XLOC_044313 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044313
Unique NameXLOC_044313
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000250_pilon:451495..466754-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044313 ID=XLOC_044313|Name=XLOC_044313|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15260bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000250_pilon:451495..466754- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GACATATGAAATTATTTTAGGGCAGGAAATCGCCAAACTTATTTTAATTT CTTATTTTATGGAAATGGGCATTACTCTACATTTGTGTCTATTTTCCACC ACAAGCGGTTAATCAGCATAAAAAGCTAGTCAAAACAGTGAGATCAGGGG GGGGTACAAAGGCAGGGTACTAACCCATAGCCGGGTGGTGGTGTCTATTT TTGCATTTCAAAAAAGTTAGTACCCGGTTCTACTTTAGGGGTGGGGGTGT GTATTTTTCACTCTTCTAGCAAGTACAGGGTACTATTTGGGTACTTTTTC ACAGAGTTTTGCTCCTTTTTCAATAAAAAATGTATTTTGTAATATTTTGA CTTTTTTCAAATATTATTTTTTTGATTTGAATTTTTTTTTAATTGAGAAA CTTTTTTTTACTCTTTCGAGAAATTTTTTGATTTTTGTGAAGACAAAACT TCCGAAATGGTCAAGAAGTGTGTTATTAAGGGCTCTGACCATAGTGAATT TTTCATAATTGCTGTGTTTAAAATGTGTTTTCTGACTGATGTAACCAACA AAACTATGGCATGTTATACATTTTCTGTTAGACAAACTATTCCTAAATCT GAAAATCCAAAAATTGCATTGAAAAAATTTGACGAAGAAGAAAATGAAGA CTTTTGCGAGAAAGAGTATTTCAACTTTGAAGAGCTTAGTTTTGGCGAAG AAAAAACATTTTGGAAAATTTTTCGCAGTAGATGGTGTATCTTTTACCGA ACAGTATAAATTTTTGCGGAAAATTTTTGTAAATGCTTCTTTGTCTCGAA ATCTTCAAAATAGTGGTTTTTCATCAATTTTTCATCCAGATTTGGCTTAA AAAAACAGTCATAACTTTCGACACATCTTTTTAGAAAAATTTTCCGCAAA ATTTTAAATAGTTCAATTCTTTGCGGACAGTGTAAAGAAATTTTGAAACA AAAAAGTTAATTACCCATTAAAACTAAGCAATTTTTTGTAAAAGAGGGTG ATGCAACATATTATTAACATCTTTTTAAATTCATAACGTCATTTTTGCAA TTAAATTCTTAATTACTCTTAAGGGATTCGATTAAAAAGCAATTTATAAA GGCTATTCTTTGTTAAAAGTGTTAAGGAACCTGAAATATAACTTTTATGT TCAAATAACAAAATCAATTTGGACTGGTCAGAGCCTTTAAAATCAAAGGA CAAAAACTCTGACTTAATCAATGATAGTTTGTTTGAATTATCTGTCCATT TCAGTCAGAAAAACTAACATAGCACCCTCTCTTTTGGTCTAATCTGTAAA ATATAAGATTTTAGGGGGTGGTGTCTCTATTTTTACCAGCAAAAATGAAG AAGAACCCAGTACTAAATATGGGTGGGTGGTACTAAAAAGAAATTGAGTG AAAAATCAAGTTAGTACCCTATGGGTTAGTACCCTGCCCCCCTCTGGTGA GATAGTAGTATGTGATTATAACAATAAATATTCTTTTTTACATTGTACAC CATTACTTCACTTAAATTAAAGTGAATCTCTAAATGGATAAAATTGCTCT GATAAATGATGAAATGAAAAACGACAAACACGAATAAAAGAAATACCAAA TCTGTCCACGAACCAGGCTTCAAATTTCTGATCAAATTTTTGACCTGCTT GGAAAGATGGTGACCTATCATTTGTTTCCCCTCCCTTTAGAGCTTTAAGG CATGTTAAGCTTTTGTTTTTTAATGCCCTTCGGCATCTTGTAGCATTTAG ATTAGATTGGCACGCCACCCGTATTACGCGGGAAAAGTGAGCGTAGGAGT TAGATAAGCGTAGGAAGAAATTTTGTTGGCGGTAAGGGCTGTTAATCAGC ACTCTCTCACCAATTTAAGCTCGTTCTCCTACGGTCTTATTTCAGAAAAC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000250_pilon:451495..466754-

>XLOC_044313 ID=XLOC_044313|Name=XLOC_044313|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5544bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000250_pilon:451495..466754- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCATCCATTCGAGGTTTTTCATACGGCAGAAGAAGAGGCAGCACTGA
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CGACAAAAGAAGAAAGCTTTGCTGAAACAAAATAAAGAAAAATGTACCAA
AAGAGCTTTAGAGACGTTGAGTAGTAGTTTATCGTTTGACGAGAACGTTA
