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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000160_pilon:760714..767910- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044515 ID=XLOC_044515|Name=XLOC_044515|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7197bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000160_pilon:760714..767910- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAATACAAGATGGCGGACGACTGACTGAGATTTTGCAAGAAAATTTTGT
AAGAAAAATGTATCTTTACTCATAATCTAGTGTAGATTGAACGCGTAAGA
GCCAGTTTTTTGTAATCGACAGGAACGTAACTTTTATCATCGATTAGTTA
TCGATTACCGTCAATTATCATTGATTGACCATCGATTGATCAATCAGTTC
CATCAATAATATGCCAAAAACATTTTGTTCCACCACTTTCACTTAAAGAT
AGGCCGCCATAGAATGAACTTTCTTTTATAGGATGAAACATATTCATGTG
GCTTTCAGCCTTGCAGTCCATCGCAGAGGCTATTTGAGATATTTTACTAA
AACTAGCCCAGAGAAAAATTTTTAACCTTTATTATTATTTGAATGCATGC
CTTTTTAATACCGTAGGATCGTCTAATCTCGACATACGTCTTGCAATCTC
GACACCGGATCTGTAAAATAATCAAAACAAACCTTGAATGAAATTCTTGG
TATCATTCTTATCGAACAAGTTCATCCATCAAACTAGAAGTTCAGTAAAC
ATTGCAATCCTTTCAATTAAAAAAACAGCCAAATTATAAGCAGTTTTACA
CAACACACGAAACCCATGCAAACTTCCTCGTAACTTTCTCGTGTGCATCA
TTAAAATTTTACAACTTTATTACGCTTCAAGTCACGTGATAAAAATAATT
CGCGCGCTTAGTCGACCTGGTTTCCATTTCCTTATTATTTATTGCAAGCA
CACGCTCTAGGCGCTAGAGGAGGCCGCGTTAAACTTCTAGGCGCCGCACC
TAGCACACCCGGTCCCTTTTCAAATTCATAAGGAAACCGGGTCTTTAAAT
TATTTTCGGTTCACGGTAAAAAGGTCTACTAAAAAATTCCTCGCACGTGC
AAAATGTTGTTGTGATTTGGGCATCTTCGTTGAAAGCATGCTAATTAGTT
TTTTAGTGATTACTACATCGTTAAAGTGTTCTTTTCAAATATAAGTAATA
ACAGTTCACATTTCTCATATTATATTAACAATCTGTGACGTGGATAGAGA
GAGAGAACAATTTAGTGATTGATTGATAACTTTGGTATGTATTTGTTTAT
GTTTGATTTTTTATTTCGAAGACCAGCCTACAGCTATGTCAAGATTGCAA
GACGTATGTCGATATTAAACGACTCTACGGTACTCAAATCAGCTCAAATA
TAAAAAAATTAAAAAATTTTAACTTGGTCATTTTAGTCAAAAAAGTCATT
AAAATTGATTAGTCTCTGTGATGGAGTGCAAGGCAAAGCCACATGAATAT
ATGGTTCATCCTATAAAAGAAAGTTCATTCTATGGTGGCCTATCTTGAAG
TGAAGGTGGTTGAACAAAATGTTTTCGGCATATTGATGGAACTGTCAATC
CATACTAATCGATGGTCAATCGATGATGATCGATGGAACGTAATTTTTCG
CGTCGCTTAATCGTCGATAGTATCGATTACGCATCAATTATTATCGCTTA
TTATCGATTATCATCAATTACCATCGATTATTTTTCCGCATCGATTTCAT
CGATTGACTACGCCTGGGATTGTTCACTGCATATATAATTTCTACGGGAA
ATCAAAAGTAATTTCATTCAGCTTGTGATGTTTGACAGTTTGAGAGCTTG
GATGTTGGGAAGCTGCAAGAATAAAGCCAGACGATCTCAATCGAACAGAA
TCGACGATCGAACCAGTCGAACAACAATCGAACCAATCGAATATTACCCA
