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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000250_pilon:179737..187855- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044323 ID=XLOC_044323|Name=XLOC_044323|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8119bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000250_pilon:179737..187855- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGACAGCAAAACTCCAAGAAGGTAGGTAATCTAACAGTTTGGTTTGTGTT
TCTTGTGAGCTCTGCTCTACACACAGACCAAAGCTCTTTTAACCCAAGGT
TTTTGCAGTGGCAATGATATGGAAGTCGAGAAGGTTCAGCATGCAACTTC
TTTCGAAAACTGTAGAGATTTCTTTCAAGCTGTCGAGATTTTCTTTCATA
AGCTGTCACTGCACTGGCCACTGGCTGTCCAAAATACCAGTCGGGTGTTT
ATGTTAAAAACTGCAATACACCGTTTAACAGTGTCGACTGCGCACGCGTA
TGAACAATTTGCCATTGTTTTGATTTTGGCAACCACAGGAAACTTCACTC
TCCCCCAAAGTGAGCATTTTTACCTACCGCCTCTACGGTGGAGATGGCGA
AGCTGTTAAACGGTGTATTATTGCTCTTTTCGGAAATTATTGCCAAAAAC
GGCAATTTTTTCAACGATGAAATGCTGAATCAGCAGAATTAAATAAAAAA
GTAAATAAATGAAAATTGCCGTTTTTTCAGCAATTATTGCCGTTTTTGGA
AATAAAAGTTGACTTTATTATTGAACACATGGTATTTGACACCCTCGCGA
TAAGTAGGCCGACTGTGCCTCGTTTGATTTTGTTTTCAACTGGTTTTTGT
TGAAAATGCAGATAGCAAAATCGAGTCATATGTAAACAAATTTACACTCT
TAAAATTAAAAATCCAAAAAAACCTTTTTCTCAATGCAATTTTACTATTT
GCAAACACCTCTGACATCTTTGCCCTTAAAAGGACAACATATTTTGCTGA
TTCAGCATTTCATTGTTGAAAAAATTGCCGTTTTCGGCAATAATTTCTGA
AAAGAGCAATAATTGCAGTTTTTATCTTGAACACCCGACTGAACACTGTT
GCTGTTTTTGATGAAAACGAACGTTCCACAAAAATCTTTGGAATAGCATG
TCTTGCAAGGTACCGTGCGTAACTTGGTCTAATATCGACACCCCTTGTCT
AGTTCCAACACCCTTCTTTTAGACAGGAATAATATGAAAGTTTGAATCAC
TGAATGAAAAAGGATTATCCCTCTGACCACTCAGAAAAGAAAAATAGTTT
TGACCTTTCTATCTATGAGCTCCCCGCAGCGGTTTGCGTGATGACGTGAT
TAGGACTTTTTTCTTGCATGATGGCGTGATTAGAGATTTTTTTGCCGTGA
TAAAGATTTTGGCGTGATGCACTGATAGGGCAAAAATTTGAGGCGTGATG
CGTGATTTTGGCTATTTTTCGCTATTTTCTGCTATTTTTTGCGTGATGAC
AAATTTTAGCGATTTTCGTGATGCGTGATGGAGAAAATCTTTTTGCGTGA
TGGGGTGATTAGGGGTGCAGCTGGGGGGCCTCATCTATTTCAGCTGATAA
AAAGGGGGTGTTGGTATTAGGTAAGGGGTGTTGACATTAGACCAAATTAA
