XLOC_044280 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044280
Unique NameXLOC_044280
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000187_pilon:282020..295579-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044280 ID=XLOC_044280|Name=XLOC_044280|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13560bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000187_pilon:282020..295579- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCTTTAAAGCTTGGCGTTTTGTATCTTGCAACCTTGCCTCACTAACCGAA GTGGCTAAGTCACGAAACTCAATGAGCTTTCTGGCTTTTGACGGCCGCAA AGAGCATGGAATTTAATCTAGACTCTTATGAACTGCTTCTCCATTCCGTG TGGGTCCAGTTGAGATATAAAATGATTTTAGCCTTGCCAGTAAGGTTTTT TTAGTTAAATGACCAATTAATCCTAAGACTTCCAAAACATAGGTGCAACA CTGGAATCTGTGGTTGTCATAAGGTTTTCATCTAAGAGTTTTCAACCGAT GTAACCTAATGATAATATAATTCATCGCTATACGTGTTCGATAATATATT TAAGCTAAAGACCAGCCTTTTCAAGCTGGTTGCTCAGTTTCTATTTATTT TCTCTTGTTTCTACAGCGGTGGGACGCGAAGAACTACTGAAGATCAATCT TCGTGAAGTGAAATGTGAAGACGATGTGAATTTAAATGAGCTGGCAAATA TGATGGACGGGTACAGTGGTTCTGATATCACCAATGTTTGCAGGTATGTT ATATAAGAAATGAAGAACTTTTCATTCTAATAAAGATTTTCATCAGTGTA TACCAATGAAAAATATCAGTTTTCTACTTGTATTCCTAATTCTTCAACAC ATGTAAACCCAAGCGGTTTATTAAGCATTATTGTAAATCATATTTTGGAA CGAGACTCATATTTTTTGTTTTTCAATAACTTTATAAAGGGGGGGGGGAC ACTATGCTAGATCTACATAAAATACCATCTGAAATTCTGAAAATTAGAAA TATCTTGCAAATATTTTTAGGATTAAAACCAGAAACATGAAGGTAATCTT TGTTGTGCAAAGTGCTCTATACCAGGATAACAAGTTGAGCTGATTTAGAA TTAAACATTTATTTGTCAACAAGTAAAAAAATACACTCTCAGTTTCACCA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000187_pilon:282020..295579-

>XLOC_044280 ID=XLOC_044280|Name=XLOC_044280|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3054bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000187_pilon:282020..295579- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTTCAATTTCATACAATGAAATTTGTGAAAATGCTAAACTGGCAAG
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TGAAAATGCTAAACTGGCAAGAGAAAATGCTTTATTAGGGCAGTATGATT
CTGCCCTTGTTTATTATCAAGGCTTGTTGCAACAAATACAAAAGGTGCTG
CTGCAAGCCAAGGATCCTTCACGAAAACAGAAGTGGCAAGTTGCACGTCA
AGAGATTGCTCAAGAATATGAGTATGTAAAAGACATCAATAGAACTTTAG
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GTAGTGAAACGAGATTACAGTGAACCACCGACAAGAGAAACACGTGATCC
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TCAAGAATATGAGTATGTAAAAGACATCAATAGAACTTTAGCAGACTTTA
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CGAGATTACAGTGAACCACCGACAAGAGAAACACGTGATCCTGATGTCTG
GCCTCCACCAACACCTGTTGAAAGGCCTTCAAAACCAGTCTCCAGGCCTG
TCGTTCGCAACATACGAAACGATAGAAATGATGAGAAATCAAATAGACAA
GCAAGAGGTAAACCTGCTCCAAAAAGAAATGTCAAGAGTTCTGATGGTCG