GAATTTTGACGTTCAATTGAGATTCAATTGCGTTCGACAATCGAATTTCA
ATCGGTCGATTGCGTTCGATTTGGTTTGATTGGTTCGATCGTCGATTCCC
TTCGATTGAGATCGTCTGGATATAATAAATAAGAACGACTTTGAGCTAGG
CCTAATATTTAAAAGAAAGGAAAAGGTCTCCAACTCCTGATAAATTGTTG
CACTATCTATGATTGGATGATATAAGATGCTTTAAAAAAATCAAGAACTA
AGACAAGTACCGTTTAAGTTGGTCTAATATAGACATCCCTCGTCTAATTC
CGACACCCTTCTTTAGAGAAAGGAATAATATGAAAGCTTGATTGAATCAC
TGATTGAAAAAGGATTATTCCTCTCTGACCAATAAGCAAAGAAAAACAGT
TTCAACCTTTCTATAAATTTCAGCCGATAAAAAGGGTGTCGGAATTTATA
GAGGAGGGGTTTCGACCAAGTTACGGTATCAATGGGTAGTTCATTTTGGG
CAAAAATCTCATCCTGAAACCGTGAGTGGCTATGAGTGGTCTTAAATCAT
CCAACAGCCCTGCCTAATTTCCAACCCCCCAAATAACTGTTACGAGAAAA
ATTCTATGTTTACAAACATTCCCTCTCCAAGTTGAACGATAAACTAATTG
CAAGAACTCTCAAAACAAAACATCCAACAAGACAACTTTGATGTCAAGAT
GTCAATTATAATGTGATAAAAAAAGCAGGCCATTTTCTAGAAAGACAAGA
AAGCGTGAGCTTGGAACCAAAAATGGAACTTTTTCTGGTGATTTTCTAAC
AAAAAGGCAATTTTTGCTGCTAATTTCAACATATTTGTAACTTTTTGTTG
GGGCAGCGTCCGATAATCGGACCCTTAAAAGGCATAAAAAATGGCCTGAA
AAGTGTGAGCTGTTAAAATAATTATGAATTTTATTCTAAAAATATTCGTT
GTTCGTTTATCTTGCTTAAAACGTTAACAAATGTTTTGGGTGAATTGCAG
AAAAATAGTACTATTTCCCGTCCGCATCAGGCACTTTTTGAGGACCCATA
GCTCAACTTTGGCAAATGCAATTTCTAAGAACTTCACATTTTTGTGAACT
TTACTAAATAGCCTTCCTTGGATTGTTATATAATTTTTTTGTTACAGCCT
CAATCTTGAGAAAATGTTGCGGACGGGAGACTTTGTTGCGGACAGGACAA
AAAGTTTTTCACTCATAGCTAGTACATGTAAAGTCAAGAAAAATGATACT
GCTGCAAAAAGCATGTGGTTCCCTACAGTTCATTGGCTTGATACAGTTAT
AACATTAAAGTTGTCTCAAAAAAGAACGGCACAAATTTCTGGACCGTATT
GGTTTTTACCAGTTTTAACAAAAGGCAAATGTCTTTAACGCAGGAAACAA
ATATTAAATTTGACTCTCATTTGCTCGTATTTATAAATTTCACAATAAAA
AGAACCTTTTACAAATTATTTTCTTTAGCGGGCGTTGAATCGATATTGAC
ATATTTAAAGATGTCCAATGCTGTGCATCTTATGCCTGCATATTGTCAGC
ATCGTGCATATTGAAGATATTTTCAGTTATAATCCAAGGTAGAATAAACT
TAAAATAGAAAGGGGGTATTTTTTAGTACTCCATACAATGATGGGTGTTT
TTTTTTAATTCTATGTTTAAATTTTTCTACCCAGCTTGGTTGCTATGTAC
ACGTCCTGACTGATCCAAAGGGCTTTTTTTGTGTGTAAGAAACACTCTGC
TCGGCGGGTACAACACCAGGTGACAGCTAGTAGATATCTAAAGCCTTATC
ACTATCCCAGGCTAAGAAAACTTAAATTTATTGCCTGGGAGAACAACTTA
GATAAACACCCTTTTTTGTTTATTATCTTTGAATTGAAGTGGGCAAAGAC
AACTGCTCAGCTCAATGATGTAGAAAGGTTTTTTAAAGGTATCTTCAGTT
GTAATCCAAGGTAGTAACAAACAGAACATGGAATAGGGGCATTTTTGATC
AGTTTTTTTTTAATTCAATGTCTAGATTTTTCTACCAAGCCCCATTGCTA
TGTGCCCATGTCCTGTTGTTAAAACTTTTGATTGAAATTGAAAACAAAAC
