|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000108_pilon:861761..867572+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044479 ID=XLOC_044479|Name=XLOC_044479|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5812bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:861761..867572+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTGTTGATTCCCTTGTTGAGAGACTTTATTTTTTGTTAACGTGTGT
GTTCATTGGACGAATTGTTTCGTTACCAGTTCTCCAGCCTATGGTAGGTT
TTATCGCTGTCCCAActggcatacaacgttgtttcaacgttcacttaacg
ttatatggacgttgtgaatgttagataaacgttaaagcaacgttgtgtgt
cagctggggtCTCATTCCAAGGGAATTATTCCTGGCACATTTCTGggatc
ttttttctttttttttctgagcATACCGATAAAAgagtttgtttaaaaaa
taatttcttaatCTTTCCAGCGTgcaacaattttttgaaaaatgttgaaa
tttcgaattttttttttttaatccaaaattttaaattggcATAAAAGCTT
GAAGCTTGAGAGTTAAACAATATTTTTGGCACCActaaaaaggtattttt
atattctttctaaaagcatttgGTGTATACCcttttaaagtctgttcacg
ataagtgtgcactcttttttctttcacctataacttttgaaggaattctt
caatctttataaatttggtatcgttggagagatatttgtgagtggaacaa
tttgaaataaaaaagtgtttaaaaaaattctaaaaatgaacatgaaaatg
aagaagaaaaaaattaagatcttgtagaaaagtgctataactttcatttt
cactggagagattctttgatcttaggagatcatcactgtgaagaaatttt
actaaaatatatattcattaaaaagttatgatacaaagttgataagtgat
tgaccccaaaaaacagcaaaaaacagcagaaaacaccgtttttagacgtc
aatcagcttataactttgcttgatatcttttgactgaatgattatttttg
agaaatcttttcacagtgataatgttcgataatcaaggagccacttcagt
gaaaatgaaagtcatatcacctttctacaagatcttcatttttttcttct
ttattttcatcttcatttttataatttttttaaagattttttaatttcaa
attgttccactcaacgtctttccaatgataccaaatttataaaaattgaa
gaattccttcaaaagttataggtaaatgaaaaaagagtgcacacttatcg
tgaatagactttaaatcaAGTGATCAGGAGTTATAGCCTCAAGTCTGGGA
CTATTGTAGGACTAACTTTGAACGAATATGTACGTCTTTCGGATTTGAAG
GGttaagaaattaaacaaaaatactcataaaatagtgaaaaataagAGCA
TTTAAAGAACATTTCTACTAGGCCTAtgactcaaaaagttaagaaagctt
caaaaacttgggaaattcttataaaaagtgtaatGTACGATGACAGTTCC
TTacttaaaattattttgttaaaatattatgATTTGTTTAAGAGCTACTT
GGAAAGGTATGGATACCACCAAAAACCGTCTGaaaaaaaCCTCCTTTTCG
AATATTCATCATCAACTATccctgaagaagaagaaacgaTCAAATCGAGC
ATCAAGAACTTCCAGAGATTCGTTGGACTCCCTCAAACAGGTAaaatatt
ttagcgatttcATTTTAGATTCTTCCCAGCTGGTACGCAATGTTGTTTTA
ACATTCATTGAACATTTAATGAACGTTAGGGACGTCAAATGAATGTTGTC
ATAACGTTCTGTTCTAATTGGGTATTGTGATTGACTGAAAGATCCTGCCA
AACCTAACCTGAAGAGTATTTTCAGAGCCTATCGTTGGCCtcaacttttt
taaagctttgaTAATAACAGTGAATTAAGAATTTTTCTAATTCAAATAAA
