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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000031_pilon:711746..716494+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045241 ID=XLOC_045241|Name=XLOC_045241|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4749bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:711746..716494+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTACTATTTGGTCAAACCGATACCCTGGTTATTCTAACAGAAAATGAACA
TTATACAAAAGAGTTATACACGCAACAATGTGTGCAAAGGACACCACATA
AGATATGGTTGGTACCAAAGCTGATGCAAAAAGAATACTTTGAAAACAAC
ATCGAGAAATGGCTCAGAGATGGAATTCAAAAATTTGTCATCTTATGTTC
GCTGGAATCGACATCTTTGTTATTAGAATTAACCAAAGGTTTATTAATTT
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CTGGGAAGTTTACCGAGTATGGTGGTGGCTGTTGAAGATGGCAACAATGA
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TTGTACACCGATTCAAGTGAACTGTTAAAGTATCTTTTAAAGTAAGACCA
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caatgggcttttccagaaagacTTTttaccccactgttgaggatattgat
ttttcgaagtatcgaaacccctggatatcctactttattattAAAGACCC
CTGGatctccactcttaaaaatatgctcaccccctggatattctttctat
aaagatgcttacctcctggatatcgtatcttttacttgaaaagacacttt
accccctggatatccgattcTGGAAAGTCCAATCTATTCAGTTCATATTA
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ACTTTCATCATTCGTACAGGAAAATTACCAACTGCAATTGAGGGTTGTAA
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AGGACCATATTGTTGCATTGGTTATTTGATCGATATGCTGGAATCGTTAG
AAGAGGATCTAATGTTTCaatcttatttatattttgtcGCCGATGGAAAA
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TAAAGGAAAAGCCGATTTGGCTTTAGCCTCGTTAACTATAAACACAAAAC
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TTGATAAGTATACTGGAAGAGAAAGCGCTACCTTTTGCTAATCTAGAACC
TTTCAAAGCTATCGCACTTGATTTATGGATTGGAGTTATAGTCGTACCGA
GTTGTACCGTATTAATTATTGTAATTACGGACAGGATAGGTGCTGGAAAA
CAGTACGCTCTTCGTGAGAGTTTTACCTACATTATGGGCTTACTTTTCCA
AAGAGACATGGGCGGTAAAAATCCAATTAGTTGGAGTTCGAAAGTCATAG
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TTGTTGACAGCAAATAGTGTAACGTTTACACGAAGTCTTGGAATATCTGG
ATTCGATGACCCAAAGGTATAACTTactattcatttttttatctaCACGT
ATCAACCTGCGGGTGAATACACAGGATGCGAACATGTGATTACTccaaaa
agttcacgtgattttattcccatgttccTTGTTTTACAACTTAacgctga
taactttattagtgtcaataatctcgaaccaatcagaaataaatgtcatg
taacaagcacataaaaatttcgaataaaagcgtgatttgttatcagactt
taattttgcaaccgatgtatttgcagttttttattagtttttgcattgac
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tataagaaccatggccaaaatatcaagaacaagctaagaacaatttaagg
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AGATCAATTTGTTGTTCAAATGAACTTGATATCATCTCAAAGATAAATAA
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ACTGGaatatttggccaaaatttcgtccccggtggtaaAAAGACCCTACA
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ATTAGGGAGACTTGCTTGTAACGATTACACGCTTTtgtataagaatagtg
tacagtatatccatttcatcatggatatttttaacattttggtaaaaatc
