XLOC_044789 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044789
Unique NameXLOC_044789
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000022_pilon:1247862..1258254-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044789 ID=XLOC_044789|Name=XLOC_044789|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10393bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1247862..1258254- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTGCCAATAACAGACTATCAGAGTAAGCTTAGAATTATTTTCCTAGC TATTTTTTTTATATAATTTAATGATCTATTATTTTCTCTCCTACTACTCA ATCAAACCAGACGTCTTCTGCGCTTGATAGGATCGATCATGGGAACGGAT TACTTAACGATCCAGATAGGAGATCGATAGAGGATCGAAACTCAAGATTT TTTTAAGCTTATGATTAGTTATCGATTATTTATCGATCTATCGTCGATCT TTTATCGATCTTCAGTCAGGCACATCCTGGCAAATGAACGGGGTGAGCAT TTGCATGGGGTATTCGTCACCCAGTGCAAATGAGATAGGACGTCTCAGGC TAAAAGCGTGAAAATGAATAAAAATGAACTTCAAACTGAAAACGGGAAAA AAGGAAGAAAACCGGGAACTTTATTTTTTCGTTAAAAGTTTCTTCAATCT TCGAAGACAAAATTGACCGATGGAAAAAAAATTTCATCTATGCAGTTCTT CAAAATGAAGCAAAATATTTCCAACCCAGTTCAATTGCGTGGGGTATCAG TTACATCAATATGCCTTCTTACCTGTCTTTAAAAATATAAATAAAAGTAA TCACGGAAAAGGACGCGAAAAAAAAAGACATAAGTGTGAGAACAGAGTAA TCAAACTCGTTAGAAAAAGTACCATTAGAAGTCATAAAAAATCAACCTGA ATAAATGCAATCGAAATCCCAGAGAACTTCATAATTCCCCAAACAACATT ACATTACTATGTCAAACTCCCATTACATAAATTTTACAATTACGTCAGAG TAGACTACGCTCGCCACCGAAGAGGTTTATTTGGAAAGGGTAATTACATT TTATTGTTCGCTTCTTTTTTAAAGATTGGCCGGGTTGGAAAAGTATGAAT TTCTTTGTACATATTTTACCTACCCCAAATATTTAGGAGGCTGAGTTTCA 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ATTTTAATCGGAATCTGGTCAAGAGATTTGAGTGCTATACTTATTTCTGT TTTCCAATAAAAGTGAGCTTTTCCTTTGAGGTCATAGAATACAGAATGTA TTAAAGCCTTAAGCAGCCTTAAGACTTAAGTGAAAGTGAAGAAAAACTTG CTAAAGTCGAAGAAAAACTTGCTAAAGTAAAAAAAAAACATCAAGTAAGG CAGTTAAGGAAAATTCATTATCAGTAATTTTTAAGGATAACTTTGAAATC TCTATGTAAATGAAATACCTTATTAGGGGGGGGTTGTAGGGGTTCGAAAT ACCGATTTCCCGTCAAAATTTTTGCTGAATCCCGGAATCCCGACAATTGA ACACCGTCACACCGGTTTGTACAAGTTCAAATACCGGCATAATGACCGTA ATACCGTACTAAAAAGAGGCCAATCCCGTCACACCGTAAAAGTACAAACC CCCCCTTATTACACGAATATTACTAGACAAGTATTCAACGGCCTTGAAAT TAACACGCATAAAATTAACACGAATTTTATTTCAAGGAAACCACACCTGG TTTTAATTAAGGGGGTTTTTATTAACACAAAAAATTTTCAATTCGTGTTA ATAAAATGACTAGTAATATTCATGTAATAAGGTAAAAACTTTTCCTAGAC AAAAAAATAACTAAGTTATCTCAAAATTGATCATTTTTTGTTTGCAAAAG CAGAACTTGATCAGAATTTCGGAATTTAGATAAAATTTGTTCTCATCAGT CAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCA GTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCGATGTCCGACTGAAA ATCTTTTGTGTCGGTCATGATGTCCGAATGAAATCTCTTACTTAGCTTAT TCTTTTAATACTCGCTTCCTTTGTAGCTCTCAAAAGTGTTTCTAAAGTTT