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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000081_pilon:132468..139173+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044731 ID=XLOC_044731|Name=XLOC_044731|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6706bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:132468..139173+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgataacgTCATATAATCCATCTGTCTTTTACAACAAAGCTGTTACAGG
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CGCtgcatatatatatatatctgtATCTTTTATGTCGTAGTCACTTCCTT
CTTCTCCatttaaaatttggaaataatttACAGCTGCTTTACTTACAGAA
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TCGCTAAAAGGTTAACTTGTTTATTATCGAGTCCAGTCCCAGAACGTTAT
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AATATTCAAGCGATTCTTGAAATTAGCTTAATGTTTTCATAACCAAAATG
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TGTAGCTACCAACAATGAAAGATACTTTCGGAAAAAACTacacatttctt
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ctgaactttttcgtgggtcacccggtatatgcGGCCGTTTCAATAAATTT
ATGGTCTTAGACCGGTGaacttttttgggttttcattttcttaaaatttc
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AAAAACCCAGTACATCTGGTATCCTTGAAGCTCCCACAAACACTTATGTG
AGTTAGAGCTACCTTATAACACGAAAATAAGGAGACATGTATTTAACACG
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TGTCGTACTTGacgaagaaaaatgaaattatttttaaatacatgattacc
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AGTGATCATGTACATGCTACTTGCTCTTGGATATTTACAGTGCATCTATT
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ATTTAATCTATATGGATGTTAAATTTTTATTACTATCACTATCCATCTAT
GGTTCGTggctttgaattttaatttccGTTTTAGACAATGACGCTAACGC
ATAAGTGTGCATGTCCTGGTGTTTGTGCATCAGATGCTCCTGCAAGTGAC
AGTGGAAAGAATCTTAGCGTGGGAAGTTTGCTCTGTATTCTGTAAGTCTT
TTTATGCCATTGGTAAAATGTCTTAGTGGTGTATCACACTGTTTTTATAA
CATACATCGAAATAGTTTCTGGTTGAGCTGGCTTATTCATGATGATATGC
ACCATTCTAATGTCTTCAACGGACCTCTTCaggtgacgtaaaatcagtca
atacgtcacttacaaccaatcagctattgggtccgtgatgtatgCAACGG
TGCATatcttgaattaaaaaataaaccaaaatcTTCAATTAGGGGTTATC
GAATGATAAATAAAATCAATCTGCCGTCCTCAGCAAGAGCTCCAATTAGT
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TCTACATACGCAAGCTATGGTTGTATTTATCTAGTCATCCCTTTAAAGTA
ATACATCTGAACTGCTTGAAACTGCATTTTCTTCTTGTCCTTAATTTCAC
ATTGTACTTCCCGACCTTGATTTGTGTTAGTGATCGTACGACTTTGAGGG
CAATTTTcggaaacattttttgaaattgccTGAAAGAAAGTGAACTCGGA
ACTTTTTCACTAAATCATATACGATTTCACATTGCAATGTCTACATTTCA
TTTTGATTCAGGTTAGTTGTGTTCGTTATTATTTATCTAATTGGTGGGAT
TTTATTCTTGAAATATTATAAGAAAGAAGAAGGGAGTGACGTCATCCCTC
ATCGAGAATTTTGGACGGATTTTCCATCGAAAGTTAAGGTGAGTTTAAGA
GAATTGACGATGACCTCCATTTTTAATTTGATGACACAGGAATATTAATT
TGATGTGTCTTTGTCCTTCTATTGGTTTATAgatgtttttcatgttttct
taagttacgtaatttccgccattatgaaagcaaTATATAGAGGCAATCCC
TTACGCAAATCAAACGTTTACTttcataatggtggaaattgaTATAATTG
TGTAACTttagaaaacatgaaaaacctctactCCAGAAATAAATATCTAC
CTTCATGTTAAGGTCTTTTTTGCAAGGTCAATTCCACTGGGTTTTCTACA
ATTTGAGATggcattttacaatttttttaaggTACCCCGTTAGATTTTCA
