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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000302_pilon:219274..220836+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045161 ID=XLOC_045161|Name=XLOC_045161|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1563bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000302_pilon:219274..220836+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAATAAATAACATGGGTTCAGTAGCAGAGACAACGTTTTTGTCTCCTGT
TGATGGAATCAACACGAAAACGACGCTAGAATCTCCGTCATTGGCAATCG
CCAATAAGTCTCTTTCATCTCAAAAGGATCAAGCTCCGGAAGAAAACACT
TTGAGACGTGAGATGAAATTCCGCCATGCGTTTTCATTCGTTGTTGGTTG
TATGGTTGGGGCGGGTATCTTCGTAACGCCTTCACTAATCGCCCAGAGAA
CGCCAAACCTGTTTGTTTCTCTACTCGCTTGGATCGTAGCTGGTCTAGTG
GCGTTGATTGGAGCACTTTGCTATTGTGAAATGGCTTCTATAGTTAAGAA
GACAGGCTCTTCTTATGTCTTTATATTGGATTGTTACGGACCAGCAGCTG
GATTTTTAGTCAACTGGGCTAACGTGTTTCTATTCGCACCATGCGACGCT
TGTATCCTGCTCCTGACTATCGGTCTGTACGCATGCGCACCTTTCTATGA
AGATCACACGTCACCAGAATATCAATGGATGTCGAAGTTAGTCGGGATTG
TTATTATGCTTTGTATATCAGTCATTCACTGTCTGGGAGCAAAGAAATCT
GGCATTTTCCAAATGGTTTTTATGGCTATACAAATGCTTGTCTTTGCAAC
GATTGTTGGCTTAGGTATCTATTCATTATCAGCCAGGAACACTTACCACC
ATTTTGAAACGAATATCGTTTTCAACAACACATTGAATGGATTAAGTGAC
GAGTTTCCGTCATTTGGGATTGCTTTATTCAACGCGCTGTATTGTTTTGA
TGGTTACGTCACTATAGCGTTTATAGTGGAAGAAGTAATCAACCCTTCGA
AAGCTGTGCCTTTACTCTCCTTCACTTCAATACCATTCGTAACCTTCCTT
TACATTTTGATCAATCTGGCTTGCGCTGCTGTATTGACACATAAAGAGAT
TGCTACTTCCAATGTTTTTCTCTCAGATGTTGCTTTCAAGATCGGTGGAG
AGTCATTATCATATGTGGTGCCTTTTGCTGTTTCTATATGTGTCGTACCG
GCTCTTTCCGCTGTCTTTTATAACCTTCCGCGCCTCATGATGTCCGCAGC
ACGGGAGGGACAATTTCCGCGGTTTTTTGCACTTATTCACAGAGAGCGAC
GGACACCCATACCGTCCGTAATCTTTCTAGCAATCGTCTCTACTGTACTC
ACACTCCTAAATCTTGAATTACAAAGCATGTTACAAATTTGTAATATTGT
GATTTGGTTTGAATACGCTTTTGCTGTCTCCACCATATTGGTCAACCGGT
GGCGTAAACCAAACATGAAACGAGCTTACAAAACATGGCTGATTACTCCT
ATAATAATGATCGTTATCCCCTTAATACTTTTAATCTTGGCTATTATGGA
AAAGTCGTTCATTACCATATTAATTTTAGTGTTGATGATGCTTGGTTTAC
CCGTTTACTTTGTTTGTTTGAAGAAACGATGGATTTCCAGTAGACTTAAT
CAATTTGTATAtagaattttggttaataacACTAATTTAGTCGAATGTAA
AATTAATTGTGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000302_pilon:219274..220836+ >XLOC_045161 ID=XLOC_045161|Name=XLOC_045161|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3126bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000302_pilon:219274..220836+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAATAAATAACATGGGTTCAGTAGCAGAGACAACGTTTTTGTCTCCTGT
TGATGGAATCAACACGAAAACGACGCTAGAATCTCCGTCATTGGCAATCG
CCAATAAGTCTCTTTCATCTCAAAAGGATCAAGCTCCGGAAGAAAACACT
TTGAGACGTGAGATGAAATTCCGCCATGCGTTTTCATTCGTTGTTGGTTG
TATGGTTGGGGCGGGTATCTTCGTAACGCCTTCACTAATCGCCCAGAGAA
CGCCAAACCTGTTTGTTTCTCTACTCGCTTGGATCGTAGCTGGTCTAGTG
GCGTTGATTGGAGCACTTTGCTATTGTGAAATGGCTTCTATAGTTAAGAA
GACAGGCTCTTCTTATGTCTTTATATTGGATTGTTACGGACCAGCAGCTG
GATTTTTAGTCAACTGGGCTAACGTGTTTCTATTCGCACCATGCGACGCT
TGTATCCTGCTCCTGACTATCGGTCTGTACGCATGCGCACCTTTCTATGA
AGATCACACGTCACCAGAATATCAATGGATGTCGAAGTTAGTCGGGATTG
