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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000020_pilon:886693..894555- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044288 ID=XLOC_044288|Name=XLOC_044288|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7863bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:886693..894555- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGCCACGAGGTCCAAAGAAGCACCTCAAGAGACTCAATGCCCCAAGGCA
TTGGATGTTGGACAAGCTTAGTGGAAACTTTGTAAGTACTGTCATTTTCT
TCCTCTATCACCATTGCATTTAACACCCTTGATGGTTTAAAGGATATAAA
GTTACGGAAACGTTTCATTAATTTCTTTAGGCTCCACGCCCAAGCTCCGG
TCCACACAAGTTGCGCGAAAGTCTCCCACTTATTGTTTTCTTGAGAAATC
GCTTGAAGTATGCCTTGAACTACACTGAAGTTGTCAAGATCATGATGCAA
AGAACCATCCAAGTTGATGGAAAAGTTAGAACCGATGTTACATATCCAGC
TGGATTTATGGGTAAGATAAATATGTGATTGGGAGAAGTTAACAAAGTTA
CCATAAAATGATTTACTGGTTTGGTTACAAGAAGTTGTTTTTCTTTTATG
GTTAACGACTGAGAGTAATGTGGGTTAGCTGGATCAATACTATTTATGGA
TAAAGCTTCAAAAATAAGCTAAATTATTAAATGGTGGAGCTTGTTGGAGA
CCTTGGAATCTTTAAATGGTGAACAACACAAGTTCATTCCATGTCAAAAG
TTACTTTTCCATGTCATTTTAAACTGGTTGTTGTTTTGATAACCAAACTA
AATTTGTGTTATTTACTTTCTTGAATTTGATAATCTTAAATTTTGCAAGT
AGGAACTTTCGAGAATCAGGACAAAAATGGAAATTTTTATTAAAGGTGAC
ATATAGAAATTTTATCTTCTTGACTTATTGGGCCTAACAGGCTAGTAAAT
GCCATAAATCTTGCAATTTTAAGTTTGAAGTTCTGCAAATTTTCTTTGAC
AAGAATTTTTTCGTAAAAATTTCAAAAGCTTGTGAAAGCTCGTTTGCTTA
AATTAGTGTATTGTGCCAGAAAAGCCTTTTGAAGCATTGCCAAAAGTTAA
TCTACTATTAAATCCCCTTGATGTGTCTTCTTCTTTTACCATGATGTATG
TTTTTTTAAGAACAAAATTTACGAGAACATAAGGCTTCAATGGCTGAAAT
AATATATTAAGAACATTCATAGTGAGAAAGGGGGACCTAACTTTTCAAAA
AAGGCTTTATATGGGTGTAAAAGAGGTTTTCCGAGGTTTGTGGGCCAACT
TTTGAATGTTCTTATAAAAGGACGTGTACTTGCTATGGGCTATTCCAAAA
AAAAAAGGTTTCCATCTTAAATTTTGAATGACTGCTGTGGACTTTAGGCG
AACCCTAAAAATATTTTTGTTTCCGGTCCACCGGGTGACGAAAAAAACAC
TCACCCGGCCGGCCGCAAAAAAAATTTTTTTGCTAAATTTCGATCCCAAA
AAATCGATTTTTTAAAGCACTCGTAGAGGTCCAGACGATGTCAATTGAAC
GAATCGAACGCCGAATCAATTTAACGCAATCGAATGATTGAAATTCGATT
GCCGAACGCAATCGAATGCCAATCGAATATTACCGCGATTTTCTCAATTG
ATTCGATTGCGTTCGATTAGTGCCTGGATTCGATTGATTCGATTGCGTTC
GATTGACTAATGTATTCGATTGATTCGATTGATTCAACTACGTTCGGTTG
GCTTATGCATTCGACTGGTTCGACTAATTGATTCTGTTGATTAACATTGA
TTCTCGTTCAACATTTGAATAGTTAAACGAGATGATATGAATCATTTTAG
