XLOC_044524 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044524
Unique NameXLOC_044524
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000160_pilon:280339..290984-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044524 ID=XLOC_044524|Name=XLOC_044524|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10646bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000160_pilon:280339..290984- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCATAATTAGCGTGTTGTGACAAAATTCTCTTGTCTCAAGCCTGATTATC TGCAAACTTTTAGGGCTTATATTTTGGGTACACCTCTCCTATACGAAAAG GTACTTATATCTTCTTGCTCAGAATGTCTTAGCAATTCTACTGATATAAC GGCATCATGACCGCACCATGATATGGAAAGCTAGAGCTCGAGGAAATTAT AACTTCATCTTGGTTTTACTCGATTTCTGACAGCTTTACAAGAATAAAAA TAAGAATTGCTCCTTATTCCTAAAAATTGAACTAGTAATCGGCGAAAAAG GAAAAACAAATTTTCATTTTTATTGTCAAATCATGTAGAAACCGTCCGAT GTGTATGGCGAGCCTTCCTTTCTGGACTTTTATTAAATGACCTAATCAAC GTTTTTACAATATAATTTTCAATAGAAGTGATCGTTGAACTTTGAGTAAT CAGAAAAGCTGTTTTTCCATCTCTTTACATTCCACTGGTAACACTACCTT CAAGTAGAAGAAAACTTTGTTCTTTGGTAATTTGGGCACAATACACAGGT TGCAAAATTAAAGTCTGAAGACAAATCACACTTTTGCTTGAAATTGTTAT GTGCTTGTACATGACATTTATTTCTGATTGTTTCGAATTTGTTGACACTA ATAAAGTTATCAGCTGTAAGTTGTAAAGCAAGTAACATGGGAATTAAATC ACGTGAACTTTTTCGAGTAATCACATGCTTTGACTGCATTGATATAATTT TCCAACCCGTGTATTCAAATTTGCGTATTCCTCAATATGAAGGTCAAAAA TTAGTGGTCGCTTGCGCGCGTCTGATTTTTCCAAAAACTAATAAGTTATA TTTCAAATTTTTCCTGAGAGTATCTCAGTAGTGCTATTATTACTGTACCA CTTTCAAAAAAATTCTGATCAAAGATTTTGCTTAGCTAGGATTGAGAAAC TTGGTCCAGGGTATACAAAGGTCATTGCTTAGACCACTTGTCCATCGTTC ACCATGTTACAGGAATTTTATTGTTTTCATATTTACCATCAGGTGCTGGT CATTCGTTGGTTGTCAAGGAGGACCGCAAGATATCAGCATTGGTAACGGA TGTGGATATAGAGGAACTGTCATTCATCAAATCATGCACGCCCTGGGTTT CCTACATGAAAATACTAGAACAGACCGTACGTTTTTAGTGTTTACCTTTT AAATTTGATATAAAGAAATTTAGTTATTTTGCTCTAGTGTAAAAGTGGAG CATTTGGCTACGGTGTGCGAGGTTGTTGGTTCTATTCCCTGGCTCGGGTC ATATAAAAAACTTCGTACTTATTACAAAAATGGTACTTGATTCTTCTCTA TTGAGTATTGAGTACTTAGTAATTAAGAGAAGGGTCACGCGAGAAAGAGT AACGCCCTCCCCTAGCTTAAGGTAGATAGCTATCGAAATATGAACCTTTG TGTCGCTTCCGACTGCGGTGGCAGATTTACTACTAAAATAGCTTATTCAG GATTTCGAGGTACTGCGAAAATAGGGTTCGGCGCGTAACAAGTTTTGAAA AGGTATTCAACGATTACTGTTCCTTGAATATAGAAAGTCAAAATTTAAGA GATGTGATTGGTGCGATTGATGATTTTTCGTATAACCTTATCGAAGATCC