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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000160_pilon:360729..368454- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044523 ID=XLOC_044523|Name=XLOC_044523|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7726bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000160_pilon:360729..368454- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGGTTCAGCTTTGAAAAGATTGATGGCTGAGTACAGGCGTAAGTA
ATTTTTGGCAGTTTTTGAACTTTCAGTGGTTTTGAGCCAGCTCTGTTTCT
GAAATTCTTATGTGTTATTTTTTATACTTAAAGGATACCACTCCATGTGA
TTGTCAGGCAAAATAGGATGTGATTGTCATGCAAAATAGGCTACGTGCTT
TTTTATTTCCAGTATTTTATTAATTACTCATGTATACAATTTTTACCTGG
TGTCTTTTAGAGCTGTTGTCAAATCCACCAGAAGGCATTCTTGCAGGTTG
ATTCACCTTTATTTATTATTTGTGTTAACTTGTTGGGCATTACAAGAAAT
AGTCCGTGCCCCCCCCCCCCCCCTTGTTGAGGATATTGGACATCCAGGTG
GTAGGATCTTATAAGAGATTGAGTATATCCAGGGGGTACAGAACATAATG
TGCCTGGATATCCGTTGGGTACAGGGTGAAAAGCCCTGAATATCCGGGGA
GTATAGGTCAAAATGCACAGATATCCTCAACCCTTATGTCCGCTTTTTCA
GGTCAGATATCCAAGGGGGTATTTATTTTTAAGTTGGACATACACGGGGC
TGGAAAGGCCCAATGCAAGTTTTATATTATAATATTTTTCTGAAAGTAAT
GAACCAACGATTATAAATTTCATATATTCTTTGAAAATCATAATCAGGTT
AAAACAAAATAAAAACCACATTAAAAACTAGAAATGTTGAGCTAAAATGT
ACTGAAAATTAACTTTTTTATCACAATATATCAATAAGATTCAACAGTTT
TATAAGTGTTCTGCAATATATATCCCTCCATTTTCACAGGACCTTCAAAT
GAAGAAAACTTTTTTGAATGGGAAGCACTGATTGCGTAAGTACACTTCTC
GTTGCTTTTTTTATGTCAGAAGCCATCGCTTCATTTTAGCACTATTTTGT
AGAAGGTAATATCTAAATTTAGTTTTAAAAGTCACATGCAAAATGGAAAT
AGTTCTAGTAAAGATGAAATGCAAATGCTATGATCAACCATCCCATCCTT
TGATAGGCATAATACCTATGCTGCACTGCAGGAAAACCTGGATCTCTCAT
AAAAAGTGAGATCCGCCAGTGAGATCCATGTCCATTCCAATAACCATGTT
GCTTTTCTAGTTTCTTTTGCGAAAAATACTCTCACTCGTAAATTCATCTA
TTATCCAAAATCAATCTTTTCCTTGTTTCATTTTTTTTCAGTGGGCCAGA
AGATACACCTTTTGATGGCGGTGTATTTCAAGCTAAGTTGAGTTTTCCAC
ATGATTATCCATTGAGTCCACCAAAAATGAAGTTCACCAGTGATGTTTTT
CATCCTAACAGTAAGTCCATTGTGATATTGAAAAAGAAATCTCCTCGCTT
TAAGCCTCTAAAAATCTAAAAATGATTTGGAGTGGCTGGGAATGTGAAAA
TGAAAGATTCAGTCAGGCATTCTTCTGTAACAATTTAAATTTTTTTGCTC
AAACTTTGTGAGGTAACTCCACATGACATGTATTTTTGGGGCAGAGGGTA
