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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000108_pilon:808322..814181+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044476 ID=XLOC_044476|Name=XLOC_044476|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5860bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:808322..814181+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGAAATCAACAACTCTATTCCTATCGGCCATCGCCATGGTAATTGT
AACAGGTACGGATGTAGCAGAAGTTGATGTTAatttcagatgagatggag
tttttataagatactttaataattggtcatttgaagtaataaaaatgacg
cgttctttagataAAATGtaacaaacattttttattacaaatcaaataag
agcttgtaaaaactccatctcgccCCCCTTAATTTATGACTATGATACGA
ACCCTTTTTTGGGagagaaaaaattcatttttcaatgtatcttctttctt
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cacttagctggaaagtggtttaaattactctctgtagtTTCAAATCTTAT
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aattttttcttttttctccttttttatgATTTAGCGACATCAAAGGTCAC
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AACCcacttattaattttcgaaagattttcgGACCCCCACCCGTTtgtat
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tATACCAAGCTGAATTGTTCTAAAAAGCCTGTGTTCAGTTTATACcaacc
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TGAAAACAACAAACCTTATGAATTTACTATTGGGCTATTTCAGAAACAGT
ATGTACCCCAAatattgcaagtattttaaaatcatctcAGTAAAGAtcaa
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gcaattggcggctacggtcgaaaaggtgtatcttAACAATTTTTTCAAGG
TGGTGTATTTGCCGATTGTCAAAAACGAAGATCAACCATCGACTGCAGCA
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CATCCAGAATGGGGAGCCACCAAAACCCCTGTTAAGAGATTAATTGGtaa
atatttaaattcataaAATTGTATTTCACAGTTCaaataccctgagtatc
agaggttaagttttcaaagaatatattaacctctgaagaccaataataga
agtTTTAtcacgcatgtgtcaatctaatcactgtagaaaaaatcaaagat
gaagagcaaatattaccatattaatgtctagcagactgtatcagtatgca
gtttactatttcggaattccccagaaacctccaagtgtaattgaaacgtg
tttatttcgaaagaaatcatttacatgatccccaaatgtatagcagtaat
tactaaacttttaattgtggaaatgtcactttaattgaatcgaaagaata
gacagactttatgttatgattctctatcactgactctttttacaaagcat
tgatgactttttaagttgtgttttcaacgacgggaataaaaatatcaact
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gttgattgcgcgctgaatagaatctcgatttgtcggcacagcgtcaatat
atgattttgagctgtgctatTCACGAGAGAGAGTAGAGAGTCGATATTTC
ATCGTTTAATTTCAAATGCTTTATCCTTTGACTTCATCTCAGTCCGCTGT
TTCAGGGACCTCGTCATTCTTTACACAaagttgttttaacgttcaaataa
cgttatttggacgtcatgaatgtcaaatggacgttgttttgacgttgtgt
gccgtccgGGTTAAGTACGAAATCTATTTCATagatttcacagtcgaaat
ggatcatttGTAATCAGGAGTGATTGTGCCTCCAtaacggcttcccgttg
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gattacccattaaaCTTTGCGACTGGGAAATGGCCTACCTTATCGGctaa
aacttagtcggccctaagtgactaaattttggcttggtgactaaaataag
