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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000046_pilon:115965..124416- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045016 ID=XLOC_045016|Name=XLOC_045016|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8452bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000046_pilon:115965..124416- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTCTTTAGGTCTTGGATTGATGCAGAAAATCTTGGCTACAAACAAGGC
GCTCAAAGCAAGAGGAAAACCCAAGAAGACCTCAAAGCTCTGTTTTGTTG
AACTCAAAAGATCTTCTGAAACAGGTGATTAAATGACTTGAAACTGTTAA
CAATAAGTATTGATTATAAAATCAATTATTTCAAAATATTCTTTATAAAA
CTTTTTCTGCCTTTTTCATTGGTTTTGTTTATAAATCTAATTTTCAACTT
AATTCCATTCTTATTTTCAATTATGTAGGACAAAGAATTTATAAACCAAA
AAGACAAAAACGAAATACTGAGCATAAAAAATCAAGGAGTAACAGCACTG
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CATCGTGTGCACCCCAGAATAGTGGGGGTTATGGTGTTTTAGGTCGAATT
TTTGTTTCATCCCTCGAATTAGTAAAAATTTTTGTGGGGATAGCATTTTT
AGCTGGGATCTGGGAGTTTGGATTGAGGGTGGGAATTTTAGGGTTAGGTG
GGGCCTGAAGTTTTAGGTGGGTCCTGGAACCCCCTTGCTCACTTATTTTT
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ACATTTTATTTCTTCAGAATTCGTGAATGAGGAATTGGCAGGCCTAGACC
AACAACATTTTGATGCTGATGTTAATGATAGCAGTATGAATGACAATATT
TGTGATGATGAACCACCAACACGTAAGTGGTTTAAAAAGTTCTTCTGTGA
GTTCATATTGTATTTGTCAAAGGTATGTTAACACGATTTTAGAAATGTAT
ACAGTACTTCCTAAAGAAGCTGATAAAGGGTAAATCTTCTTTAGTGCAAC
CAGTTGAAAATTTAATAATAAATATTGATTTTAGTGAACAGTATCAGTAG
TTGGTTGGAAACTCTCATGAAATACAGCAAGTCGAAGAAGAAGAAGAAGA
AATCCTGGTTTGATAGGACACAATCTTGTCAACAAGACTGGGATATGGTG
AGGGAAGGAATTTGGAGGTTAATGCAGGCGAGAGAAGTCGTGAATGATGT
TTGTGCTTTGTGTTGTGATCGCAAATGTGATGTACGTTGTTTGGATTGTC
TTAAGTCGTTGTGCTATGTATGTGATGATGTGTTCCATCTGTCTCATCCT
CTTCACGACCGATTCTCATCTGCTGGCAGGCCAATCGATGTGTTGGAGTG
TTTGGACGAGAACAAAGAAATCACTACGACAGGTTAATTTTTCAGTCAAT
TTTATAACTTGCTAGGAAGTATATCTATGATGCACTCAGCATATTTCAAA
ATAAACCTCTTTTACAAATTTAACACACAGTTTTTTGCTAATTTTGTTTT
TCCTTGATTTGGTCAGTCTCTGGAAAATTATTTTGAAAATCAATAATTTA
ACCCAAATGCTTGATGATTTGTGGGAAAAGTCTTCACACTTCATATACTC
TCTTTTATTTCTTGTTTATGGTCTCCATTATCACCAAGCAGATCCTTTTT
CTCTACTGAGTGAGAGGATCTGTGGTGGTTGGTTAGAAAATTTTTACAAA
TTATATATGTGCGCTATTTTGTAAAGAAACAAGATTTGGCTTGGATTAAA
GTGAAGTTTTAAGCGAACTCGGAGCGTAATGAATCCTTTAGTGCTATTTT
TTAGCCTAAGCTCATTAAATATTTATCTGTAACGGATGATAACATAAAAG
AGTTGTGTCCAACCTCTTCAGATCATCATATCCGCCGCATCACTTTAGAG
CAAAGTGTTTATTCATGATCTGTTATGAGGTTAGGTTTCCATTAGCCTGG
TTGATCTAACTTTCTATCATTAATTTTTAGTTCGTTATCCATCACTCATA
