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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000160_pilon:582656..586040- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044519 ID=XLOC_044519|Name=XLOC_044519|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3385bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000160_pilon:582656..586040- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGTGCAGGAGCTGGCAAGGAACAAGATGGCAACAAAAAACAAAAAAT
CACTAAAAAAGACTTAAAGTTTTTCTTAAAAGAAATTAAAGAGCATACTG
CTGGCATCAACAGTATGACATTAACGCCCGATGGCTCCATGCTGGTGTCC
GCCAGTGAAGACGCCAACGCCCATATCCTAGACACAACCAGTGAACAAAC
AGTATCCGTGTTAAAAGGACACGAAAAATATATAAACTCTGTGGTGTGCA
ATAACGATTTCGTGTTCACCGCCTCAGCCGATAAAATGATCCGGAAATGG
CGTATAGATACAGGCATGTGCTCCAAAACAATGCGTGGCCACACATGCGC
CGTAAATCGTCTCATGCTTGTAGACAGCTTACTTTTTTCATCATCATACG
ATCGAAGTGCAAGATGTTGGCATATCGATACTGGTGAATGCCTTGCAGTT
TTTAACGGTCACAAACTCGGTGTCTACCCATTGTTATACATTCCACAATC
AGATGATTCCTTCGAAAGAGATATCACAGACCTCAATAATAACCACGATA
TATTAATCACTGGGTCAGCAGATACTACCGCTAAATCCTGGGCACTTAAC
ACGAATGAGGTCTTATTGACGTATAAAGGCCATAATGGAGCAGTTTTATC
TATGGCATGTGACAACAGTGGGAAATATTTGTTCACAGGAAGTCAAGATT
CAACTATCCGATCATATGTCTTGTCTACAGGAAAGCCTGTCAATGTATTC
AGTGGACATGCCGCTTCAGTGCTACAGTTACAGGTGAGATAATGATAAGT
TTTTTTCCAGACATACTGTATTTTGTGATGTTTGTGACATTCGCACATGT
AATATTTGTAGCTTGGTTTAAATTACACCCCTTCTCACAGACCCGGCAGG
ATTTATTCAGCCAGTGCGGATAAAAATAACGGACAGAAACTCGATGGCAT
AGATATCTTTTTTGACTGGGATTTCAATTCTTTCGGTTTCAAGTTAGAAA
ATTCAGTGGGAATGGGAAAAATAACATAATATTTTCCAGTGAGGATTGGT
TTATTTGATTATTTTCATCGGGGATAAAAATTGGCGGATAGTTCTCCACC
GGGGACGATTTTTTGGCCAAGTTTTCCAGTGGGAAGGGGCCCGTAAGGGT
CTGTAAGAAAGGGGTATTAAATAACTCATTAAAGAGTCTCAGCATGATTT
AAGGACCCAGATCCGCAACCGTAAGTACCATCTACTTTGTTTGATCCATA
TTAAAAACATGGTTGGTATTCTGCCATAGGATTTAAATAGCTTAATCATT
CAAAACTTTTAAATATTCCAAGAATGAAAGGCACCTATGATTTTTCTTCC
TAGAGATGGTTTGTATTATACATTGTGTCCCGAAAAAAAAGTGGACAAAT
TTCCATATAAAGTAAAATCCACATTATTTGTGTCAAATTGATAACTTGTA
TGCTTGACATTTCAATCTAAAAAACTTATTCAATCAGCTTGGGAACGGAA
AATTGTAATATTATTTCAATTATTAGTCCAAGTTTTGATTATTAGTTTAG
AGGATTTTACTCCATATAAAATGCCTAGAAAATAGTCCACTCTTGTTTGG
GACACGCTGTAAGAGGTTTATTCCTAATTGCCTTATTCAATTGTAATACC
TATAAAAGCAATTCTTTTAGGTTGTTAACCGATTGCTATTTTCATCAAGT
GCTGACCATACCGTTCGATGTTGGGTATACGAGTTTGGGGAATGCACGCG
TGTCTACCGTGGACACACGCACACTGTTGGTTGCATGAAAGTTGCCAAAG
GATTATGTAAGTTCAGATATTGATTTTGTCCTTCCTTGTTCAGGGGTTTT
GCTTTGTTTTTGGTAGGCTGGCGAATGAAAAAATTAACCCTGGCGATTTC