CCTGGATTCTAGAAAATGCAGATCATGCAGGCCCACATGTTTACTGCAAG
TTGTGTGTCAAAGCCCGTTCGTTGCGTTGATTTATCTATCGTATCGCGAT
ACTTAACCTCCCTAATAAGAGGCGCTCGAAATTGAAAGGAATTGAGGTAA
ATTGGAATCTAATTTAATCGACCACCCGTCGAATGCAGTCGAACGTAATC
GAACATCAATCGAACGTAATCGAATATCATATCAATCGAACGTAATCGAA
TATCAATCGAATTTTACCCAGAATTTTACGTTCGATTGATATTCGATTGC
GTTCGGCAATCGAATCGCAATCATTCAATTGCATTCGATTGATTCGATTG
GAATTTTCGTTCGATTCCGTTCGATTGACATCGTCTAGAGAGGTGCTTCG
TATAAGAAAAATTCACGTAACCTGCAGTAAACATGTGAACCTGTATTTTC
TAGAATCCAGGCTAAAACAGCTCAAGAACTAAAAACCGTGAAAATCTTCG
TTGTTGAACAAAGAAGATATAATATAACATCTACTTTGCTACCCTTATCA
TCTTGCAGAGAAAAGGTCCGTTCGTCGCGTAGATTTATCTTTGATACTTA
ACCTCCCTAATTTTCATCGTTTATAATTTCAATTGTGTTACAATATCTCT
AAGAACTGGACACTCTCTTTCATTTTGAATATTTATCTTCAATTGCTAAA
GGCTCCAAACCGTGATTACGAAGTGAACTTTTTTGAGAAAAAAGTAGAGT
GAGAGAAACATTTCCCCAATTTTTTAAATCCTCACTTTATGAATGTTTCT
TTTTATTTTACTCACAAATCAGCATGATTCCTTTTATAAAAACAAAGCTG
TTTATATAAAAAAACATTCTTAAAAGTTGAGTTGCAAGCAAGAATTAACA
AAAACAATGCAGGGCTTAGTTTGAGATGAATAAAATTTCATTTTTATAAC
AGGACATGTTCATAAAAAAAGGCAAGTTTTTGAGGTTTTTGTGACATTTC
ATACCTATGTTACAAAATTAGCCTACATCTTTCTAACAGAATTTGATCCT
TCTCAAAGAATAACATGATGGTTAGCTCATTAGATTTCTGTTGGCAAATT
AGGTAACACCGATTTCTATAGTTTAGTATATTTCAAGTTATGACAATTTG
AATCTTGCCAGAATTCTGGCTAATGATGTAACATTGCAAATTTTAGAAAA
GCTGGCTAATGACTCTAAAACAGCTATTAGGCAATATTCACATAAAAAAT
GGTACATTAGCATCATTAGGGGGTTGAAGGGGATGCTATTGGTAATGCAT
TTGGGTTAAAAAGTTGATCGGCTAATGGTGTAACAAGGCTGAAATATCCC
AATGTGCTGTTCCATTTAAGCCAGATTTTGTCGACATAACAACAAATCCT
TAGTCAAAAGGCAATATATTGTTTAGTTCATGCATTGTTTTAGACAATAT
TATGACTTTGCCAATAAATGATAGGACAAACTGGCTAATATGGTAACATT
CAATCCTATAACTCTAATAATGGTCCCTTTTCAGGCCCATTGATAGAAGT
ATTTATTAAATTGGCTGGTATTCAGACTTTAGTCTAAGTTACATAATTCA
CATCTCAAAAATAGCATCTCAATGATAGATAATTCACTTGATGAACCTTC
CAAAAGCCTTTATTTTCATTAATCAGCCAAAATTGGCTAAATTTGTAACA
AAATTGGGATATCCAATTTTATTACTTTTTTAGCCGTTTCTGGGGAATGA
ACAAGTTGTTTAACAGCACTATCAATATCATTCATGTTTCAATCAACCTT
TTGTAATACTTATTTCAACATCACTTTGCAATGAGAGGTGTATGAGAAGT
CATACTCGCCGAAGCTTGGCTGTCAGTCAGTATAACATGGGGGAAACACG
ATAATTTCATTGAATTAATGGGATATCAATCTCAATCTTCATTTGTTGAT
GGTTACACTTTTAGCCTATTCCTGTTAAGAATGTTTTATCTTGAAGTACT
TATTTCATAATTTTTTTTGTTCCATAAGTTCATTAGTTTTTTTAAAGAAG
