|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000060_pilon:829785..838248- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045077 ID=XLOC_045077|Name=XLOC_045077|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8464bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000060_pilon:829785..838248- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTCTACAACTTAGAAGACGATCTCTTCTTGGCTTTTGGAATGATCG
CTGTAAAACCAGAGAGAGGAAATTCCATGGGGAGAAATGGTCCAACAAAT
TCTTTAATAAGACTTTTATAGTACTTGTTATCATATTCTACTTCACAAAT
TGCTGGAGGGAAACTCAAGCTGCCAATGTAGTCGTAGATATTGAAATTTT
GACTATTCCAGATAATAAAAATTTGTCACACCTTTTTGATACTTGTATAA
AGACCGCATCAACAAACCAGACTAGCATCTCGCAATATGGTTATCACACT
GTAGATATTATTAACGGAATGCATTTTGATTTTTGTAATGTATTTCATCC
TGTGTTTTTTATATCAACTACAACTTTAAATAACTCAAACACACTCAATT
TGACCATTCATTATAATCTTGACAATATTCCTCATAAAATAAATATTATG
GTTCCTGAAATTTTTGGTTGTGAAAGCATTCAAAAACTTTATAAAGACCC
CACAAAAAAAGAGAGTGGATTAAACCTTTATGCCGACATTTTCAATGATT
ACAAACAGACTTTGGATCGTCTTGATGGCTGCACGCTCCGGAAAGATGAT
GGGAAGATAAACTGTTCTGATTGCAAGGTATATAATTACATTATTTTATG
TCTGATTTGGCAGTCTGCAAGACATTTTTACAGCCTGCAGATCATCAACT
AGCCTAGATACCCTAACTTGGTTTGCCTAAAAATTGATTGAAGTAGTAGA
AACATTGAAACAAAACAAAAACACAGCTAGCACAATGACCTTTGAAGGAC
GGAATAGGATGCAGTTAGTCCAGACGATCTCAATCGAACGGAATCGACTA
TCGAACCAGCCGAACCAAATCGAACGCAATCGACCGATTGAAATTTCATT
GTCGAACGCAATCGAATCTCAATCAAATATTACCGCAATTTTCAGATTCC
ATTGATATTCCATTGCGTTCGATTGATGTTTGATTGCGTTCGATTGCGTT
TGATCGTCGATTCATTGACCCCCTGATTGTTCACCGCACAACGGGAAATC
AAGAGTAATTTCATTCGGCTTGTGATGTTTGAAAGCTTGGATGTTGGGAA
GCTGCAAGAATAAATATTGAACAGGATGTGACCAACAATTTTGTATTTCT
CTTATATTAATGATATATTTCGAGATTTGATTCTCATCTTCAGATTAATA
TCTAAAGGGGGGGTTTCAGGGGGGTACCCGATTCCGCAATTCCGCCAATT
TTTTCCCCAATTTCCGTCAAATCGTCTTAAATTGAACCAAAACTCCGTCA
CCGAAAATTCCTTTGAAATTCAATATTTTTGTCGAAAATTCCGCAAATTT
TGAATATCTTTTACCAATTCCAAAATTCCAATTTTTCCGCACTAAAATTG
TCTAATTTTCCATCTCCGTCAGAGAACCCAATTTCCGTAATTCCGTCTAA
ATTTTCGCCAAATTCCGCCACTCCGTCCGAAAAAAATGCCGATTCCGCTC
CTCCGCCAACCATGAACCCCCCCTCCAATAGCAAAATATAAAAAACAGTT
TTAAAAACAGTAAAAAATCGAAAACATGTACATCTTCGTAAAAAAAACTT
CCTCATACAACACTCGTCTCATAATAAATGTCTACTGTAAAAAATAAAAT
AGGAGAAATCAAAAATTGAAAAAATCAGTAAAGCGTAACGAAATAATTAA
AAACATTTTATTAGAAAAAGGACAATTAAATTTTTATAACTAGTGCTCAG
CTTTTGTATTCATCCTTTTTGTTTAGTTCAGGTTTGAGATCTTTAATGAA
TAATGCCTCAATTCTTTGCAAGAATAAAGTCAAACGATCTCAATCGAACG
