|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000020_pilon:607199..610669- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044299 ID=XLOC_044299|Name=XLOC_044299|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3471bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:607199..610669- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTATCAACAAAGATAAGAAGTATTCTGAATGTCAGTGGTAAATATTC
ATCACGTGTTGCCACAAGCTACTTTGCAAATCAACGTTATGTAATGCACG
ATGTTACAGCAGAGAAAGTTCCTGAAAACCTGCGTTCCCAATGGCCTAAA
GCTTCTTTCAACATAAAGAAGATGCAGGAATTGTTGGATCATGATAACCA
CCAAATGAGAGAAGATTTAAGGAAATTCTTGAGCGATCCTGTCTTCAAGC
CAAAATATAATATTTCATTGGAAGAAGAAAGAGAGGTTTGAATTTTTTTT
CACTTCAGGTTGAAAATTATTTAGAATGATCTTGTTTTGTCAGTCCTTCT
TTGTTTGCCGTGGTAAATTTTTGACAAATATTCGTATCCATACAATATTC
AAATTCATATAGCGTGAGATTTTTAAATCTAGAGGATATTGACGAAGTTA
AATAGCAACATTTGAATAGTAGTTTCTTAAAATTGATTAACAAAAAAATG
CCACCGCGAAATGCTGTTTTGTCTCAAAAATTGATAAAGAGCATTTTACC
ACGGCAAAAATAACTGAATTGCCAAGACTGTTTGCGAAGTCTTTTAGTTT
GGTGAGTTTTTTGTACTCAACTGTTTATTGCATGATTGTAACATTCTTCA
AATACTAATAATTATTCTCTTTGTATTTGAGACAATACTAAGGTACCTAA
AATATATTGGGTTGGAATAACCAGGGTGAGTGGAGGGTAATTCATGGGCC
ACTTACCTTATGATAAACTCTTTTTTTCAAACAGTAACCTTTATTATTTA
TTTTTAGGTGGCCCTACAACGTTTGAAGTTGATTTGTGATGCTGGTTACA
TTTCAGTGCTGGACTTCAAGAATAACCCACTCAAAATCTTTGCTGCACAT
GAGCTAGCTAGTATTATTGATCCTGCAATGGCCACTAAAATGACAGTCCA
ATTTAACCTGTTTGGTGGTACTGTATTGAAGTTAGGAACTGAAAGACATC
ATTCGAAATTGTTGAGTGGTATTGACGATTTAAATGATGTTGGATGTTTT
GGATTGACGGAGCTTGGGTAATTTTTGAAAGAGAATGTTTCATATCTCTT
TAACATTTTGGTCTTATTATTTCAATCAGCAAAACACAGTTTACCTATGA
TATATTAACTCTGTATTCAATTTGACTTTTTCTTGGATTTCGGGAGACAA
TTCTTTCTTCTTCTTTTGAAATTTATAGTTTTACCATGTTATAACTGCTC
TAAATAAGGTTAAAATAGAAAGTTTTACTACCTGTGATTCGGCAAGATTA
GTCCCCTACACTCACAGGTAAGGTACTTTATGCTCTGAGTTGTTTTTTAA
ACGTTTATTTATCTTATTTATTATAGGTACGGTAATAATGCGGTAGAGAT
GGAGACAACTGCAATTTATGACGAAAAAACAGATGAACTGATCGTTAACA
CCACTACACCCCTTGCTCAAAAATATTGGATCACGAATGGTGCCGTTCAT
GCTAAACATTGTGTTGTCTTCGCTCAATTAATGGTCAAAGGTAATGGCAA
TACTTTTTTAAAGTCCGTTGAGTTGATGACCAATTTATATGAAACCCGTC
CATGCCTCATTGAACCCATTCGAATTATTCCTAGCCAGTCGTGGTAAGAA
AAAAGGTTCTAAATGCTGGTCATTAAGCTTTAATGGTTCAGAAGGGTATG
