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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000239_pilon:285044..288025- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044368 ID=XLOC_044368|Name=XLOC_044368|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2982bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000239_pilon:285044..288025- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGGTTTATGCAATTATTGAGCTATGTTGCAACAATCTTTCATTTTAT
ATTTTGTACCTTATCTTTAGGTAAGTTTTTATTTTTGGACTGAGCCATTC
AAATAGGCTTTTTTTTAATATACCAAGTTAGCATGAGTGGCTAGCATTGG
GACTACCCTATCCTATGTTTTGAACTCTGTTACTCACTGATAGAAAAGAT
CAGGATAACTGACAGAAGAATAGCCTATGGTACTCAGTAATTATTATCAC
TTATTACACAAAGATTCATAATTGCTTTTAAAATCCCAGTGTACATCAGT
AACACTTAACAAAAAAACTATAAATTGTTTTATTAATTATTAAATAATGG
TTTCAATTGATTAAATTGTTTTGATTTATTCCAAACATTAATTCCAATTA
TTTAAGAAATCATGGAAATTAAAGATTGAATTTGAAGCACTTTTTTATTG
TGTTTGAATTTGTGTTGAAGGACAGACAGTTGCCAATTCCAAATAAATTC
ACAAATGTTTTTTTCTATTGAATTTCCTAATACATCTCATTTTAGCTGCT
GGTCTTTACTACATAGCTGAGGCAGTTGAAGAGTATAGCAGTGTTGCAGC
AAAAGTCATCAAATATTCAATATACGTAAGTTCTATATTATCAGTCGAGA
ATACTGTAGAGATAAATTTATTTATTTATCCATATAGATTTATCTCTATT
CTTGACTGATATACTACTCTACAAATATGGTATAGAGCAATAGACGATAT
CAGATTTAGATAAATGCAATGCATTCTGGTTTCTAGGGACTCTCAAAGGA
ATTATAATATATTATAATTGATCTATTATAATATTCCTTTGAGAGTCCCT
AGAAACCAGAATGCATTGCATTTATCTAAATCTGATAACGTCTATTTTGT
TGAAATTGCAGTCAGATTTGCAACTAAAGCTCTTAAATTAAGTGGATATT
GTAATTTATGTATCCAATTGGTCATAATGTGGTCAAAATAAGACAAGCAT
TTTGTACTAAATATGCCTCAAAAATTAACTCAGGATTTGTCGACTATAGC
TTCATTATCATACGGGGATACAGTCATGATGATTACTGGTAATTAATAAG
AATTAAGAACATTTGAAGAATATTTTTGATTTGTATTAACATTTTTCTCC
TGCTTTTTGTTTTGTTCCAGTTTACTACAAGTATTTTTGGAATGTTGTAT
CTCTTCGAAGGCTTTCCATTATACTTGATATTGATTGGGTTGTTATCAAA
TGTGGATTATTATATACTACTCAACACATTCCCTTATATCTCTATAAGTC
AACCAACGTTTGTTATTGGTTCTGGTAAGTTTGTTTTGTATTCTAAAATT
AAAGCATTGTATTTGTCTGGGAGTTTTGCAGCATCAGGTCATCGAAGTTG
TTATTGTTATCGTCATTCTATAGCACGGTTTTCCAAATTGACTTGTTTGG
TCAGATTAATTTTTAGCCTTCAAGGGTCAGGTGGTCTTTTGTCTCAAAAC
TTGGTCAAAAATCTTGGCTAGAGTCGTTTTCCATCTGAAACTTTAATTAA
CCAATGGGAAGGCTCCTGTTGGCTCCTGTTTTAGTAGTTATTAATGTCTC
AATTATTCAACTGTTTTCTTCTTTTCAATATTTTAAACAATTTTATTTAG
AAGTAAAATCTAACTCTTTGTAATTTCAGTAATGGTTTTGGTAAATCACT
ATTTAGCTTTCCAATATTTTGCAACTGTCTACTACTCATTCACTGAGGTA
TGTTCAAAGTTTAATCATTTTCAAAATTTGTTTTATTATTGTTCTTAAAA
AAGAGAATATAACTTGCTTCGATCGTTTACCGAGCTCAATCTGTTTCAAT
CAAATTTGCAAAAGAGTTAAAAACGTTCAAACTTAAGCCTCTTGGTTTGA
TTTGCTATTGAAGATAAGAGACATTTCGGGACATTTCGGGTATAACTAAC
CATGCTAAAGACTGTACCCAAGGACTTAATTGGAACGAAGCTAGGCTTTT
AAAGACTGAAGAGAACAAATTTGATAGAAAAGTGCGAGAGGCATTGGAAA
TCCAATTCCGTCAGACAGCGCCACATAGTGACCATGGTCTTAATTTAGAC
GATTGTCAGTATGTGACATCTAGGTTTTGGAAACCTATGCTCTCGTACAT
TAGGGAGAAGACAATACATTGACTTTTTTGACGTCAAAAAAAGTCAAGGT
AGCGCCTTCAACCGTTTGTATTGTTTAGACCTGACGAAGACCTGCACCAA