GAATCGTCGATCGAACCAGTCGAACAACAATCGAACCAATCAAATATTAC
CCAGAATTTTGACGTTCGATTGAGATTCGATTGCGTTTGACAATCGAATT
TCAATCGGTCAATTGCGTTCGATTTGGTTCGACTGGTTCGATCGTCAATT
TCGTTCAATTGAGATCGTCTGGAGTTAGTGGAAGTACTTCGATTTGCGAA
GCGTCTTAACGTTACACACAACAAAAGAAACTAGGAAAAAACAAAGAAAT
TACCCATAGCTACCATGAAGTTGGGTAACTTGCATCAGTGGAGGGAAACT
TGCATAGCCATCAAATGACTGACCAATCAAAGCAGCAAAATTTCCAAACA
AATGAACTACCCAGCTCCGCTCGCAGCTCTACTCTACCATTTTTGTTTTG
ATCTAATTTTAATGACCAACCAGGTCATTCATTTGAGGGCTATTTATGTT
AGCATCCACTGATGCAAGTTACCCAATCTCACGGTACCATTTCGCAACCA
TGGGGAATCGCAGTTTTATGGAAATGGGAATCCTCAAATCTAATAAAGCA
TCTTCTGAAAATTTCATTCTTCCCCATTAATGGGAAAATGAAAAATGAAG
AAACTTTCGTTTTATAATTTTCTTTTTAATCTGCCAAGAAGTGTTATAAA
ATTGAAATGCATATCAAAGATTAATGCTGCAAAAGTGCTATATCATTTAC
TTGTCTCACAAGCAAAAAATGTGCTGCAAAACTTCTAAAGGGATTAATGA
AAAAATAACCCAGCGCTTTTTAATGAAATTAACATTTTCAAAAACTATGA
GAAGTCGCCTAAATTTGGGCCATAGGTGAAAGAATTTGAACCAAGCCAAC
CTTGAAAACTAATTTGAATATCAACTTCCCAAGAAAAAGATCTACAGGGG
AGACGAAAGCCACCTAGATCCGCGCACCGCCAGATAGGCTATTTCCCGGA
AATTTTGCTGGACCTCAAACACTGACCCATTTACATGTGCAGAATTATTT
TTACTTTAGGGTATAAACAATGCTTTAAAAATCGAAGCGCTGTCTCAGGA
ATTGAATAACAAAATTTGATTGGTTGATATTCTGGCTGCCTGTTCTTAAT
TGGTCATTTTGTCTCATTTTAAGTTTTCATGTTTTGATTAATTGTCTTGG
GAACTTGAACTTGATTCAGGTAACTCATCCTTGTTGTTGCAAATACATCC
TGTAGATGACTGATGTTGTTTTTTCTGAAAGCTCGATTTCCTAGTGTAAC
TAACTGACTTGCGTGCTGGGTATGTGTAGACAACAAGGGTCTGTTTTTTC
ACTTTCCGAAGTCTCTCTAAAGGGTTATAAAAAATCAGAATTTTCAAAGT
AATCACCCTAAGGGCTGGAAAAATCATGATTTTTAGGAGTCATTTTTTAG
TTTTGAGAAAAAAGTCTCTCCAAGGGTAGAAAATTATTCGAAAATAGAAG
AAAACTTGATTAATAAATGTCTCTCTACGGGTCACTTTTTAGTATACTGT
TGGGAAAAGAGCTATGTTTTTTTTAATACTTTTTGATAGACTATCCTATG
ATTCTCAGAATTTGGAAAATTTCCAAAATTAAAGAGACACCATAGAACTG
CAGAATGAGTTTCACATACAGTAACCATAGACCTTATTGTTAATCAAGAT
ACCATTTTGACTCAAAATGTTAGCGACAAAAAGATTATGCAATCGATCCA
AAAAGTGGCAATAGTCTGCTAAAATGGTATTGTTATCGGCAAAAGTAATG
TTATTCTAATTCCATAGAGATCCTCTTCCTATCATGATTCTATTGGTGAA
AATCAGACCATGATTGGTCTAGAAAATATTGACTGATCAGTAAAAAACCA
ACAGTCTGCAAAGTTGATTTCTTTTTTATCACTGATAAATTTGACAGATC
AACCTTCGAAAAGGATGTCATAGTTCGCACCCCCCCTTTATGAAGGGGGG
GGGTAGCGATGTTCAGAAAATCTCAGAAAGGGGGGGTAAGAGAATTTTTT
CTAGAAAGGGGGAAGTTTTCAGAAAGGGGGGGGGTTCATCTAGAAAGGGG
GGGGGTAAGATGTCAGTGGTATGTTTTTTTTGTGTTTTCCCAAATTAGAA
GTTTTATTTTTAATTTACAATGCTTCTGAAAGAAGTTCACTTTTACCTTT
GATCAAAGCGTACACCACCAAATTCAGATTTCCTAATTATTTGCTTATTT
ACACTGAATGTTCTTGCTTTTTCACCGGTAGAATTATGGTAGGATTTTAA