AGGTGATCCAGGTGAAGAAAAGGTCAATGCATTTTTATTTGTATATAATT TAAGACTGATAAACATAATTTCTTCATGTTACAGGGGAAAATTATTTGAC AATCGATAGTAACAATATCGAAGAGGGATTTGCACATGATTTTGAAAAAT ATGAAAACCGAATGATTTATATGAATGGTGTACCGGCGAATTGTGATTTA ACTCAATCACAAAATCCTGGAATCCAAAATGCACAATTGTTGAAATTCAA 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CTACTCTTCTACAAAAAGTCACTTTTTTGGACAAAGTACAGACCTTGAAA CTTAGCACGATTGTAGGTGCTTCTTATTACTTTCAGATGCTTTTTACATA ATCTGAAAATTGTAAGTGGTCTTTAATTTATAACAAGTTGAATTGACCTC ACTCTCAAAACGTACGCGGTACGTCGTTCGGCCTGTATACCTTATCGGGG AAAACTTCGTCGGGGAAAATTTTCGTCGGTGAAAATTTTCGTCGGGGAAA AATTCGTCACTTGCTGGTAATTGGTAAACGCATTAAGGCCAGGGAAAATT TTCGTCGGGGAAAATATTCGTCACTTGTCCAAAATTTCTTCACTTTTCCC CGACGAAGTTTTCCCCGACGAAGTTTTCCCCGATAAGGTATATGACGTAC GCAGTACGTCGTTCGGCTTCTAAAGGTTAAGGTCCAAAAAAGGCACCCTT ACGGCATATAACCGTACCCTTCACTTGCCTAATCAACCCCCCCCCGGACC TGAATGTTTCCTTAGAAAGCACTTTGTGAAATATCACGAGTATAAATATT TTCTTCATTTGTTTCCCAAACAGATATGACTATTTCAGTATCACACATTT GGGTTGTCATGCGTTTAGTACAACATCAGAGTTGAAGACAATGCAAGCGA AGGATGATGAAGTAGATGACAACGATCTTGGTCAACGAAATGGATTCTCA CATTCTGATATTCAACGTTTAAAAGCTGCTTATGTATGATTTCATCTTTT TCTTAGAAGTCCAGTAAATTTTGGTTGAGACTACACGCTTTTTTTAAAAT AAGAATTGTGTTTTTCCAATTCATCATGAATATTCTTAATTTTTTGGGAA AAGTCATCCGGAAAAATTCTTAAGGGCTACATACACTACACAATATATTG TCAGGCAATATATTGATGATATATTGCTGAATGTCGACAATATATTCTAA GTAGCTCTTTAGACTACACGATATATTGACGAACAATATTCGACAATATG GTTTGCGGACCGTAATGTACGAAGTAAACAACTGGTACTCTATTATAAAA AGGAATTTTCTTTCTGTAAACAATCCCCCTTTATTGTTGGAATATTGCAA ATCGAGCTGACAATATATTGCGGACACCTTTTCAATATATTGTCGACATT CAGCAATATATCATCAATATATTGCCTGACAATATATTGTGTAGTGTATG TAGCCCTTAAGTAGCCCTTTACGGTATTCTTAGATTTGGATCCAAACCCA GCCAAAATCAAGCATGTAATACATACATCAGGGAAAGGTTTGGCATTTTT GTTGAACCTTTTAACCTTATTGGGGAATAATTGGCAATTTAAAGATAAAA TGCTCTTAAAATGGTATTCTTAGGTTCAGTTGCCAAATTTCATAATGGTG ATATTCTTACCATATTCTTAATCTTGATTTTGTGGCAAATTTCATCATAA ACATTCTTATAAAGTTATTCTTATTGTACTCAACTGTTCTTTTTTCTTCT TCTTGATTTTCAGGATTAAATATTCTTGAAATGTTCTTAATATGTTTCCC GTATTTACTTATTGATTTAAAAAGGGTTTAAAATTCTTTTTCTTAACCAT TTCTGAAATTTTGAGACTGGGATTTCTGTTAATTGTACAAAGTTGAGCCT GATGTTCTTATAAAAAAAGTGTGTAGATATAATCATGGTTCTTATTTTGA CCGATGAACGGCAAATTTAGTCGGTGTAAACACAAATGAAGCACATTGTA TTTGAGTGATTGAAAATGTGACCAAAGAAATTGATGTAATGTGTGATTTA