AATTTGATTTCTTTTTTTTAGTGAGTGGATTTTTAGCTCTATTATTTTTA
AAACTTAAAAGTTGAGAGAAGATATTCTTTAAAATGGTAGTGGCTTTCCC
AGTGTTGTTGAGTGTTCATTGTGGTTTTTCAAGTGGGATAAAGTTTAAGG
GAGTTATTGTCACATAGATAATTTTGAGCCAATTTCTGCAGTGAATAGGG
ACCACCAGTTGTTGTGTATCAAAAAATATAGTAGATTTTTATCCCGGTTC
TCAATATTGGTTTGGAATAAGAATTTCTTTGGTTTAAAAATCCAAATCTA
AATGCAATATTTTCTTTTAATCAATTTCAGGTGAAAACCATGGTATTCAT
GGTGTGTTAGTTCCAATCCGTGACCAGGGCTTGAATACGATGCCTGGTGT
TTTGGTCGAAGATATGGGTTACAAGATCGGGTTAAACGGCGTTGATAATG
CAAAATTAACCTTCAACGATGTTCGAGTACCACGTGAGAACCTGTTGAAC
AAATACTCCGATATTGATGATAATGGAAACTTTATAACCAGCATTAAAAG
CCCACGTGCTCGATTCTTAACAGTGGCTGATCAATTACTTTCTGGTCGTA
TTTGTATCGCTAGTATGGCTCAGGGCGCCGCTAAAACTGCACTGGCTATT
GCATTAAGGTACTTAGTGAAATTATTTTTTGAACTTCTCGACCTTTAGCT
CCTGTCATCATCACGTTGGAGTCTTAGTGATTTCAAATGAAACATGCTTC
AAGTGAAAAAATAACGAGAAAACTTTCACGAAATTCAACTTTACGGGAAG
CTGGATATGCCCTTACATTATTTATATCTTTATCCCTAAATTTTCATCTG
TGAATAAACGGAAAGTCGTGATCCTGTTAAACAAAAGCCCGATTTTATAT
TCCATTATTTTATATTTTTTCCAGATATTCCGCAACACGTCTGACTGTTG
GTGAAAGTGGTAAATCAGATACACCCATATTGAGTTATCAACTCCAACAA
AACGCATTGATGCCTTTGTTAGCTGAAACATATTGCTTGAATATCGCTTT
GGATTATGTGAAAGATCGATGGGCAAACCAAGCAGAAGATGGTTCGGAAC
ACCAGGAGGTAGTCACAATGTGTTGCGTCATGAAACCATTTTGTGGATGG
AATCTGGAGAACTTGGCATCCATCTCAAGAGAACGTACTGGTGGTCAAGG
CTACTTGTCATGTAACCGATTGGGTGTGTTCATCAACCTCTCGCATGCTT
GTATCACAGCTGAAGGTGATAACTCAGTGCTGATGCAGAAAGTTGCCAAA
GAGAGGTTATCCTTATTCAAACCATCTACTGGTGAAGCCCCTGTTAATAA
GGATCTCAGCTCTACTGAGTATCTGAATTACTTACTTCAAAAACGTGAAG
ATGTCTTGTTTACAAACCTTGGCAAGCGAATGATGAAAGCTGGTAAAGAA
AAACTCTACGATACTTGGATGTTGAAATGTAGTGATCTAGTACAACTGGC
CGCGCGTTCATTCGGCGAACGCTTGGTCAACGATCGCGTCTTGGTTGCTA
TCAATACTGCAGATCCAACGCTGAAAGAAATCCTCAGTGAATTGCATACT
TTGTATGTTGTCAGTGTGGTGAAACGTAATTTAGCTTGGTATTTAACCAA
CGGTATCTTGACCATTGAGCAAGGAAAAGAGATTGAAGACCTCTCCGATG
AACTTTGTAGAAACATTGCACCAAAATCTTTAGATTTGTGCGAAGCTTTC
GGCTTGACGGATAGTATGATT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000020_pilon:607199..610669- >XLOC_044299 ID=XLOC_044299|Name=XLOC_044299|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3768bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:607199..610669- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTATCAACAAAGATAAGAAGTATTCTGAATGTCAGTGGTAAATATTC