TTATTATGCTTTGTATATCAGTCATTCACTGTCTGGGAGCAAAGAAATCT
GGCATTTTCCAAATGGTTTTTATGGCTATACAAATGCTTGTCTTTGCAAC
GATTGTTGGCTTAGGTATCTATTCATTATCAGCCAGGAACACTTACCACC
ATTTTGAAACGAATATCGTTTTCAACAACACATTGAATGGATTAAGTGAC
GAGTTTCCGTCATTTGGGATTGCTTTATTCAACGCGCTGTATTGTTTTGA
TGGTTACGTCACTATAGCGTTTATAGTGGAAGAAGTAATCAACCCTTCGA
AAGCTGTGCCTTTACTCTCCTTCACTTCAATACCATTCGTAACCTTCCTT
TACATTTTGATCAATCTGGCTTGCGCTGCTGTATTGACACATAAAGAGAT
TGCTACTTCCAATGTTTTTCTCTCAGATGTTGCTTTCAAGATCGGTGGAG
AGTCATTATCATATGTGGTGCCTTTTGCTGTTTCTATATGTGTCGTACCG
GCTCTTTCCGCTGTCTTTTATAACCTTCCGCGCCTCATGATGTCCGCAGC
ACGGGAGGGACAATTTCCGCGGTTTTTTGCACTTATTCACAGAGAGCGAC
GGACACCCATACCGTCCGTAATCTTTCTAGCAATCGTCTCTACTGTACTC
ACACTCCTAAATCTTGAATTACAAAGCATGTTACAAATTTGTAATATTGT
GATTTGGTTTGAATACGCTTTTGCTGTCTCCACCATATTGGTCAACCGGT
GGCGTAAACCAAACATGAAACGAGCTTACAAAACATGGCTGATTACTCCT
ATAATAATGATCGTTATCCCCTTAATACTTTTAATCTTGGCTATTATGGA
AAAGTCGTTCATTACCATATTAATTTTAGTGTTGATGATGCTTGGTTTAC
CCGTTTACTTTGTTTGTTTGAAGAAACGATGGATTTCCAGTAGACTTAAT
CAATTTGTATAtagaattttggttaataacACTAATTTAGTCGAATGTAA
AATTAATTGTGAATTAATAAATAACATGGGTTCAGTAGCAGAGACAACGT
TTTTGTCTCCTGTTGATGGAATCAACACGAAAACGACGCTAGAATCTCCG
TCATTGGCAATCGCCAATAAGTCTCTTTCATCTCAAAAGGATCAAGCTCC
GGAAGAAAACACTTTGAGACGTGAGATGAAATTCCGCCATGCGTTTTCAT
TCGTTGTTGGTTGTATGGTTGGGGCGGGTATCTTCGTAACGCCTTCACTA
ATCGCCCAGAGAACGCCAAACCTGTTTGTTTCTCTACTCGCTTGGATCGT
AGCTGGTCTAGTGGCGTTGATTGGAGCACTTTGCTATTGTGAAATGGCTT
CTATAGTTAAGAAGACAGGCTCTTCTTATGTCTTTATATTGGATTGTTAC
GGACCAGCAGCTGGATTTTTAGTCAACTGGGCTAACGTGTTTCTATTCGC
ACCATGCGACGCTTGTATCCTGCTCCTGACTATCGGTCTGTACGCATGCG
CACCTTTCTATGAAGATCACACGTCACCAGAATATCAATGGATGTCGAAG
TTAGTCGGGATTGTTATTATGCTTTGTATATCAGTCATTCACTGTCTGGG
AGCAAAGAAATCTGGCATTTTCCAAATGGTTTTTATGGCTATACAAATGC
TTGTCTTTGCAACGATTGTTGGCTTAGGTATCTATTCATTATCAGCCAGG
AACACTTACCACCATTTTGAAACGAATATCGTTTTCAACAACACATTGAA
TGGATTAAGTGACGAGTTTCCGTCATTTGGGATTGCTTTATTCAACGCGC
TGTATTGTTTTGATGGTTACGTCACTATAGCGTTTATAGTGGAAGAAGTA
ATCAACCCTTCGAAAGCTGTGCCTTTACTCTCCTTCACTTCAATACCATT
CGTAACCTTCCTTTACATTTTGATCAATCTGGCTTGCGCTGCTGTATTGA
CACATAAAGAGATTGCTACTTCCAATGTTTTTCTCTCAGATGTTGCTTTC
AAGATCGGTGGAGAGTCATTATCATATGTGGTGCCTTTTGCTGTTTCTAT
ATGTGTCGTACCGGCTCTTTCCGCTGTCTTTTATAACCTTCCGCGCCTCA
TGATGTCCGCAGCACGGGAGGGACAATTTCCGCGGTTTTTTGCACTTATT
CACAGAGAGCGACGGACACCCATACCGTCCGTAATCTTTCTAGCAATCGT
CTCTACTGTACTCACACTCCTAAATCTTGAATTACAAAGCATGTTACAAA
TTTGTAATATTGTGATTTGGTTTGAATACGCTTTTGCTGTCTCCACCATA
TTGGTCAACCGGTGGCGTAAACCAAACATGAAACGAGCTTACAAAACATG
GCTGATTACTCCTATAATAATGATCGTTATCCCCTTAATACTTTTAATCT
TGGCTATTATGGAAAAGTCGTTCATTACCATATTAATTTTAGTGTTGATG
ATGCTTGGTTTACCCGTTTACTTTGTTTGTTTGAAGAAACGATGGATTTC
CAGTAGACTTAATCAATTTGTATAtagaattttggttaataacACTAATT
TAGTCGAATGTAAAATTAATTGTGAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000302_pilon | genome | sc0000302_pilon:219274..220836 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1563:1 |
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