TAAATTAAATAGCTCAAGACTGCGTGCAGGTATTATCGAAAAAGTGAAAG
GAAACTTTGATTGAATTAAGTTGTTCTTTTTCAAAATGTCCAATGTCATT
GTAGTGAAGAATTTTGGAAATTATTCCCAAAACACAAAAAATGAGAGCGA
AATTTAAATTTGACCTGGGACTGTAAGTTTTATTAATATTTTCAGGAAAG
TATAAATTCAGGGCACAATGCTATTATCTGAACAATTGTGTTCCTCCCTG
AATTAGATATGCTTACTTTAGGAAAGCAAGTCACGCAGCAATGCACGCAA
AAAAATGTTGTCATCATATCAGTTGGTTGCTAAAATTAGTATGTTATTTT
TTTCAATTTCAAGCTAACTAATGAGTCAAAATTTCTGACCTAAACCTATC
AATAACTTATAAAATAATGCTTTTTTCAGCTTATTATCATAAGAGAAATG
GCTAAAGGAAAAGAAGCAAAAAAGAAAAAGTTAAAGAAGAAAGATATCAG
CTTGCCGAATAATTTTAAACATAATTACCACATGACATATGATAATCGAG
AGGGTAATTACATTGGTGTACCTCCACAATGGAAAAAATTCCTTGCTAAA
GAATTTGAAAGACCAAAACCTTTCATTGATCCAAGTGTTGTTACTGAAAT
ACAACCAGGAGCTTTAGTTTTGCAAGCTCAAACAGTCAGCCCTGGCATGA
GACAATCTGCCAGTACAGGAAAAATAAATATCGCCAGATCCAATTCTCTA
CGACAAAACTCGGTAAAGTCCAGAGCTAAAAACAATAAGGTTGTTGAAGA
ATCTTCAGAAAACAATGCCCCAAATATGGCTTTGGATAGAAATAAAGCGG
CTACAAGAAGTTTACCAAAGAATGTTTATTCAGCTCAACGTAAGGAATAT
TATGAGGCCAGACGTCAACAACAACAGGGACAAAATAATGAACCTTCTGA
TAACATGGATACCAGTGATGGTCCACCGCAATCATCAACAGCAATGAGCG
ATAATATTTTTGTTTCCCCTGACGAATTCAGGGAAGCATTAAAATTGGTA
GTCAATCAAGACGATCCGAAAGAGATTTTTGAAAATTTTGTTAAGATTGG
TGAAGGTTCAACTGGTGTTGTTTGCATTGCTAAAGATAAACGTTCTGGTA
AACATGTTGCCATTAAAAAGATGGATCTTCACAAACAACAAAGGCGAGAA
TTGCTTTTCAATGAGGTATTTATTTCTTGACATTTCCGTTATTTACAGTT
TCTGATGTTGGTTGTTTTTCTTAGAAAATATTAAAAATACATTTCAAAAT
TTTAAGTTAAAAGTAGTACATTACTTCAAGTTCCATGTTATTGCAATAAT
CATACGCAAAAATAAACTAAAGTTCCATTTAGTTGGAGTTATTACTTAAA
GGTGTAACTCTTAAAATTAAAAATCTTAAAATCTTATTTTACAGGTTGTG
ACGATGAAAAACTATCACCATACAAATATTATTGAACTTTACGATGCTTA
CCTTGTCAATGAAGAGTTGTGGGTTGTAATGGAATATCTGGATGGTGGTG
CATTGACTGACTTAGTGACCAACACTCAGTATGAACTTTTCTTATATCTT
AATTAATTTCATTTGGTTTGTCAATACAATATTAAGCAATGATAATATGA
TGCTTTACGTTCAAAGTCCTTCCGTTTTAAACTGATTTTTGCCTCAGCGA
AGTATAATACCGGGTGCGCCAGAAAAAAGTATACAAGTTTGTCGAGATAT
TGTAGGCTTTAGGATGAGAATTTTTATTTGATTCTTTTTTCATTGTATAG
GGGAAAACCTAACTTAAATTTTGGTATATAAAACTTCAAAATCGGTTCAG
TCAATCAAAAGTTATGATAAAAAAACTGAAAATCTTGACTTACCCAAAAA
TTCAAAAATTCATTAAAAACAGTGAACAAAATTTGAATGTACAATTACCA
CTATTATCAAAGGTATTTCGATAAAATGGCATTTTCTAAGCATTTTTTTG
GTAAAATGTTGGTCTTTAAGCTTTCCTCGACTCATTGGATATTAAAATAA
TTCAGATTAAGCCTCAAAACTAAAATCGGCGTCGAAGTATCGATATGGTG
GCATTTTTAAAGTTTCACTTGAAAATTGGATGTTTTTTTTAGTTTTTAGC