AGCTCAATTTCGCTTTAAGAAAGTTAAGCAAGTTTGCCTATACATTTGaa
ccaaaattttagaaaagaatTAAATATACACCTAGTCGGAAAGTTCCAAT
TCTCCTCGCAAAGCCGTTGCGCAACACGTTCAGGTAGACAAATTCAAATA
CgatagatttcaaataaaaatggctGACGACTGACAATCCATAAGTTCTC
TGAACAATTAAATGAGAACATTTGcactgaaattaaaaatttctgaATAA
TTCGAGAGAGGAACTTAGCTGGTCGTATGTAAAACAACCCTGCAAAAACC
ATTTCGCGGATAATGTGCGAGTttggttttgtctttttttcaaagTGGCT
ATACCATAAATTAGTAAACTTTTTGCGATTTTACTGTGTTTAATTATTGT
TGAgcgaacttttttttattttcagtcgTGAGTACGGTACAAGATTAAGA
CAAATAATTTCCTCTTTAGGCGAATTCGACGATGCAACATTACATCAAAT
GGAAGCACCAAGATGCGGACGACCAGATTTTCAACCACAAACATTACTTT
TCTCGCTTCCCCAAAGATATTATTGGAAAAAATGGGATTTGACTTATCGA
GTCGAAAAATATACTTCTGATTTAGCTAAACAAGACATTGACCAGATTTT
CAAAGATTCTTTCGAGCAATGGACAAAAGCATCTGATCTTACATTTGAGA
AGAGTAATAATTCTATAGTTGATATCATGATGAAGTGAGTATTATATAAT
catatattgaaaattttggtcACTTTcccgtttttcgaaatttgaagttc
gggAGAAAAAGTCACTTTTTGGATATTCGTTGAAATAGAATAATTCAATT
TTGGAGTAATTTGTAGAATTCCAGgatatattctgagtcttattgaacca
ttcttgaacttttggatcctcagtgttaagtctagcgttaaaactccaTC
CTTACAACCTAaattagagcacttccaaatcgtttttGGCTGTAAGATTT
AGTGGGAAGTatcctttttctcaaatattgattgTTAATTTTCAGTTCAA
TCATTGCAGTCTAGGGATTTGAGGGGGTTTAAAAGGGGTTTAAAATAGca
atttctaaatttgttcTATTTATAGGCCCAGCATTGGGTCTTTCATAATC
ATGTTTAGCTATCCGAGGTTTATATGACCGTTTTTGAAAAAGCGTTGCTT
TGTCAATTAAAgctattttttgaagaaacagCACCGTGGTACGAAATGTA
GGCATTACGAGAAAAAATTCGATTATTGCTATGTGGCTATGTGGTTTGGT
CTTTATGTGGATTCGGCTTCTTGTTACTATTAAGAAAatacgtcagcatt
ttttttgatttcgaatgatttttatgtacatgtttttttttgactgtatc
aaaatttcaaattcaaaaatcccaaattttacaaaaaccttTATAATTTC
GATGCAATTGTCATTCGGGACTAGAAAATTCACAGAACTGGAGTTGATCG
TGATACAAAAAGTCCTGCAAGGTCAAATTTATGAATTAGGAGtgcaatat
gattattttggtcattttgactttaggttcatattttactcattttgttg
taatttctaaaaattctgaTTTGAAGCCAATATTTGACATTTCTGAAGTC
AAAATACCTTTTCAGGAGTAAAATAGGACAAAAAATGAGTGAAAATAACG
ATTTTGATACAGTCAATAAAAAACAAGTCCTTAAAAcactcaaaacttta
tttttcaggtttgCTTCAGGAGACCATGGTGACAATTTCCCTTTCGATGG
AATTGGGCGTGTCTTAGCGCACGCCTTTCCTCCACCCAATGGCGGAATTC
ATTTTGATGACCACGAGAATTTCATTGCATCTGGAAGTCAAGGAGGCATC
AACCTCCCTTGGGTAGCTTTGCATGAAATCGGTCATAGTTTAGGTGGGTG
GCAAAAAAGTCacaattttttcacatttatcaaaaataaaacaagagaAT
GACTTTCATTACATCTTACAAAGCATTCAATTCCAACCTCCCATGATTCA
TTGCgacatactttaatcgtagaaattttagcgagactaattttagcgtt
ttagcgagtttttcctattttcgctaaaataaatctcgctaaaacacgcc
