XLOC_044778 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044778
Unique NameXLOC_044778
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1221102..1234298-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044778 ID=XLOC_044778|Name=XLOC_044778|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13197bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1221102..1234298- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGAAGTTTGCGGTTATTATTTTTGGTTCCAGACTCTATCCTATCACCGC CTTCTCGCTCAGATGAGTTTGGAGAAGGAGGTTCATCAGTCTCTGAAGAA ACAAGGTTAGGTTGTAGAACCGGAAAAGCAGGGGCTTGAACCCTGGTGCT GTTTAGAGAAGTCATGATTATTTCTTTCGATAGCTTTTTGTTTCGAATGC TCCACGCCACTGGATACACCCTAGAGAGAATGACAGTAACAAGTGTCTAA AGAGGTCAATCACCCCATGAGGCATAACATTTTTCCTACCAATGCTTTAC TTTTAACAAATTACATACCGTTGAAAAGATAATTCAGAGCACTATAGTAG ACTTATCGTACATCACTTACACCTAATTTTCTATAGCCTCTGTAGCTGTC AATCTTCACCTCTGTAGCTGATGTCATAATCAGTTTTTGCGAGTTTTTTC GTTTTTTGCGAAAATGAGCGAAAAAACAATTAGGTTCCACATTCAGGCAA CCACCGTAGAACGGTGTCGAGGAAAAAGCCGTGGTCGTCCGGTACAGGCA AAGCACTCTTCATGTTCAGTCAGTTGTTTGGTTATTTTTTGTCGATAAAT GCGATTCTAAAAATTATGGTAATTTTCAGTTTTGGAGACAATTCATAACT TACTCGAGTTTAATATCTGGTTTCCATTTTTTATATTCAGAGAGAAGAAG TTGACAATCTTATACCGCGTGCTGATTGGTGGAAGTGACTTCAACTTTGA CCCAGACCCCAACTATCAACTGACCGTTGATAACATGAAAAAAATGCTTG CTATTTTCACCCGTATCAAGTATGTTTTTTCTCGTTTCGCTAAATAGCGT AAGTTTGTCTAATGCCGATATCCCGCATCTAATTCTGTCACCTTTCTTTG AACCTGGAAATAATAGAAATGTTGGAACCGCTGATCGCTAATTCGTGTTC AGAGAAGAAAACATCATTATTCAATCAGTGATCCCGACCTTTCTTTTAAT CCTATCTCTACCTAAGAAGGATGTCGGAATTACACAAGGGATGTCGACAT TAGACCAAACTTACGGTAGCTTATATAGCAGCTACATTCATTGACTTCAT TTAAATGCCTTTCAAACAACATCAACGAAGTTTTCAGGCCACCAATTAGG TTTCTTAGCTTTTTTTTTTTTTTTCATTAATACTAAGTGTTGCAACTTTT CCATCCATTGACAGGAAGCCGTTAAAATTTCTCGCTGTCAAATCAAACAG TCCAATCAGTCTAAAAAACATATCCCAAAACCCCCGAGGAGGGAGACATT CAGTCAGGTTAACCGACGAATGTGCGGCGGCTAAGAGTATATTTTAAAGA CAGCAGAAATACACTGTAAGGGGTGGACTTTTTGATAAAAAGACTGTGGG TGGGTGTAAATATCAGTAATTTCAGGAAAAAACAAAAATATCTTGCTCAA AGATTTTGACTTTGTTGCTCTAAAAGGGTTGAAATTTTGAGCAAATGCAC TGTAAAGGTATGAGCTTTCACAGACTTTTTGATGCACTGTAAGGGTGCGA TTTAAAATCAAACCCAACTTTTTCGCTGCATATAACTTCAGTTAGCAAAA CCAATGTTCCTAGGCCCTTAAAAACTAACATAATGTTCTCTTTTCTGTTT ATAGGTGTAGCATACCGGTCATTTTAATGGGAGAGACGGGATGTGGAAAA ACGAGTCTAATCACTTTCATGTGTAAAATTCTTGCCAAGTCTAAAGAAGC GTCAAACCTGGTTCTAGTGAAAGTATGTTATGTACTTCCTTTTCTTTGAA TTACAAAAAGATTCGAATTATAGAGGTTCGAATTAGAGAGAGTTGACTGT ATGTATACCTCCTTGTCAAGAGAGCATCTTAGCGAAGAACTACTATTTTG ATCTCATTATAGGCTGCATGCATCCACTCTGATATATAATATATGTTTTG ATTTAGTGGATGCTTATCGTACATAAGATTCCCGTCCGAGAGTTGCTTAC CCACGTCTTAAAGAGCCTTGGAAGACCTGATTAGCAGTTCTCACTGATTA TTTACGAGTTCCTCTTCGTCGTTTTTTCAAAAACTTTCAAATCTTGTACC