AATTTTTTTCCACTTACAGACTGGCCCAAAATTGCCCTTTTTTTCCTAAA
CTAAGGCTACTACATCTATTGATTGGGAAATGCAATTGACTTGAAATTTT
GGCAAGTGTTAGGTGTTAATAATACAAGCTTACAGCTAAAGTTTCAGTAA
AATCAGACGAGTGGTTATGCTGAAAGTGAGCATTTAAGGTAAAAATGGAC
CGATCTATAAAATACCAACCGCAAATTTTGTACACTGTCTTAGATGGTCA
ATATCCATCACTGGTGAAAATCTTAAGTCAAAGGCATCATTAGTTCCTGA
GTTCCGGCAGGTGGTACACGTGTTTTACAGACCGGTCTGCAAAACCAAAT
ACTCATGAGAACGGTCTTATTCAACAAATAAGCTTTAGGAACAAATTTCA
GTCAAATTGAATGAGTCAATCAGTCAATACATGATTTTGGTCAAGGTTAC
ATCCTAGCCTTTAAAATATCAACCAAAATCTTTCAAATCATTTAATTATC
CATATTTACCACTGGTCAGAATTTCAAGGTCAAAGCACCTGTCAATTTTG
AGATTTTAAAAGATGCTTCCCCTAGTAGAAAAATAGGAAAGATGTATGGT
GGCCCATAAGTGCCAAGTAATTTTTTATTGAAAAACTCAGAAAAATATTT
TTTTTACAAATGAAAATAACTTTCATTTTACAATTTAAATTAACTTTCAT
TTCAAAATCAATGTAAAAGTAATTTCGTTTTCAAAATGACTTTAAAAACA
ACTTAAAATACGACCCAGCAAGGCCACACAAATGTTTTAAATTTTGTTTT
AATTCTCATTTACTTTTCGATATCATTTTAAAAAGCATTTTGTTTTTTTA
TTTTTAAAATCACTTTTCTCACGTAGCCCATCAGTGCCAACGACAGCTTT
GTCTCCAGACCCCTACAGGCTTAAAAGATTGAAGTTACTATGGTTACTTA
TTGGTTTGTTTACAGTTCACGGCCCATCAAGGCCAAAACAACTTAGTGCT
TAGACCCCAAACATATTTACAAATGTGTAGGAGAGTATAAAATGATATCC
TTTACTCCAGTGTTCTATGGTACCATAAATGAGAGATTTTTTCTCCGTCA
CATTGCTTTTCCTTTCTATTGTTCTTTGTTTGGCTGGTGGGTTGAATTGT
CTTGAAAAATTTACTTCTTTTTGCAGACAAAATTATTCATCAAACAATGG
GGAACATGAAGAGCCTTTGTTTTGATGTGTAAATAAAGAGTCGAATTTTT
TCTTAATATGCAGCATGCGAGCATGAAAGGAAAAATGTTGAGAAGAGAGG
AAATACACTTTTTTTATATAAGAACAATTTAAGAACAGTGGAGAGGCTGA
AGTTAGAGAGTTATAGCAAAAAGAATCCCTGGTTGCCCTGGTTTCTAAAA
AGCCAAAACTTGTTTTTTACGTTGGAAAAAATAAGAACAAAATAAGAACA
ATTCAAGGCTCAAAGTGCCAAAAAATTAAGAACAGCCGAGTCTCAGCAAA
AATTTACTGGTTCTTATAAAAAAAAGAGTGTAATAAGAGGGAAGTTTTAT
TTACTTCTAACCCCTTTCATGTTGCCGCCATATGCTTTAATATTTTTGGC
TCCCCAATGTGACCCCCCCCCCTAAAACAAACAACTGGTTCGTTCTATTA
TCAAAAGAAACTTTATCTGTTGAAATTTACGGTTTGTGTAATTTACGATG
CACGATCCAACGATTCACGATGCGCGATGCACGATCCATGCATATATTAT
GTTAATTATTCTAATTATGCATTTATAGGTTTTAGTAATCACATATTTTA
ATTCCTTCTTTTGTATTCCTGGAGAATCAATGTAAAGTATGCGTGTATAA
ATTTTAACCTCAACAATCAAATCAAATCAAAACATGCCCATGCTTTGAAT
TGAATATCTTGTAACCTTCTTGCTTTCTTTCTTAAAAAAAAAACATTTCT
CCGATTAAACCAACCAAATGCATTGGATTGAGACAGGGTTATAAACAAAA
