XLOC_044809 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044809
Unique NameXLOC_044809
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1025263..1042497+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044809 ID=XLOC_044809|Name=XLOC_044809|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17235bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1025263..1042497+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgCTGCAGTATATTTTTGGCCCAAGGCTTTATCGTATTTTTTCTTTAGT AGAATCTACAGGGCAAAGAAAATTGGTAAGAttcctttctttttgtttag aataaaatttggatattttttcattatttacttacttgtgttacttgtgt TTGTAGTTGTTTGAGCATCCTGCTTCAGGTAAGGTTCTTGGTGAACCACG CCTCTGTGTGATCAATCTGTcgagagaaaaagaatctcagcagatatttt tcatgtcaattattgaatttgaattagctCTCGACTGCACCCAGTATATC CATGGATCTGGGGTTCATCTGGGATAGACTTAAGGTGTGTGTCCAGGgct cttttgaatttatcgatagaaatgtttttgaggtttctgatgctctttgg catagcattaaaaagttttgcaccttgcactgcaagtgtgctgtctctaa attttgatgtttggttctttGGAAATTGACAGTGTACACATCCGGCCCAG CCGGgggttttcagtggttttgataccatttaCAGTAGGTACAATCTTTT CCATCACCTTCCAGACGTACATTATTCTGTAGCGTTCTCTTCGCCTTTAA AGTGagtaaatttttgtctgttttagacACGTTCCCAATAATTGTTTGGG GTGCCATTTATCTTTCGTAAGAAggacttttgaatatcttcaagtCTCTG AATGAGACCAACTGCATTTGGGCTCCACAAAACGGAGCAATATTCTAATA TTGGTATCACCAATGATTTATATAGTATGATCATACAATTTAAAGATCGT GAAGAAAAAGTTCTCAGGATCCAAGATGTTAAGTTTTTAGCCTTTTCGAT TACTGCAGTAATTTGCTTCTGAAATGTGCAATTACTGTCCATCAGTATTC CAAGGTCTTTCACaacatctttgttttcaatctcaACACCAGACGGTGAT GTATAGCTTGTTTGAGTCTTGATCTCATGGTTCTTTCCATAGCGCAagag ttcaaattttatatcattcAGCTTCATATTTTTGTCATCCGTCCATTTAT ATATTCTATCAAGATCATTTTGAAGTAGGACAGCATCTTCTAGAGTTTTG ACTTCCTTTGTGGCGCGAGTGTCATCAGCGAAGGATTTGAGAAAGCTGTG CACCACTTCCTTGTCAATATCCCCAATCAATATGAGGAAAATCAAAGGTC CCAAAACACTaccttgagggactcctgaaatgACATGTTGTGATTCAGAA GTGACACCATTCACTAGCACTGATTGTTTTCTCTCTGTTAAGAAGGACTT TAGCCACTGTAATAATTTTCCATCTATtcctagtttctttatttttcgta ggACAATTGAATGGTCTactttgtcaaaagcctttgaaaaatctaggtac ACATCATCCGCATTAGCATCTTCGTCCAATATATTTAGTATCAGGTCATA TTGTTCCAAAAGCTGACTCAAACATGAACGCCCGCTTCTGAATCCATGTT GATTGGGATTGAACAGATTATTTTCATCCATGTGCTTTACAATATGTGCT CtgagtactttttcaaatatcttgatgACATGGGATGTTAGGGCTACTGG TCTATAATTTGATGCCAGTGATCTGCTACCTCCTTTGTAGATTGGTGTGA TTGTGCACCTTTTAAGTTCGTCTGGGACAATCCCTTTGTCCAAACTTTGT CTCCAGAGGATACAAAGAGGAATAGAAAGTTCTTCTTTGCATTGTTTGAG AAAGGTTGCAGGGAAACCATCGGGACCTGGTGCTGCAGTTTGGGACAGAT CGTTGATTGCTTTTATTAAATTATCTTCTGTAACTTGTAGATCTGAAATG ATATCTACGTTGACTTGATCATTTTCACTCTGCATTATATCGAATGGTTT TGGTGCACTGAAGACGGAAACATATTGTCTTGACAGaatttcagccattt ctttgcttCGTTGCGTCAATTCACCATTTGTGTTCAGCAGAgggccaatt ttcgtttttatctttgctttctttctcgcataagcaaagaaatattttga gtttttctttatggAATGGATTGCTATATTTTCTTCATAACACTTGGAAT CCCTAAATGATTTTTGTAAGTCCTTTTCAATTGTCAAAAGTTCCTTTGTT ATTTTAGTCTTCTTTGATTGggacgtgcattttaaaaattgctttgtaat tgttcttcttcttttcgtaAGAGAGCGGCAATAtctttcaacttttgatt tcttcctGGTATCTTTGGTTGTTCTGAATGGTATTCGTCCTCTGCATACG