gaatcgccagatcgctaaaatttatccatgcgaaatttctggttatattg
cattgacaaatttttatcaataagAAGGGTTttagtgcaaagaaatgcta
gaaaacgaaagcaatcaataatgtaatacgagtattcgctaaagttaatc
cacgcgaaattttttgaaatcgtgattcgctaaaataaatccaaaaaaaa
tcaagattttcctgactcgctaatatgcgctaaaattagtctcgctaaaa
tttctacgattaaagtattactCCTATCAATCTTTAAAGAGTAAAGAGAC
TAGCTTTAAGCTGGCCTTAAACGAAAGgcgtcaaaatatctaaaggCGTT
ACATTGACATCCTcagagataaaaaattttgacgtCCTTTTCTGTAATTT
AATTACCAGTCTCTTTGAAATCTGACCACACTGCAAAGGGTTtgagtaag
taagtctgcgaccacagtcggaggcgacccaaaggcttctctttcgatag
ctgtctacctgAATGTagttttaattgctgagcatcaagcagagaagcat
caagtaccatttagggaatctttggtatgacccgaccgggggttgaaccc
acaaccttgcgcaccgtagccggatgctctaccactgaacTACAGTCGCA
AAGGGTTTAGAGTTGTATCTACtatcaattcttcttttttcgCACAGGTC
TTCAACACTCGAACGTCAAGTCATCTGTTATGTACCCTTTCTATCCTGGA
CACAGCCTAGCAAGTACCGTTAACCTTGATCAAGATGACATCACAAATAT
TCAACAGCTTTATGGTAAAAGACCAGGTAAAGGTTTATGCTTTTTTAATT
ACCCACCCCTGTCATAGACCCGGTGGAACTGGCCCGCTGCAATGACATta
ggccaaaatttcttccacaGTGGAAAAATACTTTGCAAGATTCAACCTCA
CTTAGAAATTGACAAAACCATCCAACTGGATAATTTGACATAGGAACAAT
AGGCCCCCTGCCCACTTTGGGATTAAGTTTCGTTGACACTGCGAGGCAGG
GGTGTAGTTTTAAAGAGGGCACAGCTCTCAGAAGTATCATAGAGCCAGCG
CCACCgggggggggcagggggCATGGCCCGGCCACTCCTTAGACTATATT
CATTggcctcccactttcaatttcattgcGTGGAAAATAGAcgtaaaatt
ttcacttttcaacaATATATTGCTTTGATAAAACcggtaagaaaaaaaaa
caaacacaacTTTGcagaaaatcgaaatttcagaTATTTTACGTCCTATT
TTGCCTGCTCAATGTGTGGAGatgttgtatttttttataaaaacaaactt
tataagaaggCTTTATGTGTTCTTAGAAAATTGCCCAAGGAATTCGTACA
AGAAATTGTACAAAAgcgtgaaaaaaaaactattcaaaataagaacattt
caggaaTATTTATAGGATTAAAACCAAAAAGTTACAGACTTCttgattca
aaaattttaaatgttcttataaaatcgtGTATCATCGGAAAAGTCTTTGG
CATGATATTCATGTCTTAACTTAGTGGTGAGGAACCTTAAAACTGACTGA
GAATAAATTGTGCTTCCAACCACAATCGGGTTATATTTTCCTTTATAGTA
TCGACAACCTCAACAACAACTAAAGCCAACGTTATTCAAGACTGTGTTGA
CAAGTATCCAGACTATTTGTGTGGATCATGGGCTAGAGGTGGTTTTTGCA
CTCGAAGCCAAAGAGTGGCAAAGTATTGTCCAAAAACATGTAAACAGTAT
CAATATTGCTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000108_pilon:861761..867572+ >XLOC_044479 ID=XLOC_044479|Name=XLOC_044479|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1968bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:861761..867572+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTGTTGATTCCCTTGTTGAGAGACTTTATTTTTTGTTAACGTGTGT
GTTCATTGGACGAATTGTTTCGTTACCAGTTCTCCAGCCTATGATGGTTG