AAAATGATATGCATGTAATTTTAGACTACGACCCTGGACATAAATCTTTA ACCCTATTAGCCCCAGGGGGGGGGTAGAATCTACCACGCTGGAGTTCTTT TGTGAATATCTCTGAGAGAAATTTTTTAAACGACTTTTAACAAAATCTTA TTAAGAGTACTTGTGCAAAATTTTAGGATCATAGGTTGTTCAGATCAGGT TTTATGACTTTATTGTGAAACATGACATAAAACCCAGCTAAAATCGCTTA AAACTCAAAATTTTAAAGCAGCAATTATGTTAAAGAACAACCTTTTATCT TTCTGAATCTTTAAACAGAATCTAAATATCTTTATTGGTTTGACTGTAAT AGACATTTTTGTAAACCATATATTTGGGCTTTTTTCCGACAGGTGGAAAT TTTGTGATGGCGTCATCGGTTTTTGAATGATGTCAACAATTTTTTTTTCT TCCTGGAAATTTGTGTCATGATGGAGAACACCTGTACCAAATTTCAAGAC CATAACTCTTCTATATCAAAAATAATCGAGGGTGGTAGATTCTATCCCCC CCTGGGGATATCAAAGTCAAAAAAGCTTGGGGCCAATAGGGTTAATCCTT TTTAATAATTTGAATAACTTCTCTTCTCATAACTATTAAGGTTCATAAAC TGATTGGTTCTGTTTTAACATTGAAGGCCGTTGAATGGGGGTCAATTACT AATAAAATTCTACATAAGAAAAATGTTTCAATTAATCTTTTACGTTCTAA TATCCATATAAATTTTATTGTTAAATTTTCAGGGTGAATTAGCAAAATTG AATAACGCCAATGATAATGTCAATGATATCACAGTCAGCACCAACGGGAT CAACTTAAAACCAACCGAACCTCTAACAAAACTATTGGACAATCTTAATC CAAATCCATTGAGGAAGCCAGATCCAATTGCCACCGAACCTCTAACAAAA CCACTGGACAATCTTAATCCAAACCCATTGAGGAAGCCAGATCCATTGGC AACCGAACCTCTAACAAAACCACTGGACAATCTTAATCCGAACCCATTGA 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GATCTCATTACATGCAATTGTAAGCGATCTACCGTTTAACAGTTTATTGT TGACATTTCTACTTCATTTTTGCAATGTTCACTCTCTAGTTCTCAGTTAA ATATGCTTGTAGAGGTGTATGACTGGAGTTTTTCCAATATTATCTTAGTC TAGAGCTAGACTACTAATTAACATCAGTTTTACTCAAAAGCTTTTACAGT GGTAGAAACTTCTATCGAGAAGTTTGTTTACTTTTCGAGAAATTTGTCCA GACCACTATTCCAACTTCCCGTACGGCGGCTGTTTTTCTTCTTTTTGACT TTGAGGCAGGATTGCTCCTACGTTTTGTGTTAAAAGAATAGTGGTCTGAA AATCGAGACTAATATTATCTGAATTCTCCGTAGATCAACCATACTTTGTT CTTCTTTGTAAAGTACTCGCTTCATCTTTGACTCTGTTGTTATTATTGAA ATCGTTTCAGCCTATCCATGTTGGCCAGATGATTTTGTATGGTCAGATGA CGGTTTACCACCAAACTGCAACTGTGGTCCCAAATCAAAGAATCCTAATA CCAATCCAGTTTGTCGTTGCAATTGTATTAAAATGCATTCAGACAAAAGC GATAGTAGCTGGAATAATAATCTACTTTGCTTCAGAGATACAAAGTTGAA TCCAAGGTTGATCCTGTCAACAAATCGTAAGTAAATTTCTTTTTCATTAT TCATGGCGTATTGAGGAACGCCCAGTGGTGGGTTTGTGAGAGGTTAAAAG ATGGAGAGTGATAATCTCCTTGTAAGGGGCTTGGCTAAAAGAAACTCTTT CCGTTAATTTTGAACCCCCCCCCCCTTAGATCTACCACTTACACAAACTA ATATTTCTACCTACATATACATGAGCATTTTCTACTGCTTCTTCAAAACT TCAAATGCTCATTTTTTCATTCATATACTTTCTCTCCTAGCACACTTACC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000160_pilon:280339..290984-