AATTTTGAGGGGGGTAGCATCAAATTTTAAAAGGGGGAAGAACCTAGGGT
AGGGGGGGTAGCTCTAGGGTAGGGGGGGTAGTGACCCCCTTCCGAACTAT
GGATGTTTAGCCAAATCGATCAAGCTAATTAGTCAATATGTGATACCACT
TTTAAATAAACGGCAGATAGTAGTCTGAATTTTCCAAATCTTGTCCATTT
ATCCATGTCAAGATAGTTGAGCTCCTGCTCCTGCTCCTGGACTATGTCAA
GGTAGGGTGATGGCCAAGGGAGAATTGGGATAGGATTCAGAAGTGATAAT
TTTGTCAATATTTCTTAACACAAAAACGCTTTTGAAAAACGAATAAAAAA
AGGCAAATTTCGAAGTAAAAGATGTAACTTTTCTCAAAAAAATGTATTTC
TTTTAATTATTTGTTCTAGAAAGGGTATTCAGTCTATGGTTGAAAGTTTT
AAAATATAACTTTGGAATTACAAACTTATCTCAGTATCATAGTCTCTTTT
TATATTTCATTTTTATTTGATTTAGTACTTTCAACACTTGCTCTCCTTGA
GGTCAGATCCCGGTCAGATCTCTGATCTTCACCATATTATACATTGTATC
TCTGTTGTTTGTTAATTTTCAGCTCGGACGTATGTCCGTTTAATGTGGGA
CTACATACCACATTAAACGGACATACAACACAACATATTATGTTGTGTTG
TATCCTTCTTACTGAACTTTATATCGTTCATTGTTTTGTCTGGACAAAAT
CTGATAAACTGGAATTCCTTTCGAAAGTCTCCACAAGATTAAAACCTAGC
CTGTCTGTTGTTAATCAAGTTTAATTTTCCTCTTCAGTTTTTCAAAAAAA
GTCTTTTTCTTTCATGTTTTTCTACTTATGTCTAGGGGTTGGTCTAAAAA
GCAGGGTAGCCAATGGGGTAGCCAATTGGGCTAGGTTATTGGGTACCTCT
TTTTGCCTAAACTTTTGAAATCTGAAACCTATTTTCATGTGGAAATAACT
ATACAACATCTTGTTAATGATTCCATGTAATAAAATTTAAGATTCCTTTC
GAACTTCAGCCACAATAGCCTTTTTTCCAAAGGTACTGAACTTTGTTACT
TCTCAAGAGACCTGGCGCCATTTTGTCTTCCTTCTTGGCTTCGTTTGAAA
ATTTACAGACCCGAATAAAAAATATATACAAAACAGTTTTTAATATTTAA
TATTTAGATTTTATTTATATTTTTAATTGTTATTTCCGTGAAGCTGTAAT
TCGATGATAATAGCTTTGGAATCGCCTTTGGGCCATATGATCTCTAATCT
TGTCATATCTTAATAATCCTTTGTTATTGAATCTATTGTTTAATTTATAT
CATGTTTAGATGTTTCAAACAATCAATTCCTTACAAAATTTTTTAATATG
GCAGCTTATAATAGGTGCAAAAAGTCTTTTGAAATAGCTCTATTATAATG
AAGCTTTATTTCTTACTCCTCGTGCATTAACACGTGGTAATTTATATCTT
TGTTTATCTTTGTAATCATACATGATCAATCTAAGTATCAATCAGATTCG
TGCTCCCTGGTCAGTAAAATGTGGTTCTATGTATTCATTTTCGGTATTTC
TATTCTGGTCTGTAAAATATTTAGGTACCCCACAACCTAGCCCAATTGGC
TACCCCAATTGGCTACCCTGCTTTTTAGACCAACCCTATGTCTAGTGGTT
AAAAACTGGCAATCTTCGAATCGAAAATGTCTTGTTTTGATTTTTGTCTT
AATATAAGACTTGCGTAACTTAACTATTGCTCACCCAAATCCATTTTCAT
GTTATCCAATAAACCATTTTAACACATTTACCTTTTACCCTACTTTAAGG
TTTTGAATATTCAAAAAATGGTCCCAACGTATGAGTAGAGTAGAAACAAG
AGTGATAATTTTCAAAAGTTATTGATAACGAACTGGGAATTAGTGGGAGA
TGTTGGAGGTTCTTCTCCTGAATAACTTTACGTCGGTTAAAAGTAACTTA
AAGGAACTTAGTAGCTTTCTTCTTAACACCTTGTAAGAAATAGTTTTGAA
AATCAATTAACCCTATTCGGCCTAGGGGGTTTCTGTTCGGAGGTCACAGA
TTAATGGTAATAGCTCCTGAAATAATAGAGCTTTTGCCATGAAATTTTCT
GTAAATTCCTAACTTTTATTTAGCTTAAAAAAATAAAAATTTGACACCTA
