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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000239_pilon:56176..63781+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044302 ID=XLOC_044302|Name=XLOC_044302|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7606bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000239_pilon:56176..63781+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggCTGGCAGCAGCAAAGAAGAtaaatttgaaagtttcatgAAAGATGT
GAGTTgttttttcctcttttaaaCTTCACATTTGGCTAAAgcttcagatg
catccggctggacttagaatttttttcaagttgaataGTGACCAAAGGGG
GTCTCGAACCGGGAACCTATAGGTTCCGAAACCAATGCCCTATCCACTCG
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tattttctaaaactctcctttgtagaggctaaaaccgcgaaaacctcttt
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acctaaagccatttttgtgctaaattttcttttaatatacttgattaaca
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GGCAGGTGGAGCTCTAGCTGGAGCTGGCTGGAGCGGAGGGCTGCACTTTA
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TTATACGTGgcaattgcagtaaaaaattactaccgcaattaagggatttc
cctgactgataAACCAGatgtaattaatcgaacagttcaaTTGCCGAACT
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TGctcaatttctttattcaaaattttattcgaactttgtatttttgaaaa
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TGTCTGTAGAATAACAAATTACTACCAGCATAATTACATAAATTCTTGCC
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tttttaataaaacgaaAAGCTTAAGCCGAAAAATAAttgtcaaaatgttt
tttgaatcaaAGTTACCATGAAGGTAAGTTACTCGCCGACACAATCGCGG
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AGGAGATATTTATACATTTCACTATCCGCaaattttcttgtaaatttatt
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TAGTCTATTGTGAACTCCTAAACAACTCTTGGATTTTTGtccttttaaaa
gtttcttctgTTTATTAACCATCAAACCaaaagttggtctaatgtcgaca
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GATGGGAATTCACTTTCTAccatcaaactaatcaaactttttactgactG
ATGTTTTGAGtgatttatttgaattttttttttaatttttgggttttCCA
GGTATACAACCCCTTATTACCCGGTACAATCTTGATATCACCATTGAGAA
ATGACACACCATCGTTAAGTACCCTGTACTAAAGTCGATTTCCCCCTCAA
AACAGGTATACCACCCTTTAGTTCTTAGTGATGGTACTTTCTGGTACACC
TCCCCCtcctaaattttctaaaaaacacTGTATTAAAAGACATACCACAG
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ATATAGACTGCCTATAATAAGAAATGGTCCATTGCACCTCTGCAGTACTC
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TTTCAAAAGTAATCAATTCATTGTGGAATGTTCactgtatttttttaatt
tgaagcttATTAAGGACCCtaaaataatatgaaactgattttaaaatgcc
aaataaataggtgaaaaaataaaagggtacatcttttgtgattttgtaGG
ATTTTAAGTACCAGATACTAACTTGATGCCTCATATTTGGTATTGACACC
ACTTAGTCCCTTgatacaaatttacaaaaatgttttttctcaaTTATGAC
CACCACTTAGTATCATGTACTAAattgttttttacttaccttatcagacc
accacccggcactggtccccacaacttagtaccgacccccccccctgggt
ttCCCcctaaaaagtgaaattttggaaGATTTAGTTTCCTGAAGGTAAAA
TGCCATGGAAatcgaatgaaaaaaaattgaacctaATGATTGAAAAGCTG
ATGGTTGCTAAGGCAAAATGACTAAAATTTGTGCAAATGAAAAAAAAATC
ACTTTAAAAATGCCTAAAAGTACGTTTTCAGCCCAAAATCCTTAGAAATT
AAAAATACATAGGTTCAGGTATATGGATTTAGTCCAGTCCCAAATTTCAC
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GGGCGATTTCAAGAGTGCGGCTTAGTGAATTTTAGGTCTTTGATTTTGAA