GGTTGAAGGAAATAAACATTAAACTCCTCTTGCAGTATAGACCTAACTCT
TCATACAAAAATTACGGGAAACACATATTTAGACTTTGTACCCTATGCTG
CAAGCCAGCACTGAAGCTGAAGTCCCGACAAAGCGGGACAAAAATCAGTT
TTTTGCAGTTTGCAAAAAAACGCCACAGAAGATCTTTCAAATTCAGTATG
TGAATAGAGCAGTAAAAATACAATTTTTCAATTTTCCTTTTTTTTGCAAG
AGTTCTAAGACGGGCATTTGCATGTCCCGAGAGCGGAAATTAGATGAGAG
TAAAAGACGGCGTTTTTGTATACATTGCAAAATTAATTTTTGAGTTAAAA
TTTTTCAGCCAATTTTCATGATTTTGATGACGTCACAGAAATAAGAATTT
GAATAACTTCTAGTAGGAGAAAGCTTTTGACTTAAAATTTCCACCAAATG
TGTAAATCAATAAAAGGAAGCGATCCACAAAAAAAAAAATTCTTTACTGG
GGCGAACCCGAAAAAATTTTTTGTTTCCGGTCCACCGGCCGGGTGAAAAT
TTATTTCGTCGTCACCCGGCCGCATTTTTTTTTCGTACATCATCGTTAGG
GTTAGGGTTAGTTTGTTTGTTTGGAAAACTTTCGTGAATCAGTCTTTGAG
GCGTGTGATTTATCGCACGTGATATTTTATATTCTACTGTAAAATGCACG
CCTAGAAATCACTTGGAATGAAGCGGTTATCCTGATCATTGTTATAGAAA
TGAAATTTTATTCATCTCAAACTAAACCCTGCATTGTTTTTGTTAATTCT
TGCTTGCAACTCAACTTTTAAGAATGTTTTTTTTTATACAACTTGGTTTT
TATAGAAGAATCATGCTGATTTGTGAGTAAAATAAATAGAAACATTCACA
AAGTGGGGACTTTTCAGTAAGTAAACAGCTTTGTTTTTATAAAAGGAATC
ATGCTGACTTGTGAGTAAAATAAAAAGAAACATTCATAAAGTGAGGATTT
AAAAAATTGGGGAAATGTTTCTCTCACTCTACTTTTTTCTCAAAAAAGTT
CACTTCGTAATCACAGTTTGGAGCCTTTAGCAATTGAAGATAAATATTCA
AAATGAAAGAGAGTGCCAGTTCTTAGAGATATCGTAACACAATTGAAAAT
ATAAGCGATGAAAATTAAGTATTTGAATAATCGCATGCCTAGACCACCTT
AAATCAAAATCTAGGCATGCGATGATCACACGTGAATTTTTCTTATACCG
AAGACTGTAGCAGTGTCAAGTTACTACAGATTTAAGGTAAAGAAGACCAT
CATTTTAACTTCTACGAGTGCTTTAAAAAATTGAGTTTTTGGATCGAAAT
TTAGCATTTATTTAAAATTTTTTTGCGGCCGGCCGGGTGAGTGTCTTTTT
CGTCACCCGGTGGACCGGAAACAAAAAATATTTTTAGGGTTCGCCTGGCG
TCAGCAAATTTTGCAAAAAAATGAATCGTTTTTTGACTTGAACTTGAAGG
TTCCCCTCTTGGGTGATTCACAACATGTAAAATAAGGGAAGACGCATGGG
TAATTGAAAAAGTAAATTCAACATCTAAAAATATCCACTCAGGGAAAAGC
TGTGTACTTTTTTGGCTTAATTCAATATTTTTTTAAGATAGACTGCCTGA
TGTCCGCTTGACCCCCCCCCCTTTTAAGCCCATTGTGCATCCAGGTACGT
TAGATATTCTTTTCGTGTTTTTATTGACTGTAGCAAATGATAAACAAAAC
AACAAGATTATTATCAATGATGAAAAATAAAGTAACAACTCCTGACCCTT
CACAAAAGTCAATTTCATCATTTTTTCAAAAGTCAACCAAAAGGAGTAGT
AGCAACATGTCATCACCACCAGCAAAGATTGCCAAGAGAAATGATGAAAA