TGTTCTTGCTCTGTATGTGGTAGCGGAAATATTTCCAAGGTACCCAAAGA
CGAATATTGCATTGTCATTACCCTGAAAGGTATGTCGAATTTTTCTTGCT
TTCAGTTAAGCTAAGACATGAGTCAAAAGGATATGATGGTATTTTAAGTG
TAACAGTACTTAATTTGATTGTCTGAAATGATTTTTTAGCGAAATGTTTG
GCTGGTGTTTTCAAATGGCTATTTTTAAACTCAATTTACAGGTCGTTTTG
ATTTGCATAAATACATCATTAAGTGCATAGATTGTGATGCCCAGACAGAT
CCATTCACGATTGGTGTACTGCTTACCTCTGGTTTCTGGCCTGGTAATCC
TAAAAGTTTGAACTACCTTTTTAAAGAAGAAGTATTTCAACTGTGGGACA
ATTTTCGAAAGTTTATGCCTGGCTCTTCCGAAAGGGCGTTTCTTAAGTCC
CTAAATGCAATATCAGATGACAATTGTAGGGTAAGACTCAAATTTATATC
TTTTTTGTGTTTCAATCATCTTTTTGGCTTCGTTTGTGCAAAACCAAAAT
AAAGTTTTTACTGAAAACCCCATGGCTTTGCTTAGGAATCTTATATGCCT
TTGTTTTGTTTAACACACCAAATCTGATGTGTTTGGGCTCATAGGATTAA
AACCATAGACTTAAAGCTTTCTTTTAATGAGAGGCTTAAGAAAATGAATC
ATCTAAAAGTCATCTAATCATCTAAAAATGAATCATCTAAAAGTGACGGA
ATAGCAAGCCGTTGATTAACGATTACGAGTATACTGAATTTTCCAATATG
CATTTTCTTCAGAAAGCTACCATCAACCCAACAAACTTTTCAATGGCGTT
TCGTGAATGGTGTTTGTGGTTGGATCAGAAAGATTTGATTCAATCCAAAG
ATTGGATGGAATGTCCAGCTTGCTACCCTCATCCTCATAGTTGTCACGTA
GATGGAAATTCGAAGTTGTATCGTTATAAGCGAGGATTGTAAGTAAATAT
TACAAAAATTTTGTTTTTCAAAGATTTCAGTACTTTATATTAACTCAGAT
TGCAGTAACACTGATGATGCAATCAACACTTCAAAGTTTAGATTAAAAAT
TATTTCATTGGGGATGAAATTAACTATTTCAAGTGACTCTTCTTTAGGAG
GCAGCGAGAATCATTTTACGGAGGAAGATTTGTCATACCCAACGAATCTG
TTTCGAAATTCATTGACAGATTATACAACGATAAGTCGAAGAAGGTACTA
TACATACAAAATCTTAGTATTTATTTAAAATATTAGTTTAGATTTAAGCT
GCAATATTGTTATAATTTTGTCATACAGTTCAATCTCGTCATCGATCATC
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ATAGTAATTCGATTTGTGGTGGAGTTTGGTCTGCAGCACAGAATGCTTCA
AGAAAAATGGCAAAGCTCGATGAAACGGGCCTCGAGGTTGCCACTTGCAG
ACATGTTTTGGCTCAAAAAGCTCTGAACATGTTCAGAGGTGAGGTGTTTG
GCTATCCATACTTTCTGATAAAAGAGTGTATGATTAAAAATGGTACCAAT
TTCTGTTTTGCTGATGTCATGTGCAAACTTTGGCCGTTCATTGTTCGAGA
TGATGCATCAATCAAGACAAAAATCAAACCTGCTCTTTCAATAATGCACG
CAAAGGGACATTCTATAGACTGCCAGGTAAAAGAAATATTGTCAAAAATT
AATGCTGACACTTGGAATTCGTCACTTTTCAAGGAATGTTGTTGTTATTC
ATGTCTGAATTCTATAACATATATTGTGCACTCGAAATATTTGCTCTTTA
TCTCATAACTCATCCTCAGGTTGTATGGAGTGGTGAGTGGTTGGATGGCA
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AGGTTCGGGAATAGTACCAAGTATCAATTGCCTGAAAGTAAGTAACATTT
TTTTATCAATTCTATGATACGTAAACAATCGTGCATTGTTCCCTTAAAAC
TGTGCTCAATATACAATGAAAAAGGTTCAGGAGCATCATACAATATACGA
AACTCGAAGTCCTATGACTTAATTCAACTTGTTTTTTTATATCAATTCTA
TGATATGATTCAATTCCCTTACTGCCATAATAATTTTGTTCTTGGTAGCA
TACTGTATCGATGTTCAATGCTAGCATCGTTCATTACTTTGTTTTACAGA
GAGGGAAGAGACACTCACTGAAGCTGTCCTCCACTGGAACAAAACCAAAG
