XLOC_045232 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045232
Unique NameXLOC_045232
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000031_pilon:500381..507647+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045232 ID=XLOC_045232|Name=XLOC_045232|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7267bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:500381..507647+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TACGATAGCTTTCAGAAAGTCTGTTGCGAGCTAAGAGAAATTAGACTTTT AGAAATTGGTTCAGAGCTTAAAATGGATCCTGAAAAGCAAAGATTGActg aaaacaattttgaattgCAGGAAAATGAGGCATATCTCGCAGAAGAAGAA TTTGGTGAAAAAAGCAATCAAAACCAGAGGATTGACGTTGAAGAGGAACA AAAGGAGATTTCTAATACACCAAAAGGATGCAAAGAGGATGAAGATACAG CTTTCTCCAATCCGTCAAATACAGAAAACAGCGACTCACAATCTGAACCA CTTAAGCAGGTCGATGTTGACGAATTTCTCATACATATAGGACAGTTCGG TCGAGCTCAAAAGCTTCTTCTCTTAATGTTCTATTTACTTGAAGTACCGC ATTCTTACCATACTCTATCCTGGTTTTTCACCGGACATTCTCCACCTTGG AGATGCTCTTTAACGAATAACTTGACCAGAGCACAATGTAATTCAACAGC AGTTTACGATATTGGAGATCCTTTCTACGAGCAACGATGTTTCATGGAGA GAGATGCATGGAATTACACTCTACCACGATCATATTCGATCGTTACTGAG GTATATAAAACCATTTTTCGGTGAcctgggaaaatttttcttgtgGGGAT AAATTTGGTTGCGTCAAAGTTCCTAAAGTTTTAAGTGTTCTTCTGGATAT AGAAATAAAAactggggatttcaataggaaattttatccccactgaggaa aaaagttctaccgggactgtaagacaggggtgttatctataagacagggg tgttatctgtaagacaggggtgttattgtATTGAAATACACTAAATTCTT ATTCCTATATCTAGAAGAACACAATGGGGATAGGAATTATATTGatctaa ggttaaaaaatccagtggggatgcttttggagtgcaattttcaaacattg 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AAAATAGTAATCAGAcgaggctgctggcatccactaacctaacggattcg tgctccttatagaggatgctatACTACCtagggttttgtagaggtctgcg attcagactataaTCAGACGCGTCTTTTTCCGATTCTTATCTTTCGGCGA ACTGTACCTCCACTCACTCACCACTCTAACTCAAGCAATGCTAggggggg gCTCATGAAGTTCAATCGCAAGTATGATTCcaaaattttattctaaaatg tatttttaattttaatctaTACatttagcctagaaatctaagctagtttg attcagtgactaggataaatctgatctTAAGTTGTGACAGACTAACTCTG AGTTACTGATagcagtattccaaggcaaacttaaaatccgtaaatgtAAA ACATCTCAAGGTTTTGTAGTACCGTGATTTACAGACATCATTAAATCTCA GTCTTACCCAACTGTGATTTTCACGGtagcaaatattttttctcctttca gTGGGATTTGGTATGCGATAAAAAAGAATATCCCTTTCTTGCAAACTCCT TGATGTGGATTGGATGGGCTGCTGGTGCATTTGTCTTGGGATTCGTCTCG GATAAgtaagaaataaaaatgatttattcATTCTGATCAATATAACAatc accactttttgattttactggaAGGGCATAAAAACGATTCTGATTGTGCT ACTAGAATTATTGAACAGTGTTTTAAGGGTCTGTGCACTagtttgaattt tgatatgTTCTTAACCGAGGAAAGATTATTTCAAATGCCATAAGATTCTa tataaatcaataaattttcctcaaaagagagaaatttgaaaaggatagca aatttttcaaaagttattttggTATCAAAAACCCGTTTTAGGAACTGATA AACTATCAATTCTGACTTCATCAAGGTTTAcactacaatcagggacaaaa 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AAGATGGCCTCTTGATTTGAATATCACTTAATAGAAGGAGAGGTTTACAA