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gaaatggccaaaacttagttattagtcggcccttagtgactaaattttga
cagggtgactaaaattagggccgactgaTAATTAAGAATGACTAAAATtg
aggccgactaagttttggcaaATAAGTTAACTTTAATTGAATAACATCGC
ATTTTCAGAAGCCCTTTATGCAGATGGTGTGGCAACAGCTCGTGGATTTC
CAAATACACCAGTGATTCCAACAGCAAATGAAGTCTCTAAAGCTGCATTT
ACAGTTGAACAGAAGAGCATGTCAAACAGTGAAGGTTTTGCTGTTTCTTT
CATGGCCTTTGCACAATTTGTGGATCATGATATGACTGATGTCGAAATGC
AAGTttgcaaatataaaaaatacggAAGGTAATGCTTTTAATTGCTGTTT
AGGGGGTAATATGGTATAATGGTTATCATCCTTAACTTCCGGCTCTGGGC
GCCccagttcgatacccaccgtctCTATATCTCTATCACTTAGCAATTAA
ATATatcttcgcccgggtcaacccatgccatgtgaggggaattagATACG
ATTATTTTGATACAAGAGTTTGGTAGATGAAATAGACAATTCGAAGTGCC
GTGGCACTTATAAGGTTCAACCTAACGCGATCATCGCCtctgcctcgtat
tcaaacaattaccatggtgattatggctgagacattaatttttttttaat
agaaagtagttttatcAAAATCCACTGGGGAGTTAATCACCGTGGCAATA
ATTTccaaacgaggcaagtgatgttagTGACGTAGTTTATGAAAAGATAT
ATTGATGAAAACAACTTTCCCTCTTTATAGTTGCGACAACATAGAGGAAT
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GATAATTCAAAGAATACACCTTGTACACCTTTTCATCAATCCGTTTCCAT
GTGTAAAAAAGACGAAAATAATGTAGATGAAGTGCGCGAAGTTCCAAATC
GGGTATCGTCATTTCTTGATGGTTCACAAATTTATGGAGCAGAAGCTGAT
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gtctcacaacccatTCTCAAAACCTGTCTCACATACTTGTCTCGcagccc
tgtctcacagccttgTCTCACAGCCTTGTCTCACAGCTCTGTCTCACGGT
CCTGTCTCGcagccctgtctcacagccttgTCTCACGGTCCTGTCTAACA
GTCCTGTCTCACAGCTATGTCTCATAGCCTTGCTCACGGCCCTGTCTAAC
TGTCTAACAGTCATGTCTCACAGTCCTGTCTCACAATCTATTCTCACAGC
CCTGTCTAACAGTTCTTTCTCACAGCCATGTCTAACAGTTCTGCCTCATA
ACCCTGTCTCACTACCCTGTCTCATAGCCCTGTCTAACAGTCCTATCTCA
CAGCCCTGTCTTATGACCCTGTCTAACCACCCTATCTCACAGCCCTGTCT
TtcaaccctgtctcacagctctgGCAAAACTTCTCTCCACAGTGGGAGTG
AAAGTTTCTCTTGAAATTCCAATTGATTTTCCAATTGgagattgaaattt
tattgtaccaagtacccctccccccgtACGAGAGGTGTGTCAAACTAAAC
TTTTTACAATCTGAAAAACATATTGGCACGTGAAATTGATGTAAATTATG
AGGTAAAGACTCCCTGTCTTCTTCACTTGAGCGTACTAAAAAATTATTAA
CAGACAAAGTTAAATCGAGAGTAGAATTTTGTAATAAATGTTTTTTCCTT
TCCTAGATCGGGCTAAGATGAATCTTACCTGCGATGGCTTGCTACCTGTT
ATGTTAATACCTGGTGTTTCTGCATGTTCCTTCCTACAAAATATTGATGG
TTTAAAGAAGCGTAGCGCGTGTCGTGTTTTGGGTGGATGCTCTTTCGTAG
GTGACCCAAGAGGTGATGATAATATCCCCTTACACACAATGCATACCCTA
TGGCTCCGCAACCACAATAAAATTGTGGACGGTCTTCGAGCACAAAACCC
TAACATGTACACTGATGAAACTTTGTATCAAACTGCACGCAAGATTAATA
CTGGAATCTGGGCTCATTTGGCTTTTGATGAATATCTTCCAGATTTGGTT
AAACTTCCAGTCTATACAGAATACAAAGCTAACACTGATCCCAGTATTAT
TAATGCTTTTAATACCGCCGCTTTCCGTTATGGTCATAGCTTAGTTCCCA
ACTCTTTTGACCAAAATGACAATGCGTTCAATCGCCTTGCTGATCCCATT
TCATTACAAGACGCTCTCAACAATCGGGAACCAGTCAACTTCCGTGGTAT
CGAACCGATCTGGTTTGGATTAACTGGTAATAAATCAGCTCGAGTAGATT
ATAAATTTGCTGACGGAATCGCACGCAAATTATTTGTTCGCCCTCAAGAA