TATTTAGCAAGAATTTTCGAATTTTTATGGAAATTTTTACTTTCTTAGCA
AAGTTTGAGCCTCAGCGACCTTAAATCAACCATTTTACAGTTGCCAATTG
ACAATTTTATTCATTTATGGCTATTTAACTGTTTAAATGATATTAAACAG
AGAGAAAATTTTGTTCCTTGTTTCTAACGAATTTTGAATTTTTGGGTAAG
TCGAAATTTTCAGTTTTTTTAGCATAACTTTTGATTGACTGAACCGATTT
TGAAGTTTTATATACCAAAATTTAAGTTAGGTTTTCCCCTATACAATGAA
AAAAGAATCAAATAAAAATTCTCATCCTAAAGCCTACAATATCTCGACAA
ACTTGTATACTTTTTTCTGGCGCACCCGGTATAACGAAACTTTTCATTCT
CAGATTCAGCAAAACTTGAAAAATCTGTTTCAGTCTAAATGAAAAAAAAA
TTGCTTTGACCACTAATTCAGAAAATTTGAATCTTTTAAAGATTATATAT
TTCCCAATTATATTAAATACAACTATTTAAGTACAATTTTTTTACAATTA
AATCTCTATCTGAAATTTTTAGGTTGAAAGAAGAACACATTGCATATTTT
TGTAAATGTTGCTTGAAAGCTTTGGAGTATCTTCATTCACAAGGTGTTAT
CCACAGAGATATCAAGAGTGACAGTATTTTACTATCCAGAACAGGACAGG
TAGGTAAAAAAACATCTTTCTCGAATTATGCCCCCAAATGAAGCCAAACA
TTAGAGTTATGGCCATTATCTTTATTGTATACAATTTATTACCTTCTGCC
TTTTCGGGTAGAATCGCTCAAATTAGTAAGGTCAGCAATTTTTAATTTAC
ACTCCTCTCGAGGAACATAAAAAAAGTATTTTTGGCCTCGTTTCAATACA
GTTAATGATACTCCAACTGATTTTCATTCAAAATGGGAAGCTTTTACAAA
TGATTGCAGATTATGTAAGTATTTTGGCAACAAAACTTTGAAGCAAGGCC
CGCATTGATTTGATTTGATTCATCCCGAGAACAGTGCATTAACTCATATT
TTGTCTTTTCTTATTCAGATCAAACTATCTGATTTTGGTTTTTGCGCTCA
AGTCAGCAATGAGATTCCCAAACGTCGATCCTTAGTTGGCACTCCATACT
GGATGGCTCCTGAAATCATTGCTCGTGACTCATACGGTGCTGAGGTA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000160_pilon:760714..767910- >XLOC_044515 ID=XLOC_044515|Name=XLOC_044515|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2448bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000160_pilon:760714..767910- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAATACAAGATGGCGGACGACTGACTGAGATTTTGCAAGAAAATTTTAA
AATACAAGATGGCGGACGACTGACTGAGATTTTGCAAGAAAATTTTCTTA
TTATCATAAGAGAAATGGCTAAAGGAAAAGAAGCAAAAAAGAAAAAGTTA
AAGAAGAAAGATATCAGCTTGCCGAATAATTTTAAACATAATTACCACAT
GACATATGATAATCGAGAGGGTAATTACATTGGTGTACCTCCACAATGGA
AAAAATTCCTTGCTAAAGAATTTGAAAGACCAAAACCTTTCATTGATCCA
AGTGTTGTTACTGAAATACAACCAGGAGCTTTAGTTTTGCAAGCTCAAAC
AGTCAGCCCTGGCATGAGACAATCTGCCAGTACAGGAAAAATAAATATCG
CCAGATCCAATTCTCTACGACAAAACTCGGTAAAGTCCAGAGCTAAAAAC
AATAAGGTTGTTGAAGAATCTTCAGAAAACAATGCCCCAAATATGGCTTT
GGATAGAAATAAAGCGGCTACAAGAAGTTTACCAAAGAATGTTTATTCAG
CTCAACGTAAGGAATATTATGAGGCCAGACGTCAACAACAACAGGGACAA
AATAATGAACCTTCTGATAACATGGATACCAGTGATGGTCCACCGCAATC