TGAAGAAACTTGTGTCAGATTTGGCTAAAAGATATTACAAGGTAAAAAGA
ATTCACCATATTGATTGTATTTCAACATAGAAAAGTCTTTTTTTTATTGA
ATACTTAATTAATAAAACTACCAATAAATTTTTTGAGTCGCTCATTATTT
TATTGAGAAATTAAAATAGTTTGATTGCTGAAACTTGGTCATCTTTTGTT
CTCTCGCAATAAGCAAGGTAAAGTGTGTTTGTGCAAAAGTATTAGAAAGT
ACAGGGGGGTCCATGTACAAAACAGCCCCTATATTTTACAATATACTATC
CAGTACTATCCAGCAAACTCCCAAATACACCCTGACACCCCCTGTATAAT
ACAATATACTATCAAGCAAACTGCCAAATATACCCCAACACCCCCTTACA
TAGTACAATATACTATCCAGAAAACTACCAAATATACCCCTACACCCCTT
CATAAAATAAAAATTTTAAGCCAAAAACTTGAAACTTTGGGGTAAGTTTT
TTATTCTTCCTATAAAAAAATTTTCTCGAAAATTGACAAAAACAATTGAG
AATGTCAAAAAATTTTCGACAAAAATCTAAAATAAATCACAATTTGATTT
GATTTTGGCTTTTTAGTACACAGATACTAAGCAGAAAATCCGAAATTTTA
CCATGACACCCCCTGTATAGTACACGTATAATAAACAGCAAATCAGAAAT
TTGACCCTGACACCCCCATGTATAGTACACAAGTACTAAACAGCAAAATT
TTTTTGAAAACACCCATCCATCCCATGATACATGCTGTTTTTTTGTACAT
GGACCACCCCCCCCCCTGGAAAGTACAATAACTTTGGAAGGACAAGAGCT
TTGTAATTGAAATTTTCAGTTCGTTTTTAATTCATACGAAGAAAACACTG
AAAATATCAAATCAAAAGAACTGCCCAATCAAAAGATAGGACTTCTGTTT
TTGCCTGAAATCAATTGTAAAAATCATTGTTTCAAACCTCGTTTTCATTT
TTACCTGATTTTTAATAATTCTATTATGAGTGAATGAAAATTTGCTACAT
AGATCAAAATTTCATAAAGATCGCATTTTTTATTTCCCATTGATGTCATT
AATTGATTGCGCAATCAGTTTTGAGAAACGTCTATAGGAGTGACATACTA
TTTTATACTTGATGTTATTTTCAGAACGAGGAAAATTTGAAAGCTATTGG
CAAGTTGCCAGACGAATATTCTGCGGACCTCATCATAAAATGGAAAGAGG
AAATCCAAGAAGACGCCTCAGGTAAGTGTAACAAAACTTTTCATTCAAAA
TTAATTGATTGGATACAAGTTAAATTTAGTACTAATAATTCTGTATCCTG
TATTATGTTGTGTTTTCTTTTTCTTTGTCGAATATTTAATAATTTTGAAG
TTTTAATAACGATGTCCAACGTGTTAAGAATTAAATAATATACCCTTTCT
TTTTCTCCGTCCAATAAATTCTCGTGCGTTTTAATTCGTTCCCATTAGAT
TGGATATCTAAAAGATTAAATTTTTGAATATCGCGTGGGCCTTCTCTGCT
CAAACCATGGTTCGCCCTGGATGTGTGACTATTAACTTTAGCACCCCTCA
TACCCCGAAAATATTGTCTGTATCAGCTACTGCACCTTACGATTAGAAAC
TAAATTTCCATTCCCTAGATGAATTGACCGTCGGCGCATTTCGATGTATT
TCTCTTGAAAGAAGAATGCTATGTTAAAAAGTAATGCGTCGTTGGAAAGA
TTAGTGGATAATATATATTTTTTTCCTGAACATAATATAAAATATTTGAT
TGCCGATTTTGGAACTTAGCTAAGTTTTTGTAAAGTTAAAATGAAAGTTT
ATGCACCGGTAGAAGAAAAAGTTAGTTTTTTTATGAATTCTTGAGATATT
TACATTATCCACTCAAAATTTTCTTTTCAACTATTTCAAGGTATTACTTT
TTATCAAAGCATTCTTTCCGCAAGAAAAACCTACTCTTTGGTAATTAAGC
ATGAGTTTAATTGAATTTGCTCTTAAATTTTATAGGTTTGAAGAAAAGAG
TAGTTCGGCAACTTTCAGATACCGAAAAGCTTGTTCTTCTAGTAGAAAAA
CTACATGCCCCATTTAACTTTCATTTGGCTGTCAACAAAATGTCGTTCCC
CAAGAAAATCGACTATGGCAAGGTGTATCGGTTGTTGGAGTTTGATAAAA
GTGACCAACTTAGAGAGCTTGATCGACTTGCCAACAAATTCACATCTGAA
GATTTGTTGGTATGTGTTTTAACTTTATTTTCAAATAAAAAATAAAATAT