>XLOC_044524 ID=XLOC_044524|Name=XLOC_044524|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4998bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000160_pilon:280339..290984- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTTTGGTGTTTTTGATAATGATGATAAAATCAAACCACAAATTTATGGTT
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TTTATGGTTCTGTTACCGATAAATTCACAGCCACTTGGAGCATCAACAAG
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CATTCGTTGGTTGTCAAGGAGGACCGCAAGATATCAGCATTGGTAACGGA
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ATGACTATTTCAGTATCACACATTTGGGTTGTCATGCGTTTAGTACAACA
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TCTTGGTCAACGAAATGGATTCTCACATTCTGATATTCAACGTTTAAAAG
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ATGACAACGATCTTGGTCAACGAAATGGATTCTCACATTCTGATATTCAA
CGTTTAAAAGCTGCTTATGGTGAATTAGCAAAATTGAATAACGCCAATGA
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GTGAATTAGCAAAATTGAATAACGCCAATGATAATGTCAATGATATCACA
GTCAGCACCAACGGGATCAACTTAAAACCAACCGAACCTCTAACAAAACT
ATTGGACAATCTTAATCCAAATCCATTGAGGAAGCCAGATCCATTGGCAA
CCGAACCTCTAACAAAACCACTGGACAATCTTAATCCGAACCCATTGAAA
AAGCCAGATCCATTAGCAAACGAACCTCTAACAAAGCCATTAGACAATCT
TAATCCAAATCAGCTGATGAAGCCAGATCCGATAGCCACCAACCCATTGA
ACCAACACATTAACAATTTACCTAACAATGTAAACCATCCTTTATTGAAA
CCATCAAACTCTGGTGCTTTAGAAGAGAATCTGCAACCTTTACATGATCC
AGATCCATTGCCGAACCCTTCATTTCAAGACACCACAAACGCACATCTAA
ATCTGCAACATCCGTTAACAAAAGCTGCAAACGCTAACAATTTACAACAA
CAGCCCAGTCATACTTTACCACATTTAAACAATCCAGAAATGCAGCCCAC
AAATCCTCTAAATCCAACTCAACCAATAAACCGTCCACTAATAGACGAAC
AACCATTAGATTTAATGAAGCCACACGATTCTTCCATTCCTGGCAATCCT
GGACCAGGTCTTCATAACAATGTTGGAGGAATGGCTGGTGTAGATGGAAT
AGGACCCAATGGTCTACCAGTAGGTCCTGGTATTAATCCTTTAGAGAAGC
CATCCTTACCATTACCAGTAGATATGCCGACTCCACACTCGCCTCAAACC
CTTGATTCCGAATTAAACCTATTAGACAGGCTTTCGCCTGATGCGAGGCT
AGCTCAAGAAAGACTTTCACAAGACAGGCTAGCAGCGCCTCTAAATGCAT
TTAATAGACTTGGATCTCAGGGTCTACCGGTGCAGCTTATAACAACTCCT
TTACCACCAACGGCTTTAACACCAACAGTATTACAACATGTAGTTATGAG
AGGAGAATACATTCCATGCAGCAAATGTCCACCAAAGAGAGGTGACTTAT
GCACTTGTCCAAGCAAACCTAGAGATGTTAAAACCTCACAACTGCTATCA
AAACTTGTTCCCGGACGGCACAACTCTGGTCAACTACAGTCGTCTGCTGA
TCTCATTACATGCAATTGAAGCCAGATCCATTGGCAACCGAACCTCTAAC