AATAGTAGGGGAAGACGTTTAGCGCGTGTATAAACTCACCTTTTTTGAGA
AAGATCAAATAAAATGAATTAACTTGATCATCAAACAGAGAAAAAATCAA
ATAGATAAAAACACCAGTTGCCATTCTGTTGGTAAAAGGCTTTTATAAGA
ACATGCCAAAAGTAATGTAGCCAATGATTCCTTATTTACCTTATTCACTG
TTCTTAAAAAATAATAAACGTACAAAAATGAGTTTTCTTTTAAGGGAGTT
TCTAAACGTCGACCAGAAATGGCGACCACGACCAGCGACCACGACCGGCG
ACCAGATAAATTTGGGTTATCGAGTTTACCTGCTCTCTCCACCGTCGAGA
ACGTCCAAATCGAGTCCTGATGTGGCTTTCAAATGAATCACTGAGCATGT
GGCTGAGAATTACTCTATAGCTAGAGAATACTAAAAGTGACTTTTGACGT
TACCAGTCATTTTCTAGACAAAGTGACACTTTTTGACAAAAATATTGATA
GGGTAATTAAGTGTGATGCCTGTAAACTTTATTACACCAAATATTTTAAT
TGTACCGAATGAGATGCCTTTAGTATGAATGGATAGAAATTGTCAGTAGG
AGAAAGATGGGAAGGCCAGTTTTAGAGATATCAATCTCATCAATTATTCT
ATTGTCCTTACATTTACATTGTCAAAATGACTTATTTTGACAAAATAATG
ATCTGATGATCAAATATAAAGCTTCCTAAATAAATTCCAGCACAAATTTT
GTCACTAACCAATTTGATGCCGAAAATACAAAAGGATACAAATTGACACT
ATATTCAAGATCCAAGAGCGTTGAAATGGCTACTCTACACGTTTTGCACG
TGGCTTTATAATCACTACATGTGAGACAGGGGTGAGCTTTACTCTTCAAG
CCATAAATAAATGATCATAAGAGAGACTCTACGGTGGAGAAAGAGGAAAA
ACTCGATAACCCAAATTTATCTGGTCGCCGGTCGTGGTCGCTGGTCGTGG
TCGCCATTTCTGGTCGATGTTTAGAAACTCCCTTCTTTTAATAAATTTTT
CGCGCCAAAACTTTTCTATGACGTCAAGGCTTTTTCTTTCATTTTAAAAA
CAAACTCTCGCTATCAATTTTTGGTTTTTCTAAACAGAAGATATAAGTTA
TTTTAATCATTCTGATTATGATAAATTATTTACCCTTCTTTTTTTAATTT
TTTTTCGTTATTGTTATATGATGTTTGTAGCTAGCATTATGAAAACTTAT
TTGTGCATAATTAGAATAATTAACATAAATCAACATAAATCATGCATGGA
TCGTGCATCGTGCATCGTGAATCGTTGGATCGCGCATCGTAAATTACACA
AACCGTGAAATTTACTCATTTCTATGAGTGGCCTCAATGGGCTGTCAGAT
CAATTCATTTAAAAAAAATTAGAATTGATTTTAAAATGACATGGCCTCGA
TGGGCTGAGTTGGAAATCGTTTTTGAAAACAAACCCGTTTTTAATTTGAA
ACGAAAATAGAAAGTAAATCAATTTTGAAAACAAAATTTAGTTCAAAACT
TAAATTAAAAGCTATTGCAAAAATGAATGTGAAAAGTAAATTGTTTTGAT
TTTTTTTATAGAAATGTCAAAACAATTTAACTTGGCCCTCATGGGCCACC
ATAAAGATGCTTGAAGGGTTAAAATTCCTTGATGTACCTCTACTAACATG
GTTTCTGCCCCCCCCCCCTTAAAATAAGGGGGGGTCAAAAAAATTGCCTT
TTAAAAAAGGGGGGATTTTTGTCATTTTTTTTTAATAAGGGGGGATTCTT
TATCAAGGGCTGCAAGAATCTATCAAAATAAGAAAAAAGGGGGGACTAAA
ATATTTGGTTTTATTGATAATAATTTTCTTTGTCTAATAATATCTTCTTT
CCCGTTTTTGTGCTCACAATCTCATGCCCACTATTTTGTAGACCATGCTA
