XLOC_044829 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044829
Unique NameXLOC_044829
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000022_pilon:659073..666961+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044829 ID=XLOC_044829|Name=XLOC_044829|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7889bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:659073..666961+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AACCCTTTAACGACTGcgtctttttatttttccgtgCCCAAAATACCGTG GCTTTTTAAAATTACTGTTCTTAAAATACCGCTGCTTTTTAACGAACCGT GTCATAAAGACTGAAGACGAATCATCTCGTCATAATCTTGTTTGGCACGG AACGCGATGATGAGATATCTCGTCAATGGTCGTTAAAGGGTTAACATTGC GGTCGACTTTTGAGGGGAATGATAATGGATTTAAAACTGATGAAAATGAC ATCGAAAATTCTTTGACTATGAGAATaccaatgcaacgacttcattttTG CCGTCTTTCCTTCCTGGTTACTCGAACCCATTCTCTTCACGATTTAAAGA TCGATAGGTGGTATTGcttgtttttttaaaaagccccatctcgttccctg cgtattatcagcttttttatgcttactggtAGCGCTAGATAATTTTTGCG CTAGTTTTTTGCACGTGAAAGATTACGTAATCCAAAAACAAAATGTCAGA CTTTATTTGTTCTTTgattttgaagtcgttgcactgcagtgtaactttgt aacgtcagatatttttatgacgtattgttttgagaagttctcctctctcg catcagccaacaccagggtattctctggcgtcaataagcaacgtaaataa agcctggaatacacggggacgaggttgaaaAAGCCCTGAATACCAAACAA CTCAAATTTTATATCAACCAATGATTTTCTCTTCTTCTCTTTTAGCGAAA TGGTGCACAAGCATTGTAGATGCTGGTCCCTTCGTGAATGGAACTCACTA TTGTGTCCGATGTAATTATGTACTCAAAGCACGCAACCGTTTAAGATTCC GTTTCTCAGCTTATGGATGTGGGTGCGACGAATGGAAGCCCCTCCAAAGT GACGGTTGTTgtaaagaaatagaaaatgttAATAAAACGGCTCGTGCAAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000022_pilon:659073..666961+

>XLOC_044829 ID=XLOC_044829|Name=XLOC_044829|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1134bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:659073..666961+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGTTGTATTGGTTGATTTTTGGCAtcgtttcaattttttattgtgT
TGAAGGAAATCAAAGTGATAAAAATGGAGTTGTATTGGTTGATTTTTGGC
AtcgtttcaattttttattgtgTTGAAGGAAATCAAAGTGATAAAACGAA
ATGGTGCACAAGCATTGTAGATGCTGGTCCCTTCGTGAATGGAACTCACT
ATTGTGTCCGATGTAATTATGTACTCAAAGCACGCAACCGTTTAAGATTC
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GTGCCAAACGTCCTAAGTCTATAAACATTACTGGGCCAACCGTACCTGAA
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CAACTCGACCAGTTATGATAAACTTCCTCTATTAGGAGGTGGATTTTTAT
TACTTGTGGCTATCATCCTTGTTGGAAGGGTGTATATGTGCGTCCGCTCA
AATCGTCAACAAAGGAGGTCCACGTATGAATTCCATCGTGTTGTAGCCTT
AGATGTGAACTCTTTGCAAGATCACAGAGTCTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044829XLOC_044829-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000022_pilongenomesc0000022_pilon:659073..666961 +
Properties
Property NameValue
Aaloc76-567:7398
Aaloc1-72:1