|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000022_pilon:1240100..1245238+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044818 ID=XLOC_044818|Name=XLOC_044818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5139bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1240100..1245238+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AtggatttttacaagtttttgacATTCCTTATTTGCTTGAGTTCGGTTAC
GTTATGCTTTGGAGCCGGTAAGTaaggattttcttttatttgtaatCATA
CAAATTTAATACAAATTTCAGGGTATCTTTATTATCATAATGATGAATTT
TTGGCTGATATTACCAATAAGACGGGTGTCAAGCGGGTCTgaaatcgggg
ggggggggtactaagtTTGCAAATAgtccgagccaaagtttgaAAACTGA
CCCTTGGAgggattgaatttcggaaatttggccactttttgacgtttttg
ccaccTTCAGAGGGCCTAATTCCCAAAAGtttttcgagggtgtgaaaaaa
gGGATCCTTATgtctcgcacatacccggcacccatttgcCTAAGTGACCC
CCTCTCCTCTGTAAtacgtactcttaggttccaaataaacggccccccgc
ttgttaatttttcgaaaactttccaaccccccggaccttattaggacccc
cccgtttattaatctctaagaatattttcagctgtcaaagagaaggcccc
ttattttgctctaaatagcctgattttttatttttgggtttcagaagtac
aatttccaacccccacggcaattaggtccccccccgtttattaaaatcta
gaagattttccaaacccccccccccccgtttattcgaacccccccccttt
tatttggaacctaagagtagtctcctttaatttttgaatagttttttgga
aaattatgacactttgtgattttgggacccttttagAAAGCGAATTGCGA
TAATTACCCTTAGAGAAGGTTTTTGTGGTTCAAAAAAGGGCCCTTCATTG
CTGATAAATTTCAACCTTTCAAAAGCCTTGTCGGGCTTGTGtccttttta
ttttaaacaagcactgaagaaaattcttcttttaattcaatttcaaaaca
gaaaTCTCAATGTTAAAGAAATGACATCATTTAACGttatctcctaccat
ttgcttacacaacATTTTTAAACGAACGAAAAAACTTTTCCCCTTCGACG
CTGCGTtagcataaattttgaaaaatatattcacGTTTCTgtttgtcagc
atagaggcgcACCTCCTATATCttaaagaaataatatttttaagcAAATG
CGTTGAAAATGCACTTGGCCTCACTTTTAATTGATGACGACCTCcgcgca
aaatttcaaagctaTATAATTCACGCCAACAATCGAGGCAAAAACATACC
gttatcacagaaaaaaacaaacaattttccgaaaaattataaaagaatAA
TAACAGTATATGCTCTCTGACGTTCTGGTCTATTGGGGCGCCTATGGTAC
TTTAATAAAATATCTAGATTGCAGATTCATCATTTGAAAGCAAATTTGTT
GATAATTAAAGTTACAAGCATTTAATAAAGGTTTTAGGGAATAATCGCAT
TCAACTAATGTTTTTATCTATCTGCCTAATTATTAcagaaaagcttttaa
aatcGTTTAGAGGAAACTTCCTGTGCAATAGCTTTTAAAAATTGTGTACa
aaaaaaTCCTTGATAGTCAATGGCGAGAAAGCTTCTTAAAAGGGCCCCTT
AATCACAAATTTAtgttagaaaattttttgattaagaaaaagaaggtaaa
aaagtttaaatcttcttgattgaaatcgtatgaagaaaaaaaaattcatt
caacaaAAGTAAGGAACCATATACTGTTATCGTTCTCTTTCACTGTTTca
gaaaatgaagcaatttttaACGGAGTCCGATATTACTTCAGTCCAACGCC
TTTGTCTTGGCAAAACGCAGAAATTGATTGCATTAACCGCGGAGGTCATC
TTACAAGTGTGCActcaaaagctgaaaatgattTCTTGACAGACCAAAGT
ATATCAAGATTTGGAGGTGTAAGCCTTTGGTATGGTGGGATTAGAATTAA
