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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000235_pilon:178612..188840+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044964 ID=XLOC_044964|Name=XLOC_044964|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10229bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000235_pilon:178612..188840+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGATTTTGTTACTTTTGGTAGCCTTTTCTGGCGTTGTTTTCTCCGA
ATGGATCAAAGAAATGGAGAGTAAGTATCCCGGCTAGCACATAATGTAGT
TTCAGCGTTCCATAACTAACATTGGTCCCctcaactgggggggggggttc
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tccgaaattccgcaaatttttttgctaaattccgtttttccgcactaaca
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TGTTTACTGAAAAGCCTCAAATGATATCTTTAGCACCCATCAGTGATATA
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aagatttactGAGTCTGAGGATTGGCCCCGTGAATCTGCTTGGATAATGT
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ATGTTAATTTAGAGTGTTTATCACTACCCAGTTGgtacacgacgttgttt
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aaacaacgttgtgtgccagctgtcTACATAGTATACCTTTGATGTAGTTA
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CTAGCGGTACTTGGTTAAGTTATATAggttttaaacaattttataagtTC
TACAAGATTTAGATTCCCGGAAAGAGTCGAAAGACTTGTACAGCGAAAAA
ACTTGAATCAAATTACACCGTTAACATAAAAATGTTAATCTGAAAACTAC
ATTAATCGTATCAAAAAAGTTAATCGATTACAGTTGGCGCTCTCTTAGTC
AATGTTTTACGATTCAATCTACTccgttattcgataatattgaaaattac
tgtcaacaagaaactctctaattcgagaGTAAACGCTAtcttattcaatg
aaaatcctCCAATTCTTTTGTATCCCTAAACTCGAGACACATTTTCAATT
GTCTATagatgcgaaaaaaggactgagACGGTTTTAGTGGCATAAAGCGG
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tataaatttgaattattCAACCAATCTTGTATTTTAGATGTTCATCACCA
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TTGGACGAAAGGTGTCGTCATTCACGAGATCGGACACTCAATTGGTAAGT
AAtgtcattttcaaccaatcagatttaattttcaagttttccaGCCAATC
ACATTtaagattcaaaattttacaaccaatcagatttgaTTTCCAAGttt
atcaaccaatcacagtcaagattcgaaatttttttaatgaattaaaTTTA
AGTTCAAACCTTTTTAACAAAACATTAGCCAAATGTTTAAACCAGCCAAA
CCTCCCTACAAGTCTaagccaatgaaattacaataGCCACCTATTTAAAC
Cgttaaaccaatcagattcaagatacaagattttttcaaccaaccacatt
taagaatcaaaattttcaaccaatcaaatttgagattcaaaattttcaat
caatcacattttagattcaaaattttcaactaATCCACATTTaagattca
aaaattttaaccaatcagatttgaTCTCCAAGATTGTTTAACCGATCAAA
TCTCTTTTAGGTCTTTACCACGAACAATCACGACCAGATCGTGACAGTCA
CGTTAGAATCCAAACACAAAACATCATCTCTGGCATGGCTTACAACTTCA
ACAAACAACGATCATCAAATATAGACTCCAAAGgtttgtacacgtttttt
tataagaacaaactatatcagAAAATCATCaggcttcgacggccaaaatt
ttaagaacaagttaagaacatttaaaagcTTTGCGAACCATAGAACACAT
GAATTTCTTCTAAGATAATtactcataaaatggtgaaattaggacatttt
aagaaaatttttaggcttaaaactcgaaaaattaagaacatccaacagac