TTGGCCAGTGTATAATTTTTCTACTTGATCTTAGGATCTTGGTTCAGATA AGCCATATACCTTGTTACCATTCTTGCTTCTCCATGTGTATTTTCGACGA CTTTTTAATACTTTCTCTCTATTTTCCACTCAGATTCACGGAGGAGTAAC CAAACAGCATATTATGCAACACGTTCAAAACGCTAAAAAATTAGCCAAGA AATCTGGTGATAAGAAAACCATATTGTTTTTCGATGAAGCTAACACGACA GATGCTATTGGTCTGATCAAAGAGATTATCATCGACAAGTCTTTGAATGG TGAACTGTTGGGGCTGGAAGAAAATAATATGGTCGTTATTGCTGCATGTA ACCCCTACAGAAGGTATAATGTTTATCACAGTGTGCAAGGGGAGTCCAAG TCATACCAAAAATATGTTATATCAAAACCCCCCTCCTAAAATCAATTACG ATGGTCCCACCAATAAATAGGTGTCCCATCTAGAATTTAAAATTTTTTGA AAAATTAAAAATGGAAAATATAAGTGGTGATCTGCTTCAATTTTACTACA ACACCCTTTAGTCCTACCTCTAAAAATCAGGTCCCATCTAATCCTGCCCC TCCCCTAAAATCCAAAAAATCTGAAAGTTCCCCTGCAGATGTTATGTATA TTATGTAGTGGATTTCCTTATAAACAGTTTTCATAAAAAAGTGACATTAA AGGTTAACTACCGAGCAGATCCTGATCACTCTGCGTACGGCACGCTCTCG 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AAAGTCTGAGTGACAACTGAATGATGATGTGTGATGATGTGGTTTTGAAG TATGATATATAAACAAAAAGCAAAGTGGATAAATACTAAACATAGTTGAC AGAATTGATAAATAAATATAAATTAATTAATTTCTATGCATAAATTATCA TAAATAAACTTGAATTGGGATTTGTATTTGCAGAACAGAAAAACTACTAG AAAAAGGCAAAGTGGACATGCAATAAAATGATGAAAATGTAGATAGATCC TAAGCTGAAAGCTGTGATCAAATTTGAGATATGACTTGATCATTAGAAAT TTTGCAGTCTTGAGAGTCAATTTTGCTCATGCAACAGGAACCATGTTCGA ATAAGGAGATATTCAAGCTTGCGTTGGCATTTCTTTCCCTGGATCTCTTT TCAATTTAATTTACATCTCTTAGTTTAATTTTAATAGCAAATATTGGTGA ATAAACAATTATAATAGACTGGTTACGGATCCGGTAGTATAGGATATAGA TTCAGTGTAGTCTCCATAACTCGGACACGCACGGGGAACACAAATTTGTT TGAGTTAAGGAAATTTCGAGTTATGGAGTATGGTTTATAAGGCATTGTTA ACTGAAGGTACGAGAAAACTTTTCCGAGTTAAGGAGACATTCGAGTTATA GAGGTTCTAGTTATGAAGAATCCACTATACTTTCTAAATGCCAAAGAACA CTTTTCATTCCAGGTCAAATCCCCTTGAGACAGTTGGTCTATCGAGTCCA TCCCTTACCGGAAAGTATGAAGCCGTTAGTTTGGGATTTCGGACAGCTCG ATGACGTCACAGAGGAGCTGTACACACGAGAAATCGTTAACAGCGCT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1221102..1234298-

>XLOC_044778 ID=XLOC_044778|Name=XLOC_044778|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3144bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1221102..1234298- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCTCTCTTCTTCAATGTTGTCATTCTTGGCATGTTGCAAACACCTCTTGG
TAAAGTATGGCACAAAAATCAACAAGATTACGTCATCATTGAAATGACAA
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AGATGTGCCACTCCCCAGGAAACTATCAACTTCTACAAAAATGTCGGTGT
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TTGAAGCTTACGTCGCTGGTGAAGAAATATTGAACCAACTGGCTTATTTT
GTAGCCTCAGAAGAAGCGTTGACGATTCTACAGAAAGTCGCCATGCTCGA
AATGTTTGTTAGATGAAGTGATTTCGCCTACCAAGTATTGTCAATTGAAC
TTGCTATCACTTGAACCTTTCCGAAGGGTGCACACTTACCTTGAAGCTTA
CGTCGCTGGTGAAGAAATATTGAACCAACTGGCTTATTTTGTAGCCTCAG
AAGAAGCGTTGACGATTCTACAGAAAGTCGCCATGCTCGAAATGTTTGTT
AGGAAATGTGGGGTACTGAACCCAACTTGGATGGAAATTCGAAATTTCGT
