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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000031_pilon:240605..246801+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045220 ID=XLOC_045220|Name=XLOC_045220|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6197bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:240605..246801+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCAATCATGTGCTTACCTGATTGCAATATGCATTTTGTTTGCCTGCAC
TTCAGCATGGATGGACAAAGAGGAAAGGCTCAAATATAGGTAATTTGACT
ATTAAAGTTTGTGAATGAAATTTGACGAACAATGGTCACAAAAAGTTTCA
TGTCATTTGTTaactttggttaaaatttcataaaatgggAGGGGTGTTGC
ACAATTAAATCACGAAAGATTGCAGAGTGACTATAATAGTGGCCATCTGT
CACTAATGATTGCATATCCTGTAGAGtagaagatatgacgtagcctagac
CTATGAATTTAATGTCTCCTCTTCATCACTTTTAGAGAGAAAGCAAGACA
AATGTTCTATCATGGCTATGATAATTACTTGAAACACGCATACCCTTATG
ATGAGCTGAAACCTCTTTCTTGCCAAGGACAAGATACATGGGGAAGGTTT
GTATAGGAATGCTTCGTTTATATTTTGATATCTTTGAATTTATCAAGACt
ttttttACAGTTGCaacctttattttttttctattaaagAAGCTAcatct
tttatcaatcaatttTAGTTATAACCTACCTGAGAGCTTAAAAGGGAATT
ATGTCTGAATTATTGAAAAGGCATTTATTTAAGGAAATACTGTATGTTTG
CCAACTCAGATTCGTTCCTCTTTTCAATTGCAGCTATTCTCTGACTTTGG
TCGATGCTCTTGACACACTGTTGGTGAGAAATATATTTCCTAGTTTTTAA
ATGTAACAATCTGGTTCACTCTCACCAAACCCTATTTGCAATAAGACCTC
GAGTGACATCCATTCCAATTGGGAAACAgtgaaattattttaataaGTGA
CTGCAGGACAATGATAGCAGTGTGCTACAGTGCACGAGGTTGTCAGCCTC
TACCTGGGTCATACCAAATAATCACAAATAATCACAAAATGTGACTCTGC
TTATAATGCTCAGCAAACAAAAAGACGAATCAAGGGTACCTTTGTGAATT
TAGAATTTCAGTGCATATGAAGttattaatcttttattttAACTCACTAT
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GCAAAACTTTTAGTGTCAACATTATCTTTTGATCAAGATATTAATGTTTC
TGTCTTTGAAACAAATATTAGAGGTAAGAAAACTCACCACTGTGTATGCT
TGGGTGTATGGGTATGTTGATATTCCACCTGAAAGAAACTGAAAGTTATA
GCGTAAGAACTAAGTATGGTATTTGCAGAAAAACTAAACTTCTCGTTGCG
TTTTATAAAGATAATGAGTTAAATTTGTTCTGTGTTGAAAATCTTACTAA
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TCATTAATTTACTTTTAGTGGTTGGAGGATTGTTGTCAGCTCACTTGCTT
TCGCATTTCTCAAAACTGGAATTGGACCCTGGATGGCCATGTGAAGGACC
ATTGCTTAAACTTGCTGTAGATGCTGCTGAAAAGCTTTTGCCTGGTATga
aatatttagaaaataatTGTCGTGGTAAATATTATATAGGACTGTCTTGT
TTTGTTCAAGCTAAAACAGCTTTGGAACCTTGTTTTATCTGTGCTCACTT
TCCTTGTGTAATCATCTTTTGCATTTTATAATAAGAATTTGGCATATTGC
AAAAACCTTATATGGCCAAGAAGATCCactaaattttttggaaaaataca
aCTTAAAAGCCTTGAAAACAGAATTCTATAGATACCATGTATTGGTGATG
ATTGCAATCAGGTTGGGGACtttttttATTACTCGTTTTGGAATTTCAAa
gcttgaagtttttttaattgttgAAAATCTGATCGTTCAGAtacaataac
ttttgatcataCTAAAACAGTATAAACTCTGGTCGAGTAACATTTATTTT
GGACTGGTGCTATAAAGTCATTATTGTgtcttgatttttattttattttt
tctttgcagCTTTTCAAACCAACACCAGTATGCCATATGGGACAATCAAT
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ATTTCAAGATGACTGTAAAGTGTTATCAACTTGAACAATAAACGAACAAT
ATGATGAAATTAATGCTTCAATGTTTTTCAAGTCATCTTGGGCAAACCTT