ATCACGTGTTGCCACAAGCTACTTTGCAAATCAACGTTATGTAATGCACG
ATGTTACAGCAGAGAAAGTTCCTGAAAACCTGCGTTCCCAATGGCCTAAA
GCTTCTTTCAACATAAAGAAGATGCAGGAATTGTTGGATCATGATAACCA
CCAAATGAGAGAAGATTTAAGGAAATTCTTGAGCGATCCTGTCTTCAAGC
CAAAATATAATATTTCATTGGAAGAAGAAAGAGAGATGCTATCAACAAAG
ATAAGAAGTATTCTGAATGTCAGTGGTAAATATTCATCACGTGTTGCCAC
AAGCTACTTTGCAAATCAACGTTATGTAATGCACGATGTTACAGCAGAGA
AAGTTCCTGAAAACCTGCGTTCCCAATGGCCTAAAGCTTCTTTCAACATA
AAGAAGATGCAGGAATTGTTGGATCATGATAACCACCAAATGAGAGAAGA
TTTAAGGAAATTCTTGAGCGATCCTGTCTTCAAGCCAAAATATAATATTT
CATTGGAAGAAGAAAGAGAGGTGGCCCTACAACGTTTGAAGTTGATTTGT
GATGCTGGTTACATTTCAGTGCTGGACTTCAAGAATAACCCACTCAAAAT
CTTTGCTGCACATGAGCTAGCTAGTATTATTGATCCTGCAATGGCCACTA
AAATGACAGTCCAATTTAACCTGTTTGGTGGTACTGTATTGAAGTTAGGA
ACTGAAAGACATCATTCGAAATTGTTGAGTGGTATTGACGATTTAAATGA
TGTTGGATGTTTTGGATTGACGGAGCTTGGGTGGCCCTACAACGTTTGAA
GTTGATTTGTGATGCTGGTTACATTTCAGTGCTGGACTTCAAGAATAACC
CACTCAAAATCTTTGCTGCACATGAGCTAGCTAGTATTATTGATCCTGCA
ATGGCCACTAAAATGACAGTCCAATTTAACCTGTTTGGTGGTACTGTATT
GAAGTTAGGAACTGAAAGACATCATTCGAAATTGTTGAGTGGTATTGACG
ATTTAAATGATGTTGGATGTTTTGGATTGACGGAGCTTGGGTACGGTAAT
AATGCGGTAGAGATGGAGACAACTGCAATTTATGACGAAAAAACAGATGA
ACTGATCGTTAACACCACTACACCCCTTGCTCAAAAATATTGGATCACGA
ATGGTGCCGTTCATGCTAAACATTGTGTTGTCTTCGCTCAATTAATGGTC
AAAGGTACGGTAATAATGCGGTAGAGATGGAGACAACTGCAATTTATGAC
GAAAAAACAGATGAACTGATCGTTAACACCACTACACCCCTTGCTCAAAA
ATATTGGATCACGAATGGTGCCGTTCATGCTAAACATTGTGTTGTCTTCG
CTCAATTAATGGTCAAAGGTGAAAACCATGGTATTCATGGTGTGTTAGTT
CCAATCCGTGACCAGGGCTTGAATACGATGCCTGGTGTTTTGGTCGAAGA
TATGGGTTACAAGATCGGGTTAAACGGCGTTGATAATGCAAAATTAACCT
TCAACGATGTTCGAGTACCACGTGAGAACCTGTTGAACAAATACTCCGAT
ATTGATGATAATGGAAACTTTATAACCAGCATTAAAAGCCCACGTGCTCG
ATTCTTAACAGTGGCTGATCAATTACTTTCTGGTCGTATTTGTATCGCTA
GTATGGCTCAGGGCGCCGCTAAAACTGCACTGGCTATTGCATTAAGGTGA
AAACCATGGTATTCATGGTGTGTTAGTTCCAATCCGTGACCAGGGCTTGA
ATACGATGCCTGGTGTTTTGGTCGAAGATATGGGTTACAAGATCGGGTTA
AACGGCGTTGATAATGCAAAATTAACCTTCAACGATGTTCGAGTACCACG
TGAGAACCTGTTGAACAAATACTCCGATATTGATGATAATGGAAACTTTA
TAACCAGCATTAAAAGCCCACGTGCTCGATTCTTAACAGTGGCTGATCAA
