XLOC_044784 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044784
Unique NameXLOC_044784
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1082556..1092895-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044784 ID=XLOC_044784|Name=XLOC_044784|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10340bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1082556..1092895- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTACTCAAAAATTTGGGGGCAGCATGATTTGGCTGTTTGTTTTGGCTGA AAGTTTTGACACTTGAATTCAAGAGCTTTTTTTTCTCAAATTTCATGGAA TGGGTACATGTTTTAGCATGTTTTTGTGCCAAAACAAGGCTAAGATAAAC TTAGAGTGCTTATTGGTTTGACCATTTGACTTACAATTGAATTAAAAGAT CTACGCCTGTTTAGCAGATTGGATTTCCCATTGTCTTTTATCGATTACTC AAATTATTTAACTACTCTTGTCTTTAGGTGATAAACAACCTCCTAAAATG TGGCTCAACAGACTTCAATATCACATTCACTATCCTTGACAAGCTTCTCC TAACACCAGAATGGAAGAAAATCCTATTTTCCAAACCCCTCACTCTGGTT TGTTCAGTTTAACTTTTGTAAATCTTTAGCCAATATTATATGTTGTAAGT GGTCAAAGGCGTCAGCGTCTTAAACCAGGGGTTCGCGGTTCCAATCCTTA CTCCTTCCAATGTTCTGTTCAGTTCATAGAATAGCCAAGCCGGCTAGCCG TGGACCTGTGAAAACAATCGAAAGGCTACCTAAAAGTCCTAGATTACTGG GCAATCCACGTTAAATATTCACTCTATCTACAGTATCTATCAATCTATAC TGTGCCATACTGATCTCTAGAAGGCTTTTTCCTCAAAAATTACAGAAATA ACATTTAAAAAATCTGTTCAAAAAATCAATGGTCAAATATGATCAAATCC AGAGGTAATTTTAGTTTTTTACTTTGATGGATCTCGATTAATCATATTTT TCCATTTCTTTACAAGCCTGATAGCCTTTTTGTGGATATTCATTTTAGAT AATTGTTGTGATTTGTCTTGTCCTTTTGTTTTCTCTGTGTTTCTATTTGA ATAGTTCAAGGTTTCATACTTCTAGTTTATTTATATATTACTTTTTATAT 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AGTATAAAAACTTTTTCTCCACTGCTATAAAAACTAATAAAACACAAAGG ACCACAAACTGTAATGAAAATCCTATCTAGAGCGAATTTTGAATTAGAGA AAGATTGGAAACTTGCAAAAAAAGATTCAAATATTTTGGGGATGATTGAA ATGTTGAATGATCTGAAATTTTGAGACCATAATATATTTTATAATCACAG GGACCACGTAGCAAATTTGAAATTGATGCTTCAGCCAGTATCAGAAGAAA CTCCAGCTAAGAAAGCTAAATATCAAGTCTATTTCAAACAGTTATTTGAT GTACTAAAGACCAGTCTAATATCAGAGGTATGTACTTGTTATCAATCCAC ATAATCAACCACTAACTTACTTTTATATAATCTTGGCCTAGCTATATTCA CAATCTTTGATCGAAGATTTTCGAAAAGGGTATGCAATGGTAGCACAACT CGATGTATAGATCAATTTATAATTCCTGTTTATTTATAGTTTCTGTTGAA