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TCAAAGAAGGTCAAACAAAGGCATCCTTAAGGGCGGAACATGAACCCGCA
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CATCGGGTAAGGTGGGGGATGTTTTCTTCACTATTTGTACTAAAACCTTC
CTtacaaggggggggggcttgcaGGGGTTCGAAATATCATTTTCCCGATa
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ctgTCACACCAGTTTGTAGGGGTTAAAATACCCGGCATAATGAcTCAAAA
AATAAGGCTAAATACCGTCACCGTCTGATTTTAAAATACCGTTTTTTCGT
CACTTTTTTCGTCAAATTCCGTAACACCGTAATAAACACTGGGCGAAATC
ATAGATTTCTAATGTAGGAAATATATAGGAAATCTAACATTTTCTATATA
TTTCATACGTTTTGAAAGACCATATTTCCTACGAAATGTAAAGATGGAGA
TTTCCTATTCAAACATTTCCTGACACATGGAATTATCATATTTACTAACT
TTACATATAATGAAATCTCAAGTTTAGAAGTTTTCAACAAGGGAAATATT
ACATTTACTAACTTTCCATGGAATGTAATGTCAAGTTTAAAACATTTCCC
AAAGGAAAATTTTCATAATTATTATCTTTACACAAGGATGAAACATTAAG
TTttaaaagatttccaaattGCAAATGTTAAGTTTCGATGTATCAAAATA
GAGCTAAACAGGAAGGAAGACACAAAGGTTACTTTTTAATTAACATTTCA
TGTTACTGATCTATTTCATCTTTAGAAGAACTAAAAATTCATATTAAATA
AGATAAAGTAAATTTAATATTTAGATAATCTAAATTACAAGgtaaaaaaa
tacagaaaaaataCAAATGCTATGTATACAATGTATGAGGGCAAAAACTT
AAGAGTATTAGTCAAATAAGTTGAACTTTGGTCAAACtttctttattaaa
atttctatttctatttctattcgaTAATTTACAGGAGGTTACAAAACCTA
TTCTCACaaatattatctagaaaagaatataaatataaggtaaataaata
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TGGAGTCAATGGTTTACTAGAAATCTAAGTTCAGACCActaattttatca
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AGCCCAGtaattgtttatattttacGTTTTTACAAACTTTTACAACGCTG
TCTCGTGGGGAGGATTGATTTGTCTACGTGTTTTGAACCAGACATGATGT
TGTGAAAAAGTTTGAGGCGATTGATTTTGCGACGATTTTCAAGTATATCC
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ATTGTAAATCCAACGGATGGATTTTCGTTGGACGCTTTCTAACTGCGATG
TTATATTCAATTTCCCAGGTGAGTCCCATACTGAAGATGCATATTCTACT
AGAGGTCTGATGTATGTCTTATAGCAAACGAGACGAGTTTCTGTGTCTGT
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CTATTTCAAGCAACTTTTAGCTCTTGAAACAAACActcaaaacatcaaag
aaatcaGTAACCGTCACTTGCCAAATAACTCGATTTCAGGATCATAAGTC
AATCAGCTTTCTTCAAAAATCGTGTTAGTTCATGGTGTTCCCtgaagaaa
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AATTGGAACCCTGtcagaacaaaaaattaaaagatctcccattttcaccc
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GTAGGTTCTTTATGGTGCAGAGAGTTGTACAGTTTCAGTGCTTGATAAAG
TCATTTAACCTGtatagaaataaacaaaactgaTCCATCATTCATTTACA
AACAAAGATAATCATGAATTTTAATCATATCTCAGAATAgtcaaaaatta
agaagaaaactttgccaaaaacatttcactgctcaaaaaaaacttgaaat
atcTACATATACCTATAGCAAATTATCCAGCTTatagttcttttaaaaaa
agtagcATACAAATAAGCAGATAATTCCCTTACCTTACCCTTGATTTACT
TGACGAGAAATGGTTTCGTGCAGTTTATGTTATGATACAGCATCACGACC
TGTAGTGTAGAAAGacaaaagagtcaaacattttgacaacaaatgaacag
caaaaaggaaaacaacatttacaaaaaagtaaaaaaaaagtagatAATAT
ACCCCTGATCTGGGTGAATGACATGAcaaatcgcaaaggcaaattaaaga