GGAGAATGCTACAACAACTAGTCCTTTATCGCCAGAACAGAAAAGAAAAA
TGGAAGAAAACCGGGTAAAAGCACAGGAGAAACTTCTTGAGAAGACTACT
CAGGAATTTGATATTGGTCAAAGTTGGAAGAAGGCATTAGCGCCAGAATT
CTCTAAAGAATATTTTGGCAAAGTAATAAAATCTTTAAATAGTATTTGTT
TATCGATTTAACTAAATTTAACTCTAGTCCCGCTGCTGAGGTCGATAAAT
GTTTCGTTTCGTGACACACATCTTAGAACTAACTTTTTTTGGTGGAAACT
CACAAATTAGTATATGAAGATTCCAAAATCAAAAAGTTTCCACGATATTA
TCGTGCAAGTAACGAGTAATTGGCGATTTTTTGCGTTTCCAGGCAAAATT
GCAAGGCCTGGAAATTCATGATTTTTGGGGGGTCTTCAAATTATAAAAAG
ACCTATATCACATGATAGAGCTCTTCAAACTGAGCAAAAAAGTGTATTAC
ACCAAAGTCCCAACTTCTCTAGATCAAAAGTTATGGGCCTATTTGTGGTC
AAAAAGGTGTTTAATTTTGCATAAATTAATGCAGATTGTGGGGAAATTCC
CTGTTTTCCATCAGTTTTCCATAACTTTTGATCTAGAGAAGTTGGGACTT
TGGTGTAATACACTTTTTTGCTCAGTTTGAAGAGCTCTATCATGTGATAT
AGGTCTTTTTTTAATTTGAAGACCCCCAAAAAATCATGAATTTCCAGGCC
TTGCAATTTTGCCTGGAAACGCAAAAAATCGCCAATTACTCGTTACTTGC
ACGAAAATATCGTGGAAACTTTTTGATTTTGGAATCTACATATACTAATT
CGTGAGTTTCCACCAAAAAAGTTAGTTCTAAGATGTGTGTCACGAAAATC
GTTTTCTAGCCACTTTTTTCGATCTCAGCAGCGGGACTACTCTGTTTATT
TTAGTGTCATTCTTTTTATCTCATTTAAGTGCATTGTTTTGTTTGTACAA
AATACCCATTATATTTATTAGATGCAATATAATCTTTGCTTATAAATACA
TGAAGCTAAGGTTTTGATGAAGAATTCACTTTTTTTAAGCTCAAGAACTT
TGTTGCAGCTGAAAGAAAACAAAAGACAATTTATCCACCTGGTAAATATG
ATATTTTTTTATACCACTTGTACCTTATAAAACTTAGACCAGCAGGTAGT
TTTAATTCTCACCAGTCAAATTGAAATCCAATCTTAAAAACCCTAGCTTG
AGAGAGAATGATCAGAATGATCTATCAGAGGAACTGGCCTAAAATATACA
AATAATCACAAAATGATTCTGGCCCTTTAAAAGAAAACACTTAATAGTCA
TATTATTGCAACAGAAAATATTTTCCTACAATACTATCCAATCACAGGGT
TTGATCATTTTGATAAACTTTTAAAATTTAAACGATTTGACCAATATGTA
ACAGGGTCAACATTAAGTAACCTTTTTTCATTCACTTTTAGAAAAAGATG
TTTTCAGTTGGACCAATTATTTTGACATTAATGATACAAAAGTTGTTATC
ATTGGACAAGATCCCTATCATGGTCCAAAACAAGCACATGGTTTGAATTT
ATTAATCAAGTTACATTCTACTAAAAATATTTGTTTATATTTTTCATTCG
GGTGAAAGAAGATGTCTCAATAAATTGAAGGCCTTTATTCGTTGTGGCAA
AACATCATACTCTTGGGTACCTAATAGCCATCCCCACGCTTATTAATTTT
TAAAAAAGGTTTTTGAAAGTTCCCTCTTTTGTCCTAATTCTGCTGTATTA
GCCTCCTTTTTAAAAATTTTCCACCCATGACATTTTTGTTCCAACCCCCC