ACTTTAATTGACTGCGTTCTTGGTAATTTTATTAACGGTTGTTTCTAAGA TCACTTTTATCAACTCGCTTTCTTCGTAACTTTCAAGGGTGTTTCAAAGT TAACTTTTATCGACTCGCTTTCTTAGTAACTTTCAAGAGTGTTCCTAAGA TCACTTTTATCAACTCGCTTTCTTCGTAACTTTCAAGGGTGTTTCTAAAA TCATTTTTGTCGACTTGCTCTCATCGTAACTTTCTTTGTTTCTAAGTAAG ATCACTATTGTCAATTCGTTTTCTTCGTAACTTTCAAGGGTGTTTCAAAA GTTAACTTTTATCGACAATATTTCTAAGATCACTTTTATCAACTCGCTTT CTTCGTAACTTTCAAGAGTGTTCCTAAGAACACTTTTATCAACTCGCTTT CTTCGTAACTTTCAAGGGTGTTTCTAAAATCATTTTGTCGACTTGCTCTC ATCGTAACTTTCAAGAATATTTCTAAGATCACTTTTTTTACTGACTCGCT ATCTTCGTAACTTTCAAGGGTGTTTCTAAGATCACTTTTATTGAATCAAT TTCTCTGTTACAGTAACGAATTGTTCCAAGGTCACTTTTATTTTACCTAC TTGCTTTCTACGTAACTTTCAAGACTGTATAATTTTAGAAAAAAATATAC ACTGAATGACCGACAGGATTTTGAGTTTGGCAGACAGGATTTCATTGCTG TCAGACATGATGTCGGATTGACTAAAAATATTTATTTGCAGCCCCGAACA CAAAATAGCTTGTTTTTTCAACCAAGTATGATATAGTAAAGTATACTAGA TAATATTAGAATAATTAACAAAATTCAAAAGCTCTTCTGAAAAGCAAGTT ACATGGAAAGGTTTCAGTAAAACACAAAAAAAAGTTTGATAAATTGACTT ATAAAAGCTAGACTGTCAATCAAGCACATGCAAGATATCAAAGGCAAGAT AGGAAACAGAAATGAAAGATAAAGAAAGGGAAATCAAACATAAAACGCTT GTGTGCTGCAAGACCAGAATCACTACAGGACTTATGCTGAACTACCTACA CAATTAAGTTTGATTATAGTAGACCAGGTTTGTGCGGCACCTGACCAATT TTTTGCAAACAGAACTTTTTTTGAAATGGTGCATAAGGTGCCACAAAATC AGAAACAAAGAAACCTCAAGTTATGCAGGGCAAGGATGCCAGACCTTGAG ACTGAGAGTAGTTCAGCCCGCATACCCACGGCAAATAATGGAAGATTCTT AAATGCTAAAACACCCGAAGTCCCATCAGGAAAATTCAGGGGGGAGTAAA CAACACTATGCAACCCACTGACCACCCCAATAGAAAATCTTCCCCACCTG GGTTTTTACAGGATCACCCCAACCTTGCAAAGGAATCTCCTCACTTTGCA CCTGGGTGAAATTCAAGGTAGTTTCAGTCACCCCATTCAATCTTTCAAAC AAAACCTTTTATAAGCTTCCCTAAGCTTCAAACAAAATTGCTTATAATGC AATAGATCGTAAAAAAAACACAAACCTTGAGAATATACAATACCATAGAA ATTGACCAAAAAAACATTGACAACTGAAAACCTGTCATACTAAACTATTT TGTTCCATTTAGGCCCTTTTAATGTGGACTAGATCCTTTGAATGGACTTA GGCCCTTTGAGTATGGACTTAGGCCCATTAAACATGGACTTAGGCCCATT AAACATGGACTTAGGCCTATTAAATGGACTTAGGCCTTTTTAAAATTAAA GTTTTCTTTTGTGATGGACTTAGGCCCATGATCTATAAACACTGGATGGA CTTAGGCCTTTTTAAAACTAAACACACTTTTTATATAACCTTCATCGAGA AATTTTAAGGCCTTTTAAGCATAAAATCTTTACATTATACACATCAAAAG AAAGCTAGTGACTCATAGATGCAGAAAGTACAAAAAACTCATTTTTCATA AAAATGGACTTAGGCCTCTTTAAAATTGAGGGGTAAGTGGACTTAGGCCT TTTTAAAATTGAGGGGTAAGTGGACTTAGGCCTTTTTAAAATTAAGGGGT AAGTGGACTTAGGCCTTTTTAAAATTAAGGTTGCGATGTAATGCTAAAAC TAAAGCCTCATTTGCGTCCGGTGGAAAAAATTCAAGTATCAAAAAGTGAC CAAATGGAGGAATCCAACTCAACTGGAACCTATATAAAACCAAAGTGGGA AAAACATACAGTGTGTTTTGTTTTCGATAAATAAACTCACTTTTTCTTTA ACCTTTTTGACCCCGAATGCCGTAGATATACGTCCTTGATACCGTGAGTG GTCCTAAATCCGACAGCCCTGCCCAAATCCGATGGGGTCTTTTAAAGATA