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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000031_pilon:849804..852842+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045246 ID=XLOC_045246|Name=XLOC_045246|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3039bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:849804..852842+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTAGCACTGGTATAGAGAAGAGATTATTTTTCACAGCTTTACCAGA
CCTGTCTATGTTAACAGCATTTCGTGCAGCTTTTACATCAAAACAGGAGA
TTATTGGTATTCAACCACCTTGTTGCAGGTACATATTAGTTTTTGTTATG
atttattttccttggaaaatacacaatttcatttttcatcattttacaaC
TTAGTTTAGACTGTTTAGTCTAATTGCAGCAGTACAATTCTGAAGTTTTC
AACTACACAATGGTTAGTGATTTTCCTTGTTAAATATACAGAACACTAAC
TAGTTTAGTAAAGATATTTGTAGAAGCAGCAAAATACATGTTAAATGTAA
TAATGTGTTGTATATTTAATAGAAtcattaatgaaaaatttacttaTCCT
GGAAATTTAATTTCGTCATTTAAATCTTTTAGAGAACTAATATTTACACT
ACCAGAGATTTTGGTTTCACCAGCTTTCGACAACAAATCTAACCTATTCA
TTATTGCTGAGGTAAGCTTCTTCTTCAAGGTTTTTCCTTTTGATCTGCCT
TTGAAAGCATACCAGATGTACCAATCTATTGCatattattttgaaacaaa
ttaaaatttgtttaaataTAATCTGATATTCAGGAGTGGaaaattccaaa
aagatcaaaaatgaaaatgaaaatagtcATCTGCGCTGCAGATtttattg
agacagactttgaAATCAAGAAGATATAAAAACCTGGCGTGAAAGTCTTG
TTATCTTTTCTTAGTTTATAACTTAAGTTAATAATTTTGGTCATCTTGAC
AATGGTCTTTACAAgtaaaaaacaaagtaaaaaaatgtacaacaattttt
tggggaattcaagaaaaaatatttaattgcACAAATGGCAGTTTAGAAAT
AATAAATTTCAtggtaaaaaaataacaaatttcgCGAAAGTATAAACATT
GGAAAGCAGTGATAGGCTTCCAGACCAAACTGTGTTTTTATGTTTGATGT
TTTTTGGTATGCTAAatctttcttcctttttttttcagaaaaagctTTCA
TCATCTGCTGACTTCTCCAAAACTCTTGAACGTTTACAAATAAAGGTTTG
ATATGTCATATTTATTCCTTTTCCATGTACCCTTTGAATCAGTGGCACTA
ATGATGAGACAGGCAGATATTTCAGTTTGGTATGAGGTCCTGCATTAAAA
AAGGATTGCAGACTTTTGCCAAAGTATTATACTTACGCAAAACCGTAATT
TTTGATTTCTCAATACTGGATTGATTTATATTTCCAATATATAACGATTG
CTTTAATTTTAACTTAGAATTGCtattaacattttcttatttcgATTATG
TCCATTGTCTTCTTAGCTTTGTACCAGACTAGAAGTTGATGCAGAATTGT
TCGAGTACTGCTTGACTTATACTCTTTATCAAAAGTTGGCACCGTTTTGG
AATAGAACCAATTCATTCCTGGTCAGAGGTAAATCAGTCAAGTTACTTGG
TTAATATCATCTTATTTCATAAAAGTATTCAAAGTTGCTTAAACAATATA
TTGTAATTCcaaattgaaaaacttaattgaataaataaactCTTTTCTAC
TTCAGGTCGAAATTTCCTTCAAGTTAAAGACAAGCTTTCTGCAACCGGTA
AGAATGGTTCAATTCTGTACTGACTCATGGAAGGTATGTGAGAAAATCTC
CAATAGCACACAGCTATGCAATtatcataattattacttttaatatttga
cataaattcaatcccacaatccttttcatcttgattcatAATGCTTTATT
AATTTTGTATTGTCGATGAGTGTAATTaacttgcaaaagcaattaatgca
aaggatgatggAATTAAAACTCAGACAAACAGTcattttgatgtctattt
ttagagtcactgcggtatgctattgAAAGAAACTCATGTTATCTTCAATA
TAGCTAAGCTCTGGAATGACTTAAGTCAGCTTTGAACTCCTATCCAACAC
CTTTCATTCGAATTTTTCGTAACAGGTCTTGAACTTTACGTGACAGACAA
GATTTGTATTGCTATGGAACCATTCCAGATTCGATCTCCTCCAATTGAGG
TTAGTATCATTATCTCAATTTTCagtaacttgaaattttttgagttttat
taaTGTGCCAGAAATCTCAGTTGCTCCAAAAGCGATCCTCTATGGATTAG
AAACGACACTAGGTTAAAATCATTTTGACTTGTTCTCTAATGGGAACCAA
AACATGATCTTTAACTTATATAGACTTCTGCGACAAAAACGAATAGCttt
tagatttatttagatcctgactgactTAGAACGACACTAAATTAGCACTT