TCCAAACATATTTGATTGAtactttcaagaatttcttgtgGATCATCACT GTTAAGTTTTACATCCCAGTCAATTTGATTCAAATCTTCTTTTATCTTAT TCCAATCAATTTCATctgagaagaaattcaaagcgTTGAATTTGGAACGT GGTTCTGGTTTATCATCATTACTagcaaaaatttgaactttactAGGCTT GATACCATAACAATACTCaggctttgtcatttgaaaattccaggcgtgtg gtcaatcgcactcctaaaaagtactttaggtgtgtgataaggagtgctat aTATAACTTTAAGtagtaaaatccaaatttatggCGTGTGATTTTTAATC ACTCTCCTCAAAGATTTTAGGTGTGCGAGTGCTATCACACGCCTCAAACG ATGCAGCCTGAATACTGTGATGTGAAGTGCTTTGTAACACTGGTAAAATT GAGTAGTCATGTATAAGATCTTCATTATTTGTGAAGACAAGGTCTAGTGT GTTCCCATCTTTGTGTGTGGGTTGATTGACATATTGGGACACGAACAACT CGTTGCAAAATCGATTTAGATCGTTCAGCATTGATCTTTCTTCCATAGAG CATCCAGTTTTGGGTAGTCCATCAGGCCATGTTGACTTTGGAAGATTGAA ATCGCCACCAAAAATTATGTTTGTGACGGGTTCCAAGGCGGAAAGGGCTT GTTTCGCACCTTTGAGCAGTGTAAGAAGGTCCTTAGCTGTTGATGGATTT CCATTACTCTTGTCGTCAGGCTGTCTATATATTACAAGCATAGCCAAGTT TTCAGTCTTTGAGTAAACACAAAGGAGTTGTACACTTGGTGATTTATGGG AGTAGATTATTTCACATGAAGCAGCTATATCATCTCTTATGTAGAAGCAG ACTCCTCCAGTTGCTCtccctcttgattttttcttgcgtgatgaaTCACA TTTGAACAAAGTATAACCTTCTACTTTTAGTTCTGCATCTTTATGGTTGT TCGTCCTGATCAATTTCCTTCTGAGCAGGTTTTTTATCAGCCAGAGACCA TGGTTGTTTAAAGTCCCCTGGCCTGCCCAGTTGGCGTCCGGTCTAGTTGG TGACCCAACCTCTTACGCAGAAAAGTCATTCATAAACAAACCTCTGGGGA ATATGTTTTGGTAGTTATCTCTGCCTCGACCTATTCCCCATGCATACtat gttaaaaaaaatctagaaaagaacgagtagaatccgaaagatccaaccTT GCACAGGAGTACacgaaaaaaacgttgttttttttttaataaaaaatgac tacctgtggacaaaaaagttttgtaagaaaaaacgcttactgccactcaa aaaaaTACACACCCAAAACGATGATGAGTATGTTAGAGAAgacatttcta taaaaatcagCTCTATAAAGTTTCCTcgtttgaaatattgataaaaaagt agaTGCAATCAGTTTGTTTTTATCGTCCTGATCAATTCTTATAACTTAGT CTACAAGTAGAGCACTTGTTTGTTTTCAAGGGATTAGTTAAACGTATGCC TTAAAAAATGTAGgcatttgaaaaagttgaagaaattttgtttgttattt ttaaaaattgagcaCCACTTTGATGCAAATGACTCATCATCATTTATTTG ACTTGTAAgataagaaagaaattttctgaaaaacttttaaagggattTAT GAAAGAATGACCCAACTCTTTATGGCggccatcaaaaaattgttctattc acgtcacccgcccgcatcatattttccgctgattttccagtgcggagatg cggaaaaataTCCgcgaaaagcaatttgttcttttaaagtactATAGCTT TTTTCTTAATCGCTCTGACGCcaatgaaaaattgttttgttcatGTCACC ACCCGCCGCCCCCGGacttactggcgtgattaaaaaaatctgggaatttt ttcgtccgcccgcatgcatttttaacacccgttgcgacacGAACAGGGCA TTTTTTCAATGGTCGCCTATTGATcaaatttatattaaaaaaagtcatag atgaaaaaatttaaaacgatGCTATATAACCAACTGCAGGTTCTTTTCAC CTTTGTTCATGTCCACAAACCATATTGTCAAGTCTTGTTtgccaatatat tgtgtagtctgtCTTTCTGTTTCTAGGTCAAAAATTATGAAGTCAACAGA CTGGAATGGCTTAGTGAATCATTTCTCCACACAGTAAGGCTTTATTTTGT ATAAGGGGTTCAAATTATTTCACAAACACTTGTTGGATATATACATTATG TAAGGGAAGGAACTTAAATGAGAACATTTTTCACACCtttttttGTCATC TGTTAAAAATAATGTTAATTAGCTTTGAGTCTTTGTTTtgtgaaaatcat caaaaaagtacttttttttaaactttccagTCTTGCTAGAATTTTGCCTG AAGGAGCGCTAGGGTTTTCTAGatgtttgattgattgatattgattttaa ttttcaggtATCTTATGCTTTATCCATAACCTACTATTGTTCACCATTCT TTGTTTATTATGGTTACACAAGAGGtgattatttaatttttttataaact ataTATAATATACCTAAGAAAAAACTGTCTGAGTTTACTTGGTTGCAACG CCTTTAAAAGAATGTTAACATTTGTAAGTTTATCGCCATATTGATTCAAG