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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000187_pilon:568365..570011+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044393 ID=XLOC_044393|Name=XLOC_044393|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1647bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000187_pilon:568365..570011+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGTCACCTTTTTTCAGCCATTAGTCCTTTTTTCAAAGATGTGTTTTCTAA
ACTCCAAGACTCTTCAGACAACAAAATAACACTACATAATTTAACTGGGA
ATACAATGGATGATATTCTTCACTTTGCCTACACAGGGGAGGTGTGTGTC
CATGATGGAAACGTACGCCAACTTCTTGCTACATCTAGATTTCTTCAAAT
GAATAATTTAAAGGAGATGACAACTTCTTATTTGGAAAAGAAACTCAACC
CTTCTTCTGCTGTTGATATACTTTTACTGGCTGACAAGCACAAGTGTGAA
AATCTCTTGGCAGCTACTGAGAAAGtcataattgataattttgttATTGT
ATCAAAGACTGAAGGAttcaaaaagatgaaatttgaaatgatacACATGT
TTATACAAAGTGAATACATCAGAGTTAGCAAAGAAGAAGAGGTCTATGAG
GCTGTTATGCTTTGGGTAAAATCTGACTTTGGCAATCAAAGACTTGAACG
TATCAGTCAGTTACCCAACCTATTGAGAGAAATTAGATTTGCACTAATTT
CTCCCCCTTATATAACAGAAATGACCATGGATCCTACAATTCTTGAAAAC
TCTGAATGTTATGATATTGTAACAGAGGGATTGAATTATCATGGTTCAGC
AGGAGTTATGGCGCCAAATCATTCCTATGAGCCTAAATTAACAAAACCAC
GGAAATTAATGGAAACAGTTCTAGGTGTGATTTCAGTTGGTGGATGGGAT
AAAGAAAAGCCTGTCACAGATGTATATGCGTTTGTTGAATCTAAGAAGAA
TTGGtttcctttgaaatcaatgCCTACTGCTTGCTATGGTCACTCAGTAG
TTAACAGTGATGGCCTTATTTATGTTATTGGTGGGAGAGATGAAAATGCT
AAACTTCTAACAACTGTTACAAGATTTGATCCAGCAACCAATGATTGGAG
AAGTGTTAAAAATTTGCCTTACGCTTTGACTTCAACTGGggtttgtattt
ttaaaggtcaaATTTATGTTGTTGGTGGCATCTCCCATAAGGGATCATTG
AAATCAGTATTAAGATATAGTTCAAGATATAATGTATGGCAAAAGGTTGC
AAATTTGAAATATCCTAGAGGAGCCTGCACTGTAGTGACGGATGGGAAAT
TAATGTATGCAATCGGAGGAATGAGAAAGGTTGTTACTGGCCAGGATGTA
TCTTGGGAATATCTTGATTCAATGGAGATTTATGATAAAGATTCTAAGTC
TTGGACAATGGGGAAAGATTTATTAAACAAACGAGCATATGGTACTGCTG
TTTATACTaataaaaagatttatttaaCAGGAGGGCAAAATAAATTATTG
TCAAATGTCAAAGGAATTGAGCTTTATGATACCATGAAAGTTGAATGGGT
TTCTATTTCTTATTTTGGAATCCAACGCTCATTAAATGGAATTGctttaa
atgaaaatacattctTTTTGGTTGGAGGAATTTCTAAAGATGGAGAAGTT
ATTGATTCTGTTGAAGTTTTTGATATGACAAGAAACCGTTCAACAAAAGT
TGCAACGCTGCCAAAAACATTAAGTATGCTCCAATGTTGTACTTTACCTA
TGAAGTTAGCAGTGCTGCAAGGCATGGATACTGAGTTGATTAATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000187_pilon:568365..570011+ >XLOC_044393 ID=XLOC_044393|Name=XLOC_044393|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3294bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000187_pilon:568365..570011+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGTCACCTTTTTTCAGCCATTAGTCCTTTTTTCAAAGATGTGTTTTCTAA
ACTCCAAGACTCTTCAGACAACAAAATAACACTACATAATTTAACTGGGA
ATACAATGGATGATATTCTTCACTTTGCCTACACAGGGGAGGTGTGTGTC
CATGATGGAAACGTACGCCAACTTCTTGCTACATCTAGATTTCTTCAAAT
GAATAATTTAAAGGAGATGACAACTTCTTATTTGGAAAAGAAACTCAACC
CTTCTTCTGCTGTTGATATACTTTTACTGGCTGACAAGCACAAGTGTGAA
AATCTCTTGGCAGCTACTGAGAAAGtcataattgataattttgttATTGT
ATCAAAGACTGAAGGAttcaaaaagatgaaatttgaaatgatacACATGT
TTATACAAAGTGAATACATCAGAGTTAGCAAAGAAGAAGAGGTCTATGAG
GCTGTTATGCTTTGGGTAAAATCTGACTTTGGCAATCAAAGACTTGAACG
TATCAGTCAGTTACCCAACCTATTGAGAGAAATTAGATTTGCACTAATTT