ACCACTTTTCACCGCTATTGAGTAGTGCTACCATTAGGGTACAACTTTAC AAAAACTCTGATCAAAGATTTTGTTTAGTCAGGATGGAGAGACTTTGTTC GGGATATATAAAGGTCAGTGATATCAAACTTGTGACAGATTGCATAGGAC TGATAAAAGGTTTACAATAGGAATTCCTGGACATTCTATTTTAATCTTGC TAAAAATGTATGATACCATTGCATAGAGACCCCTTATATGCAATATCATA AAATCAGTCAGTTAAACTTGTTCACATGCTCAAAAGCTTGAGCACAACTA TGCACAACATGGAAAAAGTTTCTTAAACATAAATATGGTTCAGACTTGGT TTGCTTTAGATACTAACTGAAAACATTCTGCACTGAAATGAAATGTACCA AGAAAACTCTTTATCATACAAATCCTATTGCATAATGACTGAGCAACTAA GGGTCTATGAGAATGGAAAATTGTGTCAACTTTTGCTAATTAAAAGAAAG TCTTATTCTTTTAAGAAGATTTCCTTTTTCAGAGAAAAGATTTGATCATT AGAAGTACTCCTGCAATTTTCAAGGCAATTGTTGTTGGCTCAAGGTATGA TTTTAACTACTTTCTTCATATTGAATAGTTTAGGCCATAGGGAGTAACTG TATTATCATTTTCAAGGTTAGATCTATGTGACTGTTGTATCATAGTTTGC TCCTCATAAAATTTTCTTGCTTTATTATTTAAGAGAAATTGTAAATTTTT CTTCAGGTCATCAAATACTTCTCAGCTTACAAACTACGAAGAACTACAAG TTCTTTTCAAAATATTAGAACTCACCCAGACGATCGATGTCTTAAATGAA TCAACTGTGCATCAAATTCATGATAGTTTCACAATAGTTCAAGAATTGGA CGTGTATCAGGTAAATAATGAACCTTTAATTGTAGATGAAATTCCAGAGC CCCATACAAAAACGTCAAAAAAATGGACAAAATTCTTCGAAATTCAGTCT CTCTAAGGGTCGGTTTTAAAACTTTGGCTCGGACATCTAGTACCCCCGGG CTTTGTCAGGGGATTTTAAAAGGCAAAGTATACGGTCATCCTATAGCGCT TTACCGAACGAAATTTAAACCTGTATTGAACAATCTTGGTTTCACCACCT TTAGAGGATAGATGATAAGGAGAACAAACACCACATAAAAATGACTGAAT TGATGAAACTCTTGGAAAATGGCTTTAAAGATAGGTAAAACACAATAATA ATTATTATAAATAAAGCACAAATTTCAATTTAAGCAGGGGGTGGGGTGGA TCATCCCTAAAATTGTTATGAAAAACTGGACAGTCAGAAACAATCAAGAA CTCTAGCTGAAAAGTATGATATATTAAAATACCACCTCTCTCGAAATACA TAAAAACCCTTTAGCACTAACATGTTGACTTGACACTTTTTATTAATATT TATAAGCTCTGTTAACTATTTGCAATTAAATTTAAATAATAATGATATGT GGTAGTATTATATTTTGTGTTTTTCTATCTTTAGTAACATGAACGTCCAG ATGAAAATGTTATCAATATTCAAGACAATGTTGCTGATTGATTATGGGAT TGTGGAACCGTTTCTTGGCAAGCTGTGGAGATACTGTCTAACTGAAGTAT ATTATTAAATTGATTGTTTGATCACTGTTTATATCTATCTATGTCTATAT CTATATATTTCGTACTAAAAGGTCCTAGGACCCATTTATTTACAGTTTAG TCTCCTGGTTTCGGGGAAGAGTTGATTTGATGTTTCAAAGGGCGATGTTT TAGGATTTGTTATGTAATTATGCTGTGAGCTAAAATAGGTAGATTTTAAG CCTAATTTGATAAGTTCATTTGCTTTAAGTGTTCACTCGTTCACTCTTGC CTACCGTGTGGAAACTATTCTCAAAGGAATCGTTATAATTACGCTGACAT