ACATCATCACCATCACAGCCTTAAGTTCTTAATCTAGGGCAAACTTCAGT GTCCAAATTTTATTGTCTCATGGAGTAATCAATCTAGCCTGAATCCAAAC ATAATCGAGTGATGAACTAAGGCAGTTTAAGGCTCAATATTACCTTGAGA CTTGCttagtatgaagattttaagttcCATTCATcacagccttaagtcca ttaaGTGCCATTTTAGAACCTCTGGAGCAAGCTATGAAAATGTCTTTTCA AGGTTAACTCATCACATGCCCTCACCCAAGTTACTTACCACTTAGATCAC TTTCTCTAATAAGCTACTCATCTGCTGAATTAGCAGTGGCCAGGGATTGA ATCCTGGGATTGCTAGGTGAATGCTCTACTGACTGAGCTAGCTGACCAGC ATTACCTCTGCAAATCTTCTAATAAAGTAACTacacaaaattaaatattt attGTAATTATAGTCTCAGATTTAGTCTGTGCCACATTTAGTTTTATGGC GTAAGATGCTAGGCAATTCGATTcagtgcagtatgcagtgctggaTTAGT CCCAACAAGGACGAAATGCATTTGCTGCTCTGCCACCAATCTCCTGAAAC AAAATAGTTAGACAAAGTTCTAAGAATTTCTTTGCATATTTCTTTGAATA TATTCATTATTATATCCAAccagttttgaaatttaatgacAATTAAGCAA GAGGAAAATTAGAATCACTTTTTGTTAATCGTTACATttccactttttca aaattttaatatgtCATGATACTGTacatgaattttattaaatatgtatt tctatttttgatttaGAAATATTCAGTTCACCAGATCGCCTCATCTACTA TTTGAAGTTTTCTTTATCAATATGCATTGGGATGACAGCTTCCTACTTAT TGAGAGGTATGTTATAATATGTGGTCATAAATAAATCTGGTAGTTATTGA TTAGTTGATATGTCTTTGATTAAAAGGAAATAGTCTGTTCAAGAAGAATG TAAGAGAAATACTATCTGAGGCATCCTTTTGCACAAAGAGCTACAAGACC GTTCAAAAAGTATGTATGCCCTGAGAGGGGAAGGAGTGCCGTTAAAAGCC TACAAGGGGAGGAGAGTCATCGAAAATGTAAACCATGCCTTAGAATCTTG GGTTCAAACAAATTAACTCATACTCCAAGATGTTAGCTTTTAATTTCGCT ATACACAAAAAGAAAAGGAATGAGCAGTTACATAAtcaatatttgaaagt ttcttctTTCTCCATTCTGTTCATAAACTAAGAAGGAACTTTCGAGATAT TAGTTGAAAGAAATCAGCTTTTGTGCATCATGTTTGAAACTCTGTGGAGT CTGAATTGTATGTAGATTGTCCAATGTTTTATATTGTATTTTAATTATAA TAAATTTATACAGGTCTTGGTCGAAGCATTAACACAGAATACCAAAAATT CATTGAAGTTTTGAATACTGCCAAAAAAGATAAGTTACAAATGGTGAGAC AACTCGTTATTACTCATAAGTGTATCTCCTTTATAAATTGTTTCATTGGG CGCTATTCGAAAGAATCTGTTCATTGGgggtatattatttttttcaataa tttattcctagacatttcaaaatgatccCCTGGACACTACTGGACACTAG ATCTGGAAATTACTCCCGAACTTAGCAAATATACCCCATGGCAGTTTTTT CACAATCTTTCCAATACCCCTGGATAATATATCCTACACCCCTTATGAAC ATtatattttctggaaaagttcATTTTAGACGGAGGTCTAGGGCTATTCt ttgataatttatttttgacccTGTATTAGGCTTATAAAAAGTAGATTGaa cgattttttgaaaaacaaatttaaaaaccaaaatattaattttctttgTA GGAATCACTCAGAAATTATGATTTTGACTTCAAAGCATGGCCAGTTAATT TCAGATGGGATGAGTCTTCCATTAAAAGTGAAGTCACCAATCCCTCACCC ATTTCTGATCACGAAGACAGCAAATCGGTTATTGGGAAAATATTCAGCAT CCCATCAAAAATATTAGAGTAGGTATTTATTTTATAATCGAGTCTCTTTA AATCACAACTCCTTTAGTCCTTCAGAGATTTTAGTCTTTTACTTGAACTC TCCATGAATGATTTCTTTAATATTTAGTTACGGAGACTTGACTATAGTTT CAAGAAAACGTTGTTTTTTAATGCCTTTTGTGGTcaggcgaaaaaaaaat ttgtgtttctgggtgaaggaaaaaaggactttaaagataacttttatgta caaacagtatgaagtaagccctgaatactaatgtatgaACTACTGACGAA GTCTGCGGACAGGAGAACAGAAGAAATGACGCCATTCCAAAAATAGACGT ATGCTTTTGCTAAGCCCTCCTCTcccccccccTTTACTTCATACGTACTG GCGCTTCATGTTTTAATCTGATTATCTACTACTATTCTTCAGTTATTGTC TCGGTCATGGCATTGCACGTCCAATGGCATTTCCTGGATCCGTCAAACTT CTTCAGATGGCTATGGGTAATGACTCTTTTTGAAATCATATTTAAATAAC TAGGTTAAAAAATGGTATAAAATCATGCTCTTAGGAAAACTTCTTGTCAC ACAAGGGGGGTACAGCTGCAGGGTGTCTAATTCTGAATcacaaaaaagtt agtacagttaCTACATTTGAGGTGAGGGTGGGAATATCACTCATTCCAAG