GTGTCAGAAGTTCCATAGCTGATAGCTTAGCATTACTTCTTAATTACATT
TTTATTAAAACAACTAAGACAACAATATAATATGTTCTGTTACACTTTAG
CCTATTCCAGTTAAGAATGTTTTATCTTGAAGTTCTTATTTTATAACTTA
TTTTGTTCTATTAAAACTCATTATATAAGTCTTTTTTTAGAAAAAACTTT
CAGAAGTTCCATAGCTCAGCATTACTTCTGAATTATGACGTTTTCGATAA
AACAAAAATATGTTATATTTGTTACACTTTTAGCCAGACATGAGCCTATA
ATTAAAAACTTTGACTTTAAGACAAGTAATATAAAATAATCCTTTATATT
TTTGAATTCTGTTGATCCCAATTCTTTAATTTTGAAACTATAAAATTTTG
AAATTGGTCGAACACTGTTTTTGTTACATTTTAGCCAAAATGTGTATTTT
ATCAAGAAATAAGCCAATTTAAGGTATTTCCATAGCTAAGTTTATAGTCT
AGATAGTATATGGTAATTGTTTAAGTTCCATAAATTCTAAATTATTGAAA
TTATGAATAGAAGTTGATTTTCTGAGCATGTTACTTCTTTAGCCAATATC
TTCAGTTTAACGATGTGCAATTTCCGCGAATAACAACAGCGGGAAGTTAA
CATACTAAAGTTTCATTTCCAAGCCTTGCTCTAATTTTTTTCACCTGAAA
TAAAAATTTAGGTCATTTATGATGAAAATGTTACATTTTTAGCCGTTTTT
GGCAAAATAACCTACAAATCCAAAATCTTTCAATTCTAGTGCCTTTGGAC
CTTTGTTACCTTTTTAGCCAAAAAATTTTATTGATGTAGCGGCTATTTTG
AAGGTTTTATCAACATAAGACCAATTTTTCCTATTTTTTGAATGTCACAG
AGCTTGCCTTATTTTATGAACATGTCCAACAATGATCAGGATAAAACCTT
CATTCCAAGTGATTTCTAGGCGTGCATTTTACAGTAGAATATAAAATATC
ACGTGCGATAAATCACACGCCTCAAAAACTGATTCACTAAAGTTTTCCAC
TAGAGCCCTAACGATGATGTACGAAAAAATGCGGCCGGGTGACGACGAAA
TAAATTTTCACCCGGCCGGTGGACCGGAAACAAAATTTTTTTTCGGGTTC
GCCTTATTTCCTTTATTAACGCAATAGTTTCACTTTCTTTTGTTTAGATG
TTATCACCATTGAAAGAACTGGTGAATTCTTCCGTCTTCTATTTGATGTC
AAAGGACGATTTGTTTGTCATCGTATCAGTCAAGAAGAATCTGCTGTAAG
GCTTCTTTTCATTGCCATTTTTAGAATTACTTCTCTTTGAGATCAGCTGA
GTTTGAAATGTGATCACAAGTTTAAGCTAAATTGTCACAACAGAGTTGAG
AAGATTACCTTGAGAGATTAATTTTTATCTTAAATTGCAACTTTTGACTT
GTTGTGAAAAATTAGTCTCGCCAAAATCCTGTTTTTTTTACTAAAACCCT
AGGAAAAAAGAAATTGGATGAAATCAAAGTGAAATTTTTATATTCTTTAT
TAACAAAAAACTCCAGAAATTAATTCACTTCAGGTTATGATAATATGTAA
TGTTGATAGTTGAAAAGGAATTTTGGGGTTTTCAGAGAAAAACCTTTGAA
TTTCCACAAAAAAGGAGCCCTTTTTTTTCTCTTTGTAAGTATACTTAGAC
CTGGATTTGGTGGAAAATTAGTGATCTTTGAAAGATTAATTCCATTTCAA
ACAAATCATTTTATTCAGAAAAATAAATATCACTAGCTTCATATGAGCTT
TCTAGGCATGACTCAGTCTCCAAAGAATATGCTTATTGAAACATGTACTT
TTCTATCCAGTACAAACTTGGAAAGGTCAAACGTGTTGCTGTTGGCAAAA
ACACTGTTCCTTATCTGGTCACACATGATGCCAGAACCATCAGATACCCA
GACCCAGACATTAAAGTAAACGATACTGTTGTCATTGACATCAAGACAGG
AAAAATTACTGACTCAATTAAATTTGACACTGGAAATACTGTCATGGTCA
TTGGTGGACGTAACACCGGTCGTGTTGGAATCATCACCAACCGTGAAAGA