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CTGTTGAGTGCTCTGAAATGTTCCCTGGATTCAAGAATTTCGTCCTCAAA
TTCTTACTGAGGATGGCTAAGGAAATGTGGGGTACTGAACCCAACTTGGA
TGGAAATTCGAAATTTCGTTTATTTCTTCAACATGCAATTAATGGATTCT
GAGAATTGTATTTACACTTCTGTTGAGTGCTCTGAAATGTTCCCTGGATT
CAAGAATTTCGTCCTCAAATTCTTACTGAGGATGGCTAAGGATTTTTCAA
CACGTTCACTCGGTGACGATGATACCAACAAATTAGAATCAGGTGGATTC
CTTCTCGAACTTAAAACCAAATGGGAACAGAGGATTTTTCAACACGTTCA
CTCGGTGACGATGATACCAACAAATTAGAATCAGGTGGATTCCTTCTCGA
ACTTAAAACCAAATGGGAACAGAGTCACCACCCGTACCTCTTTTTCAACA
AAGACGGAGGTACTTTCACATTCTTCGGTTTGAATATCAACCAAGCAGGC
GATCTGGTCCACAAACGACCTAACGGTTCAAATGAAATTGTCGAACCTCA
ATTGATGAATTCCAAATTGCACGGCATCCTGTCTGAAAACATGAAATTCG
ATATTGTCAATTTCGCATCCGATTACCAGAAATTGCCAAGTCACCACCCG
TACCTCTTTTTCAACAAAGACGGAGGTACTTTCACATTCTTCGGTTTGAA
TATCAACCAAGCAGGCGATCTGGTCCACAAACGACCTAACGGTTCAAATG
AAATTGTCGAACCTCAATTGATGAATTCCAAATTGCACGGCATCCTGTCT
GAAAACATGAAATTCGATATTGTCAATTTCGCATCCGATTACCAGAAATT
GCCAAGAGAGAAGAAGTTGACAATCTTATACCGCGTGCTGATTGGTGGAA
GTGACTTCAACTTTGACCCAGACCCCAACTATCAACTGACCGTTGATAAC
ATGAAAAAAATGCTTGCTATTTTCACCCGTATCAAAGAGAAGAAGTTGAC
AATCTTATACCGCGTGCTGATTGGTGGAAGTGACTTCAACTTTGACCCAG
ACCCCAACTATCAACTGACCGTTGATAACATGAAAAAAATGCTTGCTATT
TTCACCCGTATCAAGTGTAGCATACCGGTCATTTTAATGGGAGAGACGGG
ATGTGGAAAAACGAGTCTAATCACTTTCATGTGTAAAATTCTTGCCAAGT
CTAAAGAAGCGTCAAACCTGGTTCTAGTGAAAGTGTAGCATACCGGTCAT
TTTAATGGGAGAGACGGGATGTGGAAAAACGAGTCTAATCACTTTCATGT
GTAAAATTCTTGCCAAGTCTAAAGAAGCGTCAAACCTGGTTCTAGTGAAA
ATTCACGGAGGAGTAACCAAACAGCATATTATGCAACACGTTCAAAACGC
TAAAAAATTAGCCAAGAAATCTGGTGATAAGAAAACCATATTGTTTTTCG
ATGAAGCTAACACGACAGATGCTATTGGTCTGATCAAAGAGATTATCATC
GACAAGTCTTTGAATGGTGAACTGTTGGGGCTGGAAGAAAATAATATGGT
CGTTATTGCTGCATGTAACCCCTACAGAAGATTCACGGAGGAGTAACCAA
ACAGCATATTATGCAACACGTTCAAAACGCTAAAAAATTAGCCAAGAAAT
CTGGTGATAAGAAAACCATATTGTTTTTCGATGAAGCTAACACGACAGAT
GCTATTGGTCTGATCAAAGAGATTATCATCGACAAGTCTTTGAATGGTGA
ACTGTTGGGGCTGGAAGAAAATAATATGGTCGTTATTGCTGCATGTAACC
CCTACAGAAGACATTCTCAAGATATGATTGAACGTTTGGAATCAGCTGGT
CTTGGATATCATGTTGGTACTGACCAAACCTATGAAAAGATAGACATTCT
CAAGATATGATTGAACGTTTGGAATCAGCTGGTCTTGGATATCATGTTGG
TACTGACCAAACCTATGAAAAGATAGGTCAAATCCCCTTGAGACAGTTGG
TCTATCGAGTCCATCCCTTACCGGAAAGTATGAAGCCGTTAGTTTGGGAT
TTCGGACAGCTCGATGACGTCACAGAGGAGCTGTACACACGAGAAATCGT
TAACAGCGCTGTCAAATCCCCTTGAGACAGTTGGTCTATCGAGTCCATCC
CTTACCGGAAAGTATGAAGCCGTTAGTTTGGGATTTCGGACAGCTCGATG
ACGTCACAGAGGAGCTGTACACACGAGAAATCGTTAACAGCGCT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044778XLOC_044778-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000023_pilongenomesc0000023_pilon:1221102..1234298 -
Properties
Property NameValue
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