GTACTGAATTTTAGTATTTAGTTGGGAAAATGGGTAGAAATttgtgggtt taccaactgacggtcaTGGCCTTTTGGAATTGCACCCTTATaatgcagca aaaatcagtaaaTTTCATACCTTTACAGTGcgtttttctcaaattgtcaa ctcttttagagcaaaataatcTAAATCTTCAGGCAAAAATTTAGATTAGC TGGAATTTCCAACCTTACAGTCCATTTCTGCTttcttgaaaaacataccc ttaaccgccgctcATACCTGTCGGTCAATAtgtctgacccccccccccca ggcctGTGGCTGAACCTCCTCCTGGTTGTTATTATCATTTATAATTCTAT TGGTCGAGAGTCGATGAGACTTTTTATTATATTCTTTTTGCATAGTTTGG AAGGGGATCACTGCCCTCCTAGTCTAGAGCAACCCCCTTACTCTAGGTTC TACCCCCTATCAGAATTTGATGGAACCCTACTCAAAATCGGGGGTGCCAT CGGGAtttttttCCCAAGACATTATGCACCACTCATATTCACTCTTaaaa aaaGGGTGCGAACTACCTATGTTTTAGGCCACTTTATGGCTGATGAAACA CTAATCTTTATACATATTATCACCTTGTTGATGAATCaaaaaaaGTAGAA TCAACTGTTTTGTACGTTCTCTTTTAGAACTTCATCAGGTAAGTTgtctt ttattgaaaaaaaaattaacattgcttCGGTCGAGTTCATTTGATTGTCT TGCTATTAACTTATTatcttttaatgattttatttttcagcgcAATTGGC TGATCAGGGAAGGACAAGCTTATTAGAAAAGGTATAACATTATAATTAAA CTGTTGGCTAGAAAAAATGTACGGAAAATTAGTGTCGTAGCATGAGTTAT CAAACCAggcgaccgtagcatgaaggtagagcatctaGCTACGGTGCGCA CGGTTGTGAGTttgatccccagccgggtcatactaaagattcccaaaatg gtacttgatgcctctctgcttgatgttcagcaactaaagagatggatcaa gggtaagtggagaaatttagggaaaggagtggcgccctctaACTTCGGTT AGACAGCTATCAAAAAGAGgtgccttcgggtcgccctcgactgtgCTCGT AAATTTACATACTTACCAAACCATTGATAATTTCTTTCCTGCATTATAGA AAGGGTTGCGAGCAAAGCTACTTTGTGAAAATGGAAATGAAATCGATTCA ATGTTTGTCGATCGTAGAAGTGATGAAACAGGCGAAGGACAAACTTTGGT TCGTTTTTCTGtcattaattttgtttttccatGTTGGATTCTAATGCAGG AATTGCAAGACATATCTACTGTAATACTTGAAATAGGAATCTTTTTGGTC TATTCTAATCACTGATTTCTAACTTACTTGACTGGATCGGATTACCCATA TATAGGAAGCATGTCCAGATTTAGAGCTTACTAGTCCCCCATCTTGTTGT CAATTCTCGTCGCCAACAGCAcgatttgaatgttttgaaattcgaacgtt cgaaaatctaagaTAGATTGGCATTggaacttgttcttaacattttggcc ttagccctatgttcttatatagtttgttcttataaaaaaacgtgtatttg tgATTCCAATATTCagctttcaaatttcaaaagattgcTCTTCATATTCT TTGTTAGGTCGTCACTTGTGAAGGAAATGCAGCTTTTTATGAAGTTGGGA TTATGGACACTGCAAGAAAAGGTAGATGTTTTTTATTGTAAGTAAACTAA GTCTGCGACCGCGGTCGGAGGCGACCCAAGCATCAAGCAtcaggcatcaa gtaccattttcggaatctttggtatgacccggatGGGGTTTGAACCCAAA atcttgcgaaccgtagccggatgctctaccactgcactaccgTCGCTTTT TATTGTAAGGTAACAAAATGATACTCTTCCATCAACGACCATCTCCTTGC CAACTGTTAACGATTTTAAAGTGAGAACTTTTGCTTGCCACACTCGATAG CAAtgaaaaaaatgcttaaaagACAAGGATTGTAGAAAGAAAATCATCAT TACCCTGTTGATAGTGGTAAATGGGCtataacaaaatttaaaacgtTAAA TGTAAAATTCATGACTTTAGGACTGACATTAAGTCTCAGAACTTACATCT GAAACTAGATTATATGTAATGTTGGATAgcacaaaatctcaaaaacatat TCACGAAGCTAAGTCCTAGTGGCTTAGGGTCTTGAAATTTCACAGATAAG CTAAACTGCAAAACTTTCTccatttaaataaataaaatgtatgcaatttc ttttatttgtctTTATAGCCGGTTATTCAGTCCTTGGTTGGAATCATCCA GGATTCTTTGGAAGTACTGTAAGTGTTGtttttttACCGTAGCTttctat attttatttattcgcGAATGAGCTTTTAAGAAATCAGCTGAAACGGCCAA TTTCCGACAAATAGTGTTTACGAATAGTTTTTgcgcaaaaaaacattttg aaaatatagatTTGAATAggaaaaaatggcgaaaatgaATCAGAATTAAT ATATAAAAGTAtctaacaaaaattcaaaactttataatcATCAAGCTTAC ATATACAATGTTCTAacttgttgaaaaaaattcattttgaaagtCGTAGG