CTCGCTTATTAAGTTTCAAGATTTTTTCCAACCCTCCCCCCCCCTCCGGC
TATTAGGTACCCAAGAGTAAGACTATCTGAAGACACTAGAAACTGTTATA
CTTTAGATATAGAAGTTCAATTTGGGTACTTTTAAGGGCTTTTTCCGGGA
TAGTGTCTTCTTATATTTGCTTGAGGTAAAAATTTAGGCAAGCATTTAGT
GACTAGAAGAATATACCCCCTGCTATAATATCGAAAACAAAACTAACTTA
TGAATTCTAATCATATTATATTTGTTATTGACAGGTCTATGTTTTAGCGT
GCAACTTGGTATAACTCCTCCTCCAAGGTTTGAAAAACGAGTTTATATTT
CAAAATTTCTTTTTTTCTTCAAAGATACATCCTTTAAATTGTGAAGCTGG
AGATTATTAATTAAGTATTCGCAAAATAAATAATGTTAAGTTAAGTTATA
AGTTATCTTAATCCTTCGAGCAAAGACCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAG
GAACGGATTTATTTATAACTTTCGAAATTGACTTGCAATTTTGCAAGTGT
GCACCAATGAATTGATATGGTAAAACTTTTGAAGGTGAAGATCATAACAC
TAGTCAACCTTGAGATTGTAAGTCCCCCAGGATGCTTCCCCTAGTGAAAA
TATAGGAATATGCTTGAAGGGTTAAAATCATTCCAGGGCATTGTTTAAAA
AGATTTTAGTTTTAACCTCTGGAGGGATTGCATCAATCATATTACAATTT
GGTCTCCTTATATTCATATTGCATGTGTATTATTTTCAAAGCTGGCATAA
TATTCTGAAGGTCAGTTTTCGGTCGTACCTTCATATCTTATAAAACAAAT
AATTTTTTGGAAAATGAAAGATCTAACAATATTACTCTTTTGCAGACCTA
TTCAAGTTTAGGTGTATTACAATCTTTCCTATAAGATAGCAAATAAATTT
AGAATCTAAATTTTCAGTTTGAAGAATATGTACAAAGAGTTGGCGAGTGA
TATCGAAGGATTTAAAATTCCAAGTCATGGTTATCTTGCCGGATGGGCAA
GCCAAGGTGAATGAAAGTATTAAATCAATTCCTACTAATGAAGAGCAATT
AAAATCATATTTGATCAGATGTTAAGATATCTCACTTAAGATATTTCACT
CTCAGGCTTAAACGAAACTAAAAGTAGCCGTACTAATGATCAGCGGCCGT
ATCATGAATGCCGAGCATCCAGCTACGGTGCGCAAGATTGTGGGTTCGAT
CCCCCAGCCGGGTCATACCAAAGATTCCCAAAATGGTACTTAATGCCTCT
CTGCTTGATGCTCAGTCATTAAAGGGACGGATCAGGGGTAAGTGGAGAAA
TCAAGGGAAAGGAGTAGCGCCTCCCCTACCTCAGGGTAAACAGCTAGAGA
AAAGAGAGCCTTCGGGTCGCCCTCGACTGCGGTCGCAAACTTACTTACTT
TACTAATGATGTTCATATTTTTGTTTTAATTTTAGGCGTTCTGCTATTAA
ACGCTTGTTTAACAGTTGTTGCTCATAATGCTAATTCACATCAAGGAAAG
GTATGAATCATATATATTCCTCTAAATTTTAAATTCAGCTAATTTTCTCT
GAATACACTTGAACTTTGAAGCCGTTCCATAACTTTAAGATTGAATTTCT
GACATAAAAGAGTGCTTATAAAAATCTTTGTTGAACTTTCATCGTTTATT
ATGAAAGTAACCTTGGGAAGTTCCATTTACATCTAATCGGGTATACTATG
GTAATTCCCTTTGATTCTAATATTTGTTAGCTACAATCAGTGCAAAAATG
TGTTGACAGTAAGTCTCGAAGAATACCACTAAAACTTTTATTTCACTGCT
