XLOC_045141 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045141
Unique NameXLOC_045141
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000302_pilon:96407..111980-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045141 ID=XLOC_045141|Name=XLOC_045141|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15574bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000302_pilon:96407..111980- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000302_pilon:96407..111980-

>XLOC_045141 ID=XLOC_045141|Name=XLOC_045141|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2634bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000302_pilon:96407..111980- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTTCAAGTTGGAATAGCTTAGGTTTACATTCATGGCTTAGTGATCA
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TACCCCAGATTTTGAAAGGCAAAGATTGCATTGGATGCTCCAAAACAGGG
AGTGGTAAAACAGCAGCATTTGCTCTTCCTATATTACAAAAACTATCTGA
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AGCTTGGAATTTTGAAACCCTCTGAAATTCAAGAGCAATGTATACCCCAG
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AACAGCAGCATTTGCTCTTCCTATATTACAAAAACTATCTGAAGATCCTT
ATGGGATATTTGCTTTGATATTGACACCTACTAGAGAGCTGGCATTCCAA
ATAGCAGACCAGTTTCGTGTGTTTGGCAAATCCATAAATTTGAAAGACAC
TATCGTGGTTGGTGGTATGGATATGGTTCAACAGGCCGGTGACCTGAACA
AGAAACCTCATATTGTCATAGCAACGCCTGGTCGCTTAGCAGCATTGATG
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GTGACCTGAACAAGAAACCTCATATTGTCATAGCAACGCCTGGTCGCTTA
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TTTGGTGTTGGACGAAGCAGATCGATTATTGGAAAGTTCCTTCGAAGACG
ATTTGAAATTCATCTTCAGTAACATTTCAAAGAGCAGACAAACGCTTTTA
TTCAGTGCAACTCTAACAGATACCATGGAACAATTACGACTTGTCACAAA
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TCCTTCACAAGTCAAAGATTGTTATCTCATACATTTACTGCAAACGTTCA
TTGAGAATAAATCGGTCATCATTTTCACGCACACATGTCGCAGTTGTCAA
GTCTTATCATTCTTATTGAGAAAACTAGGTATCAAATGCGCTGCGCTGCA
CTCCTTGCTATCTCAACGCGAACGACTGGCTTCCTTAGCACGATTCAAAA
CGGAAGTAGTGAAAATTCTGATCGCCACAGATGTTGCAAGTCGTGGTCTA
GATATACCTCTTGTTGAACTCGTTGTTAACTATAATGTACCTGGCTCTTC
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GAATGTCACTGACATTGATGACTCAATATGATATTGAACGATTAACTACT
ATTGAAGATGATATTAACACTAAAATGACGGAGTTTGAGACCAACGAAAC
AGATGCGTTGAAACTTCTCAAAATTGTTTCCGTCACTAGACGTGAAGTGG
AAATCAGGCTAAATGATTCGGGATTTGGTGAGCGAAGGCTAAATAATCGT
AAGAAACATGGACTACCTGCCAATAAGAAATTTCTAAAACACAAAAAGAT
GAGAGAAGAGCGTAAGAAAAAGCAAGAAAATGAAACAGAGAGTTGAGGTT
GCGACAGTACAAGAGTTGGATCAACGTTTTCTTCTGATTCCTTCACAAGT
CAAAGATTGTTATCTCATACATTTACTGCAAACGTTCATTGAGAATAAAT
CGGTCATCATTTTCACGCACACATGTCGCAGTTGTCAAGTCTTATCATTC
TTATTGAGAAAACTAGGTATCAAATGCGCTGCGCTGCACTCCTTGCTATC
TCAACGCGAACGACTGGCTTCCTTAGCACGATTCAAAACGGAAGTAGTGA
AAATTCTGATCGCCACAGATGTTGCAAGTCGTGGTCTAGATATACCTCTT
GTTGAACTCGTTGTTAACTATAATGTACCTGGCTCTTCTAAAGATTATAT
ACACCGTGTCGGTCGTACGGCCCGCGCGGGCAGAGGTGGAATGTCACTGA
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ATTAACACTAAAATGACGGAGTTTGAGACCAACGAAACAGATGCGTTGAA
ACTTCTCAAAATTGTTTCCGTCACTAGACGTGAAGTGGAAATCAGGCTAA
ATGATTCGGGATTTGGTGAGCGAAGGCTAAATAATCGTAAGAAACATGGA
CTACCTGCCAATAAGAAATTTCTAAAACACAAAAAGATGAGAGAAGAGCG
TAAGAAAAAGCAAGAAAATGAAACAGAGAGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045141XLOC_045141-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000302_pilongenomesc0000302_pilon:96407..111980 -
Properties
Property NameValue
Aaloc631-1317:688
Aaloc505-627:1108
Aaloc244-504:1681
Aaloc1-240:15575