GTCGTAAAAAGTCGTAAAGTTATAATCAAAAGTTGAAACAAAAGTAACAG AAAATACTACTCTCAAGGATCtgttggggacacgagaagtttctTCGCGT TGgtacaatgcaacatgctccatcccaccaacatgACGCGCTTTCTTGTG TCTCCACGCCTTTTTCTTTCTacaaataaaagtgaaatcagcgtgtcttt tgggtattttcctcactttttgtcccatgaaacaaaaaaaagaaaccatg ggacacccACTTATTCGCCGACATTTGGCAACAATTTCCTAGGGTTTATT TAGCAATTCGAACTTATTTTCGTACTTTAGAATTTCCatgtaaaaacaat ttttagctATGTGTTCATGGCTGGGTGTTGAAACACATTTtcgtttttgt gaaatttgtgatTCTTTGTATCTGAGATTACAGTGAACTTTTTTCCCAGG GCAAGCCGTTTCCTGACCAAGAGAGGGAAGCCATTGACGTAGTCATGAAG TATGCTGTCACAAAGCTCGGTTTCGAAGTTGACAATATCATTTTGTTTGC ATGGTCTATTGGAGGTTATACTGCATCTTATGGCGCCATGATGTATCCCG ATGTAAAAGCTGTGGTAAGTGATGGCCAGCGTGGTCAAAGGCATAAGCGT TTCAAGCCAGAGGTttgcggttcgaatccccgctccctTCAATGTTCCAT TCAGTTCAttgatagccgagccggctggccgtggacccagTGAAAATAAT CGAAGGACTGCCTAAacgtcctagattactgggcgggctatccacgttaa atatcgactctatctatctttCTATCTAAGTTTCACTGTCGAGTATAAAC TACGCGTTATTGGCTAGCTAAATTGAACTCATAATGAGTTTCACTATTCA TtgttttccaagaaaaaaagtgctAGACCGAAATTGTACCAGTTAACAAC ATCTAAACAGGCTATTTTCTGACTTCTTAATCTTTCAGGTTCTTGATGCT ACTTTTGATGGTATCATTCAACTTGGTGCAGCAAGAATGCCTTCCTTTGC AGGTAAAAGCTTCCGACTGACTTAcattaccttattggtattatatttcc CGCGTTACAAAATTTTGCGGGTACTTATTTTCGCGACTTTTTAGgccaaa tttcgcgaaatttaataccgtttaaatttttcaaaaatacaaaatcgcaa aattaaatacacgcaaaaaattttcaaagtaggtcgaaaatcggaaatAC TTATTTGACACTTAGttactatttttgtcactaaatttgttattattttt ggtatgtttatgctcaatacgttgtgtttcaagcgaaatcagtcattttc tttctttattcccactttttgaaaatgtccaaTTTTAGTGAATctcgaaa tttaatacacgcgaaaatttccaGAAACTGGCAATCGTGAAATTTAGTAC ACGCGAAAATCgtttcctcaaaaaaatttcgcaattcgcgaaattttata ACACGCGAAATATAAGAAGAAATCCAAAGAAATCCAATCACGATTTGTAG CaagattaaaagaaaatctgtcCAAGGGTTGATTTTTATTTCTCTAAGGA CACAGAACCCTGACTAATtatattgtttatattttttcagtGAATACCGT CAAAAGAGTAATTCGCAAATATATGTTTCTGGATGTCACCCGTCAAATTG TCAAGTGAGTCTCTACAATTCCCCTAGCCACTTTGTTGTATATTCCCGGG GGTGGGGCAAGATAAAAAAcataccgtacgtgcggccctaaAGGGTCCTT TTTCCATGTTTTCCAAAGTGCagtgtaagggtcgaaatgagcaaagatga gaaaaagtgcactctaTCTAAGGGTGTGAAATTTCGAAAGtctgaccata ttttgtctaaagatgaaaaaaaaatgcaccgtaagggtcaattttttgcc caaatttactcaaattttggctaaattttctctacactgtaagggtctga tttgaaaggcctaattttggggtGCACGTATAGTCGAGTGCCCCGTTTGT TTATTACACTGAAGGTTCAATCTTGATATTTTGCACAAGAAACCTTCTTC ATTTGAGATTTCATCGTTTTATCATCATTCGGGTTTATACTGTCTGAAAT ATAAAGTGAGATTCTGTATTCGAGATACATCGATAAAGACGGTATAAAac aaagttgacatgtcgccAAAACGGTCTTCCACTTTGCTCGAGGaaggtaa aaacaccaaaataccgtcgtctgtttaggcgTGCAAAGGCGATGTAGAGC CGTatatcaactatcgactttgttttgcttATTTCGACTTCACTTACAAT ccccctcgatatcctccgatacataaactcgttaaactttcattttgaag cacttcaatttttcctcttctttctttcttaagATATTCAGGTCCTGTTC AATTGATCAGAAGACAACGTGAAGAAATTATCACTACTAGGTAAACTCGT ATCTTCGCTTCGTGATTGGTTGATCATCTTTTCAGATCAGAGTCTTTTTC TGTTGAATGGTTTGTGCTGTTCCAAAAAATGttcatacaggggggtggag gaaccttttcaagtcaaaacaaatttcttcgAAATGTGttgataccccct ggaaataagcaaaatttgcaaaaaagaccctggaaaaaattatttcttat