TGACAACCATAAATTGGCTCCCTACAGCCCTTGCCTTTTTAACTCGAATG TTTCTATAACTTGCTTTTATTGCTGGCTTGCTCTTGTATATATTAAAAAG ATTTTAGTTGAGACTATTCGAAATTAAATTTGTCCTTGCTTGAGATGAAC tgtttttgtctttcttttctAGCCTTATGCCTGAATCCATCCGCTGGCTG CGATTGAATCTCAAATCGCAAGAATGTGAAGATGTGTTACGATCTATTTG TCAATTCAACGGACGAAAATGGCCCGATATTGTTTTACGACCACCCTTGA AAACGGAAGATCGTAATGGCAGTTTGTTCAGTTTGTTTACACATAGTAGA TTAGCAACAAACACACTTGTTCAAGGCTTCGTGTGGTAAGTACAGAtttt tagaattgcatgtctttttcttatttttaagccttctgatgttcttaagt tttttagttttaagcctaagcctaaaaatgttcttacttagtatttttga ccattttccaaAGAAACTGGGTGTTTGAGAGCCcataaaacatgaaaatg ttcttagcttgttcttaatattttggccattgaagccttatgttcttata tagtttcttCTTATAAAGGAACACGTATCCTGTCTCAGCTACGATTTTTA GCTAAGCCGTCACTAGGATTTAGGACAAACCATATTCTGCCTCGCAGAtg caatttgaaaaattgaagacaCTACAATTGGACTAGTCAAAACATTCATA CGACTGTAGCTACAAAGCCTTTCCCTTCACAGATATCTTTAACTTTAACT CGATGTTTCTTACCCCTCTAAGGTACCATCTAACTAATGGAGCCCAacgc ccttcagatttctgttTTTCAACACAGTTCACGAATTTTATTTAAAGTTC ACCTAAACTATATAGACGTTTAGTTCGATtactttttatgttttgtgCGA GCTAGGATATTATACCTTTTAAGTTTACCAGCTACTCTTATTTGCTTCCT GCATGAatgttcaaatttaaaattattttttctctgTAGGTTTGTCATCG GTCAAGTCTATTTCGGAATATCACTAGCCTCTGATCAACTAGGAGGAAAC ATATACCGTGATTTTGTATTGACCAGTCTAGTTGGTATCCCTGGCAATAT TCTTGTTATCGTTTTAACTAATAAGTGAGTATTTGATGCAAATATCTTTA AATGAAGAGCATACTCAaattttaactcaaatttttttaGGTTGATAATT GGAATTTGCAAGGTttctgaagaaaagttcttttgaccaAATATGATGAT GAGTGGCATTCTAAATCTAAGTTTAACACCATGATGGGACTTCTAAGAAA TATAATTACTCTCCAAACTCTAATCCAGTCCCTAGATTCCATCAGTGGAC TATCATCAGGGAAATTAAAAGTTGTGCAATAAAGTGgccctgggtacgag attgTTTACTCGCTGTTCTATATGTTACATTTCCTTTCAATAGATATGGT CGTAAACCAACATTGATAGGAAGTATGGCTGTGGGGAGCTTCTCTTGCAT TGGTGTATCACTTATCAATCCTTTGTCAGGTTAGCTTCAAAccacgttaa atggacgttatgGATGTTAGATAAACGTTTTTTCACAGCATAGTCCTTAT TGATCATGTTACCAAGTACTACTcttcttgggattggtttaagatttaat cacatgatcaaaaacttAGCAAGGCTGACTAATTTCTCAGCGCAAGATTA CTATACAGACTTTGATCTCAGACCACCAGTAGTCAGTAGTTAAATCTTAT ACTAACTGGGTAACACTGACGTGATTTGATCTCTATTgaatttttaagct tttgaaaGCATTTGGAAATAATGGTTTTCAATTCCCATTAGTATTCAGCT CCTTGTTTTTGTTGGATTCTCACCGGGTTTTAGATACAgaggttttttca aaatttcaaatcttctAAAGTGTCTGCTTGACTTGATGAAATGATTTTAT TCTTATAGAATTGATTTGGCTTCGAGTAACGTTTGGTATGATTGGCCAAC TATGCTTAGCTTTAGCATTCAGTTCGATGTATTCTTGGTCATTAGAGTTA ATGCCAACCATAATCAGGTAtactatacacccctgtctcacagccttgGT GAGAATTTTTCCCACAGTTGGAATAGAAATCACTATCGAAATCTAAATAG GGACAGAAATTCTATTAATCAAGTCGGAAAATATAGTGGCTGCTTAAGAG TCTAATTTTCCCCCATAAATTTCAGGTAATTTTCCCATCGGGGATGAAAT TTCCAGTGAGGTGGGGTCCAAGGTGTATGGTCGGAGGTTACGAATACCGA AATATTGACGTATTTTACTTGGAACACCATCAACAGTGACAGCAAACATC GGTTAAAATCCTAATTTTGTCGCCTCATGGTACGTTTGACGCCTAATTAC