GGTTTCTACACGTTAATATTCTATTTTTTGTCAAACTATAGGTTGAAGGA AGTACGATACAATTTGAACAAAATGCTTTATTGGAAGCTCTCTTGGAAAA CTTTGCACAGTTAAGAAAGGTCTGTCTTGAGATAATTCCTACCTCCCCCC TAATAAAAATATCCACGTGTTTTGATATATTTCTTTTAGAAAATTTGAGA GGTATTTATATTTCAACCCCCGTATTGAAAATCTCGTTTTTAAAGGTATT CTAAGGTCAGGTCTTTTGATATTTTTTTTAGAAAATTTGAGAGAGATTTA TATTTAACTCGCTTTCTTTTTAGATGGAACTTTTGCTAGATGCTTTTCCG CTAGATACCGGACTGTCCTGTAACTTTCCCCACGACTTCACTGTAAGGTA TAGAGAAATAAAATGGGCTGTTCCATAAAAAATCTATTCAGGGGGTGGTT GGACGAACCTTTTCATTTCAAAAAAGATTCTTGGAAATATCTGAATACCC CCTGGAAAATAGCAAAATTTACAAAAAAAACCTTGGAAAAATTCTTTTCA TGCCTTAAGAAAGGGTAGGCGAACTAAAATCAGTCTTATACCGCCTGGAA ATTTTAAAACAATATCTTCCCTCTTGGAAAAATGAAAAAAAACTTCTTTA GACCCGTTGGAAATTCCTCTCAGGATACCTGCTGAAAATGTTCCTCTACC CCCTGTTTGGATATAAAATGGAATTGCCCAATATTTTGCTGTTTAAAATC ATCAAATGATCTTATAATTATTTTGATGTTTGTTGGTTTCTGTTCTATTT TTTTGTTTGTTTTCAATTTCGACTGCATGTTTTACAACTCCATTCTAAAA GATTCTTTTCCCATACCTTCTCTTAGTTATTCAGAAGAGATCTCGAAACT ACAAACTTCACAAGTCATTCGATTGTTGAAAATATTCCAATCAAAGATGG AATCGATCACTGTTAAATCAGGTAACATAAAAGAAATATCTACCTAACCT ACCTGCTAACTTTTTTCAGACGCCATTCTAACTTTGGATCATTTGTTAAA GTAAATCTTTTATGGAACCATGATAAGTTTTTTTTCACATTTTGATTTTA TAGGAAAAGTGGATCATAATGTTAAAAGACTTTATAAAATTTGTAATCAT CTGTTCTATTGCTTCTTTTTTTCTAGATTCAAATTTTCACCAGTTTAGTT ATCTGCTGTTTTACCTTTTGGTAACAAACGCTTCAGTGGTGCCAGAAAAC CTCTTCACGAAACCTGAGCTTGAAGAATTCATCCTTATCGTCACAGAAAT CGGTCAACGATTTGTTGAGCTCAGTAAAACTCTTAAATCGGAGGTAAAAT ATTTTGTATAAGTATAACGAGTATAACGAGTGACGGCAGTGTTAGGGGAG CATCTGACTACATACAGGTCATAAGGTTCCATGAATAAGAAGCTTTGTAT AGTGTCCTGGTAGGTTGCCCCCTTGAAAATTGAAAAAAATCCTCTGCCTC CTTTAAGTCCTCCCCCCTAAGATTTCAACCCCCCCCTGAAATTTTTTTTT GTGTTCATACTTTTTGCTACTTGTATTCACGTTATCTTCGTAAATACAAT GACGATGAAAAAATGAAGAAGAAACTTCCACAGAACGAAACTTTCCCAAT CCTTTTCCAATTTTCTGGAAAAAACTCACTACAGATTTAATGACGATCAT GTAACCTAATATTGGTGTTAAAACTTATGATTATTTCTTGGAGTTTTTTG ATTTTTTTAGGATTGTTTTGATAATGACGCTCATGTAATCTAATTGGTGC TTAAAACCTTTTAAATTATTTTAGGATAGTTTTGGTCATATTTTGCTTTT GATCACAATGGGTGTCAACGAATGTTTCATGATCTTAAAAGATCTATCAT TGCTACCAAATGATGGAGATTGCCAAACTATTGGAAACACTCTCACAGAG