TAGATTCTAGGCCGACGAATTCTTAGCAAGCGTAGTGTATTGATTAGCGT
AAATATGTACTTGAGGCGGCGAACCGAACTTTTCGAACGGCGAATTGTTA
TTTTTTCGTGCCTTGGACCGGCGAAATTCACCGTTCACTGGACCAAAATA
AGACCCCTGCTTGTTCAGAAAATACAATCAGAAATTTTATTTTATCAAAA
AATTAGACCTTTTCATTTGGGGTATAATTCACACAGTCCTCTTGGGCATT
GTTTAAGCAATTTTTTTTATTTGCACTGATCTGAATCTATTCCAAAAACA
TCTAAGTCAACTTTCAGTTTTCATGCCAAAAATGAAAAAGACTTTTAATC
CTATTAATAATGTTTAGAAACACGAGAGAAAGTATTCAAGCAAACTCATT
AGACAGTTTAACCATGGTTTATTTAAATGTTTCCTTTAATTTCTAGTGTT
AACTGGGTCTGGGGATGATACAGCCAAAATCTTTGACGCGAAATCGGGAA
CAAACAAACGAACATTCCGTGGACATATTGGCTCAGTTAATGCACTCGTG
GTAAGTAAGGAAATAAACTAAAGTGATTAACAGAAAGTCGTACAGTCATT
CTTTAGTGTTATGTAGCCAAATACACCTTTTCGATCGTAGCCGCCAATTG
CCGTGTGGGCATTTTTTTGTCCATTTTACCACCCTAAAACCGTCCCAGTC
TTTTTTCCGCACCTACAGACAATAGGAAAAGGTGTCAGAAAAGGATTGGA
TCGAGTTTGGGGGGAAATACCCGCACGGCAATTGGCGGCTACGGTCGAAA
AGGTGTATTGTATGTGGAACTTGAAGATAGAGTTGAATGATTTCCTTCAA
GTCAATTAACTAAAGTGGTCAACACAAAGTTGCTTTGAAACTTAACTTGA
GTATATCAACTTGTCCTATTTTGACGTTTGATAATTTCTCTTAACGGAAG
CCAAGACAAGGCAGATCACAGAATCTAAAAAGATGGAATCAATTAAGAAT
AAAATAAAACGTTGTCTGAATCGAAGATCTCTACAAAACCGTCGATAGTA
TATAGAAGCACGAATCATTTAATGGATGACAGCAGCCTATATAAAACGGA
GCTACTTACTAGAAAAATTAAGAAGTACAAAGGAGAAACAGAACTACAAC
GTACATAGAACCTACATTAATTAATAAATCCCAGCCAAAAACGAAGCACA
ATTGAAAAGATGTGTCCTTTAAGACTTCTTAACTTAAACTAAGCTCTTTC
TATGTTTCCTTAGCTACACAAACATAAACTATACACTGGATCAAATGATG
GTGCGATTAGGATTTGGGATGCATCCGGTATCGGTGAAGATGATGACGAC
GACGATGAGGAGGAAGATAGTGGCGTCGTCCCGATGCAGCAAGAACAACA
AACACCACAAGCTCAATCTCCAGCACCTAGCAACGACGATGCAGCGCCGG
TTAATGATGAAAATGCACAACCAGTTAACGAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000160_pilon:582656..586040- >XLOC_044519 ID=XLOC_044519|Name=XLOC_044519|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2490bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000160_pilon:582656..586040- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGTGCAGGAGCTGGCAAGGAACAAGATGGCAACAAAAAACAAAAAAT
CACTAAAAAAGACTTAAAGTTTTTCTTAAAAGAAATTAAAGAGCATACTG
CTGGCATCAACAGTATGACATTAACGCCCGATGGCTCCATGCTGGTGTCC
GCCAGTGAAGACGCCAACGCCCATATCCTAGACACAACCAGTGAACAAAC
AGTATCCGTGTTAAAAGGACACGAAAAATATATAAACTCTGTGGTGTGCA
ATAACGATTTCGTGTTCACCGCCTCAGCCGATAAAATGATCCGGAAATGG
CGTATAGATACAGGCATGTGCTCCAAAACAATGCGTGGCCACACATGCGC
CGTAAATCGTCTCATGCTTGTAGACAGCTTACTTTTTTCATCATCATACG
ATCGAAGTGCAAGATGTTGGCATATCGATACTGGTGAATGCCTTGCAGTT
TTTAACGGTCACAAACTCGGTGTCTACCCATTGTTATACATTCCACAATC