TTGATTCCCTTGTTGAGAGACTTTATTTTTTGTTAACGTGTGTGTTCATT
GGACGAATTGTTTCGTTACCAGTTCTCCAGCCTATGAGCTACTTGGAAAG
GTATGGATACCACCAAAAACCGTCTGaaaaaaaCCTCCTTTTCGAATATT
CATCATCAACTATccctgaagaagaagaaacgaTCAAATCGAGCATCAAG
AACTTCCAGAGATTCGTTGGACTCCCTCAAACAGAGCTACTTGGAAAGGT
ATGGATACCACCAAAAACCGTCTGaaaaaaaCCTCCTTTTCGAATATTCA
TCATCAACTATccctgaagaagaagaaacgaTCAAATCGAGCATCAAGAA
CTTCCAGAGATTCGTTGGACTCCCTCAAACAGGCGAATTCGACGATGCAA
CATTACATCAAATGGAAGCACCAAGATGCGGACGACCAGATTTTCAACCA
CAAACATTACTTTTCTCGCTTCCCCAAAGATATTATTGGAAAAAATGGGA
TTTGACTTATCGAGTCGAAAAATATACTTCTGATTTAGCTAAACAAGACA
TTGACCAGATTTTCAAAGATTCTTTCGAGCAATGGACAAAAGCATCTGAT
CTTACATTTGAGAAGAGTAATAATTCTATAGTTGATATCATGATGAAGCG
AATTCGACGATGCAACATTACATCAAATGGAAGCACCAAGATGCGGACGA
CCAGATTTTCAACCACAAACATTACTTTTCTCGCTTCCCCAAAGATATTA
TTGGAAAAAATGGGATTTGACTTATCGAGTCGAAAAATATACTTCTGATT
TAGCTAAACAAGACATTGACCAGATTTTCAAAGATTCTTTCGAGCAATGG
ACAAAAGCATCTGATCTTACATTTGAGAAGAGTAATAATTCTATAGTTGA
TATCATGATGAAgtttgCTTCAGGAGACCATGGTGACAATTTCCCTTTCG
ATGGAATTGGGCGTGTCTTAGCGCACGCCTTTCCTCCACCCAATGGCGGA
ATTCATTTTGATGACCACGAGAATTTCATTGCATCTGGAAGTCAAGGAGG
CATCAACCTCCCTTGGGTAGCTTTGCATGAAATCGGTCATAGTTTAGgtt
tgCTTCAGGAGACCATGGTGACAATTTCCCTTTCGATGGAATTGGGCGTG
TCTTAGCGCACGCCTTTCCTCCACCCAATGGCGGAATTCATTTTGATGAC
CACGAGAATTTCATTGCATCTGGAAGTCAAGGAGGCATCAACCTCCCTTG
GGTAGCTTTGCATGAAATCGGTCATAGTTTAGGTCTTCAACACTCGAACG
TCAAGTCATCTGTTATGTACCCTTTCTATCCTGGACACAGCCTAGCAAGT
ACCGTTAACCTTGATCAAGATGACATCACAAATATTCAACAGCTTTATGG
TAAAAGACCAGGTCTTCAACACTCGAACGTCAAGTCATCTGTTATGTACC
CTTTCTATCCTGGACACAGCCTAGCAAGTACCGTTAACCTTGATCAAGAT
GACATCACAAATATTCAACAGCTTTATGGTAAAAGACCAGTATCGACAAC
CTCAACAACAACTAAAGCCAACGTTATTCAAGACTGTGTTGACAAGTATC
CAGACTATTTGTGTGGATCATGGGCTAGAGGTGGTTTTTGCACTCGAAGC
CAAAGAGTGGCAAAGTATTGTCCAAAAACATGTAAACAGTATCAATATTG
CTGATATCGACAACCTCAACAACAACTAAAGCCAACGTTATTCAAGACTG
TGTTGACAAGTATCCAGACTATTTGTGTGGATCATGGGCTAGAGGTGGTT
TTTGCACTCGAAGCCAAAGAGTGGCAAAGTATTGTCCAAAAACATGTAAA
CAGTATCAATATTGCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000108_pilon | genome | sc0000108_pilon:861761..867572 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 823-984:5651 |
| Aaloc | 694-819:4700 |
| Aaloc | 508-690:3610 |
| Aaloc | 244-504:2322 |
| Aaloc | 94-240:1443 |
| Aaloc | 1-93:1 |
|
