAATCGCTATCAATACAGAGACCATTATTCAGATACGAACTATCTTG TAGAAAGTTTATAAGATACGTGGAGCAAAATATGACAAATTCGAAAATCC TCAAGATGGCTTCCCTATGCAACAGACTAGTATGACCCTAGATACAGCTG ACATCAGCATTTATGGTTCAAATCGCTATCAATACAGAGACCATTATTCA GATACGAACTATCTTGTAGAAAGTTTATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000031_pilon | genome | sc0000031_pilon:1090727..1098121 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1951-2115:7231 |
| Aaloc | 1807-1947:5545 |
| Aaloc | 856-1803:4022 |
| Aaloc | 781-852:3387 |
| Aaloc | 559-777:2555 |
| Aaloc | 64-558:1530 |
| Aaloc | 1-63:1 |
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