CTTTGTAAAGAGATCAATGGTGCTGATGCAATGATAAAGTACCTTAAGGT ATGACCTATTTTATGACTTGTTTGCCGCAACCAGGGGTGAATCTGAGATT AGAAATGGATACCGGAGACTGAACGCCTACAAACATCAAAATGATTCTTG AGTGAAGGTAGACAGTCGGACTGTGTTCGAATCCCAAGCACTTCCAGGCA GGGTGCTAGGGAAATTTGGTGATAGACTCTCTACCTTCACTCATATATCA TTCTCTCTCAGTCCGTTAGTAGAACTCAAATTTCAGATGTGGAACGATAA ACTCGCTATACACTCTAAATTATGAGTTTTTTTATATTGATTGGTTTTGT TTCATTATCCCAATGAAGACCATAGGTTGTTGTTAGTTGTTTAGTGTTAC TTAAGTTTTTTCTAAATCCCTATCTCTCTTCAATTCAAAGGTATGCCAGG GCTTGACAGAGTTGAGATTCAACCAAAGCATATCCAGTAAAGATCAACTT TGTCAAATCAACAAAGAGCTGATGAGCAATATCGAGTCTGTATCGTTAAA AGAAGAAAAGATTTCTACATTAGTTAATAACAAGACAATGTGGTCTGCCA TTGCTGGCAAGATGTTGGATCATTTTGAATTTTGCTTGATGTTACCTGAA GATAATCGAATAGTTACGGATGATGCAATCAAATTACTGTTGACCGTGTT CCGTATGGGTGACGAGTAAGAAATTTAATTTTTGCGCAAAGGTGGAGAAG CAGGAGGGAGGACTAACCTAGATTTATCAAATTATCAAGGGTCAACCAAC ACTCTAGCAGGACTCTATAATTAGTGGAAAATTTTTAGAATTTGGACCGG ATTTTGGTTAGTCTTCTTGAAAAGCTAATATCGGGGAAAGAATACATTTC TATTATGTTGATTTTTTACAGGTCTCCAAAACGAATAACAAAAATCATTG AAAGTCATACTGTCTACAATTATCCTCTATTCCAATCAAAAAGCGTTGAA TTCTGGGAAGAAACTTTGACGACAACATCAAGCGATGAAATTGCATTGAA AAGAGACCTGAAGGTATTGTTACTACATTTGTAACTAAGTATCTTCGGAA TTGTGTGGCCTTCTTGCTGCTTTCTTTGGTGAGAAAAACGCTTTACACCA CGCCAAATTTACTCTAAACGGCAGAAACTTTTAGAAATCTAAGCAAAATG CCGGATAAATTCGGCCTCAAATCTGTAAAGAGTTCGTAGATTAATAAAAA GAAATTTTTGTCATTGAAAAGACGTGAGGTTTTCTTAAAGAATTTCCGCC 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GACTACATGGGATTCTTCAAGCGATTTAAAGTACTTGAAAGTTTGACCGA TCTTGGCTCAATATTAAGAGCGGTTAAGTAGTCAAAAAATTTTGTTTTAG ATCGGCCTTCGGATCATCTAGAAAATCTGTTTTTGAACTTTCCTGGCCGC GTTCATAAACGTTCATGTTAGACCGGTCCTGGCTATTTGTTAGTAACGAT TACATCAAACATCTGTTATAAAGAGATGTTGGCCGGTTGATCGAGGCCGG TTTGGGACCGGAGGCTTTAGAATGGCCGATATATTAAATGGACTCTTTCT TGACTCGGTCATTTACCGGCCCTTAAAAGATCTGTCCGATTTTAAGGTAC TTAAAATCGCTTGGGGAGTTAGAAATTAAGGCGTCTTTTTCCCTATGATT TCTTTCATTGGCTTTGTTTAATACACCAATCGACCATTGCGCCAAATCGT ACATGATGATTGTTATGTTAAGAGTTTTACCAGGCCGTCTAAGATGATAC ATATAATCATTTAATGCGTATTTGGCCCTGTTGAACTTGACCCCTCTAGG GTTGATTGATTTATTTCCATTAAAAGCAGGGTCATAATGTAAGAATGTTG