cTCTTAAAGAAAGGGTGGACGATACAGTAGATACAGTTGACGCTAGctct aatttgattttctacATGGTGTTTTTGTTTCATCGAATGTGCTATTAttt ttttAGACCACAAGTACCCATTACCAATCGTGGGAATTATCTCCTTTGGA AAATGCTCTTATACAGGTTcgctttatatttttttgtgtttctgATCATA AATTATTGATGTACCCTATAACGTATAACAATAAAGTCACCAAATTAGTC TATTGTTATCATTGTGATTCGATTGACAGGTTAAACCATTAgcttcgata ttttttatatcaGTTCCTCTATACTCTTTGGACCTACTTGGAGGTTCCAC AAACTAACTTGtgctcgttcgttcgttaccagcttttctcgggatagAAT ATTATCAGATTTTTGGTACAAATATACAAAATGGTAATATACCCAAAAAG TGACCTAGCTCGATCTTCGAAAAACAAATACTGATTGAGTGCTAGATTCG GAAATATCCCATAAAATAAGTGGTTTGTTGGGAGTTCCTCATGGTTTTCC CATtaatttttactgattttttgttcattgggcttttccagaaaaaaaaa tggagggtggaggatataacattttttggaaacttACCCTCCTCCCCGGA CATGGTGACTTTTGACCACCGGACAGCAGTTATAACCCCCGGACAatcat cagttgaccccctggacattcaaaatttcccccactggacaaggcaaatt tgtagatttttcactacccccggacatgATGTTTTCTGTTGATCAGCTAG GTGTAGGTCCATAAAATTTGTATTACCTTGTTTTTTGTAGATATCCCAAT ATCATTTCTGAAAAGAGCACAGAAGCTCTATGGCAATATTTGGCAGCATA TGATTCGACTGGCCAAGGTTTTTACTTTTCATTGTTTGGGAATTATCCCT CTGTATATTGCGTCAACCTTTTGACATATGCAGTGAAGCTTTCTTTGCCC TTTAatgggataatcagatggtctgagtaTTTTTACGATTGAAAAACCTT GaatatcgttttttttttgccttacTGTTTTGCTTTTGAAATGATGAGGG TATCGTTGACACCATCAAACGGccaaaatattagaaaatcttattatttt taaaatctctGATCTGATTGCGCAAAGTTAGTTTCTAGATGATTTTTAGG TGACGCGATAATCATGTAAGAAAAATGACTTCTTTTTCTACTTGTTTACT TTTTGCTTAGCTGCTCAGTCCTGGACAGGCCCCTTGCTCCTcgtgacgtc aatttttcaaGTAGGGCTGATCCATTGCAATGTTTTGTACTTGATCTATC TTTTCACCTTTTTGGAGGTTTCTAACGTGGTCTTGGTTTCCTGAAGTCTT CCATGCAATGTTTATTGGACtgataaaatatgatttttttctacagtAGG AcatatatttagaaaatttattggattgactttttttatattcatCTTCT AGAGAGTGTAATCGCAAAGAATGGTGGCATAGATGAAGAGGCCTGTGAAA GGCGGTTAACGTTGAAAAAGAAACCCATCTTTCCACTCGAAAAATTAGGT ATAATTATTCTGTCACATTAATTTTTCATTAAGTACGAAACCCTTGCCTT TTTCATTGATGATATGTAATTTTGTGGTAAGATTCATTCTAACTATAATG TTGTGTTTGCGCaacaaaattacaaagaaattttccagtgaaATAGTTCC CAGtacttaaaaaattttaaatttgtgctagacttttttttataagaacg taaggcttcgatggccaaaatgttaagaacattttagggcttTGAAGACt caaaaataccctatatcttaggaaaatggtcaaaaatattcacaaaatgg tcaaaaaagaacatgtcaagaatatttttaggcttaaaactcaaaaagtt aagaacatccgaaggcttcaaaaattttggatgtctttataaaaaaacgg gtaatgggctcttccagaaaaaatccgttcatggggggtggaggatatat tatttttttcatgaattacccctggacattttgatttttaaccccctgga cacgggttatacccctggacagacatcaaatcaaccccgtagacacaaaa aattacccctggacattggaatttaccccctggacattggaattttttgg tatttattcattacccctggacaattcatcctccaccccctatgaacgga ttttttctggaaaagcccaatttacAAAAGTGTAAAATCAAATTGAAGGT GTCATCAAAAACGGTTATCAACAAGGTGATATGTACATACTCTACGGTCa cctttaaagggacataaaagtagaaatttataaACAAACCATATGCAGCG ggattcaaaatcaaaacaaatgttacatgccaaaataaacaaaataaaca atcaaaacaaatatggcagaTTTTGAtagtttcaattgttttacaagttt gttttagacacgtgattttaattgttccctttaatgacacgtggttcgta caatttttacattttacatacTCTACGATCACCTTAACTTCTAGGGGTCA CTTAAAACCTGTGTATAAGTAATGTATGCAAACCTTAAGTCCTTGTCTAT GTAGGTCATATGCTACCTATCTACCAACCGATGTCTAAAcgtttaaaggt tttctttttacataaaagtgttcccgtttcatatcagacacatgtttcat