CGGTCTGAAGACTTGGAAATATCATGTACATTTTTTTGCCTAAAATCTGA
GAAAATATAACCAAAAGTTAGAACTGCAATATTTCCCATTGGTTTTAGGA
GGCACATAGAAGTCTTTCTCAAGAAATATTGCTACCCTTGATCAAAACAA
TGCTGGAAAAATCAAGAATTGAAAAAATTATGTTAAATGCTCAAGTTGGA
GAGAAAGGTAAAATGAATTTCACGAATTATAATCAGCTTTCCAAAATGTC
TCAAATATGCAAAAAATATATGTATGGAAATAGGATATTCAATTCTTTTG
TGCTTCGGGATTAGGATTATACTATTTTTATTTTTAACTTTTTAAATCAT
TTATTTTAAGATACGAGCAAGAAAAGGAAAACAGTTAGATCTAAGCTAGC
TACCTTAAAAAGTAAAGAGGGTGAAATGATCAACGACTATCTTGTTTTGA
TTGGGGAAACCAATGGATCAACGAAAGATCAACTTGAACAAGGAATTCTA
CCTTGGTTAGATGACAGTTCTTCTTCCGAAGGTATGCATTTATGGTGTAC
TATATCAATGAAAATTATTTATGGAATGATTAAATGTTCAGTGTATTTAA
ATCGATTTTGTTAAATAATCACTTCGATCCTCACTTAGGAATAGCCTAAA
GCTGGTTGTACCAGCCAATCGCACGAAACTATGAATCTTGCCTTTTTAAC
TAAATAATTCGAAAAAATTTCCTATAAAAGTGTTATGTCCAAAGAAATGG
TCAAGTAGAGTTCTGAAAAATCCATAGTTTTACCCCCCTCCCTAATCCTA
GGTGGGGAGAATCTAGGATTTATAAGAATTTTCGTAGGACGGGTCTTGTT
GCTTCCAATTTCCTAAGATGGGGTTGTCACCTAAAGGGGGGGGGATTTAG
ATATGGGTTAAAAATTGAAATTTTCGAATTATTATTTGAAAAAGAAATAT
ATTCTTTCAGGGGTCTGAAATTGACTCGTAAGGGGGGTCTTGACCTCTCT
ATAAACTATGTGGGTTATTAGATATAGAAAGTACAAACATCCCAATGAAT
ATTGTTTTAATATTTCAGCTGTTAAACGCAGAATCACTGTGGAAAAGTAC
TTAAAAAAACAACGCTTCCTCGAAGAAAAGAAGATTATCATACACGAGAT
GAGGAATGCAATTGATTTCATGGAAGGCAAGATCAAAAAATTGATGCAAG
AATATAAAGAGACAGGTAAAATAGTTTCTCAAGGTTTATTGAATTACTTT
ACTCACGGGTTTTCTTGTGAACGCCTAGTCTATAAGCCCTTGGAGGGAAT
TCAGAACACCTGGTTATGCACTCGTAATAACAAAAACGATTGTGTTTTAT
TTGGGGGAGTGTTTCCTCTTTGAAATAAGAGAGATTTTTTTTATTTCAGC
TACGAATACTGGGACAGCCTCAAACCAAGATACAGAGTCAACAAACCTGA
ATCCAGATATTTTGACGGTAAGCTACACTTCGCCCCCACTTTATGTTGCC
TTGATAAAAGGATTCCTTTAAGTGGAATATCGATTAAAGGCTCAGCAACT
TTAAACAGTAAAGCCTAACTTGATTATGACGTTATCTGGCAGGTGGCTCG
GTGAGAAATTATAATTAATTGCTTTTTGTTGGATGTGCTTGTCAATTATT
AAGACAGGGAATTTTACTTATTGATACTGATTTTTTTGTTATAGATCAAA
TCAAGACAAGGGGAAAAGGTATTAAAAGAGCAAGGTGCAGAATATTACAG
AAGGGAGTTCGAAAGTGCCATCAGAACATTTCTACCAATAATCGAACCGA
CTGGTATTCACGATTTTGAAAGTCTAATGGACTTTGGTACGGAATCGAAC
GATTTTGATGAAAAGGACATTGCTATGAATTCTAGCGACTTTGAAGATGA
TGAAGAGGAAAGTGATTCTGAGGAATATCATCTTTCACGGGTTGAGAATT
AA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000046_pilon:115965..124416- >XLOC_045016 ID=XLOC_045016|Name=XLOC_045016|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5748bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000046_pilon:115965..124416- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTCTTTAGGTCTTGGATTGATGCAGAAAATCTTGGCTACAAACAAGGC GCTCAAAGCAAGAGGAAAACCCAAGAAGACCTCAAAGCTCTGTTTTGTTG