TATTAAAAGGTGTTACTTGGTCTCTGATTCGCTAAACTAGCTAAAAGTAT ATACATATGAAATACACATTTTTAAAAGAAACTCCAATTGTTGAAGATCA GGGCTGTTGCTAAGGATTTTCTGGATTTCAGCCAAAAAGTTGCTTATGGA TTTTGAGAAAAATTGTTTGACTTTTTATCTCATTTAATATCCAGAATACC TCAAATGCCTCTTTTCCAGGTATTTTCGGTTGCTTTCCCG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1082556..1092895-

>XLOC_044784 ID=XLOC_044784|Name=XLOC_044784|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4980bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1082556..1092895- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTGCATCAAATTCATGATAGTTTCACAATAGTTCAAGAATTGGACGTGTA
TCAGGTCATCAAATACTTCTCAGCTTACAAACTACGAAGAACTACAAGTT
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AACTGTGCATCAAATTCATGATAGTTTCACAATAGTTCAAGAATTGGACG
TGTATCAGAGGATAGATGATAAGGAGAACAAACACCACATAAAAATGACT
GAATTGATGAAACTCTTGGAAAATGGCTTTAAAGATAGAGGATAGATGAT
AAGGAGAACAAACACCACATAAAAATGACTGAATTGATGAAACTCTTGGA
AAATGGCTTTAAAGATAGTAACATGAACGTCCAGATGAAAATGTTATCAA
TATTCAAGACAATGTTGCTGATTGATTATGGGATTGTGGAACCGTTTCTT
GGCAAGCTGTGGAGATACTGTCTAACTGAATAACATGAACGTCCAGATGA
AAATGTTATCAATATTCAAGACAATGTTGCTGATTGATTATGGGATTGTG
GAACCGTTTCTTGGCAAGCTGTGGAGATACTGTCTAACTGAAGTTGAAGG
AAGTACGATACAATTTGAACAAAATGCTTTATTGGAAGCTCTCTTGGAAA
ACTTTGCACAGTTAAGAAAGGTTGAAGGAAGTACGATACAATTTGAACAA
AATGCTTTATTGGAAGCTCTCTTGGAAAACTTTGCACAGTTAAGAAAGAT
GGAACTTTTGCTAGATGCTTTTCCGCTAGATACCGGACTGTCCTGTAACT
TTCCCCACGACTTCACTGTAAGATGGAACTTTTGCTAGATGCTTTTCCGC
TAGATACCGGACTGTCCTGTAACTTTCCCCACGACTTCACTGTAAGTTAT
TCAGAAGAGATCTCGAAACTACAAACTTCACAAGTCATTCGATTGTTGAA
AATATTCCAATCAAAGATGGAATCGATCACTGTTAAATCAGTTATTCAGA
AGAGATCTCGAAACTACAAACTTCACAAGTCATTCGATTGTTGAAAATAT
TCCAATCAAAGATGGAATCGATCACTGTTAAATCAGATTCAAATTTTCAC
CAGTTTAGTTATCTGCTGTTTTACCTTTTGGTAACAAACGCTTCAGTGGT
GCCAGAAAACCTCTTCACGAAACCTGAGCTTGAAGAATTCATCCTTATCG
TCACAGAAATCGGTCAACGATTTGTTGAGCTCAGTAAAACTCTTAAATCG
GAGATTCAAATTTTCACCAGTTTAGTTATCTGCTGTTTTACCTTTTGGTA
ACAAACGCTTCAGTGGTGCCAGAAAACCTCTTCACGAAACCTGAGCTTGA
AGAATTCATCCTTATCGTCACAGAAATCGGTCAACGATTTGTTGAGCTCA
GTAAAACTCTTAAATCGGAGGATAGTTTTGGTCATATTTTGCTTTTGATC