CAGATCCCCAATTTCAATGGTTAGAGAACCGAGGATTTCCTGACCGGGCA
AACACTGTTTACTGCCAAATATCTGGCACTGATTGTAGTTATTTGGTGTT
TACTAGTGAAAATGTCACCTTTATGCTTTCTCCCGCTCATTTGTGAAGTA
CTCTACTGTCAAATTTATTTGTCAATTCGTTATTTTCAGGGCTCGAAATA
ACGGTCGGACATCGGACATTGTCCAACCCAAATAGCTTCATGTCCGACCC
AAAAATCATAATTTTCAAGCTAAACCAACACTGATTGGACATTTTGTCCG
ACCCACTTGAAATCGTTATTTCGAGCCTTGATTTTTAACAGTAGTAAAAA
GTTTTTAAAAACATTATTGTCCGTCCCTTTTCGCCTGAATAATCGTTAAC
GACTACTTTTAAAGTTCAAAGTATTTATTTTCACTATAAAAAAAAGTGAA
TATAAAGTGCTGGAAAAATACAGAAGACTAGTCCTAGACCAAACAAAAAT
AATTTCTTTCATTCTTTCAAGGGTTGGGAAAAGCTGACCGACGCAACGAT
CAAATGGATCGATAGAAATCTTGATGGTGTTGTCTTTATATTGTGGGGAA
AATATGCTGAGAAAAAGGGTAGTTTTATCAATAAGGTACGACCATTATGT
TCTTTTCAACAGTTTGTGTACTTTATCGCTAGAAAATGAGTCGGTAAAAT
TGATGAAAAATTGCTTACTGTCGTAATGTTTTACCGACGAATTTTTATAG
TCGACATTTTTTTTTTCCGGCGATTATTTTGATCAACGTTTGATTTTTAG
CAACAAATATTTTTTTTACCAAAGTTATTATTGGTTTAAAATTAAAAACT
ATCTAATGTCAATGCAACGAATCTCCGAGATTATAATCTTCTTCGGACGT
TTTTTTTGTTTAGAGTCGACATTTGGTATTGACGGGAAAACATCCTTCGC
CACTGTCGGCACACCGTGGATTTTTCGGTTGTAAGCATTTTTCAAAAACC
AACGAGTATCTTCAAAAACAAAAGAAAAAACCTATCGATTGGAATTATTT
ACCAGAGAAACTTGATTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000250_pilon:179737..187855- >XLOC_044323 ID=XLOC_044323|Name=XLOC_044323|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1956bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000250_pilon:179737..187855- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGACAGCAAAACTCCAAGAAGGGACAGCAAAACTCCAAGAAGCAAATGAT
AAACAAAACAACAAGATTATTATCAATGATGAAAAATAAAGTAACAACTC
CTGACCCTTCACAAAAGTCAATTTCATCATTTTTTCAAAAGTCAACCAAA
AGGAGTAGTAGCAACATGTCATCACCACCAGCAAAGATTGCCAAGAGAAA
TGATGAAAAGGAGAATGCTACAACAACTAGTCCTTTATCGCCAGAACAGA
AAAGAAAAATGGAAGAAAACCGGGTAAAAGCACAGGAGAAACTTCTTGAG
AAGACTACTCAGGAATTTGATATTGGTCAAAGTTGGAAGAAGGCATTAGC
GCCAGAATTCTCTAAAGAATATTTTGGCAAACAAATGATAAACAAAACAA
CAAGATTATTATCAATGATGAAAAATAAAGTAACAACTCCTGACCCTTCA
CAAAAGTCAATTTCATCATTTTTTCAAAAGTCAACCAAAAGGAGTAGTAG