CAAACTAAAATAAAAGCAAACCTTTCGCTGTGACGCAATGAAGATACCAA AGTGTCAACTAAACTGAGAGATTTGATACAAATTGATTTGAACCAAATTA CAATAATTGTGCTTCTTATAAAAAACATAATTTTCTATACATAAATTGTT AACGTTTTATAAACACAAGCAACAGACAGTCAGTACCTTTAGCCAAATTA GGAACATTTTTTCTTACTTTTACTAGTATTCCTAATTAGGAATATTAGGT TTCTCCAAAAATAGCAAAAAATCGCACGTTAAAAAGTACTTCGTAAGATT CTTACCGTGAGATTGGGTAACTTGCATCAGTGGAGGCTAACATGCATAGC CCTCAAATGAAAGACCTGGCTGGTCATTAAAATACAGCTACGCAGCTCCG CTCGCAGCTCTACTCTACCATTTTTGTTTGTTTTGATTTAATTTTGTATT TTAATGACCAGCCAGGTCTTTCATTTGAGGACTATGCATGTTAGCCTCCA CTGATGCAAGTTACCCAATCTCACGGTACCATTCCATTTAGGTGGGAAAG AAAGACTGAGCTCTTGGCTTGCTCAGGGGACCGAGCTTCCTAGAAAAAAC TTCACTCCTCCCAGCCTCTCCTCCCAGTAAATTGACATCTTATTTATAAA AAGCGGGAAACTCACTTTCTGTTTTTCTTCGTGATAATAAAAACGACAGT TCGTTTAATTCCTAATTTGGAATTATTTTTTTGGGGCGTTAATAATTCCA CCATCCGCGAAAGAAATTTTTCAATTTTTTGCACAGTTATCATATTTGGT ATACCAAATCTATTGGTCATACTTGGAATTTGCGAATATAGCTCGTTTCA GAGATATTAAACTTTTAAATATTTCTTCCTAATTAGGAATCCTGGTAAAA GTAAGAAAAATGTTCCTAATTTGGCTAAAGGTACTGACTGACAGATTTAG AATAATTATAGATAGAGGTAATTATTTTTACAACTTACACTTTTTTGATC ACATTTTTGATTGACATTTATAGCCATCTTGTTAGATGTTTTGTTCTGAG AGTCCTTGCAATAGTTTATCGTTCAACTTGGAGAAGGAATTTTTGTAAAC ATAGAATTTTTTTCATAACAGTTATTTGGAGTGTCGGAATTAGGCAGGGC TGTTGGATTTAGGACCACTCACGGTACATTCTGAATGCCGTACATTATGC AATTGATAGACACGTCTTTCTCGGGCCATATCTTTTATTGGCTTGCTTGG TAATCGTTCAAAATTGTGAGCAGTAGAATGTTTTTTGGATGCTAATTTTT GGTATATGGCTTCAGGAGTAAGTATATAATGAAAAAATACTAAAGAAAGA TAATTAATAATTTTAAACTTTCCCCACTTCTTTTGCCTAAGAGGTGAAAA ATACCAAAAAAGTGACATTATCGAAAAACGAGTAAAAAAACTTTGGTAAA 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AAACACTGCGCTTGCCTGTGCACACTCGCGTGGGCTACTTGTAAGGCCGG TGCATCATGACAATTTAGTCATAAGTCAATTGTTGATTCTTAAAGGTTGA ATTTTTCATATCTTTAGTTCTCAAACAAAAGTGGGAATTCGATGCAAGCT TTATGGATTTTTCATCAGCAAACCATTATATAACTTTTGATGGGAAAACA TTCAAGATGTGTTTTTTAATATATACATCAAAATTGATGTGAATTATGCT CTTTATGCTGTTGCTTACTTTTGCTATGGCAACAAGTGATGACATTTTAC CGATTACTATGCTAAATTTAGAAATGTCTTAGTCAAAGAAATGATTTTAC ATTATAACTCTATTGTAATTTGAAGTATCATTGGAAGAATAATGTATTTG TTTTTCTTTTAGAGATTGGAATCGGCGTCACAGGATTTGGTATGCTATTC CTTTTCCTTGGAATGCTTTTGTTCTTTGATCGTGGTTTGTTGGCAATAGG AAATGTAAGTCTTTCATTTATGAAATTTCAGTCTGAATCTATGAATCAAA ATCAAATATAGCAAAAAACAGAAATATTCTTGTGCAACCCTTTATGTTCT TGTTAAATTTGTTTGATTGAAATTCTTTATTACTAATGTATTTGATCATT TTCTGAGAAGGTGGGATAAAACAGGAATAAATAAGAATGATAGTACAAAT TTGATTCAATCTGAATATGAAATGATATAAGTGGCTTACTTTTATGCCAC TTATTTGTAAAAGGTTCTAAACCTAGGTAACAGCTGAATGAAAATGTTGT ATCTACTAAAAGGGAAACCACGTTCGTTAAAAACTTCGATTACAGCAACC ATTTACATTGATTTTTACTAAATGCTTGATTGCTATTACCAAGTAACAAT