CATGCTAGTAAGTTCTTCTTTTTCTGTTTTAAGAGTTTTGTATACCTGAA
AATAGGTAGCTGCAATTAGAGCATCAGTGATCTGTTCATGAAATTGATGC
CCTGCTGGTAGCTAATAGAAACTCACTTACATGTATGGAGCTTCTTTTCC
TTGAATGATCTAAAGTTTACATGTATTACATTTTCAATTATAACAAATCC
TGTCAGAAATGCTAGTTGTGTTTTAAAAGAGTCTGGAACTTTAAACTTGA
CAAACATGTGCCACCCATAGTGGGCACACCCCCCCCCCTTTTAAAAAAGG
GGGGTTTGAGAATTTTACTGGATTTAAAAGAAGGGGGCTTGTGAAAATTT
CAAATAAAAGGGGAGGCTTGGACTAAAAGAGGGGGGTTAATTTTTTAAGG
GGGCTTGGAAGATTTGGCAATTTGCAAAAGAGTGTTTTCCATTCATTTTT
AAATTTCTCAACGATTATTATGTTTCCATTCATTTGTATGAAGCAAAAAC
TCTGTTTCTACAACTCTTGATGGAGTATGAGGGGTGTTGAACTTAAACCT
GGGAAAAAGAGGGGTGCCATTTTTAAGGGGGGCTTGATACCCCTCTGCCC
ACTATACAACCCTTTGAATCATAACCCTATTCATACTAGGGGGGGCTGTT
CCTGTACTTCCCCTTAACTTTTGATCTAGTGATGAAATTTGACACACAAG
ATCCTTGCCATATAAGCAACTTTTGACAAGGGGTCCTAATAAGGATAGTT
TGTAGGGGGTTCGGAATACCGTTTTCCTGTCAAAATTTTTGCTGAATCCC
AGAATCCCAAAAATTGAAAAAAATAATAACACCGTCATACAGGTTTGTAC
ATGTGCAAATATCTGCATAATGACAAAAAATAAGGCTGCACCATCTTATT
TTGAAATACCGTTTTCCCGTCTTTTTTTGTCAAATACCGTACTAAAAGGG
CCAGTCCTGTCACACCGTAAAAGTACAAACTCTACACCCCCCCCCCAAAT
AAGATCTGGTGGGAGAAAATTTTCAAAAAATAAACTGTGGGGGTCTGTTT
AATTTTGAACCTAAGAATAGATTCCTTTGAGCAACCTAATTCGGAAAAAA
GAGCTGCAATTAGAGCATCAGTTTTCCTTTCATGATATTGATGCCCTGCT
GGTAGCTAATAGAAACTCACTTACATGTATGGAGCTTTGTTTCCTTCTAT
GATCTAAAGTTTACATGTATTACATTTCACTGGATTCATTTTGTCTTTTG
CTTGTTTTGATATATTTGTAAGATTGTCTTTTTATTCTGATGTATAGGAT
ATTTTGTTTGTGTTGTATATTCCAAACTTTCTTTGGAGTGTGACATTAGG
ATGACACAATATTGCTGTACGCTTTCCTCTTAACAGTTATTTTGTATTGT
TAAAGAGATATGTTAATTACAGCAAAGATGAACTGTTCTGACGCTATCCT
AGGTTGTTTTTATGTAAAAACCTGGGACGATTCATAACTACATTTTATTA
TCGACTCGACTTATGAAATTGGTTTTAGAAACATTTTGTGACTGTATCTT
TCGTGTATTTTAGTTTTACACTGGTCCTTCTAAAGGCGGTGCTAAACTAT
CTGCTGTTCATGCTTTCTCCCAGTTGGGTTCTGTCTCAATTTTGGGAAAT
TTAAAAAACAGCAAAGATTAACTGATTTGACGCTATCCTTTTCCATTTCA
CTGTGCTGGAAAAGGACGATTCAAAACAACAAGCTTCAAGCGACTTTTCA
TATGACTTCGTTTGTTCCTGTTATCTCACGTGGTTTCGCGATGTTTCTTT
AATGAACTAAGACTAATCGATATACCTTTTATCTCGACAGGCTCGTACGA
TATCGTCCATATTAAAGATGCTGCTGGTCACACTTTCGCTACTCGTCTTA
GTAACATTTTCATCGTTGGCAAAGGAAACAAAGCCATGGTCACCTTACCG
AAAGGAAAAGGTGTTCGTCTCAGTATCGCTGAGGAACGTGACAGAAGACT
CGCACACAAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000020_pilon:886693..894555- >XLOC_044288 ID=XLOC_044288|Name=XLOC_044288|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1560bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:886693..894555- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGCCACGAGGTCCAAAGAAGCACCTCAAGAGACTCAATGCCCCAAGGCA
TTGGATGTTGGACAAGCTTAGTGGAAACTTTCAGCCACGAGGTCCAAAGA
AGCACCTCAAGAGACTCAATGCCCCAAGGCATTGGATGTTGGACAAGCTT
AGTGGAAACTTTGCTCCACGCCCAAGCTCCGGTCCACACAAGTTGCGCGA
AAGTCTCCCACTTATTGTTTTCTTGAGAAATCGCTTGAAGTATGCCTTGA
ACTACACTGAAGTTGTCAAGATCATGATGCAAAGAACCATCCAAGTTGAT
GGAAAAGTTAGAACCGATGTTACATATCCAGCTGGATTTATGGGCTCCAC
GCCCAAGCTCCGGTCCACACAAGTTGCGCGAAAGTCTCCCACTTATTGTT
TTCTTGAGAAATCGCTTGAAGTATGCCTTGAACTACACTGAAGTTGTCAA
GATCATGATGCAAAGAACCATCCAAGTTGATGGAAAAGTTAGAACCGATG
TTACATATCCAGCTGGATTTATGGATGTTATCACCATTGAAAGAACTGGT
GAATTCTTCCGTCTTCTATTTGATGTCAAAGGACGATTTGTTTGTCATCG
TATCAGTCAAGAAGAATCTGCTATGTTATCACCATTGAAAGAACTGGTGA
ATTCTTCCGTCTTCTATTTGATGTCAAAGGACGATTTGTTTGTCATCGTA
TCAGTCAAGAAGAATCTGCTTACAAACTTGGAAAGGTCAAACGTGTTGCT
GTTGGCAAAAACACTGTTCCTTATCTGGTCACACATGATGCCAGAACCAT
CAGATACCCAGACCCAGACATTAAAGTAAACGATACTGTTGTCATTGACA
TCAAGACAGGAAAAATTACTGACTCAATTAAATTTGACACTGGAAATACT
GTCATGGTCATTGGTGGACGTAACACCGGTCGTGTTGGAATCATCACCAA
CCGTGAAAGACATGCTATACAAACTTGGAAAGGTCAAACGTGTTGCTGTT
GGCAAAAACACTGTTCCTTATCTGGTCACACATGATGCCAGAACCATCAG
ATACCCAGACCCAGACATTAAAGTAAACGATACTGTTGTCATTGACATCA
AGACAGGAAAAATTACTGACTCAATTAAATTTGACACTGGAAATACTGTC
ATGGTCATTGGTGGACGTAACACCGGTCGTGTTGGAATCATCACCAACCG
TGAAAGACATGCTAGCTCGTACGATATCGTCCATATTAAAGATGCTGCTG
GTCACACTTTCGCTACTCGTCTTAGTAACATTTTCATCGTTGGCAAAGGA
AACAAAGCCATGGTCACCTTACCGAAAGGAAAAGGTGTTCGTCTCAGTAT
CGCTGAGGAACGTGACAGAAGACTCGCACACAAATAAGCTCGTACGATAT
CGTCCATATTAAAGATGCTGCTGGTCACACTTTCGCTACTCGTCTTAGTA
ACATTTTCATCGTTGGCAAAGGAAACAAAGCCATGGTCACCTTACCGAAA
GGAAAAGGTGTTCGTCTCAGTATCGCTGAGGAACGTGACAGAAGACTCGC
ACACAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000020_pilon | genome | sc0000020_pilon:886693..894555 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 610-780:172 |
| Aaloc | 361-606:2254 |
| Aaloc | 265-360:2915 |
| Aaloc | 82-261:7684 |
| Aaloc | 1-81:7864 |
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