CAACATGTCATCACCACCAGCAAAGATTGCCAAGAGAAATGATGAAAAGG
AGAATGCTACAACAACTAGTCCTTTATCGCCAGAACAGAAAAGAAAAATG
GAAGAAAACCGGGTAAAAGCACAGGAGAAACTTCTTGAGAAGACTACTCA
GGAATTTGATATTGGTCAAAGTTGGAAGAAGGCATTAGCGCCAGAATTCT
CTAAAGAATATTTTGGCAAACTCAAGAACTTTGTTGCAGCTGAAAGAAAA
CAAAAGACAATTTATCCACCTGCTCAAGAACTTTGTTGCAGCTGAAAGAA
AACAAAAGACAATTTATCCACCTGAAAAAGATGTTTTCAGTTGGACCAAT
TATTTTGACATTAATGATACAAAAGTTGTTATCATTGGACAAGATCCCTA
TCATGGTCCAAAACAAGCACATGAAAAAGATGTTTTCAGTTGGACCAATT
ATTTTGACATTAATGATACAAAAGTTGTTATCATTGGACAAGATCCCTAT
CATGGTCCAAAACAAGCACATGGTCTATGTTTTAGCGTGCAACTTGGTAT
AACTCCTCCTCCAAGGTCTATGTTTTAGCGTGCAACTTGGTATAACTCCT
CCTCCAAGTTTGAAGAATATGTACAAAGAGTTGGCGAGTGATATCGAAGG
ATTTAAAATTCCAAGTCATGGTTATCTTGCCGGATGGGCAAGCCAAGTTT
GAAGAATATGTACAAAGAGTTGGCGAGTGATATCGAAGGATTTAAAATTC
CAAGTCATGGTTATCTTGCCGGATGGGCAAGCCAAGGCGTTCTGCTATTA
AACGCTTGTTTAACAGTTGTTGCTCATAATGCTAATTCACATCAAGGAAA
GGCGTTCTGCTATTAAACGCTTGTTTAACAGTTGTTGCTCATAATGCTAA
TTCACATCAAGGAAAGGGTTGGGAAAAGCTGACCGACGCAACGATCAAAT
GGATCGATAGAAATCTTGATGGTGTTGTCTTTATATTGTGGGGAAAATAT
GCTGAGAAAAAGGGTAGTTTTATCAATAAGGGTTGGGAAAAGCTGACCGA
CGCAACGATCAAATGGATCGATAGAAATCTTGATGGTGTTGTCTTTATAT
TGTGGGGAAAATATGCTGAGAAAAAGGGTAGTTTTATCAATAAGAGTCGA
CATTTGGTATTGACGGGAAAACATCCTTCGCCACTGTCGGCACACCGTGG
ATTTTTCGGTTGTAAGCATTTTTCAAAAACCAACGAGTATCTTCAAAAAC
AAAAGAAAAAACCTATCGATTGGAATTATTTACCAGAGAAACTTGATTAG
AGTCGACATTTGGTATTGACGGGAAAACATCCTTCGCCACTGTCGGCACA
CCGTGGATTTTTCGGTTGTAAGCATTTTTCAAAAACCAACGAGTATCTTC
AAAAACAAAAGAAAAAACCTATCGATTGGAATTATTTACCAGAGAAACTT
GATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000250_pilon | genome | sc0000250_pilon:179737..187855 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 823-978:157 |
| Aaloc | 709-822:549 |
| Aaloc | 646-708:1433 |
| Aaloc | 556-642:1952 |
| Aaloc | 514-552:2634 |
| Aaloc | 415-510:3277 |
| Aaloc | 361-411:3681 |
| Aaloc | 22-360:4937 |
| Aaloc | 1-21:8120 |
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