AAGTGGAGCCTCAAATAAACCAGCCGAAAACAAAGCTCCAATCAAAGCTA
AAGTAGACACTGGTCGAAAACCCAAAGAAGAAAAATCCGCCTTCAAAACC
AGTCTCCAGGCCTGTCGTTCGCAACATACGAAACGATAGAAATGATGAGA
AATCAAATAGACAAGCAAGAGGTAAACCTGCTCCAAAAAGAAATGTCAAG
AGTTCTGATGGTCGAAGTGGAGCCTCAAATAAACCAGCCGAAAACAAAGC
TCCAATCAAAGCTAAAGTAGACACTGGTCGAAAACCCAAAGAAGAAAAAT
CCGAGAATGAAGAACCTCGGTTTGACGGATCCGGTTATGATAAGGATCTG
GTGGAAGGATTGGAAAGAGATATTGTACAGAAAAATCCCAATGTCAGATG
GAGAATGAAGAACCTCGGTTTGACGGATCCGGTTATGATAAGGATCTGGT
GGAAGGATTGGAAAGAGATATTGTACAGAAAAATCCCAATGTCAGATGGA
ATGACATTGCAGAACTGGACGAAGCGAAGAAGCTGTTAAACGAAGCTGTT
GTTCTGCCGCTGCTACTTCCTGGATTCTTTACCGGTATTCGAAGACCATG
GAAAGAATGACATTGCAGAACTGGACGAAGCGAAGAAGCTGTTAAACGAA
GCTGTTGTTCTGCCGCTGCTACTTCCTGGATTCTTTACCGGTATTCGAAG
ACCATGGAAAGGTGTTTTAATGGTGGGACCACCGGGAACTGGTAAGACCA
TGTTGGCTAAAGCTGTTGCTACCGAATGTGGAACGACTTTCTTCAATGTC
ACCTCGTCCACACTGACATCTAAATATCGTGGTGAATCTGAAAAACTCGT
TAGACTTCTCTTCGAGATGGGTGTTTTAATGGTGGGACCACCGGGAACTG
GTAAGACCATGTTGGCTAAAGCTGTTGCTACCGAATGTGGAACGACTTTC
TTCAATGTCACCTCGTCCACACTGACATCTAAATATCGTGGTGAATCTGA
AAAACTCGTTAGACTTCTCTTCGAGATGGCTCGTTTTTATGCACCTAGTA
CAATTTTCATTGACGAGATTGACTCTATCTGTAGTAAAAGAGGGACGGAT
AACGAGCACGAAGCCAGTCGTCGTGTCAAGTCAGAACTCTTGATCCAAAT
GGACGGCTCGTTTTTATGCACCTAGTACAATTTTCATTGACGAGATTGAC
TCTATCTGTAGTAAAAGAGGGACGGATAACGAGCACGAAGCCAGTCGTCG
TGTCAAGTCAGAACTCTTGATCCAAATGGACGGAGTATCCGGCAACACTG
CAGAGACGGATGCACAGAAAGTTGTGATGGTGTTAGCGGCTACCAATTTC
CCATGGGACATCGATGAAGCTCTCAGGAGAAGATTGGAGAAGCGTATTTA
TATCCCTCTACCCACCGGAGTATCCGGCAACACTGCAGAGACGGATGCAC
AGAAAGTTGTGATGGTGTTAGCGGCTACCAATTTCCCATGGGACATCGAT
GAAGCTCTCAGGAGAAGATTGGAGAAGCGTATTTATATCCCTCTACCCAC
CGCGGTGGGACGCGAAGAACTACTGAAGATCAATCTTCGTGAAGTGAAAT
GTGAAGACGATGTGAATTTAAATGAGCTGGCAAATATGATGGACGGGTAC
AGTGGTTCTGATATCACCAATGTTTGCAGCGGTGGGACGCGAAGAACTAC
TGAAGATCAATCTTCGTGAAGTGAAATGTGAAGACGATGTGAATTTAAAT
GAGCTGGCAAATATGATGGACGGGTACAGTGGTTCTGATATCACCAATGT
TTGCAGGGATGCTTCGATGATGGTGATGCGACGTTGTATCCAAGGACTAT
CAGCTGAAGAGATAAAGAACCTGCCTAAAGAGAAATTAGAATTGCCAGTC
AACCAATCAGATTTCAAACATGCGCTGAAGAAAGTCTCAAAATCAGTGTC
GGAAGAGGATATTAAAAAATATGAGGAATGGATGAAAGAATTCGGTTCAG
TGTAGGGATGCTTCGATGATGGTGATGCGACGTTGTATCCAAGGACTATC
AGCTGAAGAGATAAAGAACCTGCCTAAAGAGAAATTAGAATTGCCAGTCA
ACCAATCAGATTTCAAACATGCGCTGAAGAAAGTCTCAAAATCAGTGTCG
GAAGAGGATATTAAAAAATATGAGGAATGGATGAAAGAATTCGGTTCAGT
GTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044280XLOC_044280-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000187_pilongenomesc0000187_pilon:282020..295579 -
Properties
Property NameValue
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