TATTGAAAGTTATGTACATTAGAATGACCTTTAACAGACCAAATCAAACC
ATAAAAACTATTATTCTCCCCAATTAGATAACGTTTTAAGCTGTTTTGAG
GGTGTTAAAAGTGAAAAAATTTCTCCGTCGCCCAACCATGGTGGGCGACA
TTTTTTTCCTAAATCTTGCCCCCCCCCCACTCAAATAGCTCGCCGAGGCC
CATGAATCTGCATACTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTATTGTAAAAATGG
TTTGCTGAAGGGTACAAAGATTTTCTTGCAATAGTTGGTCGACATCAGTG
ATCTTTGTCATTAATGATCTTTGACATTTTCAGCTCTGTCACATCCAAAA
TCAATGTCATAAGCATGAAATCTTACTTGTGTTTTACTGCCTAAATTCTC
TACTTGGGAAGACCACTTACTCGACCCATGGCCTACTAAAAATATTTTTA
GTAGGCCATGCTCGACCTAACTTAAACTAGGACTACAATCAGAAAACATT
CCCAGTTCAAATCTAATGATAAAGATAATTTACAAGGCCTAAGATATGAA
CAAAACACAACTGTTATACCAGGTACTGCATCTTTTGTTTGGTTTTATTC
ATAAAAAGTTTTATTTGTATCATTTGATTATAGGATCCAGTTTATTTTTA
ATGATTTCTTTTTATTGAATTTTATTTATTTGGATATCATTATGTACCTA
ATATAATGTTGATGGCATTGATATCGAACCAATCGTTGTACTTTGTTATT
ATTGTCAAAGTCTAAAAATAAAAATCTGAGGGGGGGTCCCTCTTTTTTTT
CATTTTAAGGGGGGACATTCTAACAAGGGGTACCGGTAATTCTTGTTCGA
TTTAAGGGGGGAGTTTTCTTTAAGGGCAAAATTGCATTTTAAGGGGGGAC
TGAAAAAGTAGGCAGAAACCATGACTAATTTTAAAATTCAAACTATCTAT
TTTTTTGTTCAGTTTATTCTGATGGACGTGTTTGTATATCTATTCTCCAT
GCTCCTGGTGACGACCCTATGGGGTATGAAACTAGTGCTGAGAGGTGGTC
GCCTGTTCAATCTGTGGAGAAAATCCTACTTTCAGTCGTCAGTATGCTTG
CAGGTATTAGACAGTTAACTCTCATTACCTTTATACTACCTTATGACTGC
TGCAAAACCCCGAATTCAACAACTAGAGTAGACCATGATCAGCTTTCAAC
CATCATCTTCTTCATCATTATTGTTCATTTCTAGAACCAAATGATGAAAG
TCCTGCCAATGTTGATGCATCCGTAAGTTGTTCTTTGCTGTTGTTTTTTG
TTCGAATAAATTGCCTTGGAAGGTTTGTATTTAGAAAGGCTTTAAAACCT
ACTTTTAAGGAAAATTTGCACTTTACACTTCAATCTTTCTGATGTGAACC
TCCAGATGCTGCCGGATGCAGATCATTATGTAATTCAAACTAAAACGATT
GTCCCCTCAGCTTTGAAGGCTTTGAGGCTTTTTGTTATAGTAAAGAAAGG
CTCTTTGTCCCTTGATTAAATGATTGTATAAGGAAGTTGGGTACAGTATT
GTGTATTCTTGAAGGAAAATTAATTATGAAGGATGAATAGACCTTTTCAT
AAATTACGTCACTAACATTACTTGCCTCGTATTCAAACAATTACCATGGT
GATTATGTCTCTTGAGACATTAAATGATTTTTTTAGGAATAGGAAGTAGT
TTTAATAAAATCCACTGGTAGTTAATCTCCATGGCAATAATTTCAAAACG
AGGCAAGTGATGTTCGTAACGTAATTTATGAAAAGGTCTATGTGCTCTGT
CTTAGGAAAGTCGTTTCTGTGTGTTCTTGGAGGAAAATGATTTCTGTGTA
TACTTAAAGGAAAATGGAAACTTTTTTTTCATTGAAGGATGAATGTGCTC
TCTCTTGGGAAAATCTTTTCTGTGTGTTCTTAAAAGGAAAATGATTTCTG