CTCCCCCTTATATAACAGAAATGACCATGGATCCTACAATTCTTGAAAAC
TCTGAATGTTATGATATTGTAACAGAGGGATTGAATTATCATGGTTCAGC
AGGAGTTATGGCGCCAAATCATTCCTATGAGCCTAAATTAACAAAACCAC
GGAAATTAATGGAAACAGTTCTAGGTGTGATTTCAGTTGGTGGATGGGAT
AAAGAAAAGCCTGTCACAGATGTATATGCGTTTGTTGAATCTAAGAAGAA
TTGGtttcctttgaaatcaatgCCTACTGCTTGCTATGGTCACTCAGTAG
TTAACAGTGATGGCCTTATTTATGTTATTGGTGGGAGAGATGAAAATGCT
AAACTTCTAACAACTGTTACAAGATTTGATCCAGCAACCAATGATTGGAG
AAGTGTTAAAAATTTGCCTTACGCTTTGACTTCAACTGGggtttgtattt
ttaaaggtcaaATTTATGTTGTTGGTGGCATCTCCCATAAGGGATCATTG
AAATCAGTATTAAGATATAGTTCAAGATATAATGTATGGCAAAAGGTTGC
AAATTTGAAATATCCTAGAGGAGCCTGCACTGTAGTGACGGATGGGAAAT
TAATGTATGCAATCGGAGGAATGAGAAAGGTTGTTACTGGCCAGGATGTA
TCTTGGGAATATCTTGATTCAATGGAGATTTATGATAAAGATTCTAAGTC
TTGGACAATGGGGAAAGATTTATTAAACAAACGAGCATATGGTACTGCTG
TTTATACTaataaaaagatttatttaaCAGGAGGGCAAAATAAATTATTG
TCAAATGTCAAAGGAATTGAGCTTTATGATACCATGAAAGTTGAATGGGT
TTCTATTTCTTATTTTGGAATCCAACGCTCATTAAATGGAATTGctttaa
atgaaaatacattctTTTTGGTTGGAGGAATTTCTAAAGATGGAGAAGTT
ATTGATTCTGTTGAAGTTTTTGATATGACAAGAAACCGTTCAACAAAAGT
TGCAACGCTGCCAAAAACATTAAGTATGCTCCAATGTTGTACTTTACCTA
TGAAGTTAGCAGTGCTGCAAGGCATGGATACTGAGTTGATTAATTGAAGT
CACCTTTTTTCAGCCATTAGTCCTTTTTTCAAAGATGTGTTTTCTAAACT
CCAAGACTCTTCAGACAACAAAATAACACTACATAATTTAACTGGGAATA
CAATGGATGATATTCTTCACTTTGCCTACACAGGGGAGGTGTGTGTCCAT
GATGGAAACGTACGCCAACTTCTTGCTACATCTAGATTTCTTCAAATGAA
TAATTTAAAGGAGATGACAACTTCTTATTTGGAAAAGAAACTCAACCCTT
CTTCTGCTGTTGATATACTTTTACTGGCTGACAAGCACAAGTGTGAAAAT
CTCTTGGCAGCTACTGAGAAAGtcataattgataattttgttATTGTATC
AAAGACTGAAGGAttcaaaaagatgaaatttgaaatgatacACATGTTTA
TACAAAGTGAATACATCAGAGTTAGCAAAGAAGAAGAGGTCTATGAGGCT
GTTATGCTTTGGGTAAAATCTGACTTTGGCAATCAAAGACTTGAACGTAT
CAGTCAGTTACCCAACCTATTGAGAGAAATTAGATTTGCACTAATTTCTC
CCCCTTATATAACAGAAATGACCATGGATCCTACAATTCTTGAAAACTCT
GAATGTTATGATATTGTAACAGAGGGATTGAATTATCATGGTTCAGCAGG
AGTTATGGCGCCAAATCATTCCTATGAGCCTAAATTAACAAAACCACGGA
AATTAATGGAAACAGTTCTAGGTGTGATTTCAGTTGGTGGATGGGATAAA
GAAAAGCCTGTCACAGATGTATATGCGTTTGTTGAATCTAAGAAGAATTG
GtttcctttgaaatcaatgCCTACTGCTTGCTATGGTCACTCAGTAGTTA
ACAGTGATGGCCTTATTTATGTTATTGGTGGGAGAGATGAAAATGCTAAA
CTTCTAACAACTGTTACAAGATTTGATCCAGCAACCAATGATTGGAGAAG
TGTTAAAAATTTGCCTTACGCTTTGACTTCAACTGGggtttgtattttta
aaggtcaaATTTATGTTGTTGGTGGCATCTCCCATAAGGGATCATTGAAA
TCAGTATTAAGATATAGTTCAAGATATAATGTATGGCAAAAGGTTGCAAA
TTTGAAATATCCTAGAGGAGCCTGCACTGTAGTGACGGATGGGAAATTAA
TGTATGCAATCGGAGGAATGAGAAAGGTTGTTACTGGCCAGGATGTATCT
TGGGAATATCTTGATTCAATGGAGATTTATGATAAAGATTCTAAGTCTTG
GACAATGGGGAAAGATTTATTAAACAAACGAGCATATGGTACTGCTGTTT
ATACTaataaaaagatttatttaaCAGGAGGGCAAAATAAATTATTGTCA
AATGTCAAAGGAATTGAGCTTTATGATACCATGAAAGTTGAATGGGTTTC
TATTTCTTATTTTGGAATCCAACGCTCATTAAATGGAATTGctttaaatg
aaaatacattctTTTTGGTTGGAGGAATTTCTAAAGATGGAGAAGTTATT
GATTCTGTTGAAGTTTTTGATATGACAAGAAACCGTTCAACAAAAGTTGC
AACGCTGCCAAAAACATTAAGTATGCTCCAATGTTGTACTTTACCTATGA
AGTTAGCAGTGCTGCAAGGCATGGATACTGAGTTGATTAATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000187_pilon | genome | sc0000187_pilon:568365..570011 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 262-1908:1 |
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