TAATTTAATTTTTCGGTgctttgaatctttttttcagATCACAAGCTATC GGGCTTCTAGGTGTGCTCATACGTTTTGGTGGATCTAGCGCGCCATGGGT TAGTCAATGGTTAGAGCATTTCCATTATACTTTACCATTTGCTGTAATGG GAAGTTTGGCGCTCGTTGCATCCGGACTTTGTGTAAGACTACCAGAAACA TTGAATGTTCCGACTATAGAAACCATTGATGatgcaaaaaggtaaaaaat ttagtaattttcaTACCTCAATTTCGTACCTTAAATCCTTTTTGTTTCGT CTAAAGTTCATCGTTTGATTTTTTCACAAACACACTCACACACTCATGGA CTCTTGAATTAAATAATTGATTCGCTGAAATTTGGGGCAAACTGGGGAGC TATATGTTTATAAGATGGTTAgaataagaacttttttgaaaaaccaaaac aaactactattttcattttcaaaaggtCCTCAGAAAATCACACTGGGCGA aaaaagagatttccaatcctggaaatatcttgaaaatatgatatttccat atactcttgtaaatatggaaatatgacttttctatatttcgaaAGTTGTT GAAGTAATctgaaacatcatattttcaaaatatttccaacttttggaaat atgatatttccaacttttggaaatatgatatttccaaaaaatggaaatag cttgaaaatatgatgtttcaatgaatttcggaattggaaatatcatgaaa tatgatatttccacaactttggaaaaatagaaaagttgatCGGTTGATCA ACCAACCATTGACAGCAGCTGCCTCCTGCCACAATACTACTTTTCACATA TTGAAGCTGTTATTTGCAGTAAGCTTACAATTACATACTTCCAATTATAA TTACAGGCATTTGAAAGGCGAAGAGTTTGCAAAACCATTAACAAACAATA TCATCTCTAATGCTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000031_pilon:500381..507647+

>XLOC_045232 ID=XLOC_045232|Name=XLOC_045232|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3678bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:500381..507647+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TACGATAGCTTTCAGAAAGTCTGTTGCGAGCTAAGAGAAATTAGACTTTT
AGAAATTGGTTCAGAGCTTAAAATGGATCCTGAAAAGCAAAGATTGActg
aaaacaattttgaattgCAGGAAAATGAGGCATATCTCGCAGAAGAAGAA
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AGAAATTGGTTCAGAGCTTAAAATGGATCCTGAAAAGCAAAGATTGActg
aaaacaattttgaattgCAGGAAAATGAGGCATATCTCGCAGAAGAAGAA
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AAAGGAGATTTCTAATACACCAAAAGGATGCAAAGAGGATGAAGATACAG
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CTTAAGCAGGTCGATGTTGACGAATTTCTCATACATATAGGACAGTTCGG
TCGAGCTCAAAAGCTTCTTCTCTTAATGTTCTATTTACTTGAAGTACCGC
ATTCTTACCATACTCTATCCTGGTTTTTCACCGGACATTCTCCACCTTGG
AGATGCTCTTTAACGAATAACTTGACCAGAGCACAATGTAATTCAACAGC
AGTTTACGATATTGGAGATCCTTTCTACGAGCAACGATGTTTCATGGAGA
GAGATGCATGGAATTACACTCTACCACGATCATATTCGATCGTTACTGAG
TGGGATTTGGTATGCGATAAAAAAGAATATCCCTTTCTTGCAAACTCCTT
GATGTGGATTGGATGGGCTGCTGGTGCATTTGTCTTGGGATTCGTCTCGG
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CCTTGATGTGGATTGGATGGGCTGCTGGTGCATTTGTCTTGGGATTCGTC
TCGGATAAATATGGAAGAAAGAAGGTGTTAATGATTTCTTTCTCTGGGAT
GATCACTTTTGCTTTCACTTGTGCCTTTCTACATCAATTCTGGATCTACG
CTTTGATGGCATTTCTCATTGGGTTTTGCCAAGGGGGAATTGCACTCACC
ATCTATGTTATGGCATCAGAATTCGTTGGTCCAAAATACAAAAGTTTGGC