GTTTTTTAATTAAGATAGACCTTTTGGGAGGACCTTTATTAATTAATTAT
CTTGAACTTCTTTAAGACCTTCTATGATGATGAAACACAAAAATTGCACA
GCTAATCAAAGGAAAAACTTTTGTCGATCAACTCGATAAGTAGGGAATAA
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ATTGAATAATATTATTATTTCTGACCACTTATTTTGTCTTAATTTTCTTA
CACCAGGTGATGAGAGGTTTTTGAAGGCAGCATTGGATGCACTTGACGGG
CTATGGAAAGCCAAATCTAAAATTGGTTTGGTATGAATGCATTTTACTTT
AATGGAGTTGATTTTCACGAGACCTAAATAATTATAATAAAAGTCAGCAT
TATAAGCATCACAAACTTATCATTCAACCCTATCTGCATTTAATTCTTGA
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TTGGGTACttaatagccccccccccccccccgctaattaatttttcgaaa
attttccacacaGGGACTTCTTATtaacaaccccccccccccgcttatta
atttttgggaaaatgtttttgaaagttcccttttttgtcctaattcagct
ttattagcctccttttcaaaaattttccacccaggacattttttttccaa
ccccaccccccccccccgctttattcccacccccccccccccccccggct
attaggtacccgagagtaagctGTGCTCTAAGATACTCGAATGTGAATGT
GCCTAAAAATTCTGAATGCTTAATTTGGAGTGACAAATATCCATAGTAtt
acttttaacttttgaattaaaaaagtgaATAAGTTATGGCATTGCAAGGA
ATCTTGATGGATGTAATTTTTGCTGTAGGTGTTTTCTGTAATCTGTAATG
AGTTTTATTTGTCTTATTTCAAGGTTGGAAATCATATAGATGTTCAGAAA
GGCTTTTGGACAGCGACAGATGCAGGGATTGGAGCTGGTGTGGATTCATA
TTTTGAATACCTTGTCAAAGGGGCGTCTCTTTTCTCCGACCCTAAACTTC
TGGAAATGTTCAATGGTGAGATTAAATGGATGTTTACTCAAATCTTTTGA
ACAAGTAGTGATTGAGTAGTGACTTTTTTCTGTCTATATCTGCTGGTAGG
TGTCCTAATCTGGAGTCTTGTTAATTAAACATAGCTTTTCTAACTTTTCT
AACCATttaaatcatattcaaatttctaCTTTCTGTTTATAGATTTGAAT
AAGTCgatacaaaaatatttgaaatatcaTGATTGGTATGTTTGGACAAA
TATGGATTCTGGGAAAATCACTCTTCCCATTTTTCAATCGTTGGAGGCTT
TCTGGCCTGGTGTCCAGGTATTTGTTACACTCCTAACCActaaactttta
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CATCTTAAATAATTAAAAGGCTtaactaccgggtgcgccacaaaaaagtt
tctctctttgaaactaattttctcaaaatctaaaatttttaaaagaaccg
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agatttttggttctagactggataaagtctatgtaaggctggatctacct
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tttttcgacgaattttcttcctttcattgaaattcaaccttatTTTAAAT
Aagttcaaccttcctttaaataacaaaaggtcatttagacagctaattat
catttttaacgactgaaacgaaaatagtGATGTACCATATAactatgctt
ctgtttaatttgataggtcgatttttaacgtttttgagcattttctgaaa
gtaacttttttattcaattgagtataacttttggtctaatgaatcgaatt
caatGAATGAcccaccaaaatttaagtttatctttcttctttccaatgaa
ataggaatggttcttttaaaacttttagatatcgagaaaattagttttaa
agagagaaacttttttgtggcgcacccggtagaattACTCAGGGTATAAC
AGTCACTGGAATGGATTATGCATTCAATATTTCCACAAAGTTATGTCTAT
GTGATGGAGAAATTCAAAATGAGTATAAATTCATATGGACGGGTTCCTCC
GAAAACTGTTCGTTGTATTTCACAACATTTTTAATCTAATTTCTCTCAAA
TTTTTCAGGTACTCCTCGGAAACGTCGGGGAAGCCTCAAGGACGTTTTAT
AATTATTATTCAGTGTGGAAACAGTATGGAGGAACACCTGAGTTCTATAC
TATTGCATACAATAAAGTTTTTCCTAAACGAGAAGGTTATCCACTTAGAC
CAGGTATTATTTCATCAATTTAAGTAggcattttctttaaaatcgtATGA
GAGAAGGAttcagatgattttttttttgaataattagatatattatttta