ACCAAGTTATGATAATAAGAATGAAATGTTTTGAAGTGTACACTTTTTAT CACTCTTTTTCAAAATATGTTTTATTTTTATAGATCCTTTTCATATCTGG TTTAGCATTGGTGATTGGCCTTGAAAGAACATTCAGATTCTTTTTCCAAG TAGAAAAATTGCGCGGAACAGCCTTCTTCCTTGGTGGAATATGTATTGTG TTGTTAGGGTGGCCCTTTGTAGGAATGATTGTTGAAATTTATGGTTTCGT TCAATTGTTCAAGTAAGAAACGTTTTATTTCGTTTTTACTGTAGTACAGT ATTGTTCTTTCTACCCAAAGAACTGCTTTAATAACTTTCGCCCAGTTTTT TAAGGGGACTTATTTCTTTTACAATATTCTGACATTTCAATTATGTTTTA CGTTCTTCTTTTCAGAGGATTCTTTCCAGTTGTTATAAATTTCCTTCGGC GAGTTCCAGTTCTAGGGAATCTCCTACTTTTACCAGGAATTAGCACTGTA AGTAACTTTAGCCAATGATTTTAGAGAAGAACTTTCGTCCATTTTAAATC AACTCAAAATTAGCATTTTGTATTGTGTATTTCATTATTATATGATCGCT TCAGCTAACAATGAGAGGTGCTGATGATATCAATATATGTTGTTTTTCGC CTTGACCTAGTCTCCGAGTAGAATCAAGCAAATGTATCACATCTGTTGAT TCATACTAATCTGGAGTTTATATTCTTTCTTTTCAGTTTGTCAATTACAT TGCGAACGATCCAAATAGCATGGTATGAGCTCTATATAAACTCTTTTCTC AACTTCTAATCTCATCTTCGTAATAATAACGACCAAAACAAACCAACGAT CAGACAATGACGACACAATGACGTTATAGCGACTATGTAACCAACTGCAT TGTTTTGTTTCCGTATTAGAATGCAGAGAAATCTATGCGGTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000022_pilon:1247862..1258254-

>XLOC_044789 ID=XLOC_044789|Name=XLOC_044789|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=876bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1247862..1258254- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTGCCAATAACAGACTATCAGAATGCTGCCAATAACAGACTATCAGA
AGATTGGAATCGGCGTCACAGGATTTGGTATGCTATTCCTTTTCCTTGGA
ATGCTTTTGTTCTTTGATCGTGGTTTGTTGGCAATAGGAAATAGATTGGA
ATCGGCGTCACAGGATTTGGTATGCTATTCCTTTTCCTTGGAATGCTTTT
GTTCTTTGATCGTGGTTTGTTGGCAATAGGAAATATCCTTTTCATATCTG
GTTTAGCATTGGTGATTGGCCTTGAAAGAACATTCAGATTCTTTTTCCAA
GTAGAAAAATTGCGCGGAACAGCCTTCTTCCTTGGTGGAATATGTATTGT
GTTGTTAGGGTGGCCCTTTGTAGGAATGATTGTTGAAATTTATGGTTTCG
TTCAATTGTTCAAATCCTTTTCATATCTGGTTTAGCATTGGTGATTGGCC
TTGAAAGAACATTCAGATTCTTTTTCCAAGTAGAAAAATTGCGCGGAACA
GCCTTCTTCCTTGGTGGAATATGTATTGTGTTGTTAGGGTGGCCCTTTGT
AGGAATGATTGTTGAAATTTATGGTTTCGTTCAATTGTTCAAAGGATTCT
TTCCAGTTGTTATAAATTTCCTTCGGCGAGTTCCAGTTCTAGGGAATCTC
CTACTTTTACCAGGAATTAGCACTAGGATTCTTTCCAGTTGTTATAAATT
TCCTTCGGCGAGTTCCAGTTCTAGGGAATCTCCTACTTTTACCAGGAATT
AGCACTTTTGTCAATTACATTGCGAACGATCCAAATAGCATGTTTGTCAA
TTACATTGCGAACGATCCAAATAGCATGAATGCAGAGAAATCTATGCGGT
AGAATGCAGAGAAATCTATGCGGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044789XLOC_044789-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000022_pilongenomesc0000022_pilon:1247862..1258254 -
Properties
Property NameValue
Aaloc415-438:25
Aaloc379-414:208
Aaloc298-378:528
Aaloc118-294:861
Aaloc28-117:1430
Aaloc1-24:10394