CAATGTCTTTACTTGGTCCGATAGAACACCTTTTACGACAACATTCTGGG
CTTTAGGAGAACCTAATGGTCCACATGTTGAAAACTGTTTACATATGACA
GCTGACCATATTGGTCAGTGGAATGATCTTCGTTGTATTCCAGAGCTTAG
ATATGTTTGTAAATTAGGTGAAGGTGAGTGATGGGCTTTCATATTAACAT
ACAATCAACTCTcaatctaattcgaacctctattacaatttttttttata
agcaagtgtatgcctcttggtcaggctcgtgtatgcttaagttcttaaag
catccaggcatagcttatgcttattatatgcttatgaatcatgcttatga
ttcaccccgagcaaAGTTGTAGttaaatttgttcagatttcgggagcagt
ggaatgtagctagccgtggaatgtcttttttactTGACCGTAGAggtcaa
acctttttaaacagataaaaaatgacaaattgaaaaatatccCAGGCTGA
CATATTTGCTTATGTTATGcgtaggaattctgcaaatctgagccttcata
tgcttataagtgttatgcttataaaaaaacatttctttaatTCTAACTAC
CATAAATGGCGGCCCTCccataaataaagaaaatggaTAAAAGTTCATTT
ATGATCCCTCCTTTCTCAGATCACCGATTACTAGCCTGCGTTCGTTTGTT
ACTTGAAATCCCAAGTTCTAACATCAGAGTACAGGAAAATTAAGTATaac
tattttttaaaagaatcgtTTATCTCTAGGAATTCCAATTGATGTCGAAT
GTTCAGCCAGTAGTCTAAAAGCAATATTCAATATTACTGACCTTGATGCA
CAACTTCTGCCATATTCAATCAAATTCCTTGGAAACGACACGTGTGAATC
AATCACTGCCGCATCCACTAATCACATTAAAGATGGAAAAACTTGGATTG
CAACTAACTATACAGATTGTGGAACAAAAGCGTATCACCAGGGAAACCAA
ATCGCTTTCGAACAAACAATTCTCATAGAATATGGATCTCGATCACAACA
ATCACTTGTCTACAGATATTTTAACTCTTCGTACACAGTTAAATGTGTTT
TGGACCGTAGTATCACAACCAATCTAACAATTGATGTTATAGATCGCCAA
ACAGATCAACAAGGTAGGTTGATTGATGATCAACGAGGTAGGTTGATTGA
TGTAAATACTGATAGATAAAAAACTTGCCTCTTACATATCTCACATTATA
AGAAAACCATCAAAGCTGGATAGAGCTGTTGCAAATCTTGTCACATTTAC
TTATTTCAAGggaaaattgataaatattAATCATGATATGCCCAAAAATA
TGAtgtatattttccttttcttcttttccttcttttaGTTAATGGtgatt
caaaattcaaacttcAACTGAAGGCTATAGATGCTGGCACGAATAATGAA
ATTCAAGGTGTGgcaaaaattggagaaaaattaaaatttgaaatcaatct
aCAAGATCCGACAAATACTGTCAAAACTTCACCTCAAAACTGTTATGCTA
CAAGATATAATGGAACTGGACGGTACAACCTCATTGCAAATAGGTATACC
TaagtttttttcctttttccgcaaaaataaatccaaaagatTTTAATGAG
TTTTCAGGTAAGAAAATAGGAATACTTCCTCCCCATTGGGAGTAAGCCCT
AACCTAAGTCAGAGATCACTGCACATAAGCAATTTTTCAGACACACGAAA
ATAAATACTAATAAACCCCAGGTCTTTggcccgaaaattggagttgctta
tataAGAAAGGGCTAGTCtcttaaagaaaatttgaaaagtatttaaaaaa
aacttgtgaccgttttcttttaaaagatgtgCTGGACAAGACGACAATAC
AACTCAAATCACATCGGCGAATAACGCTATCCATACCTTCTCTTGGGAAT
TATTGGCGTTCAGATATTTCGGAAGTTCAGATGCAGTCATCATTGTTTGT
GAAGTTTTGATTTGCAAGAATGATCCTTTTGCAATTTTGAGTGAAGAATG
TAAAAGATGCGGACAGATACGGACAAGATACGGACAAGATAGACGACGAA
GAGATGAAGTTTATTCAAAAGAAAACACGATTCTTGAAAGATCGACCATT
CAAACAGCTCCAATTTACATTATCGAAAGAGAAGGTATACCACGTTCACC
AGCTATAAATAATAAAAGGCTTCTTCTAGGGTAGAAAAGGAACTTGCTAT
