XLOC_045021 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045021
Unique NameXLOC_045021
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000391_pilon:194410..204124+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045021 ID=XLOC_045021|Name=XLOC_045021|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9715bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000391_pilon:194410..204124+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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taatcAAAGTGATtacaagaaatttatttttatatcttCAAGCTGACGAT CACCAAGCATTGATTTGGGACATCCAACCCATGCCACGTGCAATTGAGGA CCCAATACTCGCTTACACAGCTGAAGGTGAAATCAATAATGTCAAGTGGG CCACAAATCAACCTGATTGGATCGCTATCAGCTACAACAAAAGTGTTGAA ATCCTACGTGTTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000391_pilon:194410..204124+

>XLOC_045021 ID=XLOC_045021|Name=XLOC_045021|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2052bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000391_pilon:194410..204124+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgtcTAAGCCTCAAGTtggcaaaaagaaagaaatttacaAGTACAATGC
GCCATGGACAGTTTATGGTATGAACTGGAGTGTCCGTCCTGATAAAAAAT
TCAGATTGGCTTTGGGTAGCTTTATTGAAGAATATAGTAATAAGatgtcT
AAGCCTCAAGTtggcaaaaagaaagaaatttacaAGTACAATGCGCCATG
GACAGTTTATGGTATGAACTGGAGTGTCCGTCCTGATAAAAAATTCAGAT
TGGCTTTGGGTAGCTTTATTGAAGAATATAGTAATAAGgtACAAATTGTT
CAACTTGATGAAGAAAGTGGTGATTTCATACTCCGCTCAACTTTTGATCA
TCCTTATCCAACAACGAAGATTGTTTGGATCCCTGATGAGgtACAAATTG
TTCAACTTGATGAAGAAAGTGGTGATTTCATACTCCGCTCAACTTTTGAT
CATCCTTATCCAACAACGAAGATTGTTTGGATCCCTGATGAGAGAGGACA
TTATCCAGATTTAGTGGCAACATCTGGTGATTATTTGCGAGTGTGGAATG
TCTCAAATGATGAAGTCAAATTGGAAACACTTTTGAATAATAGAGGACAT
TATCCAGATTTAGTGGCAACATCTGGTGATTATTTGCGAGTGTGGAATGT
CTCAAATGATGAAGTCAAATTGGAAACACTTTTGAATAATAATAAGAATT
CAGATTACTGTGCACCATTGACCAGCTTTGATTGGAATGAAGTGGACCCG
AACATCCTGGGAACTTCAAGTATCGATACCACATGCACTATTTGGGGATT
GGAGAATAAGAATTCAGATTACTGTGCACCATTGACCAGCTTTGATTGGA
ATGAAGTGGACCCGAACATCCTGGGAACTTCAAGTATCGATACCACATGC
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TGTAAAAACACAACTGATAGCTCACGATAAAGAGaCTGGTCAACCGATTG
GGCGAGTACAAGGCCATGTAAAAACACAACTGATAGCTCACGATAAAGAG
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TTCGGTCGGTGGCGATGGTTCTGTTCGGATGTTTGATCTCAGGTATACGA
CATTGCATTCAGTCGAGCGTGCAGCGGTCGCGATACGTTCGCTTCGGTCG
GTGGCGATGGTTCTGTTCGGATGTTTGATCTCAGACACTTGGAACACTCG
ACTATTATTTACGAAGAAGCACAACACACACCTTTATTAAGACTGGCCTG
GAATAAGCAGGATCCGAACTATTTGTCTACATTTGCTCTTGATAGCATGG
AGACACTTGGAACACTCGACTATTATTTACGAAGAAGCACAACACACACC
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ACTCCAGTGGCTCGTTTGAGTAATCATCGTGCGGCGATCAACGGTATGGC
ATGGGCACCACATTCTTCATGTCATATTTGCACATCAGACGATCATTTTG
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GGCGATCAACGGTATGGCATGGGCACCACATTCTTCATGTCATATTTGCA
CATCAGCTGACGATCACCAAGCATTGATTTGGGACATCCAACCCATGCCA
CGTGCAATTGAGGACCCAATACTCGCTTACACAGCTGAAGGTGAAATCAA
TAATGTCAAGTGGGCCACAAATCAACCTGATTGGATCGCTATCAGCTACA
ACAAAAGTGTTGAAATCCTACGTGTTTAACTGACGATCACCAAGCATTGA
TTTGGGACATCCAACCCATGCCACGTGCAATTGAGGACCCAATACTCGCT
TACACAGCTGAAGGTGAAATCAATAATGTCAAGTGGGCCACAAATCAACC
TGATTGGATCGCTATCAGCTACAACAAAAGTGTTGAAATCCTACGTGTTT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045021XLOC_045021-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000391_pilongenomesc0000391_pilon:194410..204124 +
Properties
Property NameValue
Aaloc856-1026:9545
Aaloc736-852:8699
Aaloc619-735:8139
Aaloc526-615:7496
Aaloc460-525:6562
Aaloc346-459:5793
Aaloc247-345:5312
Aaloc145-246:468
Aaloc1-144:1