TTACTTTCTGGTCGTATTTGTATCGCTAGTATGGCTCAGGGCGCCGCTAA
AACTGCACTGGCTATTGCATTAAGATATTCCGCAACACGTCTGACTGTTG
GTGAAAGTGGTAAATCAGATACACCCATATTGAGTTATCAACTCCAACAA
AACGCATTGATGCCTTTGTTAGCTGAAACATATTGCTTGAATATCGCTTT
GGATTATGTGAAAGATCGATGGGCAAACCAAGCAGAAGATGGTTCGGAAC
ACCAGGAGGTAGTCACAATGTGTTGCGTCATGAAACCATTTTGTGGATGG
AATCTGGAGAACTTGGCATCCATCTCAAGAGAACGTACTGGTGGTCAAGG
CTACTTGTCATGTAACCGATTGGGTGTGTTCATCAACCTCTCGCATGCTT
GTATCACAGCTGAAGGTGATAACTCAGTGCTGATGCAGAAAGTTGCCAAA
GAGAGGTTATCCTTATTCAAACCATCTACTGGTGAAGCCCCTGTTAATAA
GGATCTCAGCTCTACTGAGTATCTGAATTACTTACTTCAAAAACGTGAAG
ATGTCTTGTTTACAAACCTTGGCAAGCGAATGATGAAAGCTGGTAAAGAA
AAACTCTACGATACTTGGATGTTGAAATGTAGTGATCTAGTACAACTGGC
CGCGCGTTCATTCGGCGAACGCTTGGTCAACGATCGCGTCTTGGTTGCTA
TCAATACTGCAGATCCAACGCTGAAAGAAATCCTCAGTGAATTGCATACT
TTGTATGTTGTCAGTGTGGTGAAACGTAATTTAGCTTGGTATTTAACCAA
CGGTATCTTGACCATTGAGCAAGGAAAAGAGATTGAAGACCTCTCCGATG
AACTTTGTAGAAACATTGCACCAAAATCTTTAGATTTGTGCGAAGCTTTC
GGCTTGACGGATAGTATGATTATATTCCGCAACACGTCTGACTGTTGGTG
AAAGTGGTAAATCAGATACACCCATATTGAGTTATCAACTCCAACAAAAC
GCATTGATGCCTTTGTTAGCTGAAACATATTGCTTGAATATCGCTTTGGA
TTATGTGAAAGATCGATGGGCAAACCAAGCAGAAGATGGTTCGGAACACC
AGGAGGTAGTCACAATGTGTTGCGTCATGAAACCATTTTGTGGATGGAAT
CTGGAGAACTTGGCATCCATCTCAAGAGAACGTACTGGTGGTCAAGGCTA
CTTGTCATGTAACCGATTGGGTGTGTTCATCAACCTCTCGCATGCTTGTA
TCACAGCTGAAGGTGATAACTCAGTGCTGATGCAGAAAGTTGCCAAAGAG
AGGTTATCCTTATTCAAACCATCTACTGGTGAAGCCCCTGTTAATAAGGA
TCTCAGCTCTACTGAGTATCTGAATTACTTACTTCAAAAACGTGAAGATG
TCTTGTTTACAAACCTTGGCAAGCGAATGATGAAAGCTGGTAAAGAAAAA
CTCTACGATACTTGGATGTTGAAATGTAGTGATCTAGTACAACTGGCCGC
GCGTTCATTCGGCGAACGCTTGGTCAACGATCGCGTCTTGGTTGCTATCA
ATACTGCAGATCCAACGCTGAAAGAAATCCTCAGTGAATTGCATACTTTG
TATGTTGTCAGTGTGGTGAAACGTAATTTAGCTTGGTATTTAACCAACGG
TATCTTGACCATTGAGCAAGGAAAAGAGATTGAAGACCTCTCCGATGAAC
TTTGTAGAAACATTGCACCAAAATCTTTAGATTTGTGCGAAGCTTTCGGC
TTGACGGATAGTATGATT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000020_pilon | genome | sc0000020_pilon:607199..610669 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1039-1884:847 |
| Aaloc | 712-1035:1440 |
| Aaloc | 547-708:2095 |
| Aaloc | 286-543:2665 |
| Aaloc | 1-285:3472 |
|