TAGAACTGCAGGCTTTTCATAATCGTTTCTGTCACGTATACAATAAACTG
ACTAATGatgatttttaggaaaatacggtcttaaaaaatttaattagtGA
CAGTTTTCTTCTTcccaaatgtttttaaaatcataATCAATCACTTTTCA
AGTAAGGTTTGGAGAAGTCcactttatctttttttttttcaaagctaAGA
CTTTCATTGAGatcaaatttgatcaaattaaTTCTGATATAATTTACATT
CATTCTAACAGGTGGAAGATTTCACGATTGATTTTAAATCTCTATGGAAT
TTCAAACGTGATTCATCAGCTAAGATTTCTGGTCATTCGATTGAAGACTC
CATCTGTTATGTTTTGCCAAGGTACGAAATGACATTTCCATTGTTCAATG
TCTTCAATTGCAGGCAGAATTCCGTCTTGACCAAGTTCATAAAGTGATAA
TTTTATCTCAACTTCCAAAACACTTCAAGAGACTGGATGAATTTTTTCCT
GTCTGATATAAAAATGTTgcaacaaaatctttcaagGGACTAAGAATGTT
TATGAATTATCTATCATaagattatttatttatttcatcttTTAGTTTTC
GTAAATGTCACATAACATCGATAACACATTCTATTCCAAAAAATACGCCT
TTCAAAGACTATAATGCTTTAAAACAGCATTGGAAACTA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000031_pilon:849804..852842+ >XLOC_045246 ID=XLOC_045246|Name=XLOC_045246|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1392bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:849804..852842+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTAGCACTGGTATAGAGAAGAGATTATTTTTCACAGCTTTACCAGA
CCTGTCTATGTTAACAGCATTTCGTGCAGCTTTTACATCAAAACAGGAGA
TTATTGGTATTCAACCACCTTGTTGCAGATGGCTAGCACTGGTATAGAGA
AGAGATTATTTTTCACAGCTTTACCAGACCTGTCTATGTTAACAGCATTT
CGTGCAGCTTTTACATCAAAACAGGAGATTATTGGTATTCAACCACCTTG
TTGCAGAGAACTAATATTTACACTACCAGAGATTTTGGTTTCACCAGCTT
TCGACAACAAATCTAACCTATTCATTATTGCTGAGAGAACTAATATTTAC
ACTACCAGAGATTTTGGTTTCACCAGCTTTCGACAACAAATCTAACCTAT
TCATTATTGCTGAGaaaaagctTTCATCATCTGCTGACTTCTCCAAAACT
CTTGAACGTTTACAAATAAAGaaaaagctTTCATCATCTGCTGACTTCTC
CAAAACTCTTGAACGTTTACAAATAAAGCTTTGTACCAGACTAGAAGTTG
ATGCAGAATTGTTCGAGTACTGCTTGACTTATACTCTTTATCAAAAGTTG
GCACCGTTTTGGAATAGAACCAATTCATTCCTGGTCAGAGCTTTGTACCA
GACTAGAAGTTGATGCAGAATTGTTCGAGTACTGCTTGACTTATACTCTT
TATCAAAAGTTGGCACCGTTTTGGAATAGAACCAATTCATTCCTGGTCAG
AGGTCGAAATTTCCTTCAAGTTAAAGACAAGCTTTCTGCAACCGGTCGAA
ATTTCCTTCAAGTTAAAGACAAGCTTTCTGCAACCGGTCTTGAACTTTAC
GTGACAGACAAGATTTGTATTGCTATGGAACCATTCCAGATTCGATCTCC
TCCAATTGAGGTCTTGAACTTTACGTGACAGACAAGATTTGTATTGCTAT
GGAACCATTCCAGATTCGATCTCCTCCAATTGAGGTGGAAGATTTCACGA
TTGATTTTAAATCTCTATGGAATTTCAAACGTGATTCATCAGCTAAGATT
TCTGGTCATTCGATTGAAGACTCCATCTGTTATGTTTTGCCAAGGTGGAA
GATTTCACGATTGATTTTAAATCTCTATGGAATTTCAAACGTGATTCATC
AGCTAAGATTTCTGGTCATTCGATTGAAGACTCCATCTGTTATGTTTTGC
CAAGTTTTCGTAAATGTCACATAACATCGATAACACATTCTATTCCAAAA
AATACGCCTTTCAAAGACTATAATGCTTTAAAACAGCATTGGAAACTATT
TTCGTAAATGTCACATAACATCGATAACACATTCTATTCCAAAAAATACG
CCTTTCAAAGACTATAATGCTTTAAAACAGCATTGGAAACTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000031_pilon | genome | sc0000031_pilon:849804..852842 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 604-696:2947 |
| Aaloc | 493-600:2612 |
| Aaloc | 421-492:2028 |
| Aaloc | 379-417:1608 |
| Aaloc | 265-375:1367 |
| Aaloc | 208-264:1039 |
| Aaloc | 130-207:434 |
| Aaloc | 1-126:1 |
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