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CGTAAAAGGCTGGAGACAAATATTGATCAACGGAAACCTGTTAACCAGAC
AATGCATAGTAGTTATTATAGAAACAGACATATGCCGTGTCATTTAGAAC
CAATAAAAGATGAATCTATAATAGAACCATCAGAAGATGCTAAAAATGTG
AAAAGCTCAGAATCTTTATGGTTAGGTGTCATCAATAGTAGTGAACACTT
GGCAAAAATTTCCCATAATCCAACTGAACAACAAAATACGAACATCAAAC
TAAGTCCCAAGGAAAATACATCAACAAAATTAACTTCTAACGAACACACG
AAGAAACCTTTGAAGTCAGTCCAATCAGCAGCTGGCTGGGAAGAACATGT
CCTTTCGTTGATTAGTGAGGGAACAGCAGATACTATTGTTAAAGAATTTT
CAAATCACAATCAAACACAATTAAATAAGTATTTAGATAAAAAGAAACAA
GATAACAAACCTTCATTAAATATTGAATCAAACGAAAGTTTGTCTGATGT
ATTCTCTACTAAAACCATTGAAAATCAAGAATCTATGCAAAAGGAAGTAC
ATAAACACATAATGTACGACCATATAGATTTATCTGAATTAACATCAAAG
AACGTTAAGAAAATGCCAAAAAAGTTCGAATCTCGTATCCAGCAAACATA
CCCGTTAACACCAGAAACATGGTCCAAGAACATTGAAATCAAAGCCAGCA
TGCAAAATAAGAATCAAAAGGGGATACGGAAATGGACAGACTATCCTCAA
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CAGCACTGAGATATCTCAAGTTGGTCTGGCAAACTATCCTAATGAATCAG
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TTACTTCTTCGACAAAAGAAGAAAGCTTTGCTGAAACAAAATAAAGAAAA
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AGAACGTTATAAAGCAAAGAAGCTCACAGAATGTTCCTTTTGAAGCTTAT
TTTGATATTCGTAAAAGGCTGGAGACAAATATTGATCAACGGAAACCTGT
TAACCAGACAATGCATAGTAGTTATTATAGAAACAGACATATGCCGTGTC
ATTTAGAACCAATAAAAGATGAATCTATAATAGAACCATCAGAAGATGCT
AAAAATGTGAAAAGCTCAGAATCTTTATGGTTAGGTGTCATCAATAGTAG
TGAACACTTGGCAAAAATTTCCCATAATCCAACTGAACAACAAAATACGA
ACATCAAACTAAGTCCCAAGGAAAATACATCAACAAAATTAACTTCTAAC
GAACACACGAAGAAACCTTTGAAGTCAGTCCAATCAGCAGCTGGCTGGGA
AGAACATGTCCTTTCGTTGATTAGTGAGGGAACAGCAGATACTATTGTTA
AAGAATTTTCAAATCACAATCAAACACAATTAAATAAGTATTTAGATAAA
AAGAAACAAGATAACAAACCTTCATTAAATATTGAATCAAACGAAAGTTT
GTCTGATGTATTCTCTACTAAAACCATTGAAAATCAAGAATCTATGCAAA
AGGAAGTACATAAACACATAATGTACGACCATATAGATTTATCTGAATTA
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GCAAACATACCCGTTAACACCAGAAACATGGTCCAAGAACATTGAAATCA
AAGCCAGCATGCAAAATAAGAATCAAAAGGGGATACGGAAATGGACAGAC
TATCCTCAAGAAATCAAGGAAGAAGTTTTAAAATTAAGTAAACTTTCAAT
CAAGAACTTAGTCGTTGACAAACCTCCGTCACAAAACATCGAACTGAAGA
TTGCCACCAGACAACGGAACAATAATAATTTACTCATTGCTGGAAGAAGT
TTTAAAATTAAGTAAACTTTCAATCAAGAACTTAGTCGTTGACAAACCTC
CGTCACAAAACATCGAACTGAAGATTGCCACCAGACAACGGAACAATAAT
AATTTACTCATTGCTGTGGATGAATGGCGAACGAAATGGTTGTTAGAAAA
GAAATGGCAAAGTAAAACTATTCTGCAATTGCGGGATGGAATGAAAAATA
TCAACGATCATGTCCGTCTTGCAGCTGTATCCGCAAGTGGGAAAGTTATA
CTCGATAGAAAAGAACGTTTTCGAAGGAAAGAAGTGGATGAATGGCGAAC
GAAATGGTTGTTAGAAAAGAAATGGCAAAGTAAAACTATTCTGCAATTGC
GGGATGGAATGAAAAATATCAACGATCATGTCCGTCTTGCAGCTGTATCC
GCAAGTGGGAAAGTTATACTCGATAGAAAAGAACGTTTTCGAAGGAAAGA
AGATATGATGCCAGAAGAATCGAATTGGCCCGAAGTGGAGAGTGAAATTA
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GCAGCGTCCATCGCTTTGTACAGTGTCAACCAGGTCGATACAAAGATATG
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TGAGAGAAGAGGGCGCTCAAGGCGGAGTATATTCGCTCAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044313XLOC_044313-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
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