AAATTATATCGTGATTTACTTGCTATTAATATCCAAAGAGGTCGTGATCA
TGGCTTGCAAACGTATGGCCATTACCGTAAGTTGTGCAAGCTCGCAACAT
TGGAGTCCTGGAAGGAAGCAGAAGATAAAAAAGTCTTCTTTAAAGCCGCA
AGAGAAGGCTTACAAAGAATCTTCAAGCATCCCAATGACGTCGATCTGTA
TGCTGCTGGTGTCTCGGAGATTCATGCAACGGGTTCAGAACTGGGTCCGA
CGTTTCAATGCTTAGTCAAGAAGCAATTTTCGGCAATCCGAGATGGAGAT
CGATTCTTTTGGCGAAGTCCTAAGGTTTTTAGTGAAGCTCAGAGGAATGC
CATCGAAGCTGTCAGTTTTGCGAGTATTCTTTGCGACAACTTGAATGGTA
TCGTATCCATCCAACCAAAAGCATTGAGAGTACCTAATACAGTTGACAAC
CAGCGAACCGAATGCGGTAATatcaaaaaacttgatttatcTAAATGGAA
GATCGATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000108_pilon:808322..814181+ >XLOC_044476 ID=XLOC_044476|Name=XLOC_044476|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3894bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:808322..814181+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGAAATCAACAACTCTATTCCTATCGGCCATCGCCATGGTAATTGT
AACAGATGTTGAAATCAACAACTCTATTCCTATCGGCCATCGCCATGGTA
ATTGTAACAGgtgggGCCATTTCGTTGGAGAATTTGGAAGAAAATTACAA
ACGTTTTATTGGAGGGTTCCTTAACAATATCGAAGGAGAAAATAACAAGC
CTAGCAAAGgtgggGCCATTTCGTTGGAGAATTTGGAAGAAAATTACAAA
CGTTTTATTGGAGGGTTCCTTAACAATATCGAAGGAGAAAATAACAAGCC
TAGCAAAGgtgtatcttAACAATTTTTTCAAGGTGGTGTATTTGCCGATT
GTCAAAAACGAAGATCAACCATCGACTGCAGCAAAGCCAGCAAAAATTTC
CGATCCATCGATGGGCTTTGTAACAATCTTGATCATCCAGAATGGGGAGC
CACCAAAACCCCTGTTAAGAGATTAATTGgtgtatcttAACAATTTTTTC
AAGGTGGTGTATTTGCCGATTGTCAAAAACGAAGATCAACCATCGACTGC
AGCAAAGCCAGCAAAAATTTCCGATCCATCGATGGGCTTTGTAACAATCT
TGATCATCCAGAATGGGGAGCCACCAAAACCCCTGTTAAGAGATTAATTG
AAGCCCTTTATGCAGATGGTGTGGCAACAGCTCGTGGATTTCCAAATACA
CCAGTGATTCCAACAGCAAATGAAGTCTCTAAAGCTGCATTTACAGTTGA
ACAGAAGAGCATGTCAAACAGTGAAGGTTTTGCTGTTTCTTTCATGGCCT
TTGCACAATTTGTGGATCATGATATGACTGATGTCGAAATGCAAGTttgc
aaatataaaaaatacggAAGAAGCCCTTTATGCAGATGGTGTGGCAACAG
CTCGTGGATTTCCAAATACACCAGTGATTCCAACAGCAAATGAAGTCTCT
AAAGCTGCATTTACAGTTGAACAGAAGAGCATGTCAAACAGTGAAGGTTT
TGCTGTTTCTTTCATGGCCTTTGCACAATTTGTGGATCATGATATGACTG
ATGTCGAAATGCAAGTttgcaaatataaaaaatacggAAGTTGCGACAAC
ATAGAGGAATCATTTAAATATCCTTGTCTACCGATCCTGTTCAATAACAA
CAACTTGAACGATAATTCAAAGAATACACCTTGTACACCTTTTCATCAAT
CCGTTTCCATGTGTAAAAAAGACGAAAATAATGTAGATGAAGTGCGCGAA
GTTCCAAATCGGGTATCGTCATTTCTTGATGGTTCACAAATTTATGGAGC
AGAAGCTGATCTAGCAGATGCACTGAGAAGTACAACAGTTGCGACAACAT
AGAGGAATCATTTAAATATCCTTGTCTACCGATCCTGTTCAATAACAACA
ACTTGAACGATAATTCAAAGAATACACCTTGTACACCTTTTCATCAATCC
GTTTCCATGTGTAAAAAAGACGAAAATAATGTAGATGAAGTGCGCGAAGT
TCCAAATCGGGTATCGTCATTTCTTGATGGTTCACAAATTTATGGAGCAG
AAGCTGATCTAGCAGATGCACTGAGAAGTACAACAGATCGGGCTAAGATG
AATCTTACCTGCGATGGCTTGCTACCTGTTATGTTAATACCTGGTGTTTC
TGCATGTTCCTTCCTACAAAATATTGATGGTTTAAAGAAGCGTAGCGCGT
GTCGTGTTTTGGGTGGATGCTCTTTCGTAGGTGACCCAAGAGGTGATGAT