atcaggacagcgTCTCCCTATTGTTttgttatgctgatataaataagaaa atgtttttttcttccaattatgaccaatcttgctccacatccgtgccaat tcgatgtgaaaaagcttgtaaattaaaatttttgagtaagcaaacgatat cactcttacttATTGAAAACAAAACGTTTAAGACAGTTTTAGCAACCCAT TTTTATATGACCCGCGTTTTTAACttctacttttcttttcatGTTGTCAG GCGAATCTTGGTCGGAAGAAGAACGAATTGAAGTTACACTATTCTTGGTA TGTCTTTCTATATTGGAGACTGTTAATTCAAACCGGCCTATACTGTATTT ATTCGCTGCCATCGAGAcaaaaggttcaatctcaaaattagtgtcGATAA GGAAAGGCTTTTTTGCTTtcataacttaaattttgagattggcccttttt tttaGTGGATGAAGGCCCTTTTCCCTGATCAATACCTCATAGCTCAACCT TTAACCAGGGGGGACTGGGAAtgtaattttatcaaatattcacttttaat aagattgtatcaaaaattaaaatgtcaGAGTTTTCGCCAATCAGAGCTCA AAGTTCGACCAAACGTATTTCTCTTGTTTCCAGGCTACAAAATACATGGC ACATTTTGACGCAACACATTGTATTGCATTACCAGCATCTTATTTCCAAA TGCCCTGGGCACATCGCGTACGTAGATAGTGTTGTGTGGGCGCAGGTGgt taggaaaaaatcaaaatcaatgttatttatttatttcccGTACGCTCGTA AAAGACATAGACGAAATTTATAGGAGAACTGAATTGCTTGATTTAAAACT TTATCTTCGTTAAAAGTGAGGTGCGGTGAAATGGGTTACACAATTAAAGT GAACAATATTAACAGTGAACAGAATTTTTATCCATCTTAAAACGTCGACA AGTACCCATCATGGACAACAATTATGAGAAAGAGCGAATTTTAAGCTCTC TCCCACCTCCTTTTCTCTCATTTTCAATGTTCGAGAAACGGTGAAACGGT CGTGCATAAAGAACTTTGCAACTTGGGGGAAAGAGGGAGGAAGATTTTAC TTCATTTTTGATATGATTCCTTATTTTTTCTCAAGCATTTTTATCCATGA TTATAATACCCCTTTTTGCTATTGTGCCGGGTAACTTGTCAAAGTTTCAC ATTTTCAATTAACATAATTCATTTGATTTGCCTCTATTCAAAATTTACTa agattaaatttcaaatttgttttcgtAATAGTTCTGTTTTAAACTTTAGC AGTTGTTCTTTAAGGTGGAATCTTTCATTGTGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1025263..1042497+

>XLOC_044809 ID=XLOC_044809|Name=XLOC_044809|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3198bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1025263..1042497+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgCTGCAGTATATTTTTGGCCCAAGGCTTTATCGTATTTTTTCTTTAGT
AGAATCTACAGGGCAAAGAAAATTGatgCTGCAGTATATTTTTGGCCCAA
GGCTTTATCGTATTTTTTCTTTAGTAGAATCTACAGGGCAAAGAAAATTG
GTCAAAAATTATGAAGTCAACAGACTGGAATGGCTTAGTGAATCATTTCT
CCACACAGTCAAAAATTATGAAGTCAACAGACTGGAATGGCTTAGTGAAT
CATTTCTCCACACAgtATCTTATGCTTTATCCATAACCTACTATTGTTCA
CCATTCTTTGTTTATTATGGTTACACAAGAGgtATCTTATGCTTTATCCA
TAACCTACTATTGTTCACCATTCTTTGTTTATTATGGTTACACAAGAGAA
ATATTCAGTTCACCAGATCGCCTCATCTACTATTTGAAGTTTTCTTTATC
AATATGCATTGGGATGACAGCTTCCTACTTATTGAGAGAAATATTCAGTT
CACCAGATCGCCTCATCTACTATTTGAAGTTTTCTTTATCAATATGCATT
GGGATGACAGCTTCCTACTTATTGAGAGGTCTTGGTCGAAGCATTAACAC
AGAATACCAAAAATTCATTGAAGTTTTGAATACTGCCAAAAAAGATAAGT
TACAAATGGTCTTGGTCGAAGCATTAACACAGAATACCAAAAATTCATTG
AAGTTTTGAATACTGCCAAAAAAGATAAGTTACAAATGGAATCACTCAGA
AATTATGATTTTGACTTCAAAGCATGGCCAGTTAATTTCAGATGGGATGA
GTCTTCCATTAAAAGTGAAGTCACCAATCCCTCACCCATTTCTGATCACG
AAGACAGCAAATCGGTTATTGGGAAAATATTCAGCATCCCATCAAAAATA
TTAGAGAATCACTCAGAAATTATGATTTTGACTTCAAAGCATGGCCAGTT
AATTTCAGATGGGATGAGTCTTCCATTAAAAGTGAAGTCACCAATCCCTC
ACCCATTTCTGATCACGAAGACAGCAAATCGGTTATTGGGAAAATATTCA
GCATCCCATCAAAAATATTAGATTATTGTCTCGGTCATGGCATTGCACGT