ATCAACAGCAATGAGCGATAATATTTTTGTTTCCCCTGACGAATTCAGGG
AAGCATTAAAATTGGTAGTCAATCAAGACGATCCGAAAGAGATTTTTGAA
AATTTTGTTAAGATTGGTGAAGGTTCAACTGGTGTTGTTTGCATTGCTAA
AGATAAACGTTCTGGTAAACATGTTGCCATTAAAAAGATGGATCTTCACA
AACAACAAAGGCGAGAATTGCTTTTCAATGAGCTTATTATCATAAGAGAA
ATGGCTAAAGGAAAAGAAGCAAAAAAGAAAAAGTTAAAGAAGAAAGATAT
CAGCTTGCCGAATAATTTTAAACATAATTACCACATGACATATGATAATC
GAGAGGGTAATTACATTGGTGTACCTCCACAATGGAAAAAATTCCTTGCT
AAAGAATTTGAAAGACCAAAACCTTTCATTGATCCAAGTGTTGTTACTGA
AATACAACCAGGAGCTTTAGTTTTGCAAGCTCAAACAGTCAGCCCTGGCA
TGAGACAATCTGCCAGTACAGGAAAAATAAATATCGCCAGATCCAATTCT
CTACGACAAAACTCGGTAAAGTCCAGAGCTAAAAACAATAAGGTTGTTGA
AGAATCTTCAGAAAACAATGCCCCAAATATGGCTTTGGATAGAAATAAAG
CGGCTACAAGAAGTTTACCAAAGAATGTTTATTCAGCTCAACGTAAGGAA
TATTATGAGGCCAGACGTCAACAACAACAGGGACAAAATAATGAACCTTC
TGATAACATGGATACCAGTGATGGTCCACCGCAATCATCAACAGCAATGA
GCGATAATATTTTTGTTTCCCCTGACGAATTCAGGGAAGCATTAAAATTG
GTAGTCAATCAAGACGATCCGAAAGAGATTTTTGAAAATTTTGTTAAGAT
TGGTGAAGGTTCAACTGGTGTTGTTTGCATTGCTAAAGATAAACGTTCTG
GTAAACATGTTGCCATTAAAAAGATGGATCTTCACAAACAACAAAGGCGA
GAATTGCTTTTCAATGAGGTTGTGACGATGAAAAACTATCACCATACAAA
TATTATTGAACTTTACGATGCTTACCTTGTCAATGAAGAGTTGTGGGTTG
TAATGGAATATCTGGATGGTGGTGCATTGACTGACTTAGTGACCAACACT
CAGTTGTGACGATGAAAAACTATCACCATACAAATATTATTGAACTTTAC
GATGCTTACCTTGTCAATGAAGAGTTGTGGGTTGTAATGGAATATCTGGA
TGGTGGTGCATTGACTGACTTAGTGACCAACACTCAGTTGAAAGAAGAAC
ACATTGCATATTTTTGTAAATGTTGCTTGAAAGCTTTGGAGTATCTTCAT
TCACAAGGTGTTATCCACAGAGATATCAAGAGTGACAGTATTTTACTATC
CAGAACAGGACAGGTTGAAAGAAGAACACATTGCATATTTTTGTAAATGT
TGCTTGAAAGCTTTGGAGTATCTTCATTCACAAGGTGTTATCCACAGAGA
TATCAAGAGTGACAGTATTTTACTATCCAGAACAGGACAGATCAAACTAT
CTGATTTTGGTTTTTGCGCTCAAGTCAGCAATGAGATTCCCAAACGTCGA
TCCTTAGTTGGCACTCCATACTGGATGGCTCCTGAAATCATTGCTCGTGA
CTCATACGGTGCTGAGGTAATCAAACTATCTGATTTTGGTTTTTGCGCTC
AAGTCAGCAATGAGATTCCCAAACGTCGATCCTTAGTTGGCACTCCATAC
TGGATGGCTCCTGAAATCATTGCTCGTGACTCATACGGTGCTGAGGTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000160_pilon | genome | sc0000160_pilon:760714..767910 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1096-1224:130 |
| Aaloc | 970-1095:625 |
| Aaloc | 835-966:1904 |
| Aaloc | 49-834:2919 |
| Aaloc | 1-48:7198 |
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