GCAGGTCGAAATATTGTTTACACGAAAAAATATATACAGAATGACCATTA
AAATGTTCTTTAAATTAAGAGTTGCAAATGAATTAAAATAAACCAGCAGA
TTTTATTATTCAAGATGTCAGAATTTTTCATTTCATTTTAGATTTTGGCA
TATTTCACAATCTGTTTGTGGATAGTTCCTTTCTCTTTTTTCGTATCACT
CTCAATAAACGAATGCGTGTTACCTACTACCATGCAAACCATGGATGCGC
CATCTCATCAGTTGGGTAGTAAGTCAAAATTGTTAAAACATGATTTTTTT
GATCGTCAAAACCATTTCCTTTTGTATCCTCTTCAAAACTACCATTAGAC
ATTGTTCACAATCAAGTCAAGGCTTCTTTTTAGGATGTTTAAATATCATA
CAGTCTGAGCGCTCTTTGTAATGTAGCAAAGAATGGTTCTTTTAATAAGT
CTATCTTTGAAAATATGCACGCTTTTTGCTATAATGTGGAAGCCACGACT
TATTTCACATGGAAGATAAAATAATTAGAGCGCATGGACTTTATTCTGGT
TTTTGATTGAGCTATCTAAATCTGTTTTAATCATTCTAACGTCTTCTAAC
AAATTAGGTAATGCACCACATGATCTGTTTCAAAGACCAAGGAGATCAGG
TTTACTGGGTTTGTTTGATATGATTTCTGAAAAGAAAGATAAGATGAAAG
AGGACTTGTTTGGACGAAGCAAAATGTTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000239_pilon:285044..288025- >XLOC_044368 ID=XLOC_044368|Name=XLOC_044368|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1248bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000239_pilon:285044..288025- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGGTTTATGCAATTATTGAGCTATGTTGCAACAATCTTTCATTTTAT
ATTTTGTACCTTATCTTTAGATGTGGTTTATGCAATTATTGAGCTATGTT
GCAACAATCTTTCATTTTATATTTTGTACCTTATCTTTAGCTGCTGGTCT
TTACTACATAGCTGAGGCAGTTGAAGAGTATAGCAGTGTTGCAGCAAAAG
TCATCAAATATTCAATATACCTGCTGGTCTTTACTACATAGCTGAGGCAG
TTGAAGAGTATAGCAGTGTTGCAGCAAAAGTCATCAAATATTCAATATAC
TTTACTACAAGTATTTTTGGAATGTTGTATCTCTTCGAAGGCTTTCCATT
ATACTTGATATTGATTGGGTTGTTATCAAATGTGGATTATTATATACTAC
TCAACACATTCCCTTATATCTCTATAAGTCAACCAACGTTTGTTATTGGT
TCTGTTTACTACAAGTATTTTTGGAATGTTGTATCTCTTCGAAGGCTTTC
CATTATACTTGATATTGATTGGGTTGTTATCAAATGTGGATTATTATATA
CTACTCAACACATTCCCTTATATCTCTATAAGTCAACCAACGTTTGTTAT
TGGTTCTGTAATGGTTTTGGTAAATCACTATTTAGCTTTCCAATATTTTG
CAACTGTCTACTACTCATTCACTGAGTAATGGTTTTGGTAAATCACTATT
TAGCTTTCCAATATTTTGCAACTGTCTACTACTCATTCACTGAGATTTTG
GCATATTTCACAATCTGTTTGTGGATAGTTCCTTTCTCTTTTTTCGTATC
ACTCTCAATAAACGAATGCGTGTTACCTACTACCATGCAAACCATGGATG
CGCCATCTCATCAGTTGGGTAATTTTGGCATATTTCACAATCTGTTTGTG
GATAGTTCCTTTCTCTTTTTTCGTATCACTCTCAATAAACGAATGCGTGT
TACCTACTACCATGCAAACCATGGATGCGCCATCTCATCAGTTGGGTAGT
AATGCACCACATGATCTGTTTCAAAGACCAAGGAGATCAGGTTTACTGGG
TTTGTTTGATATGATTTCTGAAAAGAAAGATAAGATGAAAGAGGACTTGT
TTGGACGAAGCAAAATGTTTTAAGTAATGCACCACATGATCTGTTTCAAA
GACCAAGGAGATCAGGTTTACTGGGTTTGTTTGATATGATTTCTGAAAAG
AAAGATAAGATGAAAGAGGACTTGTTTGGACGAAGCAAAATGTTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000239_pilon | genome | sc0000239_pilon:285044..288025 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 502-624:124 |
| Aaloc | 373-498:592 |
| Aaloc | 307-372:1302 |
| Aaloc | 151-303:1813 |
| Aaloc | 73-150:2436 |
| Aaloc | 1-69:2983 |
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