AACCATTCCGATTGGATACCttaagagaactaattttggtgataACTAAC
TAATAACAGCATcagaattcttgaaaaaaattatttggcaaGGAACTGTT
TTTCGAAGAATTTGTAGACTGgaagtcgtttataatgcgtgtaatactaa
taataccaatactaataataataataacacgggatttagtttgtataaac
gactggaagaatccggtgttccagccttatagatacaggggctagctacg
cagaaacttgcgtagcgagaaaacaatttatcaagcaataacaaactctc
aaaacaaaatcaactcaaatgaaaaactttcaatacacaaatccacacat
attttttttctcaagaattattttgagcaggaaaaaattataattgcaat
attgacacttttcttttgtttggtgttagtgcacaaaggtttctagacga
ctaaaatttctccctttattactttttgctttatttctactatgtatgaa
ttagtcgtctagcttgctagactaaagaATTTGCCAAATTCAACTAAAAT
AGTCTTCGCCAAAATCGTAACAAAAGCTCATTTTAAATGCCTTGAACATT
GAATATCTTTTGATCAAATGAGGAATTAATTGTTATATAATTATAAAATC
CGCCAATGAAGTCTATTCTCTATAAGGATCGGGGTTGAGAGGTCCGGTac
gaaatacaataaaaaaatcataatttttttatcctCATCATTTTTCAGAA
GCACCGGCCGTTGTAGTGAAGAGTGACAACTTTTTGGCAGAGCCAGCAGG
AATATCAATCATTGTGATCCTTGCATTGTTTATGTTGGTCATTTGTTCTG
TTCTTCTTAAAAGAACATTTTGTGCCGCTGCAATTGCATCCGATAAAAAG
AATGTTGAAAGCGGATTCGATAATCCAGCCATGCAgtga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000022_pilon:1240100..1245238+ >XLOC_044818 ID=XLOC_044818|Name=XLOC_044818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3054bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1240100..1245238+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AtggatttttacaagtttttgacATTCCTTATTTGCTTGAGTTCGGTTAC
GTTATGCTTTGGAGCCGAtggatttttacaagtttttgacATTCCTTATT
TGCTTGAGTTCGGTTACGTTATGCTTTGGAGCCGaaaatgaagcaatttt
taACGGAGTCCGATATTACTTCAGTCCAACGCCTTTGTCTTGGCAAAACG
CAGAAATTGATTGCATTAACCGCGGAGGTCATCTTACAAGTGTGCActca
aaagctgaaaatgattTCTTGACAGACCAAAGTATATCAAGATTTGGAGG
TGTAAGCCTTTGGTATGGTGGGATTAGAATTAACAATGTCTTTACTTGGT
CCGATAGAACACCTTTTACGACAACATTCTGGGCTTTAGGAGAACCTAAT
GGTCCACATGTTGAAAACTGTTTACATATGACAGCTGACCATATTGGTCA
GTGGAATGATCTTCGTTGTATTCCAGAGCTTAGATATGTTTGTAAATTAG
GTGAAGaaaatgaagcaatttttaACGGAGTCCGATATTACTTCAGTCCA
ACGCCTTTGTCTTGGCAAAACGCAGAAATTGATTGCATTAACCGCGGAGG
TCATCTTACAAGTGTGCActcaaaagctgaaaatgattTCTTGACAGACC
AAAGTATATCAAGATTTGGAGGTGTAAGCCTTTGGTATGGTGGGATTAGA
ATTAACAATGTCTTTACTTGGTCCGATAGAACACCTTTTACGACAACATT
CTGGGCTTTAGGAGAACCTAATGGTCCACATGTTGAAAACTGTTTACATA
TGACAGCTGACCATATTGGTCAGTGGAATGATCTTCGTTGTATTCCAGAG
CTTAGATATGTTTGTAAATTAGGTGAAGGAATTCCAATTGATGTCGAATG
TTCAGCCAGTAGTCTAAAAGCAATATTCAATATTACTGACCTTGATGCAC
AACTTCTGCCATATTCAATCAAATTCCTTGGAAACGACACGTGTGAATCA
ATCACTGCCGCATCCACTAATCACATTAAAGATGGAAAAACTTGGATTGC