AGATGATTCCTTCGAAAGAGATATCACAGACCTCAATAATAACCACGATA
TATTAATCACTGGGTCAGCAGATACTACCGCTAAATCCTGGGCACTTAAC
ACGAATGAGGTCTTATTGACGTATAAAGGCCATAATGGAGCAGTTTTATC
TATGGCATGTGACAACAGTGGGAAATATTTGTTCACAGGAAGTCAAGATT
CAACTATCCGATCATATGTCTTGTCTACAGGAAAGCCTGTCAATGTATTC
AGTGGACATGCCGCTTCAGTGCTACAGTTACAGATGGGTGCAGGAGCTGG
CAAGGAACAAGATGGCAACAAAAAACAAAAAATCACTAAAAAAGACTTAA
AGTTTTTCTTAAAAGAAATTAAAGAGCATACTGCTGGCATCAACAGTATG
ACATTAACGCCCGATGGCTCCATGCTGGTGTCCGCCAGTGAAGACGCCAA
CGCCCATATCCTAGACACAACCAGTGAACAAACAGTATCCGTGTTAAAAG
GACACGAAAAATATATAAACTCTGTGGTGTGCAATAACGATTTCGTGTTC
ACCGCCTCAGCCGATAAAATGATCCGGAAATGGCGTATAGATACAGGCAT
GTGCTCCAAAACAATGCGTGGCCACACATGCGCCGTAAATCGTCTCATGC
TTGTAGACAGCTTACTTTTTTCATCATCATACGATCGAAGTGCAAGATGT
TGGCATATCGATACTGGTGAATGCCTTGCAGTTTTTAACGGTCACAAACT
CGGTGTCTACCCATTGTTATACATTCCACAATCAGATGATTCCTTCGAAA
GAGATATCACAGACCTCAATAATAACCACGATATATTAATCACTGGGTCA
GCAGATACTACCGCTAAATCCTGGGCACTTAACACGAATGAGGTCTTATT
GACGTATAAAGGCCATAATGGAGCAGTTTTATCTATGGCATGTGACAACA
GTGGGAAATATTTGTTCACAGGAAGTCAAGATTCAACTATCCGATCATAT
GTCTTGTCTACAGGAAAGCCTGTCAATGTATTCAGTGGACATGCCGCTTC
AGTGCTACAGTTACAGGTTGTTAACCGATTGCTATTTTCATCAAGTGCTG
ACCATACCGTTCGATGTTGGGTATACGAGTTTGGGGAATGCACGCGTGTC
TACCGTGGACACACGCACACTGTTGGTTGCATGAAAGTTGCCAAAGGATT
ATGTTGTTAACCGATTGCTATTTTCATCAAGTGCTGACCATACCGTTCGA
TGTTGGGTATACGAGTTTGGGGAATGCACGCGTGTCTACCGTGGACACAC
GCACACTGTTGGTTGCATGAAAGTTGCCAAAGGATTATTGTTAACTGGGT
CTGGGGATGATACAGCCAAAATCTTTGACGCGAAATCGGGAACAAACAAA
CGAACATTCCGTGGACATATTGGCTCAGTTAATGCACTCGTGTGTTAACT
GGGTCTGGGGATGATACAGCCAAAATCTTTGACGCGAAATCGGGAACAAA
CAAACGAACATTCCGTGGACATATTGGCTCAGTTAATGCACTCGTGCTAC
ACAAACATAAACTATACACTGGATCAAATGATGGTGCGATTAGGATTTGG
GATGCATCCGGTATCGGTGAAGATGATGACGACGACGATGAGGAGGAAGA
TAGTGGCGTCGTCCCGATGCAGCAAGAACAACAAACACCACAAGCTCAAT
CTCCAGCACCTAGCAACGACGATGCAGCGCCGGTTAATGATGAAAATGCA
CAACCAGTTAACGAATAACTACACAAACATAAACTATACACTGGATCAAA
TGATGGTGCGATTAGGATTTGGGATGCATCCGGTATCGGTGAAGATGATG
ACGACGACGATGAGGAGGAAGATAGTGGCGTCGTCCCGATGCAGCAAGAA
CAACAAACACCACAAGCTCAATCTCCAGCACCTAGCAACGACGATGCAGC
GCCGGTTAATGATGAAAATGCACAACCAGTTAACGAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000160_pilon | genome | sc0000160_pilon:582656..586040 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1024-1245:223 |
| Aaloc | 922-1023:1038 |
| Aaloc | 784-918:1716 |
| Aaloc | 1-783:3386 |
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