TATTTCTGAAGGAAAATTGATTCTTTGTTTCAATGAAGGAATGAATAGAT
TATTTCGTTGTTCTCTTGAAAAAAAATGTTTCCTGGCTTAAGATATTGAG
AGTGCAGGATGGGTCACTTTCGTATAACAGATTATGCCTTTGTAAACTGT
CCTCGATTGAAAACTTACTTTTGTTTTTCTTTTCAGAAAATATGGCGTGA
AAGCCGTGACCAATTTAACCGAATGGCTGATGAATGTGTCCGAAAATCAC
TTGGTATCACCAAAAAACTTCAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000160_pilon:360729..368454- >XLOC_044523 ID=XLOC_044523|Name=XLOC_044523|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1026bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000160_pilon:360729..368454- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGGTTCAGCTTTGAAAAGATTGATGGCTGAGTACAGGCATGGCTG
GTTCAGCTTTGAAAAGATTGATGGCTGAGTACAGGCAGCTGTTGTCAAAT
CCACCAGAAGGCATTCTTGCAGAGCTGTTGTCAAATCCACCAGAAGGCAT
TCTTGCAGGACCTTCAAATGAAGAAAACTTTTTTGAATGGGAAGCACTGA
TTGCGACCTTCAAATGAAGAAAACTTTTTTGAATGGGAAGCACTGATTGC
TGGGCCAGAAGATACACCTTTTGATGGCGGTGTATTTCAAGCTAAGTTGA
GTTTTCCACATGATTATCCATTGAGTCCACCAAAAATGAAGTTCACCAGT
GATGTTTTTCATCCTAACATGGGCCAGAAGATACACCTTTTGATGGCGGT
GTATTTCAAGCTAAGTTGAGTTTTCCACATGATTATCCATTGAGTCCACC
AAAAATGAAGTTCACCAGTGATGTTTTTCATCCTAACATTTATTCTGATG
GACGTGTTTGTATATCTATTCTCCATGCTCCTGGTGACGACCCTATGGGG
TATGAAACTAGTGCTGAGAGGTGGTCGCCTGTTCAATCTGTGGAGAAAAT
CCTACTTTCAGTCGTCAGTATGCTTGCAGTTTATTCTGATGGACGTGTTT
GTATATCTATTCTCCATGCTCCTGGTGACGACCCTATGGGGTATGAAACT
AGTGCTGAGAGGTGGTCGCCTGTTCAATCTGTGGAGAAAATCCTACTTTC
AGTCGTCAGTATGCTTGCAGAACCAAATGATGAAAGTCCTGCCAATGTTG
ATGCATCCAACCAAATGATGAAAGTCCTGCCAATGTTGATGCATCCAAAA
TATGGCGTGAAAGCCGTGACCAATTTAACCGAATGGCTGATGAATGTGTC
CGAAAATCACTTGGTATCACCAAAAAACTTCAATAAAAAATATGGCGTGA
AAGCCGTGACCAATTTAACCGAATGGCTGATGAATGTGTCCGAAAATCAC
TTGGTATCACCAAAAAACTTCAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000160_pilon | genome | sc0000160_pilon:360729..368454 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 424-513:91 |
| Aaloc | 388-423:991 |
| Aaloc | 247-384:1263 |
| Aaloc | 127-243:6485 |
| Aaloc | 82-123:6886 |
| Aaloc | 46-78:7465 |
| Aaloc | 1-42:7727 |
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