AACTAACTATACAGATTGTGGAACAAAAGCGTATCACCAGGGAAACCAAA
TCGCTTTCGAACAAACAATTCTCATAGAATATGGATCTCGATCACAACAA
TCACTTGTCTACAGATATTTTAACTCTTCGTACACAGTTAAATGTGTTTT
GGACCGTAGTATCACAACCAATCTAACAATTGATGTTATAGATCGCCAAA
CAGATCAACAAGGAATTCCAATTGATGTCGAATGTTCAGCCAGTAGTCTA
AAAGCAATATTCAATATTACTGACCTTGATGCACAACTTCTGCCATATTC
AATCAAATTCCTTGGAAACGACACGTGTGAATCAATCACTGCCGCATCCA
CTAATCACATTAAAGATGGAAAAACTTGGATTGCAACTAACTATACAGAT
TGTGGAACAAAAGCGTATCACCAGGGAAACCAAATCGCTTTCGAACAAAC
AATTCTCATAGAATATGGATCTCGATCACAACAATCACTTGTCTACAGAT
ATTTTAACTCTTCGTACACAGTTAAATGTGTTTTGGACCGTAGTATCACA
ACCAATCTAACAATTGATGTTATAGATCGCCAAACAGATCAACAAGTTAA
TGGtgattcaaaattcaaacttcAACTGAAGGCTATAGATGCTGGCACGA
ATAATGAAATTCAAGGTGTGgcaaaaattggagaaaaattaaaatttgaa
atcaatctaCAAGATCCGACAAATACTGTCAAAACTTCACCTCAAAACTG
TTATGCTACAAGATATAATGGAACTGGACGGTACAACCTCATTGCAAATA
GTTAATGGtgattcaaaattcaaacttcAACTGAAGGCTATAGATGCTGG
CACGAATAATGAAATTCAAGGTGTGgcaaaaattggagaaaaattaaaat
ttgaaatcaatctaCAAGATCCGACAAATACTGTCAAAACTTCACCTCAA
AACTGTTATGCTACAAGATATAATGGAACTGGACGGTACAACCTCATTGC
AAATAGatgtgCTGGACAAGACGACAATACAACTCAAATCACATCGGCGA
ATAACGCTATCCATACCTTCTCTTGGGAATTATTGGCGTTCAGATATTTC
GGAAGTTCAGATGCAGTCATCATTGTTTGTGAAGTTTTGATTTGCAAGAA
TGATCCTTTTGCAATTTTGAGTGAAGAATGTAAAAGATGCGGACAGATAC
GGACAAGATACGGACAAGATAGACGACGAAGAGATGAAGTTTATTCAAAA
GAAAACACGATTCTTGAAAGATCGACCATTCAAACAGCTCCAATTTACAT
TATCGAAAGAGAAGatgtgCTGGACAAGACGACAATACAACTCAAATCAC
ATCGGCGAATAACGCTATCCATACCTTCTCTTGGGAATTATTGGCGTTCA
GATATTTCGGAAGTTCAGATGCAGTCATCATTGTTTGTGAAGTTTTGATT
TGCAAGAATGATCCTTTTGCAATTTTGAGTGAAGAATGTAAAAGATGCGG
ACAGATACGGACAAGATACGGACAAGATAGACGACGAAGAGATGAAGTTT
ATTCAAAAGAAAACACGATTCTTGAAAGATCGACCATTCAAACAGCTCCA
ATTTACATTATCGAAAGAGAAGAAGCACCGGCCGTTGTAGTGAAGAGTGA
CAACTTTTTGGCAGAGCCAGCAGGAATATCAATCATTGTGATCCTTGCAT
TGTTTATGTTGGTCATTTGTTCTGTTCTTCTTAAAAGAACATTTTGTGCC
GCTGCAATTGCATCCGATAAAAAGAATGTTGAAAGCGGATTCGATAATCC
AGCCATGCAgtgaAAGCACCGGCCGTTGTAGTGAAGAGTGACAACTTTTT
GGCAGAGCCAGCAGGAATATCAATCATTGTGATCCTTGCATTGTTTATGT
TGGTCATTTGTTCTGTTCTTCTTAAAAGAACATTTTGTGCCGCTGCAATT
GCATCCGATAAAAAGAATGTTGAAAGCGGATTCGATAATCCAGCCATGCA
gtga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000022_pilon | genome | sc0000022_pilon:1240100..1245238 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1339-1527:4951 |
| Aaloc | 1030-1335:3828 |
| Aaloc | 826-1026:3341 |
| Aaloc | 442-822:2732 |
| Aaloc | 70-438:1754 |
| Aaloc | 1-66:1 |
|