gatttatggCCTTCAGACACCTTCTATATTATTACTGagaaaaaatctcg
aaaaatagGAGATCTGgactattttttcaagaatcaTCTGCCTATCCTGA
AAGTGAATCTTGAGCCATGTTATACCCACCTAGACATCATTGCCAAGATT
TCCACAAAAAACCTCAAAATCCCCACTTTCAAACATTCTAAAATCTATTT
TACCTTCTACAGAGCTGATAGAAAGCACGATGTACCTATACCAGGCAACG
AAAGATCCGTTTTTTCTTGAAGTTGGGCGTGATATTATAGATGGTATTGA
ACAGATAGCACGAACGCCTTGTGGTTATGCCACGGTAAGTACATTCAATG
AACTTTCCTTTTATAAACTCGAAACATGTTAAGGTTTACCAGAGCGGGGT
TTTTCTTACCACTAGGGCTTAAAAAACCCGATGAAGAATCGGCTTTTTAA
GGATGATGTTAACGCTAACCAGAAtctaagtggagaaatccagagaAAGA
AGTGGCACCCACCCCTACTTTCGAGTATGCACTCAGCCTTCTGTTCAGCC
TCGACTGCGATCGAAAACTAGCTTACTTAGAGCTAATCATGTTAAtcgaa
ataatattttttacgATTCTTTTAAATGTTTGAAACTAGATTTTTACTGA
ACTTTAGTCTAGTGAAGTGTAAATTATGTCATCCAGTCGATAAAAGCCGA
AATAGGGTGTTTAAGACTGATGCATCGGTTCATTACGATGgtttcgattt
tttaaattttcagatcaaAAACGTGGAGACACACCAGCTTGACGATCGTA
TGGAATCATTTTTCTTAGCCGAAACTACGAAATATTTGTACCTCTTGTTC
GATGAAGATAATTTTATacataaaatcaatcaaaatcaaagtcattaTCA
ACCAAAAGACTCGACTCAATGCTTTCCTGCAAGCTctggttttattttca
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AAGCATAAGCAGGATAGTTTGTATTTCACGCGCGAGAAACTGAAACCCCA
GGATGGATGCAAGAGGAGgccaaaatatcagaaattttatgcttttGGGA
ATTATAAAGAGGACAAGTATGATTTATTTGATAAGCCGCCATCTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000031_pilon:240605..246801+ >XLOC_045220 ID=XLOC_045220|Name=XLOC_045220|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3204bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031_pilon:240605..246801+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCAATCATGTGCTTACCTGATTGCAATATGCATTTTGTTTGCCTGCAC
TTCAGCATGGATGGACAAAGAGGAAAGGCTCAAATATAGATGCAATCATG
TGCTTACCTGATTGCAATATGCATTTTGTTTGCCTGCACTTCAGCATGGA
TGGACAAAGAGGAAAGGCTCAAATATAGAGAGAAAGCAAGACAAATGTTC
TATCATGGCTATGATAATTACTTGAAACACGCATACCCTTATGATGAGCT
GAAACCTCTTTCTTGCCAAGGACAAGATACATGGGGAAGAGAGAAAGCAA
GACAAATGTTCTATCATGGCTATGATAATTACTTGAAACACGCATACCCT
TATGATGAGCTGAAACCTCTTTCTTGCCAAGGACAAGATACATGGGGAAG
CTATTCTCTGACTTTGGTCGATGCTCTTGACACACTGTTGCTATTCTCTG
ACTTTGGTCGATGCTCTTGACACACTGTTGGTGATGGGAAATGTCACAGA
ATTTGAAAGAGTTGCAAAACTTTTAGTGTCAACATTATCTTTTGATCAAG
ATATTAATGTTTCTGTCTTTGAAACAAATATTAGAGGTGATGGGAAATGT
CACAGAATTTGAAAGAGTTGCAAAACTTTTAGTGTCAACATTATCTTTTG
ATCAAGATATTAATGTTTCTGTCTTTGAAACAAATATTAGAGTGGTTGGA
GGATTGTTGTCAGCTCACTTGCTTTCGCATTTCTCAAAACTGGAATTGGA
CCCTGGATGGCCATGTGAAGGACCATTGCTTAAACTTGCTGTAGATGCTG
CTGAAAAGCTTTTGCCTGTGGTTGGAGGATTGTTGTCAGCTCACTTGCTT
TCGCATTTCTCAAAACTGGAATTGGACCCTGGATGGCCATGTGAAGGACC
ATTGCTTAAACTTGCTGTAGATGCTGCTGAAAAGCTTTTGCCTGCTTTTC
AAACCAACACCAGTATGCCATATGGGACAATCAATCTCAAAAATGGTGTC
CCCAAGGGTGAAACGCCTATCACTTGTACTGCAAGCATTGGAACATTTGT
ACTTGAGTTTGGTACTATCACATATTTAACAGCTTTTCAAACCAACACCA