aacaaaaagatacaaaaaaatccttaaatgTTAAATGAGTGTTGTCTGAT
CGACCCTTAGTTTAGGATAGATAGAAATAGCACTAACTAGACTCATTTGT
TGATATAAATGGGTGAAGTAATACTTACACATCATGATTTTGTGGTTGAA
TTATGTTTCTCCTTTCCATTGTTCTTACACCAGACTCCAGATCAGCTTAT
CACTTCCACCACTCCAACTTTAACACTCAAAGAAACCACAAAATTGAAAA
CTggttttcaatgttttgatttcgtaAAGCGAATCTGGCATCTGGTCAGG
GGGTTACATTattaaattttacttaagatactctcaaaaatataatataa
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TATCATACGAAACATATTGATTTTCTATTGACCCCCGGTTTAAGATCTAT
GCCGCCATTTTAGATTGGCGCTctcatatttcaaaaaatgtaaatttagt
gaaataccgtaatttctctaatttaatacgtCCTCTAATTAATGCGAGGA
aattattttcgtcattttgaaCTAATTTAAATCCGCTAATTATTAGTGCG
AGCACCCATTTACCTACTtttgattttcctctaatttaatacggtaaagt
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TCGCCCAAATGAGGCAGATGACACGTgaaaagttggaagagtttgaaaag
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TACATGTTCGAAAGATGGACTTTCAAAGTCCgcttgaaattcattgaaat
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ATAGGAACTCCATACGATTTTGATTCCATCATGCATTATGGACCATATGC
TTTCGCAAGAAGTCGTGGTTTAATCACTATCAAAACTTTAGATCCACAGT
ATGTATTCTCCGATTTGAACAAGAAACTCGATTTTAGAATGGGCTCTTCT
AGCAGAAAATGTCATGGGGGtagaggatatagtgtccggggtaatgaaaa
atctacaaaatttgccccgtccggggggtaaacttgctctgtttgggggt
aattttgttCGGTTTGAGggttattttgaatgtccagggtgTCAACTGAT
GTATGTCCAGGTGGTCAGACCTGCAATCTGGAGGGTTAAAGTCACAAAAT
GTCCGGAGGGTAAATTCCTAAAACATGtcatatcctccaccccctatatt
caatttttctctgGAAAAGCCTAATTTTGGAAACCTTATCAGTCCTTTAT
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AGAGACCGGAAATAAATTGGCCCTAAATTGGAGCCAGGCTatgattggaa
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TGAGTAGAATATcttaacttttatttattttgtaattttaagaTACCAAA
ATCGTATCGGCAACAGAGGTGGATTCAGTACTATCGATAAGCGGCAAATC
AACTTGATGTATTGTGGCGGTTCAGGCGGTTCAGGCGGTAATGGCGGTAA
CGGTGGAAACGGAGGCGGTTCTGGATGTAAGTAACCAATCacattatttg
tttcaatcttttCGACTAATCAGATTGTATATTCCAAATTTTGAACCAGT
TAGATTACacgtttccaaatttttgaCCAATCACATTGcttgtttcaata
ttttgaccaatcagattGTGCATGTTTCTAAATGTTTGACCAATCACGTT
GCTAAGAATCTACAGACTAGGTGTCTGCCTTAAGCTTTTCCTATtataaa
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ACGGTACACCTTTCAGTCAAAGCAAACCAACTAGGCCTTCAGGCTTTTAC
ACCAATCTGTGATCTATGATATCTTTTTCGAAAGAATGGATTTTAGTACT
AAGTGActaataaaaaatatcgaacacgaaaattttgttcaaaaataaat
gattaaaCATATTTTAggttaaccctttccgtgcccatGTCAAGTGTATT
TGAAGCGAAACTCCCCTGTAATGCTCAGTTTGAGTCAGAAAACGCCATTT
TTGGTCTAAATTGTAGTAatcggattgggcttcatgtaaagcaaaaaaaa
taattcaaaagtgagtctttccagcgagattttaagctaaaaagccaaaa
taatgctaaaatgtgacaaaaatccacaaaagttttgctcaaaaataaat
tataaacaTTAAATAACTACAACATACTGAGCTAAACTTTCTGACTTCtt
tttttAACAGCATGTTCTGATAAAGTCACTGATTGTCaaaaaaaCATCCA