ACAATGGGTGTCAACGAATGTTTCATGATCTTAAAAGATCTATCATTGCT
ACCAAATGATGGAGATTGCCAAACTATTGGAAACACTCTCACAGAGCTTT
GTAAAGAGATCAATGGTGCTGATGCAATGATAAAGTACCTTAAGGATAGT
TTTGGTCATATTTTGCTTTTGATCACAATGGGTGTCAACGAATGTTTCAT
GATCTTAAAAGATCTATCATTGCTACCAAATGATGGAGATTGCCAAACTA
TTGGAAACACTCTCACAGAGCTTTGTAAAGAGATCAATGGTGCTGATGCA
ATGATAAAGTACCTTAAGGTATGCCAGGGCTTGACAGAGTTGAGATTCAA
CCAAAGCATATCCAGTAAAGATCAACTTTGTCAAATCAACAAAGAGCTGA
TGAGCAATATCGAGTCTGTATCGTTAAAAGAAGAAAAGATTTCTACATTA
GTTAATAACAAGACAATGTGGTCTGCCATTGCTGGCAAGATGTTGGATCA
TTTTGAATTTTGCTTGATGTTACCTGAAGATAATCGAATAGTTACGGATG
ATGCAATCAAATTACTGTTGACCGTGTTCCGTATGGGTGACGAGTATGCC
AGGGCTTGACAGAGTTGAGATTCAACCAAAGCATATCCAGTAAAGATCAA
CTTTGTCAAATCAACAAAGAGCTGATGAGCAATATCGAGTCTGTATCGTT
AAAAGAAGAAAAGATTTCTACATTAGTTAATAACAAGACAATGTGGTCTG
CCATTGCTGGCAAGATGTTGGATCATTTTGAATTTTGCTTGATGTTACCT
GAAGATAATCGAATAGTTACGGATGATGCAATCAAATTACTGTTGACCGT
GTTCCGTATGGGTGACGAGTCTCCAAAACGAATAACAAAAATCATTGAAA
GTCATACTGTCTACAATTATCCTCTATTCCAATCAAAAAGCGTTGAATTC
TGGGAAGAAACTTTGACGACAACATCAAGCGATGAAATTGCATTGAAAAG
AGACCTGAAGGTCTCCAAAACGAATAACAAAAATCATTGAAAGTCATACT
GTCTACAATTATCCTCTATTCCAATCAAAAAGCGTTGAATTCTGGGAAGA
AACTTTGACGACAACATCAAGCGATGAAATTGCATTGAAAAGAGACCTGA
AGAAAATCTCAAAACTAAAGACGGAATACCTAACAGAAGAAAATTGGTTC
AAATTATTCAATGTTCTTTATGATAAGCGCCCAAGTATTACAAAACATAG
TCAGAAAATCTCAAAACTAAAGACGGAATACCTAACAGAAGAAAATTGGT
TCAAATTATTCAATGTTCTTTATGATAAGCGCCCAAGTATTACAAAACAT
AGTCAGAATAATGAGCTTTCAATAGTTCATACCAAACTGCTGACTCAGAT
GTTTCAAGATGCAGAGACTGCGTGTCATTCCAGTTGTGGAGTACCCTTTT
CAAATGTTTTTGAACACTTGCTGGATACTGGTTCCTCAATAACAAAGAAT
AATGAGCTTTCAATAGTTCATACCAAACTGCTGACTCAGATGTTTCAAGA
TGCAGAGACTGCGTGTCATTCCAGTTGTGGAGTACCCTTTTCAAATGTTT
TTGAACACTTGCTGGATACTGGTTCCTCAATAACAAAGGTATTTTCGGTT
GCTTTCCCGGTATTTTCGGTTGCTTTCCCG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044784XLOC_044784-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000023_pilongenomesc0000023_pilon:1082556..1092895 -
Properties
Property NameValue
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