AATATCCCCTTACACACAATGCATACCCTATGGCTCCGCAACCACAATAA
AATTGTGGACGGTCTTCGAGCACAAAACCCTAACATGTACACTGATGAAA
CTTTGTATCAAACTGCACGCAAGATTAATACTGGAATCTGGGCTCATTTG
GCTTTTGATGAATATCTTCCAGATTTGGTTAAACTTCCAGTCTATACAGA
ATACAAAGCTAACACTGATCCCAGTATTATTAATGCTTTTAATACCGCCG
CTTTCCGTTATGGTCATAGCTTAGTTCCCAACTCTTTTGACCAAAATGAC
AATGCGTTCAATCGCCTTGCTGATCCCATTTCATTACAAGACGCTCTCAA
CAATCGGGAACCAGTCAACTTCCGTGGTATCGAACCGATCTGGTTTGGAT
TAACTGGTAATAAATCAGCTCGAGTAGATTATAAATTTGCTGACGGAATC
GCACGCAAATTATTTGTTCGCCCTCAAGAAAAATTATATCGTGATTTACT
TGCTATTAATATCCAAAGAGGTCGTGATCATGGCTTGCAAACGTATGGCC
ATTACCGTAAGTTGTGCAAGCTCGCAACATTGGAGTCCTGGAAGGAAGCA
GAAGATAAAAAAGTCTTCTTTAAAGCCGCAAGAGAAGGCTTACAAAGAAT
CTTCAAGCATCCCAATGACGTCGATCTGTATGCTGCTGGTGTCTCGGAGA
TTCATGCAACGGGTTCAGAACTGGGTCCGACGTTTCAATGCTTAGTCAAG
AAGCAATTTTCGGCAATCCGAGATGGAGATCGATTCTTTTGGCGAAGTCC
TAAGGTTTTTAGTGAAGCTCAGAGGAATGCCATCGAAGCTGTCAGTTTTG
CGAGTATTCTTTGCGACAACTTGAATGGTATCGTATCCATCCAACCAAAA
GCATTGAGAGTACCTAATACAGTTGACAACCAGCGAACCGAATGCGGTAA
TatcaaaaaacttgatttatcTAAATGGAAGATCGATTAAATCGGGCTAA
GATGAATCTTACCTGCGATGGCTTGCTACCTGTTATGTTAATACCTGGTG
TTTCTGCATGTTCCTTCCTACAAAATATTGATGGTTTAAAGAAGCGTAGC
GCGTGTCGTGTTTTGGGTGGATGCTCTTTCGTAGGTGACCCAAGAGGTGA
TGATAATATCCCCTTACACACAATGCATACCCTATGGCTCCGCAACCACA
ATAAAATTGTGGACGGTCTTCGAGCACAAAACCCTAACATGTACACTGAT
GAAACTTTGTATCAAACTGCACGCAAGATTAATACTGGAATCTGGGCTCA
TTTGGCTTTTGATGAATATCTTCCAGATTTGGTTAAACTTCCAGTCTATA
CAGAATACAAAGCTAACACTGATCCCAGTATTATTAATGCTTTTAATACC
GCCGCTTTCCGTTATGGTCATAGCTTAGTTCCCAACTCTTTTGACCAAAA
TGACAATGCGTTCAATCGCCTTGCTGATCCCATTTCATTACAAGACGCTC
TCAACAATCGGGAACCAGTCAACTTCCGTGGTATCGAACCGATCTGGTTT
GGATTAACTGGTAATAAATCAGCTCGAGTAGATTATAAATTTGCTGACGG
AATCGCACGCAAATTATTTGTTCGCCCTCAAGAAAAATTATATCGTGATT
TACTTGCTATTAATATCCAAAGAGGTCGTGATCATGGCTTGCAAACGTAT
GGCCATTACCGTAAGTTGTGCAAGCTCGCAACATTGGAGTCCTGGAAGGA
AGCAGAAGATAAAAAAGTCTTCTTTAAAGCCGCAAGAGAAGGCTTACAAA
GAATCTTCAAGCATCCCAATGACGTCGATCTGTATGCTGCTGGTGTCTCG
GAGATTCATGCAACGGGTTCAGAACTGGGTCCGACGTTTCAATGCTTAGT
CAAGAAGCAATTTTCGGCAATCCGAGATGGAGATCGATTCTTTTGGCGAA
GTCCTAAGGTTTTTAGTGAAGCTCAGAGGAATGCCATCGAAGCTGTCAGT
TTTGCGAGTATTCTTTGCGACAACTTGAATGGTATCGTATCCATCCAACC
AAAAGCATTGAGAGTACCTAATACAGTTGACAACCAGCGAACCGAATGCG
GTAATatcaaaaaacttgatttatcTAAATGGAAGATCGATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000108_pilon | genome | sc0000108_pilon:808322..814181 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 793-1944:4709 |
| Aaloc | 631-789:3819 |
| Aaloc | 547-630:3732 |
| Aaloc | 328-543:3061 |
| Aaloc | 157-324:1678 |
| Aaloc | 58-153:310 |
| Aaloc | 1-54:1 |
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