AAAACCACTGGACAATCTTAATCCGAACCCATTGAAAAAGCCAGATCCAT
TAGCAAACGAACCTCTAACAAAGCCATTAGACAATCTTAATCCAAATCAG
CTGATGAAGCCAGATCCGATAGCCACCAACCCATTGAACCAACACATTAA
CAATTTACCTAACAATGTAAACCATCCTTTATTGAAACCATCAAACTCTG
GTGCTTTAGAAGAGAATCTGCAACCTTTACATGATCCAGATCCATTGCCG
AACCCTTCATTTCAAGACACCACAAACGCACATCTAAATCTGCAACATCC
GTTAACAAAAGCTGCAAACGCTAACAATTTACAACAACAGCCCAGTCATA
CTTTACCACATTTAAACAATCCAGAAATGCAGCCCACAAATCCTCTAAAT
CCAACTCAACCAATAAACCGTCCACTAATAGACGAACAACCATTAGATTT
AATGAAGCCACACGATTCTTCCATTCCTGGCAATCCTGGACCAGGTCTTC
ATAACAATGTTGGAGGAATGGCTGGTGTAGATGGAATAGGACCCAATGGT
CTACCAGTAGGTCCTGGTATTAATCCTTTAGAGAAGCCATCCTTACCATT
ACCAGTAGATATGCCGACTCCACACTCGCCTCAAACCCTTGATTCCGAAT
TAAACCTATTAGACAGGCTTTCGCCTGATGCGAGGCTAGCTCAAGAAAGA
CTTTCACAAGACAGGCTAGCAGCGCCTCTAAATGCATTTAATAGACTTGG
ATCTCAGGGTCTACCGGTGCAGCTTATAACAACTCCTTTACCACCAACGG
CTTTAACACCAACAGTATTACAACATGTAGTTATGAGAGGAGAATACATT
CCATGCAGCAAATGTCCACCAAAGAGAGGTGACTTATGCACTTGTCCAAG
CAAACCTAGAGATGTTAAAACCTCACAACTGCTATCAAAACTTGTTCCCG
GACGGCACAACTCTGGTCAACTACAGTCGTCTGCTGATCTCATTACATGC
AATTCCTATCCATGTTGGCCAGATGATTTTGTATGGTCAGATGACGGTTT
ACCACCAAACTGCAACTGTGGTCCCAAATCAAAGAATCCTAATACCAATC
CAGTTTGTCGTTGCAATTGTATTAAAATGCATTCAGACAAAAGCGATAGT
AGCTGGAATAATAATCTACTTTGCTTCAGAGATACAAAGTTGAATCCAAG
GTTGATCCTGTCAACAAATCCCTATCCATGTTGGCCAGATGATTTTGTAT
GGTCAGATGACGGTTTACCACCAAACTGCAACTGTGGTCCCAAATCAAAG
AATCCTAATACCAATCCAGTTTGTCGTTGCAATTGTATTAAAATGCATTC
AGACAAAAGCGATAGTAGCTGGAATAATAATCTACTTTGCTTCAGAGATA
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CGCAAATGTTTACGTTTCCCACAATCGAATGTCGGTTGGAAAGATACTTT
CCTTTGCATGGATTCAAATGTTCCTTATCATTTGTTTTGGTCGAGAAATA
ATGATGATATGGCAGATAAAAATCAATGTCTGTTGATTTCAGAGCCTGAT
GATAAACAATGGAACAAAATGTATTTATGTAATGCACTGTAGCACACTTA
CCGCAACGCAAATGTTTACGTTTCCCACAATCGAATGTCGGTTGGAAAGA
TACTTTCCTTTGCATGGATTCAAATGTTCCTTATCATTTGTTTTGGTCGA
GAAATAATGATGATATGGCAGATAAAAATCAATGTCTGTTGATTTCAGAG
CCTGATGATAAACAATGGAACAAAATGTATTTATGTAATGCACTGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044524XLOC_044524-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000160_pilongenomesc0000160_pilon:280339..290984 -
Properties
Property NameValue
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