TCTAAATTTCAGAGACCTCTCCTGGAACTTCCCggtttttgaggaaattt
gaCCTCCTCAATTTTAGGGTAAAATTCTTCCTTGGAACAACCCATTCTAA
GTCGGCTTCTTATTGTAGGATTATGCTAACTTTACTTCACTTTTTTATCA
AGCAATTCTTACTTCTGCGATGGAATCATGAATTAGTCTACCACGTTAAT
ATTGTTCATAAATTTAGCTTGTTTTTGTCCGTTGAATTTTCGGTTAGGTG
GAATTTAATAAACACTTTTGATCATTTAATTCAATTTGTTTTTCAGGATG
GTTTCAAATTTACCGTCAGTAAAGTTCGCAAGAAGGACGAATACGAATCC
ATTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081_pilon:132468..139173+ >XLOC_044731 ID=XLOC_044731|Name=XLOC_044731|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1674bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081_pilon:132468..139173+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgataacgTCATATAATCCATCTGTCTTTTACAACAAAGCTGTTACAGa
tgataacgTCATATAATCCATCTGTCTTTTACAACAAAGCTGTTACAGAA
AATACTACAATGATTTATATACAAAAGGCTTTCACGTTGCTTGCCTTGAT
ACACAACTTTGGATCTTTGACTTATGGGGCAAAAATTTGTAAACCAGTGG
ATCAGTGTTCATGTAATTTGGAAGGAGAAGGAGAGGTTTCTTTACATGCT
ATTGATCAACGCAATTCACCACTAAAATACTACAATGATTTATATACAAA
AGGCTTTCACGTTGCTTGCCTTGATACACAACTTTGGATCTTTGACTTAT
GGGGCAAAAATTTGTAAACCAGTGGATCAGTGTTCATGTAATTTGGAAGG
AGAAGGAGAGGTTTCTTTACATGCTATTGATCAACGCAATTCACCACTGT
TTCCAGATATTCCTCAAAGTTCAGGGTCCACATTTTTAATCAGTTACAAT
CCTTGCACCACATTCACCAAAGAAGATAATTGTAATAATGTCTTGGTTTC
CAGATATTCCTCAAAGTTCAGGGTCCACATTTTTAATCAGTTACAATCCT
TGCACCACATTCACCAAAGAAGATAATTGTAATAATGTCTTGGCTTGTCA
ATATGCATCAGGTGACCCAACACAAACTTTCCCATTGGCAAAACCAGCTA
CACGTGTCTTCACATACGATGAAACCAACCAACAAGTTGTTTTTACTTAT
ACTGCTACCTCAAGTGACCTCGCTAAAAGGCTTGTCAATATGCATCAGGT
GACCCAACACAAACTTTCCCATTGGCAAAACCAGCTACACGTGTCTTCAC
ATACGATGAAACCAACCAACAAGTTGTTTTTACTTATACTGCTACCTCAA
GTGACCTCGCTAAAAGGACGTTTAATGTTGGTTTGAAATGTGACAAAACT
GTGGAAAAACCCAGTACATCTGGTATCCTTGAAGCTCCCACAAACACTTA
TGACGTTTAATGTTGGTTTGAAATGTGACAAAACTGTGGAAAAACCCAGT
ACATCTGGTATCCTTGAAGCTCCCACAAACACTTATACAATGACGCTAAC
GCATAAGTGTGCATGTCCTGGTGTTTGTGCATCAGATGCTCCTGCAAGTG
ACAGTGGAAAGAATCTTAGCGTGGGAAGTTTGCTCTGTATTCTACAATGA
CGCTAACGCATAAGTGTGCATGTCCTGGTGTTTGTGCATCAGATGCTCCT
GCAAGTGACAGTGGAAAGAATCTTAGCGTGGGAAGTTTGCTCTGTATTCT
GTTAGTTGTGTTCGTTATTATTTATCTAATTGGTGGGATTTTATTCTTGA
AATATTATAAGAAAGAAGAAGGGAGTGACGTCATCCCTCATCGAGAATTT
TGGACGGATTTTCCATCGAAAGTTAAGGTTAGTTGTGTTCGTTATTATTT
ATCTAATTGGTGGGATTTTATTCTTGAAATATTATAAGAAAGAAGAAGGG
AGTGACGTCATCCCTCATCGAGAATTTTGGACGGATTTTCCATCGAAAGT
TAAGGATGGTTTCAAATTTACCGTCAGTAAAGTTCGCAAGAAGGACGAAT
ACGAATCCATTTAAGATGGTTTCAAATTTACCGTCAGTAAAGTTCGCAAG
AAGGACGAATACGAATCCATTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000081_pilon | genome | sc0000081_pilon:132468..139173 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 778-837:6647 |
| Aaloc | 652-777:5863 |
| Aaloc | 544-648:5135 |
| Aaloc | 460-543:4664 |
| Aaloc | 322-456:3074 |
| Aaloc | 226-321:2431 |
| Aaloc | 52-222:1447 |
| Aaloc | 1-48:1 |
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