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GCacaacatattttgaaaaatgtgaagaATTCCAATTAAAAGCCTTTGTA
CCTTGAGAGTTAGACATTATTGATCTTGGTACCAttgaaaaggtattttt
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CGAAGATTTATCTTGGCTAGCACTTTATAGCTGTCATTGTTTActatttt
gatttgttgacCTCCCTAATTAGAAATATATATATCTTCATCGTTGTAGG
TAATCCTAGACTTTTACCTTGTTTTTCACAATATTATACATATTATTTTG
GCATTCTATTTATGGATTTTGAGTACTTTTGGAAgaaaattaacaatttt
attgtttgaaaagtAATGCTACAGCTCAAAGCCTGCATTGTAAGTAAGAT
TTATCAAATCATGAAATCAACAACAGCTGTAATAAACAACTTTTGGGGCA
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TGTTGACAATTATAATTTATACTCTCTGTCATAGGTTCTTCAAATTTCAC
AAGATACAACAGAAGAGGATATgagaaagaaatataaaaaggTACAAAAT
CTGTATTGTGAATGTTCtagttttatagatttttgggTTTGAATACTTGA
GAACTAAATCAACTCATCAAAAGTCATGGTAAGATGTTTCACTTACTGCT
TTTAAGATCatagaaatttttaaagagcaAAATGTCACGTATATTTATTC
CAAAACATTTTAACGGTCATTTCTTGTTGTTTGCTTATTTCTAGCTTTCG
ATTTTAGTTCATCCAGACAAAAATCCTGATGAAAAAGAACGTGCTCAAAA
AGCCTTTGATGGTATGGTGATAGAATATATTTCTTACAATACTATCATAA
AATAAATCTAATCCAAATGATTAAATAACCTTTACTGTTTAGATCCTTAT
CTCGTAAAGGTGAATTTTGATCAGACCAAtggttgataaatttattcgaa
gaAAGAATGTCCCTATAATATACTATATTCTAACTATTATTTTATGTATA
TTCATTGTTCCCAAAACCTTAGAACGAATTGTCTTATATTACACTGCTAC
CTTAATTAGAGCATTTTTTCTGTCTTTTAAAAACTCGAAACGGTTCCGAA
TCTTTAGCCGATGGGGCCCTTACTTACCTGCCATTGACTGGCTGTTTTTT
CTTTAAGACTGTTGATGTTTTCTAATGTTATTTTCAGCTTTAAAGACTGC
AAAGGAAACACTAAGTGACCCTGATCAagtcaaaaagatcaaattatTAC
TTGAGGAAGCAGCTGCTCTCTTAGAAATGAATGTAAGTGTTATTGGATGT
TGCTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000239_pilon:56176..63781+ >XLOC_044302 ID=XLOC_044302|Name=XLOC_044302|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=786bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000239_pilon:56176..63781+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggCTGGCAGCAGCAAAGAAGAtaaatttgaaagtttcatgAAAGATat
ggCTGGCAGCAGCAAAGAAGAtaaatttgaaagtttcatgAAAGATGTGA
AAGAAATCGAGAAGAGAGATCAAGTATTGACAAGTGACAAACAAATTGAC
AGGTTGACAAAAGCAGGATCAAAATATCTTAACTTGAATCCTTACGAGGT
GAAAGAAATCGAGAAGAGAGATCAAGTATTGACAAGTGACAAACAAATTG
ACAGGTTGACAAAAGCAGGATCAAAATATCTTAACTTGAATCCTTACGAG
GTTCTTCAAATTTCACAAGATACAACAGAAGAGGATATgagaaagaaata
taaaaagGTTCTTCAAATTTCACAAGATACAACAGAAGAGGATATgagaa
agaaatataaaaagCTTTCGATTTTAGTTCATCCAGACAAAAATCCTGAT
GAAAAAGAACGTGCTCAAAAAGCCTTTGATGCTTTCGATTTTAGTTCATC
CAGACAAAAATCCTGATGAAAAAGAACGTGCTCAAAAAGCCTTTGATGCT
TTAAAGACTGCAAAGGAAACACTAAGTGACCCTGATCAagtcaaaaagat
caaattatTACTTGAGGAAGCAGCTGCTCTCTTAGAAATGAATGTAAGTG
TTATTGGATGTTGCTGACTTTAAAGACTGCAAAGGAAACACTAAGTGACC
CTGATCAagtcaaaaagatcaaattatTACTTGAGGAAGCAGCTGCTCTC
TTAGAAATGAATGTAAGTGTTATTGGATGTTGCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000239_pilon | genome | sc0000239_pilon:56176..63781 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 277-393:7490 |
| Aaloc | 208-273:7045 |
| Aaloc | 151-207:6785 |
| Aaloc | 49-150:6260 |
| Aaloc | 1-48:1 |
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