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TAAAACGTTATGCCaagcagtggcgtggtgggaaaatttctctggggtag
ccaaggcaaatatggtgcccttttaaaagattttttgtttttggcgcccc
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cgagcgaagcgagccagaaaatttttgaggtgatgaggggcgccattttt
gttttttcatttgtcaatctttcgatatgggcgcctgaaaaatccttctt
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taaaaaatgccccAAATTTAGCCTAAATTTAGCATTCTTAGATTCAGTTT
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TAATATTCTTATAGACTAAATTCTAACAAGAACTGTCActttttaaaact
tgaaaaccaATTGGATTCATACTTAAATTTGATTGGTTTCCtcttatttt
tatattatttagaTCAAAAATCCAACACGAGAGTTTCGTTATGGTACAGT
TGCCAACTCGGCATACACCCAATTATTTGCCAACAGTCAAGATCCTGTGT
GGAATCGAATGGCACAGTTCATGAAAGATTACAATTTTACAAATACATCA
AAAGCGTTTGAGCAACTGGCTACTGGGTATGGACCATTATAGTCTTAACT
TAAATCTCCCTATCTTAGAATGCCAACACAGAAATAGCACAATGAGGTTG
AAGGTTTTTGAGAAATCAGATCACTAAAAATCAGATTACAAGATGTTCAC
TCCTCGTTTTCTGAAAAAGACTATTTTTGTCTCCCTTAATTTGTCAATGA
ATATCAGATTGCCAATTCTGTGTTCGAGTTTATTTCACTAATCAATCATT
TTAGAGAACTGCAAGCTATCATACACGATTACTTCATTGCATACCACAAT
ATCGCTAAAGACACAAACTGTAGATTCAAATTTGCTGGTGAGTCGATAAA
AGATGGTGGTTCAGGGTTGGCTGTACAAAAAGGGTCAAAACTAGCTAACC
AAATCTCCACGctaattttgaaatatcaagaccaagaattttttttacaa
ctgcaacaaaaatggatggaaaataaATGCGTTGAAACGTCTAAAGGATC
GTCGCCAGGGGCAACCAATAATAACAATGTAGTCGTTCGAATCGGTAAAG
AATATTTTGGGGGAGTTTTTATTGCACTTTGTGGAGTAActttaatttct
tttggaatATTGGTTGTAGAATATTTATTGAATCGAAAAATTCACACAAG
AACTTATTGGGTTTCTGAAAGACGGAGAAAAAGATGGAGAAGATATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000031_pilon:711746..716494+ >XLOC_045241 ID=XLOC_045241|Name=XLOC_045241|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3738bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:711746..716494+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTACTATTTGGTCAAACCGATACCCTGGTTATTCTAACAGAAAATGAACA
TTATACAAAAGAGTTATACACGCAACAATGTGTGCAAAGGACACCACATA
AGATATGGTTGGTACCAAAGCTGATGCAAAAAGAATACTTTGAAAACAAC
ATCGAGAAATGGCTCAGAGATGGAATTCAAAAATTTGTCATCTTATGTTC
GCTGGAATCGACATCTTTGTTATTAGAATTAACCAAAGGTTTATTAATTT
CAAGTTTAGAACCTTTATTTTTCATTACCAGTCGACAGCCAATGTATTTC
CTGGGAAGTTTACCGAGTATGGTGGTGGCTGTTGAAGATGGCAACAATGA
AaaTTACTATTTGGTCAAACCGATACCCTGGTTATTCTAACAGAAAATGA
ACATTATACAAAAGAGTTATACACGCAACAATGTGTGCAAAGGACACCAC
ATAAGATATGGTTGGTACCAAAGCTGATGCAAAAAGAATACTTTGAAAAC
AACATCGAGAAATGGCTCAGAGATGGAATTCAAAAATTTGTCATCTTATG
TTCGCTGGAATCGACATCTTTGTTATTAGAATTAACCAAAGGTTTATTAA
TTTCAAGTTTAGAACCTTTATTTTTCATTACCAGTCGACAGCCAATGTAT
TTCCTGGGAAGTTTACCGAGTATGGTGGTGGCTGTTGAAGATGGCAACAA
TGAAaaCTCCGGTGATCCGACAGAAAAGAACTTTGACTTCTACATACACG
ATGCAATATACCATAAATGGAGGACCATCAACTACCACGACCTTATGCAC
CAACATTATACCAGTCTTGAACTCCGAGACCTCATCGAATCATATCCACT
TTCATCATTCGTACAGGAAAATTACCAACTGCAATTGAGGGTTGTAACAG
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gATGGTTCGTGCGTTGTTGGTAAGATTTGCTGGAAGCCAAACAATAAAGG
ACCATATTGTTGCATTGGTTATTTGATCGATATGCTGGAATCGTTAGAAG