GTATGCCATATGGGACAATCAATCTCAAAAATGGTGTCCCCAAGGGTGAA
ACGCCTATCACTTGTACTGCAAGCATTGGAACATTTGTACTTGAGTTTGG
TACTATCACATATTTAACAGGTGATGAGAGGTTTTTGAAGGCAGCATTGG
ATGCACTTGACGGGCTATGGAAAGCCAAATCTAAAATTGGTTTGGTGATG
AGAGGTTTTTGAAGGCAGCATTGGATGCACTTGACGGGCTATGGAAAGCC
AAATCTAAAATTGGTTTGGTTGGAAATCATATAGATGTTCAGAAAGGCTT
TTGGACAGCGACAGATGCAGGGATTGGAGCTGGTGTGGATTCATATTTTG
AATACCTTGTCAAAGGGGCGTCTCTTTTCTCCGACCCTAAACTTCTGGAA
ATGTTCAATGGTTGGAAATCATATAGATGTTCAGAAAGGCTTTTGGACAG
CGACAGATGCAGGGATTGGAGCTGGTGTGGATTCATATTTTGAATACCTT
GTCAAAGGGGCGTCTCTTTTCTCCGACCCTAAACTTCTGGAAATGTTCAA
TGATTTGAATAAGTCgatacaaaaatatttgaaatatcaTGATTGGTATG
TTTGGACAAATATGGATTCTGGGAAAATCACTCTTCCCATTTTTCAATCG
TTGGAGGCTTTCTGGCCTGGTGTCCAGATTTGAATAAGTCgatacaaaaa
tatttgaaatatcaTGATTGGTATGTTTGGACAAATATGGATTCTGGGAA
AATCACTCTTCCCATTTTTCAATCGTTGGAGGCTTTCTGGCCTGGTGTCC
AGGTACTCCTCGGAAACGTCGGGGAAGCCTCAAGGACGTTTTATAATTAT
TATTCAGTGTGGAAACAGTATGGAGGAACACCTGAGTTCTATACTATTGC
ATACAATAAAGTTTTTCCTAAACGAGAAGGTTATCCACTTAGACCAGGTA
CTCCTCGGAAACGTCGGGGAAGCCTCAAGGACGTTTTATAATTATTATTC
AGTGTGGAAACAGTATGGAGGAACACCTGAGTTCTATACTATTGCATACA
ATAAAGTTTTTCCTAAACGAGAAGGTTATCCACTTAGACCAGAGCTGATA
GAAAGCACGATGTACCTATACCAGGCAACGAAAGATCCGTTTTTTCTTGA
AGTTGGGCGTGATATTATAGATGGTATTGAACAGATAGCACGAACGCCTT
GTGGTTATGCCACGAGCTGATAGAAAGCACGATGTACCTATACCAGGCAA
CGAAAGATCCGTTTTTTCTTGAAGTTGGGCGTGATATTATAGATGGTATT
GAACAGATAGCACGAACGCCTTGTGGTTATGCCACGatcaaAAACGTGGA
GACACACCAGCTTGACGATCGTATGGAATCATTTTTCTTAGCCGAAACTA
CGAAATATTTGTACCTCTTGTTCGATGAAGATAATTTTATacataaaatc
aatcaaaatcaaagtcattaTCAACCAAAAGACTCGACTCAATGCTTTCC
TGCAAGCTctggttttattttcaatacaGAAGCCCACCCGTTGGATTTGG
CGAGTTTATATTGTTGTAAGCACAAGCATAAGCAGGATAGTTTGTATTTC
ACGCGCGAGAAACTGAAACCCCAGGATGGATGCAAGAGGAGgccaaaata
tcagaaattttatgcttttGGGAATTATAAAGAGGACAAGTATGATTTAT
TTGATAAGCCGCCATCTTAGatcaaAAACGTGGAGACACACCAGCTTGAC
GATCGTATGGAATCATTTTTCTTAGCCGAAACTACGAAATATTTGTACCT
CTTGTTCGATGAAGATAATTTTATacataaaatcaatcaaaatcaaagtc
attaTCAACCAAAAGACTCGACTCAATGCTTTCCTGCAAGCTctggtttt
attttcaatacaGAAGCCCACCCGTTGGATTTGGCGAGTTTATATTGTTG
TAAGCACAAGCATAAGCAGGATAGTTTGTATTTCACGCGCGAGAAACTGA
AACCCCAGGATGGATGCAAGAGGAGgccaaaatatcagaaattttatgct
tttGGGAATTATAAAGAGGACAAGTATGATTTATTTGATAAGCCGCCATC
TTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000031_pilon | genome | sc0000031_pilon:240605..246801 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1219-1602:5814 |
| Aaloc | 1099-1218:5265 |
| Aaloc | 952-1095:4809 |
| Aaloc | 829-951:3545 |
| Aaloc | 685-825:3224 |
| Aaloc | 613-684:2509 |
| Aaloc | 475-609:2012 |
| Aaloc | 349-471:1421 |
| Aaloc | 241-345:1068 |
| Aaloc | 202-240:685 |
| Aaloc | 91-198:337 |
| Aaloc | 1-87:1 |
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