AGGTTGTCGAAGCTGGGGTCAAGCTTGGATTGACTACATGAAGAAACATT
GCCAAAAATCTTGCGGATTCTGTCGCTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000235_pilon:178612..188840+ >XLOC_044964 ID=XLOC_044964|Name=XLOC_044964|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1806bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000235_pilon:178612..188840+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGATTTTGTTACTTTTGGTAGCCTTTTCTGGCGTTGTTTTCTCCGA
ATGGATCAAAGAAATGGAGAATGAAGATTTTGTTACTTTTGGTAGCCTTT
TCTGGCGTTGTTTTCTCCGAATGGATCAAAGAAATGGAGAACCAAGAACT
TTTCCAAGGAGACATTGTTTTGGACCCAGATGAAGATGAACGTGGGTTGA
ACAAAAACACTTTCGCCAGCATCAAAGGTGGACGTTGGCCAAACGCAAGA
ATCCCTTACGTCATTGACGGAAGCATCAGCTCAAGAGACCAAGAACTTTT
CCAAGGAGACATTGTTTTGGACCCAGATGAAGATGAACGTGGGTTGAACA
AAAACACTTTCGCCAGCATCAAAGGTGGACGTTGGCCAAACGCAAGAATC
CCTTACGTCATTGACGGAAGCATCAGCTCAAGAGGTCAATCGGCCATTTC
CGCTGCGATTAGCGATTACCACAGTTACACCTGTATCCGATTTCACCGAA
GAACAAACGAACGAAGTTACATCAAATTCTACAAAGGACGAGGGTCAATC
GGCCATTTCCGCTGCGATTAGCGATTACCACAGTTACACCTGTATCCGAT
TTCACCGAAGAACAAACGAACGAAGTTACATCAAATTCTACAAAGGACGA
GGATGTTCATCACCAGTTGGATACAGATATGGACGTGTCAACTCCGTTTC
TTTGGCTTCTGGATGTTGGACGAAAGGTGTCGTCATTCACGAGATCGGAC
ACTCAATTGATGTTCATCACCAGTTGGATACAGATATGGACGTGTCAACT
CCGTTTCTTTGGCTTCTGGATGTTGGACGAAAGGTGTCGTCATTCACGAG
ATCGGACACTCAATTGGTCTTTACCACGAACAATCACGACCAGATCGTGA
CAGTCACGTTAGAATCCAAACACAAAACATCATCTCTGGCATGGCTTACA
ACTTCAACAAACAACGATCATCAAATATAGACTCCAAAGGTCTTTACCAC
GAACAATCACGACCAGATCGTGACAGTCACGTTAGAATCCAAACACAAAA
CATCATCTCTGGCATGGCTTACAACTTCAACAAACAACGATCATCAAATA
TAGACTCCAAAGGAACTCCATACGATTTTGATTCCATCATGCATTATGGA
CCATATGCTTTCGCAAGAAGTCGTGGTTTAATCACTATCAAAACTTTAGA
TCCACAGAACTCCATACGATTTTGATTCCATCATGCATTATGGACCATAT
GCTTTCGCAAGAAGTCGTGGTTTAATCACTATCAAAACTTTAGATCCACA
aTACCAAAATCGTATCGGCAACAGAGGTGGATTCAGTACTATCGATAAGC
GGCAAATCAACTTGATGTATTGTGGCGGTTCAGGCGGTTCAGGCGGTAAT
GGCGGTAACGGTGGAAACGGAGGCGGTTCTGGATaTACCAAAATCGTATC
GGCAACAGAGGTGGATTCAGTACTATCGATAAGCGGCAAATCAACTTGAT
GTATTGTGGCGGTTCAGGCGGTTCAGGCGGTAATGGCGGTAACGGTGGAA
ACGGAGGCGGTTCTGGATCATGTTCTGATAAAGTCACTGATTGTCaaaaa
aaCATCCAAGGTTGTCGAAGCTGGGGTCAAGCTTGGATTGACTACATGAA
GAAACATTGCCAAAAATCTTGCGGATTCTGTCGCTAACATGTTCTGATAA
AGTCACTGATTGTCaaaaaaaCATCCAAGGTTGTCGAAGCTGGGGTCAAG
CTTGGATTGACTACATGAAGAAACATTGCCAAAAATCTTGCGGATTCTGT
CGCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000235_pilon | genome | sc0000235_pilon:178612..188840 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 790-906:10113 |
| Aaloc | 655-786:9194 |
| Aaloc | 562-651:8557 |
| Aaloc | 439-558:3463 |
| Aaloc | 331-435:2889 |
| Aaloc | 223-327:2042 |
| Aaloc | 76-219:1219 |
| Aaloc | 4-72:1 |
|