AGGATCTAATGTTTCaatcttatttatattttgtcGCCGATGGAAAATAT
GGAGAAATCGTGAACGGTTCTTGGGTTGGCATGGTCGGTGATTTGGTTAA
AGGAAAAGCCGATTTGGCTTTAGCCTCGTTAACTATAAACACAAAACGAT
CTGAGGCTGTAAGCTATTCACTACCTTTCCTTGTTGGTGGTATGATATTG
ATAAGTATACTGGAAGAGAAAGCGCTACCTTTTGCTAATCTAGAACCTTT
CAAAGCTATCGCACTTGATTTATGGATTGGAGTTATAGTCGTACCGAGTT
GTACCGTATTAATTATTGTAATTACGGACAGGATAGGTGCTGGAAAACAG
TACGCTCTTCGTGAGAGTTTTACCTACATTATGGGCTTACTTTTCCAAAG
AGACATGGGCGGTAAAAATCCAATTAGTTGGAGTTCGAAAGTCATAGCTT
TGAGTGTTGCTATGTTTACCTTGGTTGTCATGTCAACGTATACAGCATTG
TTGACAGCAAATAGTGTAACGTTTACACGAAGTCTTGGAATATCTGGATT
CGATGACCCAAAGCTCCGGTGATCCGACAGAAAAGAACTTTGACTTCTAC
ATACACGATGCAATATACCATAAATGGAGGACCATCAACTACCACGACCT
TATGCACCAACATTATACCAGTCTTGAACTCCGAGACCTCATCGAATCAT
ATCCACTTTCATCATTCGTACAGGAAAATTACCAACTGCAATTGAGGGTT
GTAACAGTAGTTGAAGAACCTTATATGATGATTGCtaatttttcgaatgt
ttttgaagATGGTTCGTGCGTTGTTGGTAAGATTTGCTGGAAGCCAAACA
ATAAAGGACCATATTGTTGCATTGGTTATTTGATCGATATGCTGGAATCG
TTAGAAGAGGATCTAATGTTTCaatcttatttatattttgtcGCCGATGG
AAAATATGGAGAAATCGTGAACGGTTCTTGGGTTGGCATGGTCGGTGATT
TGGTTAAAGGAAAAGCCGATTTGGCTTTAGCCTCGTTAACTATAAACACA
AAACGATCTGAGGCTGTAAGCTATTCACTACCTTTCCTTGTTGGTGGTAT
GATATTGATAAGTATACTGGAAGAGAAAGCGCTACCTTTTGCTAATCTAG
AACCTTTCAAAGCTATCGCACTTGATTTATGGATTGGAGTTATAGTCGTA
CCGAGTTGTACCGTATTAATTATTGTAATTACGGACAGGATAGGTGCTGG
AAAACAGTACGCTCTTCGTGAGAGTTTTACCTACATTATGGGCTTACTTT
TCCAAAGAGACATGGGCGGTAAAAATCCAATTAGTTGGAGTTCGAAAGTC
ATAGCTTTGAGTGTTGCTATGTTTACCTTGGTTGTCATGTCAACGTATAC
AGCATTGTTGACAGCAAATAGTGTAACGTTTACACGAAGTCTTGGAATAT
CTGGATTCGATGACCCAAAGaTCAAAAATCCAACACGAGAGTTTCGTTAT
GGTACAGTTGCCAACTCGGCATACACCCAATTATTTGCCAACAGTCAAGA
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ATACATCAAAAGCGTTTGAGCAACTGGCTACTGGaTCAAAAATCCAACAC
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AACTGCAAGCTATCATACACGATTACTTCATTGCATACCACAATATCGCT
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CCACGctaattttgaaatatcaagaccaagaattttttttacaactgcaa
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AGGGGCAACCAATAATAACAATGTAGTCGTTCGAATCGGTAAAGAATATT
TTGGGGGAGTTTTTATTGCACTTTGTGGAGTAActttaatttcttttgga
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CAGGGTTGGCTGTACAAAAAGGGTCAAAACTAGCTAACCAAATCTCCACG
ctaattttgaaatatcaagaccaagaattttttttacaactgcaacaaaa
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CAACCAATAATAACAATGTAGTCGTTCGAATCGGTAAAGAATATTTTGGG
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GGTTGTAGAATATTTATTGAATCGAAAAATTCACACAAGAACTTATTGGG
TTTCTGAAAGACGGAGAAAAAGATGGAGAAGATATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000031_pilon | genome | sc0000031_pilon:711746..716494 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1426-1869:4306 |
| Aaloc | 1261-1422:3913 |
| Aaloc | 355-1260:911 |
| Aaloc | 1-351:1 |
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