GTCAGGCGCACTGACTGGATTGACATACACACTATCGCTATGTTTACTAA
GTTTCCAGTCTTGGTTGATGCCCGAATGGAGAAAATTATTGGTGGTGACG
TCATTTCCATATCTCATACTATTGTTTTCTTTCGGATATGGAAGAAAGAA
GGTGTTAATGATTTCTTTCTCTGGGATGATCACTTTTGCTTTCACTTGTG
CCTTTCTACATCAATTCTGGATCTACGCTTTGATGGCATTTCTCATTGGG
TTTTGCCAAGGGGGAATTGCACTCACCATCTATGTTATGGCATCAGAATT
CGTTGGTCCAAAATACAAAAGTTTGGCGTCAGGCGCACTGACTGGATTGA
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GTTTTCTTTCGGCCTTATGCCTGAATCCATCCGCTGGCTGCGATTGAATC
TCAAATCGCAAGAATGTGAAGATGTGTTACGATCTATTTGTCAATTCAAC
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TCGTAATGGCAGTTTGTTCAGTTTGTTTACACATAGTAGATTAGCAACAA
ACACACTTGTTCAAGGCTTCGTGTGCCTTATGCCTGAATCCATCCGCTGG
CTGCGATTGAATCTCAAATCGCAAGAATGTGAAGATGTGTTACGATCTAT
TTGTCAATTCAACGGACGAAAATGGCCCGATATTGTTTTACGACCACCCT
TGAAAACGGAAGATCGTAATGGCAGTTTGTTCAGTTTGTTTACACATAGT
AGATTAGCAACAAACACACTTGTTCAAGGCTTCGTGTGGTTTGTCATCGG
TCAAGTCTATTTCGGAATATCACTAGCCTCTGATCAACTAGGAGGAAACA
TATACCGTGATTTTGTATTGACCAGTCTAGTTGGTATCCCTGGCAATATT
CTTGTTATCGTTTTAACTAATAAGTTTGTCATCGGTCAAGTCTATTTCGG
AATATCACTAGCCTCTGATCAACTAGGAGGAAACATATACCGTGATTTTG
TATTGACCAGTCTAGTTGGTATCCCTGGCAATATTCTTGTTATCGTTTTA
ACTAATAAATATGGTCGTAAACCAACATTGATAGGAAGTATGGCTGTGGG
GAGCTTCTCTTGCATTGGTGTATCACTTATCAATCCTTTGTCAGATATGG
TCGTAAACCAACATTGATAGGAAGTATGGCTGTGGGGAGCTTCTCTTGCA
TTGGTGTATCACTTATCAATCCTTTGTCAGAATTGATTTGGCTTCGAGTA
ACGTTTGGTATGATTGGCCAACTATGCTTAGCTTTAGCATTCAGTTCGAT
GTATTCTTGGTCATTAGAGTTAATGCCAACCATAATCAGAATTGATTTGG
CTTCGAGTAACGTTTGGTATGATTGGCCAACTATGCTTAGCTTTAGCATT
CAGTTCGATGTATTCTTGGTCATTAGAGTTAATGCCAACCATAATCAGAT
CACAAGCTATCGGGCTTCTAGGTGTGCTCATACGTTTTGGTGGATCTAGC
GCGCCATGGGTTAGTCAATGGTTAGAGCATTTCCATTATACTTTACCATT
TGCTGTAATGGGAAGTTTGGCGCTCGTTGCATCCGGACTTTGTGTAAGAC
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agATCACAAGCTATCGGGCTTCTAGGTGTGCTCATACGTTTTGGTGGATC
TAGCGCGCCATGGGTTAGTCAATGGTTAGAGCATTTCCATTATACTTTAC
CATTTGCTGTAATGGGAAGTTTGGCGCTCGTTGCATCCGGACTTTGTGTA
AGACTACCAGAAACATTGAATGTTCCGACTATAGAAACCATTGATGatgc
aaaaagGCATTTGAAAGGCGAAGAGTTTGCAAAACCATTAACAAACAATA
TCATCTCTAATGCTTGAGCATTTGAAAGGCGAAGAGTTTGCAAAACCATT
AACAAACAATATCATCTCTAATGCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045232XLOC_045232-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000031_pilongenomesc0000031_pilon:500381..507647 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1780-1839:7208
Aaloc1576-1776:6339
Aaloc1468-1572:5861
Aaloc1381-1464:5345
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Aaloc1033-1242:4024
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Aaloc601-702:2402
Aaloc1-600:1