AAAATGTTTACACCTTGAGCATGACAATAAGAAGTCACAAAAATTGATAC
TTTTCCAATACAAATTTATTTTTTATGTCAAATGTATCATTTAAACCGTA
ATTTATTGAATATTTAGGATAAAATAAGCATTTTAGACTCAGGCAACTTT
TTTCTAAAGCCTTTGTTAGAATACAATAGCTATTTATAAGAACAAAGGAA
ATTTTCGGTTTTTGCTCACTTTGGGCATGCTGAGTGACGTCATCAAAAAG
ATTTTTGTCAAAAGTTGCCTTATGTGACAAGGATCTCGTGTGCCAAATTT
CATCCAAAAAGACCCACTAGATCAAAAGTTAAGGGGTGGTACAGGAAAAC
CCCCCTAGTTTTGAACCGCCCCTAAAAGCCTAGGATGAATAGGGTTAAAG
TGGGTCATAACCCTTCTTGTTTTGATATGCGGATAAAATGCCTTATCAAA
ACTTTGTAACAAATTCTTCCTGGCATAAATAAATTTTTGTGATTCTTTGG
GCTCTATATAGATCCACTTTTTAACGTTCTGGTCTGTAAATTTACCAAGA
CATTCGATCGAAGAACAGTTTCATGTTATATATATGGTCAAAATTTCAAG
TCTTTAGCATTTGTAGATCATAAGAGGGAATGGGATCAAATGCTAGAATT
CTTTCTTTCCCAAATTCACTAGATTCCATTTGTACTTTGTTCATCCGTGA
CCATAACCTATTTTCTTTTCCCTATAGGACTCGTACAAAGAATGGATTTG
TTCTCAATACGCAAGTGAAATGATGTCACAACGTTTCCGTAAACCTGTCT
GTCCGCATCTCTTCACCAACGTTTGTCACCATTGTCCGGCTGTTGAACCG
GATGAAGGATATGGCGGGTACTCTATTTTCCAGTGTTTGTCTGATCAAGG
TAAGAATCAAAGACTTCCCAACCTGCGCAAGATATCCTTATTCCTTTACA
CATAAAATTGAGGTTTTAGCTTTGGCCAAAGTTACATCACTTAGCGAAAA
TTTGATGTTATGAGATCAAACGTTCGAATCTGTAACGGTTGTCTTTACAA
ACAGACCGGCACCCGATATCTACTGTAATTTCAAAATCCATTTCTGTTCA
GATACTACTCTGCCATAGAGAGTACTGTCGAGGAGATCTCTAACGTTACG
CAAATTGAATATTTGCTTTCATAACGGTTGAAATTACGTGGATTTTTTAA
CGAAATATGAAAAGCCTCTTTAAATAACTGTCTTACCGATTTCCCTTGAA
AGTGTTTAGTTTAAAGGAATTATACGGTGTATATACACCCGACTCGTCTG
AAACTGATGTCAGCAAAATTTTAATAAAAGAGTCCTTTCAAATTTGTAAA
TAAAAGGAGGAAAAAAATCTTGCTCCACATTTTTCTTTATTCATTACAAA
AGATTCTATTTATTTCAATCTGCTGAATCAACATCAACATTATAACTATG
TAAAAGGTCAATGGCTTTAAGGGTAAAACTAGATATCGTCATTTTATTTT
CTGTTTTTTTTTTGGGGGATCGTTTACACATTCGAATTATCGCGTCTTAG
TATATCAAAGTGTAAAGAGGACCTTACAGAAAAAATTGAAATCATTGGAA
TCTGCCGACAAATTAACATAAATGTCACGACATAAACAAATCTTGAGAAA
ATGTGTTATAACAAAGCCTGATTAGTGGAAATTTTATTGATATATTGCGC
GCGAAAATGAAAAAGAAAATTCAGACAAAAGTTTTCATAGGGGAGCTGTG
AGGATTTTAAGCAATTTTCTAAAGCTCTACTAAATTTTTTTAGCAATACG
GTATGTCACGATTTAAGTCGTTACTAAATTTAAGAAAAATATCCTTTTTT
ATTTTTTTTCCCATTCCCTCAGATTCCCTTTAGTGAAAATAATGAAGATG
GATAAATTCTAAAAGTGATATATTTCGGTGGTATCACCTTTTTCAAGCTT
ATAAAATACAAGTATTCTATCATATTACACAAATTTCTATCTACATAGTT
CAGTTTTTTCTTGAGAGAGTAATTAATAAAGAATACTTCTAATTATTGAA
GTTTTTCATATTTTTCGTTATGTTTTAGATGATAGCTGCAATCCATCAAA
TCCCGATTGTCTCTCGTTCAATTGTTTACCGACGTACGATGAAACTAGAA
TTACTTATCATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000060_pilon:829785..838248- >XLOC_045077 ID=XLOC_045077|Name=XLOC_045077|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1770bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000060_pilon:829785..838248- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTCTACAACTTAGAAGACGATCTCTTCTTGGCTTTTGGAATGATCG
CTGTAAAACCAGAGAGAGGAAATTCCATGGGGAGAAATGGTCCAACAAAT
TCTTTAATAAGACTTTTATAGTACTTGTTATCATATTCTACTTCACAAAT
TGCTGGAGGGAAACTCAAGCTGCCAATGTAGTCGTAGATATTGAAATTTT
GACTATTCCAGATAATAAAAATTTGTCACACCTTTTTGATACTTGTATAA
AGACCGCATCAACAAACCAGACTAGCATCTCGCAATATGGTTATCACACT
GTAGATATTATTAACGGAATGCATTTTGATTTTTGTAATGTATTTCATCC
TGTGTTTTTTATATCAACTACAACTTTAAATAACTCAAACACACTCAATT
TGACCATTCATTATAATCTTGACAATATTCCTCATAAAATAAATATTATG
GTTCCTGAAATTTTTGGTTGTGAAAGCATTCAAAAACTTTATAAAGACCC
CACAAAAAAAGAGAGTGGATTAAACCTTTATGCCGACATTTTCAATGATT
ACAAACAGACTTTGGATCGTCTTGATGGCTGCACGCTCCGGAAAGATGAT
GGGAAGATAAACTGTTCTGATTGCAAGATGGTTCTACAACTTAGAAGACG
ATCTCTTCTTGGCTTTTGGAATGATCGCTGTAAAACCAGAGAGAGGAAAT
TCCATGGGGAGAAATGGTCCAACAAATTCTTTAATAAGACTTTTATAGTA
CTTGTTATCATATTCTACTTCACAAATTGCTGGAGGGAAACTCAAGCTGC
CAATGTAGTCGTAGATATTGAAATTTTGACTATTCCAGATAATAAAAATT
TGTCACACCTTTTTGATACTTGTATAAAGACCGCATCAACAAACCAGACT
AGCATCTCGCAATATGGTTATCACACTGTAGATATTATTAACGGAATGCA
TTTTGATTTTTGTAATGTATTTCATCCTGTGTTTTTTATATCAACTACAA
CTTTAAATAACTCAAACACACTCAATTTGACCATTCATTATAATCTTGAC
AATATTCCTCATAAAATAAATATTATGGTTCCTGAAATTTTTGGTTGTGA
AAGCATTCAAAAACTTTATAAAGACCCCACAAAAAAAGAGAGTGGATTAA
ACCTTTATGCCGACATTTTCAATGATTACAAACAGACTTTGGATCGTCTT
GATGGCTGCACGCTCCGGAAAGATGATGGGAAGATAAACTGTTCTGATTG
CAAGGACTCGTACAAAGAATGGATTTGTTCTCAATACGCAAGTGAAATGA
TGTCACAACGTTTCCGTAAACCTGTCTGTCCGCATCTCTTCACCAACGTT
TGTCACCATTGTCCGGCTGTTGAACCGGATGAAGGATATGGCGGGTACTC
TATTTTCCAGTGTTTGTCTGATCAAGGACTCGTACAAAGAATGGATTTGT
TCTCAATACGCAAGTGAAATGATGTCACAACGTTTCCGTAAACCTGTCTG
TCCGCATCTCTTCACCAACGTTTGTCACCATTGTCCGGCTGTTGAACCGG
ATGAAGGATATGGCGGGTACTCTATTTTCCAGTGTTTGTCTGATCAAGAT
GATAGCTGCAATCCATCAAATCCCGATTGTCTCTCGTTCAATTGTTTACC
GACGTACGATGAAACTAGAATTACTTATCATTGAATGATAGCTGCAATCC
ATCAAATCCCGATTGTCTCTCGTTCAATTGTTTACCGACGTACGATGAAA
CTAGAATTACTTATCATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000060_pilon | genome | sc0000060_pilon:829785..838248 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 802-885:85 |
| Aaloc | 628-798:1438 |
| Aaloc | 1-627:8465 |
|
