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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000391_pilon:194410..204124+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045021 ID=XLOC_045021|Name=XLOC_045021|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9715bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000391_pilon:194410..204124+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atgtcTAAGCCTCAAGTtggcaaaaagaaagaaatttacaAGTACAATGC
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TCATCTCATAGAGAGGACATTATCCAGATTTAGTGGCAACATCTGGTGAT
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TCCTCTGCTCTTTTTACTCGTCATGtgcatagcgtcagcctgggtttagg
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GTCGGCTTTTGAGGGGACTGGTAATgaatataaaatgtttttctttgaga
ATGTTAATGCAGCGACTTAAGACAATTTGACGCCCTTCTTTCCTTTTAAA
ATTCAATCCAGTCTTCTCAAGATTTTAAAGGTTGATGGGTGTATAAAGTG
GAATTaaacttgtttgttgtttacaaacaaaaatctctaatattatctac
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GATTCATTAGAAATGTTCCTGTAACAGTAATTTGTGGACACGATCTGTCT
AATTTCAAATTAGGTCTCTCAGAAATCTTGATGTTCATAACATAGGTTAT
GCTTCTCTAATAGGATAAgataaattcgaaaaaatttagATGAATTTATC
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tagacagAACATTTTGTCATTAGttgatttttttacaatatttgaCTTGA
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GATGTAATATTTTATGCTCTACCTTTTATTATCATAGACACTTGGAACAC
TCGACTATTATTTACGAAGAAGCACAACACACACCTTTATTAAGACTGGC
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TGGAGGTAAGTTGATTTCATATTCTAATACtgtcttgtttttctttcttc
aaaaacagTACATTTTTGTTTGGGCTCTTATTTTCTGGTGCTTTGaccct
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TTCACTCGGCTAGACACATGACCTTCGAAATTTTAGTCCATCATAGAGCG
CGGTGTTTCTGATCACCCATGATTCCTTTTCACTATGAAATGGCATGTTC
GGGATTTCTACTACAATGTCTTCTGGGAAATCgagtataaaaaaattatt
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TTTTCTGATAACTTATTCTCTATTTTTCTTATCTTACTTACACAATAGAC
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CATATTTGCACATCAGGTACGTTTCTTTTTGTACTGTGATTATCAGATGG
TTTTGAAGATATATGGCCTGAAAAAGCTAATGTTGTCCTTAATAAGACCT
TCAAGCATTTTGgtgtaacttttttctaatGTTGATATATCACAatccaa
aaaatctgaaaatgggTTCTCGTATGTTTCTTACGTTGTAGTTCTATTAC
TTTCTTACTAAAAGGCGAAAACTTGCAACTTAAGATATTTccactttgga
aaatatttgGGGAAAAGTATTTTGAATTATGTAGTAAATCGAGTATCCGA
AAAGAGATTCTGATTTAATGTTTGTCGATCATTTTCTCTAAAGCTGGTCA
ATTAGAGCCCAATCCTCTTTCCATGCACTTTTTGACATATTGGTTGATTT
TGTGTGTTGACTGATGTATTTCGATATGCAAGGAGATTTGAAAGTCGCGC
TTTCCATAGTTCGAACCGGTATAAACGCTCTATGTATCTATAAATACTAT
GGCCAGGATGGACTTTTGCCAAATATTACAGTGCAGTCTCTTCAACTGAa
acttctataactcgaatatcttCTTAACTCAAACAAGATTCATGGTCCCT
TATGTCAACAATGCCTTAtcaaccttactccataactcgaacaaatttgt
gttctgCCTgtgttttcatgttattgagactccaattattttcaaaaatc
taatcAAAGTGATtacaagaaatttatttttatatcttCAAGCTGACGAT
CACCAAGCATTGATTTGGGACATCCAACCCATGCCACGTGCAATTGAGGA
CCCAATACTCGCTTACACAGCTGAAGGTGAAATCAATAATGTCAAGTGGG
CCACAAATCAACCTGATTGGATCGCTATCAGCTACAACAAAAGTGTTGAA
ATCCTACGTGTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000391_pilon:194410..204124+ >XLOC_045021 ID=XLOC_045021|Name=XLOC_045021|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2052bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000391_pilon:194410..204124+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atgtcTAAGCCTCAAGTtggcaaaaagaaagaaatttacaAGTACAATGC GCCATGGACAGTTTATGGTATGAACTGGAGTGTCCGTCCTGATAAAAAAT TCAGATTGGCTTTGGGTAGCTTTATTGAAGAATATAGTAATAAGatgtcT AAGCCTCAAGTtggcaaaaagaaagaaatttacaAGTACAATGCGCCATG GACAGTTTATGGTATGAACTGGAGTGTCCGTCCTGATAAAAAATTCAGAT TGGCTTTGGGTAGCTTTATTGAAGAATATAGTAATAAGgtACAAATTGTT CAACTTGATGAAGAAAGTGGTGATTTCATACTCCGCTCAACTTTTGATCA TCCTTATCCAACAACGAAGATTGTTTGGATCCCTGATGAGgtACAAATTG TTCAACTTGATGAAGAAAGTGGTGATTTCATACTCCGCTCAACTTTTGAT CATCCTTATCCAACAACGAAGATTGTTTGGATCCCTGATGAGAGAGGACA TTATCCAGATTTAGTGGCAACATCTGGTGATTATTTGCGAGTGTGGAATG TCTCAAATGATGAAGTCAAATTGGAAACACTTTTGAATAATAGAGGACAT TATCCAGATTTAGTGGCAACATCTGGTGATTATTTGCGAGTGTGGAATGT CTCAAATGATGAAGTCAAATTGGAAACACTTTTGAATAATAATAAGAATT CAGATTACTGTGCACCATTGACCAGCTTTGATTGGAATGAAGTGGACCCG AACATCCTGGGAACTTCAAGTATCGATACCACATGCACTATTTGGGGATT GGAGAATAAGAATTCAGATTACTGTGCACCATTGACCAGCTTTGATTGGA ATGAAGTGGACCCGAACATCCTGGGAACTTCAAGTATCGATACCACATGC ACTATTTGGGGATTGGAGaCTGGTCAACCGATTGGGCGAGTACAAGGCCA TGTAAAAACACAACTGATAGCTCACGATAAAGAGaCTGGTCAACCGATTG GGCGAGTACAAGGCCATGTAAAAACACAACTGATAGCTCACGATAAAGAG GTATACGACATTGCATTCAGTCGAGCGTGCAGCGGTCGCGATACGTTCGC TTCGGTCGGTGGCGATGGTTCTGTTCGGATGTTTGATCTCAGGTATACGA CATTGCATTCAGTCGAGCGTGCAGCGGTCGCGATACGTTCGCTTCGGTCG GTGGCGATGGTTCTGTTCGGATGTTTGATCTCAGACACTTGGAACACTCG ACTATTATTTACGAAGAAGCACAACACACACCTTTATTAAGACTGGCCTG GAATAAGCAGGATCCGAACTATTTGTCTACATTTGCTCTTGATAGCATGG AGACACTTGGAACACTCGACTATTATTTACGAAGAAGCACAACACACACC TTTATTAAGACTGGCCTGGAATAAGCAGGATCCGAACTATTTGTCTACAT TTGCTCTTGATAGCATGGAGACGATCATTTTGGACATGCGAATGCCGTGT ACTCCAGTGGCTCGTTTGAGTAATCATCGTGCGGCGATCAACGGTATGGC ATGGGCACCACATTCTTCATGTCATATTTGCACATCAGACGATCATTTTG GACATGCGAATGCCGTGTACTCCAGTGGCTCGTTTGAGTAATCATCGTGC GGCGATCAACGGTATGGCATGGGCACCACATTCTTCATGTCATATTTGCA CATCAGCTGACGATCACCAAGCATTGATTTGGGACATCCAACCCATGCCA CGTGCAATTGAGGACCCAATACTCGCTTACACAGCTGAAGGTGAAATCAA TAATGTCAAGTGGGCCACAAATCAACCTGATTGGATCGCTATCAGCTACA ACAAAAGTGTTGAAATCCTACGTGTTTAACTGACGATCACCAAGCATTGA TTTGGGACATCCAACCCATGCCACGTGCAATTGAGGACCCAATACTCGCT TACACAGCTGAAGGTGAAATCAATAATGTCAAGTGGGCCACAAATCAACC TGATTGGATCGCTATCAGCTACAACAAAAGTGTTGAAATCCTACGTGTTT AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000391_pilon | genome | sc0000391_pilon:194410..204124 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 856-1026:9545 |
| Aaloc | 736-852:8699 |
| Aaloc | 619-735:8139 |
| Aaloc | 526-615:7496 |
| Aaloc | 460-525:6562 |
| Aaloc | 346-459:5793 |
| Aaloc | 247-345:5312 |
| Aaloc | 145-246:468 |
| Aaloc | 1-144:1 |
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