AACTCAAAAGATCTTCTGAAACAGATGTCTTTAGGTCTTGGATTGATGCA GAAAATCTTGGCTACAAACAAGGCGCTCAAAGCAAGAGGAAAACCCAAGA AGACCTCAAAGCTCTGTTTTGTTGAACTCAAAAGATCTTCTGAAACAGGA CAAAGAATTTATAAACCAAAAAGACAAAAACGAAATACTGAGCATAAAAA ATCAAGGAGTAACAGCACTGGACAAAGAATTTATAAACCAAAAAGACAAA AACGAAATACTGAGCATAAAAAATCAAGGAGTAACAGCACTGAATTCGTG AATGAGGAATTGGCAGGCCTAGACCAACAACATTTTGATGCTGATGTTAA TGATAGCAGTATGAATGACAATATTTGTGATGATGAACCACCAACACAAT TCGTGAATGAGGAATTGGCAGGCCTAGACCAACAACATTTTGATGCTGAT GTTAATGATAGCAGTATGAATGACAATATTTGTGATGATGAACCACCAAC ACTGAACAGTATCAGTAGTTGGTTGGAAACTCTCATGAAATACAGCAAGT 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AATCCTAAAAGTTTGAACTACCTTTTTAAAGAAGAAGTATTTCAACTGTG GGACAATTTTCGAAAGTTTATGCCTGGCTCTTCCGAAAGGGCGTTTCTTA AGTCCCTAAATGCAATATCAGATGACAATTGTAGGGTCGTTTTGATTTGC ATAAATACATCATTAAGTGCATAGATTGTGATGCCCAGACAGATCCATTC ACGATTGGTGTACTGCTTACCTCTGGTTTCTGGCCTGGTAATCCTAAAAG TTTGAACTACCTTTTTAAAGAAGAAGTATTTCAACTGTGGGACAATTTTC GAAAGTTTATGCCTGGCTCTTCCGAAAGGGCGTTTCTTAAGTCCCTAAAT GCAATATCAGATGACAATTGTAGGAAAGCTACCATCAACCCAACAAACTT TTCAATGGCGTTTCGTGAATGGTGTTTGTGGTTGGATCAGAAAGATTTGA TTCAATCCAAAGATTGGATGGAATGTCCAGCTTGCTACCCTCATCCTCAT AGTTGTCACGTAGATGGAAATTCGAAGTTGTATCGTTATAAGCGAGGATT AAAGCTACCATCAACCCAACAAACTTTTCAATGGCGTTTCGTGAATGGTG TTTGTGGTTGGATCAGAAAGATTTGATTCAATCCAAAGATTGGATGGAAT GTCCAGCTTGCTACCCTCATCCTCATAGTTGTCACGTAGATGGAAATTCG AAGTTGTATCGTTATAAGCGAGGATTGAGGCAGCGAGAATCATTTTACGG AGGAAGATTTGTCATACCCAACGAATCTGTTTCGAAATTCATTGACAGAT TATACAACGATAAGTCGAAGAAGGAGGCAGCGAGAATCATTTTACGGAGG AAGATTTGTCATACCCAACGAATCTGTTTCGAAATTCATTGACAGATTAT ACAACGATAAGTCGAAGAAGGAAAATAGTAATTCGATTTGTGGTGGAGTT 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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000046_pilon | genome | sc0000046_pilon:115965..124416 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 2617-2874:259 |
| Aaloc | 2551-2616:552 |
| Aaloc | 2404-2547:883 |
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| Aaloc | 2122-2229:1855 |
| Aaloc | 1900-2121:2216 |
| Aaloc | 1801-1896:3079 |
| Aaloc | 1711-1800:4302 |
| Aaloc | 1591-1707:4684 |
| Aaloc | 1261-1590:5157 |
| Aaloc | 1165-1260:5405 |
| Aaloc | 988-1161:5741 |
| Aaloc | 751-987:6310 |
| Aaloc | 652-747:6571 |
| Aaloc | 304-648:7517 |
| Aaloc | 199-300:7784 |
| Aaloc | 127-195:8173 |
| Aaloc | 1-123:8453 |
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