CCAATGGCATTTCCTGGATCCGTCAAACTTCTTCAGATGGCTATGGTTAT
TGTCTCGGTCATGGCATTGCACGTCCAATGGCATTTCCTGGATCCGTCAA
ACTTCTTCAGATGGCTATGGcgcAATTGGCTGATCAGGGAAGGACAAGCT
TATTAGAAAAGcgcAATTGGCTGATCAGGGAAGGACAAGCTTATTAGAAA
AGAAAGGGTTGCGAGCAAAGCTACTTTGTGAAAATGGAAATGAAATCGAT
TCAATGTTTGTCGATCGTAGAAGTGATGAAACAGGCGAAGGACAAACTTT
GAAAGGGTTGCGAGCAAAGCTACTTTGTGAAAATGGAAATGAAATCGATT
CAATGTTTGTCGATCGTAGAAGTGATGAAACAGGCGAAGGACAAACTTTG
GTCGTCACTTGTGAAGGAAATGCAGCTTTTTATGAAGTTGGGATTATGGA
CACTGCAAGAAAAGGTCGTCACTTGTGAAGGAAATGCAGCTTTTTATGAA
GTTGGGATTATGGACACTGCAAGAAAAGCCGGTTATTCAGTCCTTGGTTG
GAATCATCCAGGATTCTTTGGAAGTACTCCGGTTATTCAGTCCTTGGTTG
GAATCATCCAGGATTCTTTGGAAGTACTGGCAAGCCGTTTCCTGACCAAG
AGAGGGAAGCCATTGACGTAGTCATGAAGTATGCTGTCACAAAGCTCGGT
TTCGAAGTTGACAATATCATTTTGTTTGCATGGTCTATTGGAGGTTATAC
TGCATCTTATGGCGCCATGATGTATCCCGATGTAAAAGCTGTGGGCAAGC
CGTTTCCTGACCAAGAGAGGGAAGCCATTGACGTAGTCATGAAGTATGCT
GTCACAAAGCTCGGTTTCGAAGTTGACAATATCATTTTGTTTGCATGGTC
TATTGGAGGTTATACTGCATCTTATGGCGCCATGATGTATCCCGATGTAA
AAGCTGTGGTTCTTGATGCTACTTTTGATGGTATCATTCAACTTGGTGCA
GCAAGAATGCCTTCCTTTGCAGGTTCTTGATGCTACTTTTGATGGTATCA
TTCAACTTGGTGCAGCAAGAATGCCTTCCTTTGCAGtGAATACCGTCAAA
AGAGTAATTCGCAAATATATGTTTCTGGATGTCACCCGTCAAATTGTCAA
tGAATACCGTCAAAAGAGTAATTCGCAAATATATGTTTCTGGATGTCACC
CGTCAAATTGTCAAATATTCAGGTCCTGTTCAATTGATCAGAAGACAACG
TGAAGAAATTATCACTACTAGATATTCAGGTCCTGTTCAATTGATCAGAA
GACAACGTGAAGAAATTATCACTACTAGACCACAAGTACCCATTACCAAT
CGTGGGAATTATCTCCTTTGGAAAATGCTCTTATACAGACCACAAGTACC
CATTACCAATCGTGGGAATTATCTCCTTTGGAAAATGCTCTTATACAGAT
ATCCCAATATCATTTCTGAAAAGAGCACAGAAGCTCTATGGCAATATTTG
GCAGCATATGATTCGACTGGCCAAGATATCCCAATATCATTTCTGAAAAG
AGCACAGAAGCTCTATGGCAATATTTGGCAGCATATGATTCGACTGGCCA
AGAGAGTGTAATCGCAAAGAATGGTGGCATAGATGAAGAGGCCTGTGAAA
GGCGGTTAACGTTGAAAAAGAAACCCATCTTTCCACTCGAAAAATTAGAG
AGTGTAATCGCAAAGAATGGTGGCATAGATGAAGAGGCCTGTGAAAGGCG
GTTAACGTTGAAAAAGAAACCCATCTTTCCACTCGAAAAATTAGGCGAAT
CTTGGTCGGAAGAAGAACGAATTGAAGTTACACTATTCTTGGCGAATCTT
GGTCGGAAGAAGAACGAATTGAAGTTACACTATTCTTGGCTACAAAATAC
ATGGCACATTTTGACGCAACACATTGTATTGCATTACCAGCATCTTATTT
CCAAATGCCCTGGGCACATCGCGCTACAAAATACATGGCACATTTTGACG
CAACACATTGTATTGCATTACCAGCATCTTATTTCCAAATGCCCTGGGCA
CATCGCGTGGAATCTTTCATTGTGTAAGTGGAATCTTTCATTGTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044809XLOC_044809-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000023_pilongenomesc0000023_pilon:1025263..1042497 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1579-1599:17215
Aaloc1495-1578:16534
Aaloc1450-1494:16153
Aaloc1354-1446:14655
Aaloc1276-1350:13992
Aaloc1216-1272:13258
Aaloc1159-1212:12885
Aaloc1096-1155:12093
Aaloc1030-1092:11439
Aaloc865-1029:10900
Aaloc817-864:10121
Aaloc751-813:9458
Aaloc652-750:8950
Aaloc613-651:8543
Aaloc538-609:7494
Aaloc370-534:6902
Aaloc292-369:6416
Aaloc202-288:5819
Aaloc133-198:4808
Aaloc76-132:4477
Aaloc1-75:1